科学家在蔷薇科叶绿体系统发育基因组研究中取得进展
系统发育基因组学是基因组学和系统发育生物学融合产生的一个交叉学科，主要用基因组水平的大规模分子数据解析生物之间的系统发育关系，并利用系统发育原理研究基因组进化机制。基因组大量的数据信息具有“缓冲”作用，能减少系统发育重建中的随机误差，使得引起基因树冲突的各种生物学因素被逐一分析，是当前重建生命之树，解析困难系统发育关系的最有效途径。由于大小适中、核苷酸置换率适度、容易比对、不存在旁系同源问题等优点，叶绿体基因组已经被广泛应用于解析困难类群的系统发育关系。蔷薇科包括约90属3000种，全球广布，具有多种世界最具经济价值的水果，如苹果、梨、桃、李、杏、樱桃、山楂，以及著名花卉如玫瑰、月季、梅花。植物学家对蔷薇科开展了大量分类和系统关系的研究，但由于频繁的杂交、孤雌生殖和可能的快速辐射分化等因素的影响，该科的亚科、族、属分类范畴仍存在很大争议，主要分支间系统发育关系难以解析，是系统发育重建最困难的植物类群之一。 中国科学院昆明植......阅读全文
我国学者破解冬青属系统发育及生物地理特性
为何有些植物分支的物种广泛分布并演化出许多物种而有些则不然？冬青属植物的进化研究，可能为回答这一进化生物学关键问题提供有力证据。 冬青属（Ilex）是木本雌雄异株植物中最大的属（至少664种）。该属植物大多喜好温暖湿润的生境，无法存活于土壤长期干旱或寒冬较长的生境，暗示该属植物可能存在较强的生
鲤形目的分子系统发育研究取得新进展
鲤形目隶属硬骨鱼纲辐鳍鱼亚纲，有约4200个物种，是现存淡水鱼类最大的一目，占中国淡水鱼类的80%。鲤形目包括主要食用经济鱼类，如青鱼、草鱼、鲢、鳙、鲤、鲫、鳊、团头鲂、泥鳅等，也包括风靡世界的高档观赏鱼——锦鲤等。鲤形目一直是动物系统学研究的重点，在国内国际备受关注。我国有中国动物志硬骨鱼纲鲤
蚜虫mtDNACOI/COII基因序列测定及系统发育分析
实验概要本研究通过分析三种蚜虫mtDNA COI/COII基因序列的进化，揭示了三种蚜虫与已知其它蚜虫的该段序列的进化关系。实验材料本研究中的蚜虫为桃蚜、豆蚜、棉蚜。桃蚜、豆蚜、棉蚜在实验室内分别用萝卜、菜豆、黄瓜进行饲养；各种群分别置于50X50X50的正方体铁架外罩100目双层沙网内，饲养条件为
SynMRL：一种进行系统发育重建的方法
系统发育重建对研究生物各类群间亲缘关系与进化演变至关重要，也是探索重要性状的起源与演化、提出相应科学猜想的框架基石。虽然当前大量的全基因组数据、转录组数据极大地丰富了可供分析的信息位点，依然有一些分支关系饱受争议，例如被子植物中木兰类植物与单子叶植物、真双子叶植物之间的关系，葡萄目、檀香目、石竹
《Cell》:－新技术揭示新生儿免疫系统发育模式
2018年，拓展质谱流式应用方向的文献频出。5月斯坦福大学Alex J. Kuo实验室将质谱流式研究引入表观修饰领域和衰老领域的热潮还未过去，8月瑞典皇家理工学院Petter Brodin实验室就实力抢镜，在Cell上发表其研究“Stereotypic Immune System Develop
昆明动物所在食肉目分子系统学方面取得新进展
食肉目犬型超科(Caniformia)各科间的系统发育关系一直是近年来食肉目系统发育关系研究的热点，至今仍处于众说纷纭的状态，尤其是小熊猫科的系统发育位置。小熊猫因其似熊非熊的形态特征，使得它的进化地位存在很大的争议，无法得到解决。 中国科学院昆明动物研究所张亚平院士、云南大
昆明动物所等在灵长目疣猴亚科分子系统学研究中取得进展
灵长目疣猴亚科（Colobinae）物种是经历快速辐射进化和近期物种形成事件的典型类群，围绕其所包含的各属之间的系统发育关系一直是国内外研究的热点。 中国科学院昆明动物研究所张亚平院士、云南大学于黎研究员和博士研究生王晓萍结合模式生物基因组信息，系统筛选得到44个新的单拷贝核基因内含子片段
我国学者完成山刺番荔枝全基因组测序
近日，华南农业大学林学与风景园林学院副教授唐光大与福建农林大学教授刘仲健团队合作完成了山刺番荔枝的全基因组测序。相关成果发表于Ornamental Plant Research。山刺番荔枝花和果实图。研究团队 供图 该研究通过比较基因组学分析表明木兰科植物是真双子叶植物的姐妹，而基于串联法（A
青岛能源所提出微藻属内精确种质鉴定新策略
