科学家在蔷薇科叶绿体系统发育基因组研究中取得进展
系统发育基因组学是基因组学和系统发育生物学融合产生的一个交叉学科，主要用基因组水平的大规模分子数据解析生物之间的系统发育关系，并利用系统发育原理研究基因组进化机制。基因组大量的数据信息具有“缓冲”作用，能减少系统发育重建中的随机误差，使得引起基因树冲突的各种生物学因素被逐一分析，是当前重建生命之树，解析困难系统发育关系的最有效途径。由于大小适中、核苷酸置换率适度、容易比对、不存在旁系同源问题等优点，叶绿体基因组已经被广泛应用于解析困难类群的系统发育关系。蔷薇科包括约90属3000种，全球广布，具有多种世界最具经济价值的水果，如苹果、梨、桃、李、杏、樱桃、山楂，以及著名花卉如玫瑰、月季、梅花。植物学家对蔷薇科开展了大量分类和系统关系的研究，但由于频繁的杂交、孤雌生殖和可能的快速辐射分化等因素的影响，该科的亚科、族、属分类范畴仍存在很大争议，主要分支间系统发育关系难以解析，是系统发育重建最困难的植物类群之一。 中国科学院昆明植......阅读全文
鲤形目的分子系统发育研究取得新进展
鲤形目隶属硬骨鱼纲辐鳍鱼亚纲，有约4200个物种，是现存淡水鱼类最大的一目，占中国淡水鱼类的80%。鲤形目包括主要食用经济鱼类，如青鱼、草鱼、鲢、鳙、鲤、鲫、鳊、团头鲂、泥鳅等，也包括风靡世界的高档观赏鱼——锦鲤等。鲤形目一直是动物系统学研究的重点，在国内国际备受关注。我国有中国动物志硬骨鱼纲鲤
我国学者破解冬青属系统发育及生物地理特性
为何有些植物分支的物种广泛分布并演化出许多物种而有些则不然？冬青属植物的进化研究，可能为回答这一进化生物学关键问题提供有力证据。 冬青属（Ilex）是木本雌雄异株植物中最大的属（至少664种）。该属植物大多喜好温暖湿润的生境，无法存活于土壤长期干旱或寒冬较长的生境，暗示该属植物可能存在较强的生
颠覆认知！脑膜淋巴系统发育的大脑调控机制首次发现
中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）研究员杜久林、副研究员李佳课题组，联合上海交通大学医学院附属瑞金医院主任医师尚寒冰课题组，首次发现脑膜淋巴系统发育的大脑调控机制，突破了传统脑膜淋巴发育的理论框架，发现了“神经-胶质-成纤维细胞-淋巴”动态调控轴，为神经-免疫系统互作研究领域提
蚜虫mtDNACOI/COII基因序列测定及系统发育分析
实验概要本研究通过分析三种蚜虫mtDNA COI/COII基因序列的进化，揭示了三种蚜虫与已知其它蚜虫的该段序列的进化关系。实验材料本研究中的蚜虫为桃蚜、豆蚜、棉蚜。桃蚜、豆蚜、棉蚜在实验室内分别用萝卜、菜豆、黄瓜进行饲养；各种群分别置于50X50X50的正方体铁架外罩100目双层沙网内，饲养条件为
昆明植物所建立叶绿体基因组遗传信息获取技术体系
在分子生物学和基因组时代，叶绿体基因组为植物分类、系统发育和物种鉴定等提供了不可或缺的遗传信息。随着新一代测序技术的快速发展，叶绿体基因组学已经成为植物系统基因组学和超级条形码研究的热点，也是中国科学院昆明植物研究所三个重大突破目标——iFlora 研究的重要内容。 昆明植物所种质资源库多年来
中国科研人员在兰科植物研究方面获得进展
中科院成都生物研究所植物多样性研究团队利用Illumina测序技术分别研究了极小种群之一的巴郎山杓兰和对叶杓兰的叶绿体基因组特征，并基于叶绿体基因组数据重建了兰科植物5个亚科中的47个物种的系统发育树，为阐明杓兰属和兰科植物的系统发育关系和分类关系作出了重要贡献。 据了解，兰科是被子植物中最大
昆明动物所等在食肉目鼬科分子系统学方面取得新进展
食肉目鼬科（Mustelidae）物种是经历快速辐射进化和近期物种形成事件的典型类群，围绕其所包含的各亚科之间的系统发育关系一直是国内外研究的热点，至今仍处于众说纷纭的状态。 中国科学院昆明动物研究所张亚平院士、云南大学于黎研究员和博士研究生刘江，硕士研究生彭丹结合模式生物基
中国农大团队构建首个苹果属图形泛基因组
中国农业大学教授韩振海团队基于30份苹果属植物高质量基因组，系统解析了苹果属数千万年的演化历程，并构建了首个苹果属图形泛基因组，发布了苹果属遗传多样性全景图。日前，相关研究成果发表于《自然-遗传学》。苹果属植物倍性复杂，分布横跨欧亚、美洲等多个地理区域，是研究基因组多倍化与杂交的重要木本植物类群。全
石松类和蕨类植物的基因组大小与进化研究中取得新进展
