华北理工大学豆科作物比较基因组学研究获重要进展
3月21日,华北理工大学生命科学学院王希胤课题组在植物科学顶尖杂志《Plant Physiology》 (IF=6.28;中科院JCR分区1区)上发表标题为“Hierarchically aligning 10 legume genomes establishes a family-level genomics platform”的创新性研究成果。 豆科作物是人类粮、油等食品的重要来源之一,具有重要的经济价值,包括大豆、野生花生等10个豆科植物也因此相继完成了全基因组测序,然而,目前缺少一个综合性豆科植物比较基因组学研究平台。论文描述的相关研究对10个豆科植物受反复多倍化影响的复杂基因组结构进行了层级解析,构建了基因组间的与多倍化事件和物种分歧事件相关联的同源基因列表;研究发现大豆最近加倍产生的重复染色体之间基因保留水平具有高度相似性,这一发现支持大豆可能有一个同源四倍体祖先。研究揭示了不同植物的进化速率存在着显著差异,并......阅读全文
中国大骨节病与克山病基因表达谱的比较研究
最近由西安交通大学郭雄教授研究团队完成的一项研究发现,分布在同一病区的大骨节病与克山病外周血单核细胞中存在共同和不同的差异表达基因,为从基因水平揭示这两种地方病的病因发病机制提供新的科学依据和思路。 这篇名为“大骨节病与克山病基因表达谱的分析比较”的研究论文发表于《中国科学:生命科学》20
安捷伦推出用于诊断用途的比较基因组杂交(CGH)测定法
分析测试百科网讯 近日,安捷伦推出了其首个用于诊断用途的比较基因组杂交(CGH)测定法:GenetiSure Dx出生后测定法。这种测定将使临床遗传学家能够比传统方法更早和更准确地检测遗传异常。 这种异常与儿童和成人的发育迟缓,智力残疾,自闭症,先天性畸形和畸形特征有关。 GenetiSur
IRES-与-2A-peptide在同时表达多个目标基因中的应用比较
导读Hello! 大家好!有一个问题不知道大家考虑过没有:为了研究单个基因的功能机制或实现多基因协同表达, 那这种同时表达多个目标基因该如何实现呢?实际上,目前广泛采用多顺反子表达方案,即利用内部核糖体进入位点(internal ribosome entry site,IRES)或自剪切多肽2A(s
比较分子生理基因组学-—cDNA阵列的异种杂交实验
近几年来, DNA 微阵列已经被公认是分子生物学研究的一种标准方法。特别是在生物医学研究方面,常用物种的微阵列一面世就得到广泛应用。但是对于非模式生物来说 ,微阵列的应用尚未得到充分开展,而这些物种往往表现出一些很有趣的生理表型。对大多数比较生物学的研究者来说,制备一个新物种的 D N A 阵列或微
比较分子生理基因组学-—cDNA阵列的异种杂交实验
实验步骤 一、材料 这里用到的所有化学试剂都为分子生物学等级,或者用它们最高纯度的等效物。所有的塑料和玻璃制品,包括瓶子和移液器吸头都要高压灭菌,在核酸实验操作过程中必须始终戴手套。 cDNA A T L A S阵列从Clo
中国科学报:普通菜豆高精度图谱来了
普通菜豆是全球种植范围最广、栽培面积最大、食用人群最多的食用豆类。日前,《自然—遗传学》以长文形式发表了683份普通菜豆资源全基因组重测序结果分析,以及普通菜豆最大规模的主要农艺性状表型鉴定结果。该项工作由中国农业科学院作物科学研究所(以下简称作科所)特色农作物优异种质资源发掘与创新利用团队联合
治理粉尘方式比较
治理方式比较 除尘方式成本能耗降尘率%缺点袋式除尘投资大高》=90%布袋容易堵塞,影响除尘效果,使用成本较高。湿式通风除尘投资很大高》=80%投入成本高,后期维护成本高喷水或喷雾除尘投入较少低
电学比较仪
常用电感式或电容式测微仪(见长度传感器)作为放大、指示部件。图4 [数字显示电感式比较仪]是数字显示的电感式比较仪,其分辨率有1微米、0.1微米和0.01微米等几好种。
菌落特征比较总结
菌落特征比较:细菌:湿润,粘稠,易挑起放线菌:干燥,多皱,难挑起,菌落较小,多有色素酵母菌:湿润,粘稠,易挑起,表面光华,比细菌的菌落大而厚 霉菌:菌丝细长,菌落疏松,成绒毛状、蜘蛛网状、棉絮状,无固定大小,多有光泽,不易挑起 细菌:一般形成较小的圆形菌落,颜色有白色、黄色等,表面光滑或不
