中国大陆神经精神障碍内表型研究数据库获得国际学者关注

基因组测序工作的完成并不意味着我们已经能够全面了解各种神经精神障碍的病因,因为这类疾病的研究通常受到疾病的多样性、环境因素(包括基因环境间的交互)以及发展阶段和表观遗传有关的不同因素的影响。到目前为止,即使进行了基因组的测查,我们仍不能精确地说明个体的基因表型(基因型的外在表现,例如精神疾病患者的症状),基因表型的说明主要依赖于标准化的精神疾病诊断,但这样的诊断既不全面,也不准确。 因此,随着人类基因组项目的完成,后基因组时代下生物医学科学面临的主要困难是:如何从分子水平到心理水平来描绘人类“内表型”的多样性,其中最重要的就是筛查精神障碍的“不和谐心理”。认知神经科学、神经心理学和影像遗传学(绘制人脑神经结构图和描述基因型功能活动的策略)的发展促进了观念的转变,内表型更大的优势在于考察临床病人的未患病亲属中基因变异的风险,将之作为研究和发现神经调节机制的工具,在DNA序列和病理行为之间架起一座桥梁。电生理......阅读全文

研究构建绵羊和山羊肠道高质量微生物基因组数据库

近日,西北农林科技大学羊遗传改良与生物育种团队携手国内外多家科研机构,在绵羊和山羊肠道微生物基因组数据库构建及肠道粘蛋白和多糖代谢功能菌种挖掘方面取得进展,研究成果发表在Microbiome上。研究团队在全国范围内的32个羊场收集了来自21个绵羊和山羊品种共计320个肠道样本,分别构建了包含1.6亿

北京基因组所杨运桂研究员到昆明动物所进行学术交流

  1月14日上午,应中国科学院、云南省动物模型和人类疾病机理重点实验室陈策实研究员邀请,中国科学院北京基因组研究所杨运桂研究员到昆明动物研究所进行学术交流,并作了题为N6-methyl-adenosine (m6A) in RNA: An Old Modification with A Nov

我国学者揭示基因数目减少在植物适应性进化中的作用

  一般认为,基因数目的增加,例如基因重复或者形成全新基因,对于生物生存繁衍具有重要意义。然而,基因数目减少同样也能产生重要的遗传变异,进而对生物的生存及繁衍产生积极的效果。这一事实在以往并未得到充分关注。而以“减少就是增加”(less is more)为代表的假说,则提出了基因的假基因化或丢失等基

Nature-Genetics:多基因风险评分不一定准确哦

  多基因风险评分(PRS)是一个时髦的新名词。它可以预测一个人患上冠状动脉疾病、乳腺癌或糖尿病等疾病的风险。最近,23andMe公司也开始提供2型糖尿病的多基因风险评分。  许多疾病是由一系列常见变异和低频变异所介导的。尽管每个变异的影响很小,不过综合起来可以预测一个人的风险。多基因风险评分的目标

武汉植物园在苹果遗传多样性及驯化特征方面取得进展

  DNA序列差异的鉴定是解析重要生物学性状的基础。中国科学院武汉植物园果树分子育种学科组博士马百全在研究员韩月彭的指导下,对30份苹果种质资源进行了简化基因组测序,获得39,635个均匀分布在苹果染色体上的单碱基多态性位点(SNPs)。  基于这些SNPs的遗传学研究结果表明:苹果野生种的遗传多样

科学家开发完成水稻多组学数据整合和信息共享数据库

  水稻不仅是世界近一半人口的主要粮食作物,同时也是一种重要的模式生物。高通量测序技术的迅速发展促进了水稻组学数据的广泛积累,使深入研究控制水稻重要农艺性状、种质资源多样性以及水稻驯化过程的机制成为可能。为此,研究人员构建了相关的水稻数据库,主要包括RAP-DB(日本农业生物资源研究所构建的水稻注释

仰韶文化人群母系遗传结构特点通过基因组数据揭开

  5月19日,《遗传学报》(英文版)(Journal of Genetics and Genomics)在线发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所研究员付巧妹研究团队、郑州市文物考古研究院研究员顾万发、四川大学考古文博学院副教授原海兵完成的关于距今约5500-5000年的中国河南荥阳青台遗址古代