微藻通过光合作用，在地球生物圈的碳固定、初级生物量积累和能量转化等方面发挥着重要作用。一些具有含油量高、生长速度快、抗逆性强等生理特征的微藻，具备规模生产生物柴油等可再生燃料的潜力。而目前使用的ITS等系统发育分子标记经常无法准确区分与鉴定种内不同藻株或属内不同藻种。因此，开发高灵敏度和高可靠性
一个高质量的黄连染色体规模的基因组组装和注释
黄连 (Coptis chinensis Franch.) 是毛茛科的一员，代表了一个重要的早期分叉双子叶植物谱系，具有多种药用价值。 2021年6月2日，湖北省食品药品监督检验研究院聂晶，华中农业大学王学奎，中国中医科学院陈士林及湖北中医药大学Liu Yifei（湖北中医药大学为第一单位）共
昆明植物所探索解决温带木本竹子系统发育关系的SNP标记
温带竹子支系(the temperate bamboo clade)包括23-32属，约600种，分布于东亚地区(特别是喜马拉雅)、东南亚部分地区、印度南部和斯里兰卡、非洲和马达加斯加以及北美洲东部的温带低海拔地区和热带或亚热带高山。东亚有该支系约500种，是其多样化中心，其中中国西南特有种
东非高山千里木属植物系统发育及生物地理学研究获进展
千里木属（Dendrosenecio）隶属菊科（Asteraceae），包括11个物种和5个亚种，特有分布于东非高山地区，为世界著名的高山植物类群之一，也是研究高山植物辐射分化及适应性进化的理想材料。长期以来，虽然学界高度关注这一类群，但由于缺乏有效的分子标记来揭示其属内系统发育关系，该类群的分
基因组学研究重建苔类植物演化历程获突破
深圳市仙湖植物园研究团队与合作者使用转录组数据，首次对苔类目级系统框架进行了重建，得到了高支持的系统发育树。相关研究9月8日在线发表于Annals of Botany。该论文第一作者为深圳市仙湖植物园董珊珊副研究员，通讯作者为刘阳研究员。深圳市仙湖植物园张力研究员，深圳华大生命科学研究院联合培养研究
中国境内鼢鼠发育、成种为何如此迅猛
一直以来，甘肃、青海、宁夏、内蒙和东北等地鼠害严重，对农作物、树木和草皮造成大面积破坏。过去五十年来，当地群众一直采用地箭射杀或者投毒等手段进行鼠害控制，但是无法有效控制其种群密度，药物对土壤、地下水也造成污染，急需寻找科学有效地控制害鼠种群大小的方法。 日前，由兰州大学生态学院教授李克欣课题
古脊椎所等在角形类系统发育研究中取得进展
犀牛和貘在外形上差别较大，但两者均属于奇蹄目，形态和分子生物学的证据表明两者构成姐妹群，由共同的祖先演化而来，统称为角形类（Ceratomorpha）。虽然现生的犀仅包括四属五种，貘仅有一属四种，但是在新生代（6500万年前至今）的较长时期内，角形类是非常繁盛、多样的类群。约5000万年前的早
古脊椎所等在亚洲蝮系统发育研究中取得进展
亚洲蝮是一类小型剧毒蛇，也是我国分布最广，数量最多的毒蛇之一。亚洲蝮属（Gloydius）隶属蝰蛇科，蝮亚科，该属成员有20余种，分布于亚洲及欧洲边缘。关于亚洲蝮属的多样性、系统发育、起源演化、蛇伤防治和生物医药开发等内容，一直是国内外学者关注的热点。近年来，随着野外工作的推进，分子系统学研究的
研究揭示系统发育和功能性状维度的树种共存机制
群落物种共存的生态学机制一直是生态学家关注的焦点之一。中科院西双版纳热带植物园森林群落结构、功能与动态研究组与植物系统与保护生物学研究组，以及美国密歇根州立大学Swenson实验室等国内外研究团队合作，从系统发育和功能维度，对西双版纳20公顷热带季节雨林动态监测样地的群落树种共存机制进行研究，取
仔猪出生氧化应激和抗氧化系统发育研究获进展
氧化应激即指机体内氧化与抗氧化作用失衡，倾向于氧化状态。氧化应激能氧化和损伤体内的脂质、蛋白质、核酸等大分子物质，从而诱导各种氧化性疾病，如糖尿病、神经退化性疾病、衰老、心脏病、帕金森综合症等。 近年来有研究表明，人和动物出生过程也能导致胎儿产生应激反应。分娩出生过程中一个最大的特点是胎儿
华南植物园发现系统发育对植物元素含量的影响
阐明植物元素含量特征及其影响因子对于理解植物对环境变化的响应与适应具有重要意义。长期以来，人们对土壤和气候条件如何影响植物元素含量做了大量的研究，然而系统发育（或进化历史）对植物元素含量的影响却往往被忽视。华南喀斯特地区是一个全球生物多样性热点地区，喀斯特植物是我国植物多样性和特有性的重要组成部
刷新教科书认知！最全人体免疫系统发育图谱来了
免疫细胞作为防止病毒细菌等病原体入侵人体的“卫士”，是免疫系统中不可或缺的组成部分。明确免疫细胞类型、分化及功能状态，对理解免疫力和揭示免疫相关疾病的发生发展机制具有重大的科学和社会意义。 9月12日，在《细胞》上发表的一项最新研究中，研究人员首次成功构建了覆盖组织范围最广、时间跨度最长、采样
