华北理工大学豆科作物比较基因组学研究获重要进展
3月21日,华北理工大学生命科学学院王希胤课题组在植物科学顶尖杂志《Plant Physiology》 (IF=6.28;中科院JCR分区1区)上发表标题为“Hierarchically aligning 10 legume genomes establishes a family-level genomics platform”的创新性研究成果。 豆科作物是人类粮、油等食品的重要来源之一,具有重要的经济价值,包括大豆、野生花生等10个豆科植物也因此相继完成了全基因组测序,然而,目前缺少一个综合性豆科植物比较基因组学研究平台。论文描述的相关研究对10个豆科植物受反复多倍化影响的复杂基因组结构进行了层级解析,构建了基因组间的与多倍化事件和物种分歧事件相关联的同源基因列表;研究发现大豆最近加倍产生的重复染色体之间基因保留水平具有高度相似性,这一发现支持大豆可能有一个同源四倍体祖先。研究揭示了不同植物的进化速率存在着显著差异,并......阅读全文
关于蓝藻和叶绿体基因组的比较研究介绍
原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。 蓝藻基因组的
分析和比较各种基因组数据的多面手
Partek®是一家致力于开发与整合用于生命科学研究数据分析软件的公司。该公司的系列软件包括――Partek® Flow™, Partek® Genomics Suite™, and Partek® Pathway™――可以提供基因组数据分析的整体解决方案,也是唯一一家可以提供
细胞化学基础蓝藻和叶绿体基因组的比较研究
原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。蓝藻基因组的作图和测
活体电穿孔法与其他活体基因导入方法的比较
到目前为止,非病毒载体的活体基因导入方法有直接注射法、脂质体法、基因枪法、电穿孔法等。每一种方法都有其各自的特殊性,因此很难将这几种方法进行简单的比较。 1、直接注射法 可将外源基因直接注射到靶位点或血管中,但此种方法不适合以肌肉作为靶器官,它的外源基因表达效率极低,仅为电穿孔法的百分之一。
454测序应用于花生种子败育研究
花生为豆科作物,是我国优质食用油主要油料品种之一,又名“落花生”或“长生果”,在全国各地均有种植,主要分布于辽宁、山东、河北、河南、江苏、福建、广东、广西、贵州、四川等地区。在花生种子的生长发育过程中,胚栓插入土壤,膨压将种皮推开后露出胚轴是一个重要过程,因此,胚栓入土失败、胚轴的膨压
什么是定性比较-什么是定量比较
定量比较是准确数值之间的比较,多是多多少,高是高几分。定性比较法是研究地景与观赏地景的方法之一。在地球科学定性方法应用中,最常用的是比较法,是对地学客体认知的进步,也是迈向定量数学化方法的前奏。
昆明动物所等采用新的比较基因组方法定位改良相关基因
经历过长期人工选育的具有独特性状的作物优良品种很可能固定了一些在祖先基因库中以低频状态存在的优质等位基因 (elite allele)。这些优质等位基因贡献了该优良品种的优良农艺性状。在传统的遗传学研究中,科学家使用数量性状位点连锁作图(Quantitative trait loci l
基本方案1-应用直接标记-DNA-比较基因组杂交
实验方法原理实验材料荧光素标记的待测探针 DNA德克萨斯红标记的参照 DNA试剂、试剂盒乙酸钠乙醇主要的杂交溶液正常人染色体铺片变性液蛋白酶 K 溶液杂交片洗液2 X SSCPN 缓冲液DAPI 的抗淬灭溶液仪器、耗材玻璃刀水浴箱玻片加热器橡皮胶带湿盒实验步骤展开
用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验
实验方法原理比较基因组杂交(CGH)是一种能够在一步全基因组筛查程序,描述G带不能发现的细胞遗传物质增加或减少的分子细胞遗传学技术。CGH优于进行全染色体涂染(wcp)的常规荧光原位杂交(FISH)和多色FISH之处,是它不仅能够识别增加的未知片段的染色体来源,而且还可将该片段定位于特定的染色体区带
比较基因组杂交技术在肿瘤研究中的应用实验