基因组的大小与物种进化之间的关系一直以来都受到学者广泛关注。作为遗传信息的载体，基因组大小不可避免地逐步增加。已有研究显示，基因组的大小同物种的进化程度之间存在一定的正相关关系。从大尺度的分类水平来看，基因组大小和物种复杂程度在总的趋势上呈正相关性。然而随着研究的深入，人们发现基因组的大小和物种
中山大学张鹏教授到水生所进行学术交流
张鹏教授作学术报告 5月10日，中山大学张鹏教授应邀来到中国科学院水生生物研究所进行学术交流，并为科研人员和研究生作了题为“两栖爬行动物分子系统学--从mtDNA到基因组”的学术报告。 张鹏教授以线粒体基因组(mtDNA)为出发点，首先介绍了mtDNA的特点及其在系统发育中的应用及优势，
昆明动物所在食肉目分子系统学方面取得新进展
食肉目犬型超科(Caniformia)各科间的系统发育关系一直是近年来食肉目系统发育关系研究的热点，至今仍处于众说纷纭的状态，尤其是小熊猫科的系统发育位置。小熊猫因其似熊非熊的形态特征，使得它的进化地位存在很大的争议，无法得到解决。 中国科学院昆明动物研究所张亚平院士、云南大
古脊椎所等在角形类系统发育研究中取得进展
犀牛和貘在外形上差别较大，但两者均属于奇蹄目，形态和分子生物学的证据表明两者构成姐妹群，由共同的祖先演化而来，统称为角形类（Ceratomorpha）。虽然现生的犀仅包括四属五种，貘仅有一属四种，但是在新生代（6500万年前至今）的较长时期内，角形类是非常繁盛、多样的类群。约5000万年前的早始
运用鲤科鱼类系统发育重建长江水系的演化历史
现代长江的起源及南亚、东亚水系的演变，与新近纪青藏高原隆升和现代亚洲季风系统建立相关。然而，准确刻画长江水系的时空演变规律颇具挑战性。之前的地质学研究基于不同的采样地点、测年方法和替代指标进行估算，认为古金沙江在“第一湾”开始改道东流和三峡贯穿的时间从始新世到最近的更新世均有可能。 河流的地貌
刷新教科书认知！最全人体免疫系统发育图谱来了
免疫细胞作为防止病毒细菌等病原体入侵人体的“卫士”，是免疫系统中不可或缺的组成部分。明确免疫细胞类型、分化及功能状态，对理解免疫力和揭示免疫相关疾病的发生发展机制具有重大的科学和社会意义。 9月12日，在《细胞》上发表的一项最新研究中，研究人员首次成功构建了覆盖组织范围最广、时间跨度最长、采样
华南植物园发现系统发育对植物元素含量的影响
阐明植物元素含量特征及其影响因子对于理解植物对环境变化的响应与适应具有重要意义。长期以来，人们对土壤和气候条件如何影响植物元素含量做了大量的研究，然而系统发育（或进化历史）对植物元素含量的影响却往往被忽视。华南喀斯特地区是一个全球生物多样性热点地区，喀斯特植物是我国植物多样性和特有性的重要组成部
刷新教科书认知！最全人体免疫系统发育图谱来了
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508369.shtm免疫细胞作为防止病毒细菌等病原体入侵人体的“卫士”，是免疫系统中不可或缺的组成部分。明确免疫细胞类型、分化及功能状态，对理解免疫力和揭示免疫相关疾病的发生发展机制具有重大的科学和社会意
仔猪出生氧化应激和抗氧化系统发育研究获进展
氧化应激即指机体内氧化与抗氧化作用失衡，倾向于氧化状态。氧化应激能氧化和损伤体内的脂质、蛋白质、核酸等大分子物质，从而诱导各种氧化性疾病，如糖尿病、神经退化性疾病、衰老、心脏病、帕金森综合症等。 近年来有研究表明，人和动物出生过程也能导致胎儿产生应激反应。分娩出生过程中一个最大的特点是胎儿
研究揭示系统发育和功能性状维度的树种共存机制
群落物种共存的生态学机制一直是生态学家关注的焦点之一。中科院西双版纳热带植物园森林群落结构、功能与动态研究组与植物系统与保护生物学研究组，以及美国密歇根州立大学Swenson实验室等国内外研究团队合作，从系统发育和功能维度，对西双版纳20公顷热带季节雨林动态监测样地的群落树种共存机制进行研究，取
古脊椎所等在亚洲蝮系统发育研究中取得进展
亚洲蝮是一类小型剧毒蛇，也是我国分布最广，数量最多的毒蛇之一。亚洲蝮属（Gloydius）隶属蝰蛇科，蝮亚科，该属成员有20余种，分布于亚洲及欧洲边缘。关于亚洲蝮属的多样性、系统发育、起源演化、蛇伤防治和生物医药开发等内容，一直是国内外学者关注的热点。近年来，随着野外工作的推进，分子系统学研究的
膨瑚菌属真菌系统发育和分类研究中取得进展
