中国大陆神经精神障碍内表型研究数据库获得国际学者关注
基因组测序工作的完成并不意味着我们已经能够全面了解各种神经精神障碍的病因，因为这类疾病的研究通常受到疾病的多样性、环境因素（包括基因环境间的交互）以及发展阶段和表观遗传有关的不同因素的影响。到目前为止，即使进行了基因组的测查，我们仍不能精确地说明个体的基因表型（基因型的外在表现，例如精神疾病患者的症状），基因表型的说明主要依赖于标准化的精神疾病诊断，但这样的诊断既不全面，也不准确。 因此，随着人类基因组项目的完成，后基因组时代下生物医学科学面临的主要困难是：如何从分子水平到心理水平来描绘人类“内表型”的多样性，其中最重要的就是筛查精神障碍的“不和谐心理”。认知神经科学、神经心理学和影像遗传学（绘制人脑神经结构图和描述基因型功能活动的策略）的发展促进了观念的转变，内表型更大的优势在于考察临床病人的未患病亲属中基因变异的风险，将之作为研究和发现神经调节机制的工具，在DNA序列和病理行为之间架起一座桥梁。电生理......阅读全文
聚焦降焦减害的烟草膨胀素基因研究取得新进展
近日，中国农业科学院烟草研究所烟草功能基因组创新团队有关细胞壁多糖代谢膨胀素基因研究取得新进展，相关结果分别发表于《植物细胞报告（Plant Cell Reports）》、《分子遗传学和基因组学（Molecular Genetics and Genomics）》学术期刊上。 烟草是我国重要的
北京基因组所合作开发完成长非编码RNA数据库
长非编码RNA（Long non-coding RNA, lncRNA）是近年来国际研究的新热点,与人类癌症、神经系统等疾病发生密切相关，在疾病诊疗方面表现出了潜在的重大应用价值。虽然长非编码RNA表达量相对较低，但由于其在转录、基因组印记、翻译、可变剪切、转录后表达调控、蛋白运输与定位等过程的
科学家得到详细的恶性胶质细胞瘤细胞基因组数据库
科学家启动了肿瘤基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas，TCGA)，打算分析所有组织的肿瘤细胞的基因组。脑组织肿瘤是科学家的第一个目标，因为其挑战性大回报也最大。 TCGA收集了多形性成胶质细胞瘤(glioblastoma multiforme，GBM)的组
北京基因组所开发完成DNA甲基化重编程数据库
DNA甲基化是一个重要的表观遗传标记，在胚胎早期发育过程中起到至关重要的作用，不同物种所采用的机制亦各不相同。因而，整合多个物种的海量甲基化数据并提供在线的数据浏览、获取及其功能分析，可帮助更多研究人员深入探析不同物种在早期发育时期的DNA甲基化差异，并揭示其DNA甲基化重编程过程与机制。
天津大学：新冠病毒基因组注释数据库向全球开放
疫情就是命令！30日从天津大学获悉，该校生物信息中心新型冠状病毒基因组注释数据库上线，并纳入中国国家基因组科学数据中心向全球开放服务。新型冠状病毒基因组注释数据库 ZCURVE_CoV Database 网站截图 面对疫情加快蔓延的严重形势，科技界正在争分夺秒与病毒抗争，开展病毒防治相关药物的
基于同源基因簇的水稻泛基因组综合数据库建成
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498300.shtm近日，华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室教授张建伟课题组联合国内外高校与科研机构在《自然—通讯》与《分子植物》连续发表两篇研究论文。这两项工作以代表亚洲稻群体结构的
首个近完整黄瓜参考基因组及多组学综合数据库发布
近日，中国农业科学院蔬菜花卉研究所葫芦科蔬菜遗传育种创新团队在黄瓜基因组学方面取得重要进展，首次完成接近完整的黄瓜参考基因组组装和基因注释，搭建了第一个黄瓜多组学综合数据库。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》（IF5 year = 21.4）上。黄瓜（Cucumis s
研究人员发布全基因组单核苷酸变异数据库
10月22日，国际学术期刊Genome Biology 以PGG.SNV： understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse popul
动物所等揭示小鼠行为和神经基因的驯化机制
实验小鼠是生物学和医学研究中最常用的哺乳动物模型之一，由野生小家鼠长期驯化而来。实验小鼠和野生小家鼠在体型、生理及行为方面存在很大差异。特别是，实验室驯化下小鼠攻击行为减弱、温顺行为增强。已知实验小鼠的基因组来自Mus musculus domesticus (M. m. domesticus)