比较基因组杂交技术在肿瘤研究中的应用 试剂、试剂盒 Ham F10 培养基 胎牛血清
西安交大最新文章:疾病基因表达谱的比较分析
来自西安交通大学医学院,山东省地方病防治研究所等处的研究人员发表了文章,通过对比分析发生在同一病区的大骨节病和克山病患者外周血差异表达基因, 深入探讨了两病的病因与发病机制,指出大骨节病与克山病患者不同靶器官损伤可能是由共同和非共同的差异表达基因与环境危险因素相互作用所致。 大骨节病(
西安交大最新文章:疾病基因表达谱的比较分析
来自西安交通大学医学院,山东省地方病防治研究所等处的研究人员发表了文章,通过对比分析发生在同一病区的大骨节病和克山病患者外周血差异表达基因, 深入探讨了两病的病因与发病机制,指出大骨节病与克山病患者不同靶器官损伤可能是由共同和非共同的差异表达基因与环境危险因素相互作用所致。 大骨节病(
比较基因组杂交技术在肿瘤研究中的应用实验
比较基因组杂交(CGH) 可以提供肿瘤细胞全基因组染色体拷贝数改变的信息 [1]。与常规细胞遗传学分析不同,CGH 无需细胞培养,因此只要是可以获得 DNA 的临床标本,包括存档的石蜡包埋组织,都可以进行该实验 ra。CGH 可以在正常染色体上定位扩增或缺失的 DNA 序列,从而显示出重要基因的位点
微阵列—比较基因组杂交技术检测染色体异常
【摘要】近年微阵列一比较基因组杂交(microarraycomparativegenomichybirdization,microarray.CGH)技术被应用到临床细胞遗传学领域。该技术是选择DNA特殊片段作为靶,固化在载体上,形成密集、有序的分子微阵列。然后,从测试标本中提取DNA,将测试DNA
定性比较和-定量比较有什么区别
1、比较内容不同定性比较主要采用的是文字言语的方式,关于产品的问题停止相关的描绘,而定量比较主要采用的是数学言语,经过一系列的数据来对产品问题停止描绘。2、研究对象不同定性比较和定量比较是对同一个问题停止比较的两个方面,定性比较是停止定量比较的重要前提,假如短少产品的定性比较,那么,一系列的定量比较
版纳园等自主开发出叶绿体全基因组分析比较基因组程序包
高通量测序(High-throughput sequencing),又称“下一代”测序(Next-generation sequencing),是近年来在测序技术发展史中具有革命性改变的新突破,能一次并行对几十万到几百万条DNA分子同时测序,因此能对物种的转录组和基因组进行比以往较细致全貌的
中国科学院植物所揭示豆科果荚炸裂抗性及其遗传调控的进化机制
果荚炸裂对野生豆科植物种子传播及适应性具有重要意义,也是造成豆科作物种子流失、产量减少等不利农业生产的关键因素之一。目前,豆科植物果荚炸裂抗性的形成及其进化机制尚不清楚。 中国科学院植物研究所贺超英研究组利用大豆染色体片段代换系鉴定到两个调控果荚炸裂的位点qPdh1和qPSH1。其中qPdh1
载脂蛋白-E-基因型分析:不同方法间比较实验
实验材料溶解于 TE 缓冲液(pH 7.4)的 3〜5ng ul gDNA(来自血液)试剂、试剂盒APOE 引物4dNTP 混合物Taq 酶二甲基亚砜10 X PCR 缓冲液10 X TBE溴化乙锭6X 上样缓冲液实验步骤展开 经验交流
知识课堂之活体电穿孔法其他活体基因导入方法的比较
活体电穿孔法(in vivo electroporation) 是将外源基因通过电场作用,导入动物目标组织或器官。由于这种方法能有效导入外源基因,可在多种组织器官上应用,并且效率较高。活体电穿孔法的原理很简单,在直流电场作用的瞬间,细胞膜表面产生疏水或亲水的微小通道105~115μm ,这种通道
用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验(二)
二、正常男性中期染色体标本的制备1.准备一个封闭环境,其相对湿度约55%(可在50%〜60%变化),温度24〜26.5℃。2.将巴斯德吸管置于玻璃载片上方2〜4in处,让一滴细胞悬液滴在玻片的左侧。然后迅速将第二滴细胞悬液滴在玻片右侧(见注释7)3.在固定液全部蒸发前,将玻片浸入盛有新鲜固定液的染色