梅毒检测方法比较
目前,我国大部分临床检验室对梅毒的血清学检查多采用RPR或TRUST。TP-ELISA已多用于血站对献血者血液的检验,在医院临床检验室的应用较少。TPPA多用于梅毒抗体的确诊试验。 结合临床治疗过程中的实验室监测情况,比较实验结果,分析认为: ① TRUST灵敏度和特异性均低于TP-ELISA、
梅毒检测方法比较
目前,我国大部分临床检验室对梅毒的血清学检查多采用RPR或TRUST。TP-ELISA已多用于血站对献血者血液的检验,在医院临床检验室的应用较少。TPPA多用于梅毒抗体的确诊试验。 结合临床治疗过程中的实验室监测情况,比较实验结果,分析认为: ① TRUST灵敏度和特异性均低于TP-EL
梅毒检测方法比较
目前,我国大部分临床检验室对梅毒的血清学检查多采用RPR或TRUST。TP-ELISA已多用于血站对献血者血液的检验,在医院临床检验室的应用较少。TPPA多用于梅毒抗体的确诊试验。 结合临床治疗过程中的实验室监测情况,比较实验结果,分析认为: ① TRUST灵敏度和特异性均低于TP-E
光学比较仪
利用光学测微仪作为放大指示部件。常见的有立式、卧式和影屏式 3种。 ①立式光学比较仪:又称立式光学计,图3[光学测微仪的光学系统]为光学测微仪的光学系统。它是按自准直原理(见自准直仪)设计的。分划板位于物镜焦平面上,平面反射镜按杠杆原理设置。当测杆上下移动时,平面反射镜绕支点转动一个很小角度,
土壤养分速测仪比较
土壤养分是指土壤提供给作物生长的必须营养元素,包括 氮(N),磷(P),钾(K)等13种元素。土壤养分含量的多少,可通过土壤养分速测仪测出。然后对照土壤养分丰缺指标,就可判断这块土地的养分含量多 寡。因为在我们对一块土地进行调查研究或者播种施肥前,都需要对这块土地的土壤养分含量进行一定得了解。只有这
比较FPLC与HPLC
1、二者原理相同:都是由经典的液体柱层析引入气相色谱理论,并且对相体进 行了改革,配用高压输液泵,采用高灵敏检测器、梯度洗脱装置、自动收集装置和微机等发展起来的现代液相色谱。 2、特点:二者均具有快速、分辨率高、检测灵敏度高、分离效能高等特点,而且FPLC还具有柱容量大、回收效率高及不易使生物大
比较详细的PCR
1.PCR反应的最适条件4.1 TaqDNA聚合酶在早期进行的PCR反应中,使用的是大肠杆菌DNA聚合酶1的大片段,,即Klenow片段。也曾有人用噬菌体T4 DNA聚合酶。这两种酶的共同弱点是对热不稳定性,DNA合成反应只能在370C进行。PCR时每一循环的解链温度都在90C以上进行,故在每两个循
全基因组测序的竹亚科及生物学性状的比较基因组学研究
禾本科(禾草)是被子植物最大科之一,约有12000种,是水稻、小麦、玉米等人类粮食和牲畜饲料的主要来源,也为人类提供了加工淀粉、制糖、酿酒、造纸、编织和建筑等方面的重要原料。同时,禾本科又是植物遗传学和基因组学研究的模式类群。竹亚科(竹子)是禾本科的12个亚科之一,与早熟禾亚科、稻亚科组成BOP
微阵列中期分裂相染色体的比较基因组杂交(CGH)-实验
染色体 CGH 的独特优点在于它的全基因筛查功能,与检测单一靶 DNA 剂量改变的低通量方法,如 Southern 分析、PCR 和荧光原位杂交(FISH) 相比,速度显著提高且省力。目前染色体 CGH 是一种比较完善的分子细胞遗传学方法,但是它的两个缺陷限制其作为一种综合性筛查工具的应用。来源:《
科学家开发比较基因组学进化分析新方法
比较基因组学是从进化角度分析不同物种的基因组数据,解析基因功能和疾病、表型的遗传学机制。通过同源基因编码区序列的进化比较是其中最常见的分析方法之一,如PAML等方法,都在物种序列比较分析中被广泛应用。但这些方法仅分析多个物种的单一序列和分歧位点信息。随着二代、三代测序技术的发展,众多物种的基因组
微阵列中期分裂相染色体的比较基因组杂交(CGH)-实验