动物所等揭示小鼠行为和神经基因的驯化机制
实验小鼠是生物学和医学研究中最常用的哺乳动物模型之一，由野生小家鼠长期驯化而来。实验小鼠和野生小家鼠在体型、生理及行为方面存在很大差异。特别是，实验室驯化下小鼠攻击行为减弱、温顺行为增强。已知实验小鼠的基因组来自Mus musculus domesticus (M. m. domesticus)
遗传发育所鉴定出小麦穗发育的转录调控因子
小麦是重要的粮食作物之一。小麦的产量主要由亩穗数、千粒重和穗粒数决定。穗型结构影响小麦的小穗数、穗粒数和产量，是育种改良地重要的选择性状。挖掘小麦穗发育重要调控因子与解析分子调控机制，对小麦穗型的分子设计与精准改良、突破产量瓶颈具有重要意义。由于小麦功能基因组学发展较晚，穗发育关键基因挖掘及作用
心理所关于疾病相关非编码区域的研究取得新进展
遗传学因素在精神类疾患发生发展过程中的重要性已经得到公认。此外，影像遗传学证据显示，正常心理学现象中的行为/认知加工过程也表现出一定程度的遗传相关性。目前已有大量精神疾患及行为/认知加工相关易感基因鉴定工作发表在心理学主流杂志上，但是这些易感基因的功能分析，尤其是针对非蛋白质编码区域的功能研究有
我国建成全球第四个综合基因组权威数据库
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为“The BIG Data Center： from deposition to integration to translation”（北京基因组研究所生命与健康大数据中心：从存储到整合、再到转化）的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》
全球共享的基因组数据库办不下去了，怎么办？
1资金困境 作为世界上最具权威性的人类疾病相关的基因目录第五十个生日时，它面临着令人不安的变化。在接下来的几年里，美国国家人类基因组研究所（NHGRI）预计退出作为基因组数据库的始祖——称为在线人类孟德尔遗传（OMIM）唯一的资助者。谁将继承标签尚未明确。当美国国家卫生研究院（NIH）评估其数
我国牵头完成高质量豌豆参考基因组和泛基因组解析
9月22日，中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位，成功绘制了中国豌豆基因组高质量精细物理图谱，构建了栽培和野生豌豆泛基因组，解析了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构，为揭示豌豆起源驯化，以及基因挖掘、种质创新、育种改良提供了宝贵资源及数据支
西瓜甜瓜“甜蜜基因”双双被揭示
作为甜蜜美味的世界性水果，西瓜和甜瓜同属于葫芦科作物。北京时间11月2日，《自然—遗传学》以两篇长文形式在线发表了两项由中国农业科学院联合国内外优势单位完成的瓜类作物基因组研究成果。两项研究分别构建了西瓜和甜瓜的全基因组变异图谱，揭示了两种水果的驯化历史及果实品质的遗传分子机制。 论文共同通讯
“真菌基因组学与进化小型国际学术研讨会”在京举行
10月22日，由中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室（筹）及中国菌物学会主办的“真菌基因组学与进化小型国际学术研讨会-庆祝真菌学国家重点实验室（筹）成立”在京举行。 随着国际真菌基因组学研究的快速发展，国内不同真物学研究实验室已完成或正开展基因组测序的真菌达60种以上。中
基因组所发布全转录组关联研究知识库
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（NGDC）开发的全转录组关联研究知识库正式上线。该研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association studies”为题在
国际最新研究发现，一基因罕见突变或与智力障碍相关
中新网北京6月1日电 (记者 孙自法)施普林格·自然旗下专业学术期刊《自然-医学》最新发表一篇健康研究论文称，研究人员开展的一项大规模遗传学研究显示，相比目前已知的其他任何非性别相关基因，RNU4-2基因的罕见突变可能是更多临床诊断智力障碍(ID)病例的一个促进因素。研究人员指出，RNU4-2基因负
浙大教授Nature子刊：水稻基因组重测序及群体遗传学研究