版纳植物园叶绿体比较基因组学研究取得进展
樟科油丹属树种木材质优,国际市场上的商品名为“medang”,和楠木树种的亲缘关系较近。以往的分子系统学研究表明油丹属为复系类群,但与润楠属、鳄梨属和楠属等的系统关系尚不明晰。 近日,中国科学院西双版纳热带植物园生物多样性研究组以分布于印度南部的油丹模式种Alseodaphne semecar
用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验(三)
六、中期染色体标本的变性1.在染色缸中加入大约50mL变性液,将染色缸放于75〜76℃水浴中。预热变性液使其温度达到(73±2)℃。2.从-20℃冰箱中取出实验所需的标本,室温下系列乙醇脱水,各2min。3.室温干燥片子(5min),或在实验室抽风橱中微风吹过标本使标本干燥。4.在37〜40℃电热板
用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验(一)
实验方法原理 比较基因组杂交(CGH)是一种能够在一步全基因组筛查程序,描述G带不能发现的细胞遗传物质增加或减少的分子细胞遗传学技术。CGH优于进行全染色体涂染(wcp)的常规荧光原位杂交(FISH)和多色FISH之处,是它不仅能够识别增加的未知片段的染色体来源,而且还可将该片段定位于特定的染色体区
比较原核生物和真核生物基因组的结构特征
异:1、原核生物基因组很小,一般只有一条染色体;而真核生物基因组结构庞大。2、原核dna分子的绝大部分是用来编码蛋白质的,只有非常小的一部分不转录,这与真核dna的冗余现象不同。3、原核生物dna序列中功能相关的rna和蛋白质基因,往往丛集在基因组的一个或几个特定部位,形成功能单位或转录单位,它们可
各类ICP比较
对于拥有ICP-AES技术背景的人来讲,ICP-MS是一个以质谱仪作为检测器的等离子体(ICP),而质谱学家则认为ICP-MS是一个以ICP为源的质谱仪。事实上,ICP-AES和ICP-MS的进样部分及等离子体是及其相似的。ICP-AES测量的是光学光谱(165~800nm),ICP-MS测量的是离
植物所揭示豆科果荚炸裂抗性及其遗传调控的进化机制
果荚炸裂对野生豆科植物种子传播及适应性具有重要意义,也是造成豆科作物种子流失、产量减少等不利于农业生产的关键因素之一。目前,豆科植物果荚炸裂抗性的形成及其进化机制尚不清楚。 中国科学院植物研究所贺超英研究组利用大豆染色体片段代换系鉴定到两个调控果荚炸裂的位点qPdh1和qPSH1。其中,qPd
微生物所多粘菌素耐药基因mcr1的比较基因组研究获进展
12月17日,国际学术期刊《柳叶刀感染性疾病》杂志在线发表了中国科学院微生物研究所病原室研究员朱宝利课题组对多粘菌素耐药基因mcr-1的比较基因组分析通讯文章。 11月18日,华南农业大学教授刘健华和中国农业大学教授沈建忠领导的团队在《柳叶刀感染性疾病》杂志发表文章,在动物和住院患者中发现多粘
微生物所多粘菌素耐药基因mcr1的比较基因组研究获进展
12月17日,国际学术期刊《柳叶刀感染性疾病》杂志在线发表了中国科学院微生物研究所病原室研究员朱宝利课题组对多粘菌素耐药基因mcr-1的比较基因组分析通讯文章。 11月18日,华南农业大学教授刘健华和中国农业大学教授沈建忠领导的团队在《柳叶刀感染性疾病》杂志发表文章,在动物和住院患者中发现多粘
中国科学报:普通菜豆高精度图谱来了
普通菜豆是全球种植范围最广、栽培面积最大、食用人群最多的食用豆类。日前,《自然—遗传学》以长文形式发表了683份普通菜豆资源全基因组重测序结果分析,以及普通菜豆最大规模的主要农艺性状表型鉴定结果。该项工作由中国农业科学院作物科学研究所(以下简称作科所)特色农作物优异种质资源发掘与创新利用团队联合
中国大骨节病与克山病基因表达谱的比较研究
最近由西安交通大学郭雄教授研究团队完成的一项研究发现,分布在同一病区的大骨节病与克山病外周血单核细胞中存在共同和不同的差异表达基因,为从基因水平揭示这两种地方病的病因发病机制提供新的科学依据和思路。 这篇名为“大骨节病与克山病基因表达谱的分析比较”的研究论文发表于《中国科学:生命科学》20