实验方法原理 实验材料 高分子质量基因组DNA EcoR I 或 Dpn II试剂、试剂盒 SSCcDNA阵列dNTP 混合液 dCTP 酵母 tRNADNA 聚合酶 I仪器、耗材 Qiaquick PCR 纯化试剂盒 BioPrime 标记试剂盒Micrcon 30 滤器杂交炉Maxiprep D
北京基因组研究所最新文章比较高通量筛选方法
P2X7受体是嘌呤-配体门控离子通道受体家族 P2X的一员,是神经退行性疾病、类风湿关节炎、神经性疼痛药物筛选的重要靶标, 已成为大型制药公司新的研究热点。近期中国科学院北京基因组研究所的研究人员针对3 种用于检测 P2X7受体高表达细胞系药理学特征的高通量荧光检测方法,进行了比对,指出
科学家开发比较基因组学进化分析新方法
比较基因组学是从进化角度分析不同物种的基因组数据,解析基因功能和疾病、表型的遗传学机制。通过同源基因编码区序列的进化比较是其中最常见的分析方法之一,如PAML等方法,都在物种序列比较分析中被广泛应用。但这些方法仅分析多个物种的单一序列和分歧位点信息。随着二代、三代测序技术的发展,众多物种的基因组
比较分子生理基因组学-—cDNA阵列的异种杂交实验(一)
实验步骤 一、材料这里用到的所有化学试剂都为分子生物学等级,或者用它们最高纯度的等效物。所有的塑料和玻璃制品,包括瓶子和移液器吸头都要高压灭菌,在核酸实验操作过程中必须始终戴手套。 cDNA A T L A S阵列从Clontech购得。人 19K cDNA 阵列从Ontario 癌症研究所购得
比较分子生理基因组学-—cDNA阵列的异种杂交实验(二)
二、方法在开始任何微阵列实验之前,必须要选定合适的对照和时间点,这样获得的数据才有生物学意义。关于如何选择合适的对照,参见注释 1 和 2。1 总 R N A 的提取2 R N A 变性凝胶电泳(1)制备一块 1 % 的琼脂糖甲醛变性胶,浸没在 IXM OPS 缓冲液中,胶上的孔应被溶液完全没过。将
我国低碳经济还处比较初级阶段-前景比较乐观
近年来低碳成为了流行词汇之一,发展低碳经济、建设低碳社会也成为政府工作的重点。低碳生活、低碳消费也逐渐成为时尚,我国的低碳经济发展处于什么阶段?国家政策实验室主任唐方方今日接受本网专访时表示,我国的低碳经济状况目前不是特别好,据他估计还处在比较初级的阶段。 唐方方
首个豆科绿肥作物染色体水平基因组组装完成
紫云英 中国农科院供图近日,中国农业科学院农业资源与农业区划研究所肥料及施肥技术团队完成了首个豆科绿肥作物——紫云英的染色体水平参考基因组组装,并利用比较基因组学解析了紫云英共生结瘤的遗传基础。该研究填补了豆科绿肥作物基因组学研究的空白,为豆科植物与根瘤菌共生提供了新的见解。相关研究成
利用大规模比较基因组学绘制A群链球菌候选疫苗图谱
近日,澳大利亚昆士兰大学等科研人员在Nature Genetics上发表了题为“Atlas of group Astreptococcalvaccine candidates compiled using large-scale comparative genomics”的文章,利用大规模比较基
昆明植物所山茶属代表植物比较叶绿体基因组学研究获进展
山茶属是山茶科中包含许多举世闻名经济植物的一个重要类群,包括为人类提供天然保健饮料的茶(Camellia sinensis var. assamica 和C. sinensis var. sinensis),健康型高级食用植物油的油茶(C. oleifera)以及观赏花卉云南山茶(C. reti
组织相溶性抗原基因分型中三种DNA快速抽提法比较
血液DNA抽提的质量和速度是影响组织相溶性抗原(HLA)基因分型效果的一个主要因素,目前普遍采用的标准酚-氯仿抽提法,因耗时较长,难以满足临床需求。为此,我们建立了NP-40法及辛酸法,进一步缩短时间,简化了操作步骤。现将NP-40法、辛酸法与标准酚-氯仿抽提法对比研究结果报告如下。一、资料和方法本
极限氧指数如何比较
氧指数越高,材料要燃烧所需要的氧气量余额大,也就是材料越难燃烧,其中氯纶的氧指数最高,37.1%丙烯腈共聚纤维其次,26.7%羊毛也不错,25.2%