浙江大学农业与生物技术学院作物科学研究所，中国水稻研究所的研究人员发表了题为“Genomic variation associated with local adaptation of weedy rice during de-domestication” 的文章，以杂草稻群体为材料，通过基因组
西瓜甜瓜“甜蜜基因”双双被揭示
作为甜蜜美味的世界性水果，西瓜和甜瓜同属于葫芦科作物。北京时间11月2日，《自然—遗传学》以两篇长文形式在线发表了两项由中国农业科学院联合国内外优势单位完成的瓜类作物基因组研究成果。两项研究分别构建了西瓜和甜瓜的全基因组变异图谱，揭示了两种水果的驯化历史及果实品质的遗传分子机制。 论文共同通讯
竹类组学和分类学信息平台发布
日前，中国科学院昆明植物研究所研究员李德铢带领的研究团队在《分子植物》上在线发表论文，发布了“竹类组学和分类学信息平台（BambooBase，https://bamboo.genobank.org/）”。BambooBase收录了竹类植物18个基因组、476个转录组和16个表观基因组的数据，以及13
肥胖的进化机制研究取得新进展
对人类祖先来说，储存脂肪的基因在饥荒时期可能是有用的，但这些基因是否让后代更易发胖还存在争议。尽管目前流行的“节俭基因”假说（ Thrifty Gene Hypothesis ）饱受质疑，但是并没有直接的证据能推翻该假说。9月22日《细胞代谢》（ Cell Metabolism ）杂志报道了中国
遗传发育所在肥胖的进化机制研究中取得新进展
对人类祖先来说，储存脂肪的基因在饥荒时期可能是有用的，但这些基因是否让后代更易发胖还存在争议。尽管目前流行的“节俭基因”假说（Thrifty Gene Hypothesis）饱受质疑，但是并没有直接的证据能推翻该假说。9月22日《细胞代谢》（Cell Metabolism）杂志报道了中国科学院遗
研究构建绵羊和山羊肠道高质量微生物基因组数据库
近日，西北农林科技大学羊遗传改良与生物育种团队携手国内外多家科研机构，在绵羊和山羊肠道微生物基因组数据库构建及肠道粘蛋白和多糖代谢功能菌种挖掘方面取得进展，研究成果发表在Microbiome上。研究团队在全国范围内的32个羊场收集了来自21个绵羊和山羊品种共计320个肠道样本，分别构建了包含1.6亿
我国发布空间转录组综合资源存储库CROST
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/509953.shtm近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心合作开发的空间转录组综合资源存储库（CROST）正式上线，该研究成果以“CROST: a comprehen
空间转录组综合资源存储库CROST正式上线！
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心合作开发的空间转录组综合资源存储库（CROST）正式上线，该研究成果以“CROST: a comprehensive repository of spatial transcriptomics”为题在国际学术期刊Nucleic
科学家绘制正常组织DNA甲基化单体图谱
中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员石建涛，联合上海交通大学医学院附属瑞金医院教授方海，在《基因组研究》（Genome Research）上，在线发表了题为A DNA methylation haplotype block landscape in human tissues and preim
上海生科院在多不饱和脂肪酸遗传易感基因研究中取得进展
1月6日，国际遗传学期刊Human Molecular Genetics（《人类分子遗传学》）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所林旭研究组开展亚洲人群多不饱和脂肪酸全基因组关联研究的成果：Genome-wide meta-analyses identify novel loci
北京基因组所杨运桂研究员到昆明动物所进行学术交流
1月14日上午，应中国科学院、云南省动物模型和人类疾病机理重点实验室陈策实研究员邀请，中国科学院北京基因组研究所杨运桂研究员到昆明动物研究所进行学术交流，并作了题为N6-methyl-adenosine (m6A) in RNA: An Old Modification with A Nov