膨瑚菌属（Physalacria）为蘑菇目（Agaricales）膨瑚菌科（Physalacriaceae）的模式属。该属真菌主要分布于泛热带地区，前人共描述了30余种，但中国大陆仅报道过1种。该属多数种形似气球，头部直径不足6 mm，柄部长度不超过1 cm，不易发现和保存，馆藏标本很难用于分子
昆明植物所在微型真菌系统发育研究中取得新进展
拟盘多毛孢属（Pestalotiopsis）通常以植物病原体或内生的方式存在。据前人研究，它是一个包含300多种新化合物和具有生物活性代谢产物的属，因此成为很多新化合物骨架筛选的目标。目前发现该属的许多新化合物都是来自于该属未命名的种。针对该属分子系统学的研究开始于2011年，截止到2014年7
昆明动物所等在灵长目疣猴亚科分子系统学研究中取得进展
灵长目疣猴亚科（Colobinae）物种是经历快速辐射进化和近期物种形成事件的典型类群，围绕其所包含的各属之间的系统发育关系一直是国内外研究的热点。 中国科学院昆明动物研究所张亚平院士、云南大学于黎研究员和博士研究生王晓萍结合模式生物基因组信息，系统筛选得到44个新的单拷贝核基因内含子片段
利用完整质体基因组精准鉴定天冬及其9种混伪品
在传统医学的宝库中，天冬（Asparagus cochinchinensis）作为一味重要的中药材，其加工后的块根 —— 天门冬，在东亚地区尤其是中国，有着悠久的药用历史。它不仅能治疗多种疾病，如胃痛、便秘、发热、哮喘等，还被广泛应用于制药和保健品行业，可谓是 “药界明星”。然而，近年来天冬市场却遭
我国学者完成山刺番荔枝全基因组测序
近日，华南农业大学林学与风景园林学院副教授唐光大与福建农林大学教授刘仲健团队合作完成了山刺番荔枝的全基因组测序。相关成果发表于Ornamental Plant Research。山刺番荔枝花和果实图。研究团队 供图 该研究通过比较基因组学分析表明木兰科植物是真双子叶植物的姐妹，而基于串联法（A
青岛能源所提出微藻属内精确种质鉴定新策略
微藻通过光合作用，在地球生物圈的碳固定、初级生物量积累和能量转化等方面发挥着重要作用。一些具有含油量高、生长速度快、抗逆性强等生理特征的微藻，具备规模生产生物柴油等可再生燃料的潜力。而目前使用的ITS等系统发育分子标记经常无法准确区分与鉴定种内不同藻株或属内不同藻种。因此，开发高灵敏度和高可靠性
一个高质量的黄连染色体规模的基因组组装和注释
黄连 (Coptis chinensis Franch.) 是毛茛科的一员，代表了一个重要的早期分叉双子叶植物谱系，具有多种药用价值。 2021年6月2日，湖北省食品药品监督检验研究院聂晶，华中农业大学王学奎，中国中医科学院陈士林及湖北中医药大学Liu Yifei（湖北中医药大学为第一单位）共
新疆蔷薇网状进化与适应研究有了新进展
近日，中国科学院成都生物研究所生物多样性保护中心研究员徐波团队围绕新疆野生蔷薇类群，开展了系统的野外调查与多维数据整合研究。团队在新疆和四川地区收集并整理了252份材料，结合形态学、倍性分析与基因组证据，系统解析了新疆野生蔷薇的多样性格局、网状演化历史及潜在环境适应线索。相关成果于2月4日在线发表于
昆明植物所探索解决温带木本竹子系统发育关系的SNP标记
温带竹子支系(the temperate bamboo clade)包括23-32属，约600种，分布于东亚地区(特别是喜马拉雅)、东南亚部分地区、印度南部和斯里兰卡、非洲和马达加斯加以及北美洲东部的温带低海拔地区和热带或亚热带高山。东亚有该支系约500种，是其多样化中心，其中中国西南特有种
东非高山千里木属植物系统发育及生物地理学研究获进展
千里木属（Dendrosenecio）隶属菊科（Asteraceae），包括11个物种和5个亚种，特有分布于东非高山地区，为世界著名的高山植物类群之一，也是研究高山植物辐射分化及适应性进化的理想材料。长期以来，虽然学界高度关注这一类群，但由于缺乏有效的分子标记来揭示其属内系统发育关系，该类群的分
基因组学研究重建苔类植物演化历程获突破
深圳市仙湖植物园研究团队与合作者使用转录组数据，首次对苔类目级系统框架进行了重建，得到了高支持的系统发育树。相关研究9月8日在线发表于Annals of Botany。该论文第一作者为深圳市仙湖植物园董珊珊副研究员，通讯作者为刘阳研究员。深圳市仙湖植物园张力研究员，深圳华大生命科学研究院联合培养研究