中国本土期刊《基因组蛋白质组与生物信息学报》被SCIE收录

  由中国科学院主管、中国科学院北京基因组研究所和中国遗传学会主办的英文期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics(简称GPB,中文名《基因组蛋白质组与生物信息学报》,ISSN 1672-0229,CN 11-4926/Q)于2017年8月被科睿唯安旗下的Scie

中国新生儿基因组计划启动-未来5年开展10万例样本检测

   为从根本上实现新生儿遗传病的早发现、早诊断、早干预,7日,中国遗传学会遗传咨询分会联合复旦大学附属儿科医院在上海发起中国新生儿基因组计划。  中国新生儿基因组计划将在未来的5年内开展10万例样本的新生儿基因检测,旨在构建中国新生儿基因组数据库,建立新生儿遗传病基因检测标准,促进新生儿遗传病基因

中国新生儿基因组、胚胎基因组计划启动

  为从根本上实现新生儿遗传病的早发现、早诊断、早干预,7日,中国遗传学会遗传咨询分会联合复旦大学附属儿科医院在上海发起中国新生儿基因组计划。  中国新生儿基因组计划将在未来的5年内开展10万例样本的新生儿基因检测,旨在构建中国新生儿基因组数据库,建立新生儿遗传病基因检测标准,促进新生儿遗传病基因检

中国医学科学院,中山大学Nature子刊破解癌症异质性

  来自中国医学科学院北京协和医学院,加州大学洛杉矶医学院,中山大学等处的研究人员发表了题为“Spatial intratumoral heterogeneity and temporal clonal evolution in esophageal squamous cell carcinoma”

山西煤化所王森副研究员获国家自然科学基金优青资助

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505777.shtm

水生生物所等公布斑马鱼1号染色体全基因敲除研究成果

  斑马鱼是开展生命科学、健康科学、环境科学等研究的重要模式动物。在斑马鱼研究历史上,欧美学者发起过几次大规模的随机诱变突变体库,开展基于“从表型到基因型”的正向遗传学筛选,奠定了斑马鱼作为国际公认模式动物的重要基础。  随着斑马鱼全基因组测序的完成和CRISPR/Cas9等基因组编辑技术的成熟,规

首个万份水稻群体变异图谱发布

  近日,中国农业科学院基因组研究所联合海南三亚崖州湾实验室、中国水稻研究所和河南大学等单位在《核酸研究》上在线发表了全球首个万份水稻群体变异图谱。  水稻是世界上最重要的粮食作物之一,其自然变异是基因改良和现代育种的重要遗传基础,因此广泛挖掘水稻种质群体中的丰富变异具有重要意义。近年来,稀有变异对

新研究发布中国人群可移动元件插入变异图谱

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/3/474900.shtm 可移动元件(也被称为转座子或转座元件)约占人类基因组的一半。在人类基因组中,Alu、LINE-1(L1)、SINE-VNTR-Alu(SVA)以及HERV-K等是普遍认为仍然活跃

徐涛/何顺民团队发布中国人群可移动元件插入变异图谱

可移动元件(也被称为转座子或转座元件)约占人类基因组的一半。在人类基因组中,Alu、LINE-1(L1)、SINE-VNTR-Alu(SVA)以及HERV-K等是普遍认为仍然活跃的可移动元件家族,它们能够通过转座作用在基因组上形成新的插入,这种现象被称为可移动元件插入(Mobile Element

GenOrigin——一种多物种蛋白质编码基因起源与演化的数据库

  2021年6月14日,JGG在线发表了华中农业大学陈振夏教授课题组题为“GenOrigin: A Comprehensive Protein-coding Gene Origination Database on the Evolutionary Timescale of Life”的研究论文。

DNA样品采集与知情同意原则

哈瓦苏派族一成员在和解达成后讲话  6年前,美国一个印第安小部落状告亚利桑那州立大学研究人员未经同意采集其部落成员的血液样品,要求5000万美元的赔偿。如今,双方达成庭外和解,亚利桑那州立大学退还部落成员的DNA样品,并赔偿70万美元。《科学》杂志的文章认为,这不是一件普通