昆明植物所在微型真菌系统发育研究中取得新进展
拟盘多毛孢属（Pestalotiopsis）通常以植物病原体或内生的方式存在。据前人研究，它是一个包含300多种新化合物和具有生物活性代谢产物的属，因此成为很多新化合物骨架筛选的目标。目前发现该属的许多新化合物都是来自于该属未命名的种。针对该属分子系统学的研究开始于2011年，截止到2014年7
运用鲤科鱼类系统发育重建长江水系的演化历史
现代长江的起源及南亚、东亚水系的演变，与新近纪青藏高原隆升和现代亚洲季风系统建立相关。然而，准确刻画长江水系的时空演变规律颇具挑战性。之前的地质学研究基于不同的采样地点、测年方法和替代指标进行估算，认为古金沙江在“第一湾”开始改道东流和三峡贯穿的时间从始新世到最近的更新世均有可能。 河流的地貌
膨瑚菌属真菌系统发育和分类研究中取得进展
膨瑚菌属（Physalacria）为蘑菇目（Agaricales）膨瑚菌科（Physalacriaceae）的模式属。该属真菌主要分布于泛热带地区，前人共描述了30余种，但中国大陆仅报道过1种。该属多数种形似气球，头部直径不足6 mm，柄部长度不超过1 cm，不易发现和保存，馆藏标本很难用于分子
刷新教科书认知！最全人体免疫系统发育图谱来了
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508369.shtm免疫细胞作为防止病毒细菌等病原体入侵人体的“卫士”，是免疫系统中不可或缺的组成部分。明确免疫细胞类型、分化及功能状态，对理解免疫力和揭示免疫相关疾病的发生发展机制具有重大的科学和社会意
科学家证实串联模型存在缺陷
由哈佛大学博士、沈阳师范大学兼职教授伍少远领导的研究小组采用大规模基因组数据，首次证实目前在系统发育以及比较基因组研究领域广泛应用的串联分析模型具有内在缺陷，不适用于基因组数据分析，并提出了多物种溯祖模型，为解决哺乳动物系统发育关系提供了一个可靠的物种树。相关成果日前发表于美国《国家科学院院刊》
山苍子基因组图谱揭秘精油合成分子机制
山苍子，是我国南方家喻户晓的一种香树，其果实有香气，无毒，可治疗急性肺炎，有抗病毒抗菌消炎作用。山苍子精油还是高级化妆品紫罗兰酮的原料。山苍子花 陈炳华摄 4月3日，《自然—通讯》在线发表中国林业科学研究院亚热带林业研究所（以下简称亚林所）研究员汪阳东团队的重要成果。该团队成功组装全球首个染色
昆明植物所解析核心十字花科植物的系统发育关系
十字花科（Brassicaceae或Cruciferae）植物约有351属3977种，是一个全球分布的自然类群，包括常见绿叶类蔬菜、油料作物油菜、园艺观赏植物香雪球等。该科有模式植物拟南芥，也是被子植物全基因组序列数据发表最多的科之一，为研究全基因组加倍、环境适应机制、基因功能进化等重要生物学问
蝴蝶基因组大小进化进展－发现表型多样性进化遗传基础
蝴蝶因其丰富的形态多样性，自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一，近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型，已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。 中国科学院昆明动物研究所科研团队在2015年完成所有蝴蝶模式种金凤蝶及其
昆明动物所研究团队在蝴蝶基因组大小进化方面获进展
蝴蝶因其丰富的形态多样性，自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一，近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型，已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。 中国科学院昆明动物研究所科研团队在2015年完成所有蝴蝶模式种金凤蝶及其
新研究揭示海生昆虫起源之谜
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505163.shtm 近日，中山大学教授谢强团队与华南师范大学教授栾云霞、荷兰自然历史博物馆博士陈萍萍等科研人员合作，研究揭示了海生昆虫起源之谜。相关研究以《海蝽回归海洋的3亿年进化历程》为题发表于《