苏州大学医学院周哲敏教授为中国疾控中心作学术报告

  2023年12月13日,应中国疾控中心传染病所的邀请,苏州大学医学院周哲敏教授作了题为“基于遗传大数据的流行病主动防御技术研究”的科技学术报告,重点是微生物群体遗传学、生物信息学及微生物组学等领域的最新成果和创新方法,中心总部和相关直属单位的科研人员、研究生等参加学术活动。  周教授长期从事微生

昆明动物所等在胶质母细胞瘤分型研究中取得新进展

  胶质瘤是常见的颅内肿瘤,其中恶性程度最高的是胶质母细胞瘤。异常的快速增殖、极强的浸润性及高度异质性是胶质母细胞瘤的典型特征。患者的平均中值生存期仅为一年左右,是目前人类肿瘤中死亡率极高的肿瘤之一。胶质母细胞瘤难以治疗的重要原因之一是其高度异质性。遗传突变的多样性是其异质性形成的重要原因。而现有以

Cell:健康免疫系统是这样的

  科学家们已经发现了一些与自身免疫和感染疾病有关的遗传学变异。但他们对健康免疫系统的遗传学调控还并不了解。  美国NIH领衔的研究团队通过全面的免疫分型,在669对女性双胞胎中分析了78,000个免疫性状。他们在此基础上建立了大规模数据库,展现了人类免疫系统的遗传学构成,这项研究发表在三

新研究!揭示现代大豆品种重要性状结构变异

  近日,《自然—遗传学》(Nature Genetics)在线发表河北农业大学张彩英团队研究论文。该研究率先组装高产优质抗病现代品种“农大豆2号”高质量基因组,在基因组水平发掘现代大豆育成品种特有结构变异及其作用,并揭示影响黄淮海地区大豆群体重要产量和品质性状的结构变异与基因,为大豆遗传改良提供新

期刊数据库更新

图片来源:B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评,认为其扭曲了学术出版。近日,美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告(JCR)数据库的更新版本,并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数,除以其两年间发表的文章数量,

期刊数据库更新

图片来源:B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评,认为其扭曲了学术出版。近日,美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告(JCR)数据库的更新版本,并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数,除以其两年间发表

韩敬东课题组研究成果在《Genome-Research》发表

  近日,国际基因组研究权威期刊《Genome Research》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所、中科院遗传与发育生物学研究所和清华大学等处的最新研究论文“Single-cell-level spatial gene expression in the embryonic n

关于基因组的基本内容介绍

  在分子生物学和遗传学领域,基因组是指生物体所有遗传物质的总和。这些遗传物质包括DNA或RNA(病毒RNA)。  基因组包括编码DNA和非编码DNA、线粒体DNA和叶绿体DNA。  研究基因组的科学称为基因组学。  2023年,英国生物银行发布了迄今世界上最大的全基因组测序数据库,有望为全球的诊断

植物生物学研究数据库

实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant

熊立仲教授到武汉植物园作学术报告

   熊立仲教授应邀到武汉植物园作学术报告  12月10日下午,应中国科学院植物种质创新与特色农业重点实验室、武汉植物园生物多样性保护中心研究员杨平仿的邀请,作物遗传改良国家重点实验室“基因组研究与水稻遗传改良”创新团队成员、华中农业大学生命科学技术学院副院长熊立仲教授来武汉植物园作

中科院孙青原等人在PLOSGenetics发表最新遗传学成果

近期,来自中科院动物研究所、首都师范大学和深圳大学等处的研究人员,在国际遗传学权威期刊《PLOS Genetics》发表题为“Protein Phosphatase 6 Protects Prophase I-Arrested Oocytes by Safeguarding Genomic Inte

两种南瓜基因组图谱绘制成功为育种改良提供遗传学参考

  南瓜不仅是西方万圣节用来点缀节日的装饰,对世界上多数人来说,更是一种必不可少的营养主食。最新出版的10月刊《分子植物学》杂志以封面文章形式介绍了中美科学家的合作成果:他们对两种重要南瓜品种进行了完整基因组测序,不仅揭示了南瓜与众不同的进化史,更可为南瓜育种改良提供遗传学方面的参考。  据物理学家