华人先锋《NatureMethods》利用CRISPRi绘制遗传互作图谱

斯坦福大学亓磊(Lei Stanley Qi)教授早年毕业于清华大学,现任斯坦福大学生物工程学、化学和系统生物学系的助理教授,近年来他在CRISPR研究领域取得了一系列突破性进展,比如第一次采用CRISPR-Cas9系统的变种技术,改变了读取诱导多能干细胞(iPSCs)基因组的方式(由此入选了生物通的2016年生命科学风云人物)。 作为基因组靶向改造(敲除和敲入)的遗传学手段,基因组编辑技术历经ZFN、TALEN和CRISPR/Cas9,已发展成为自20世纪70年代生物技术时代开启以来最重要的基因工程技术。因没有物种限制、简单、高效,以CRISPR/Cas9为代表的基因组编辑技术已广泛应用于人、大鼠、小鼠、斑马鱼、果蝇、猪、羊、水稻、小麦和拟南芥等动植物(细胞)以及细菌等微生物的基因组靶向改造,成为后基因组时代的功能基因组研究、动植物品种改良、疾病模型建立以及基因治疗等不同领域研究与应用的利器。 2013年,亓磊研究组在......阅读全文

我国学者阐述CBL和CIPK基因家族互作产物间剂量平衡策略

  重复基因可通过全基因组加倍、串联重复、逆转录转座等机制形成,为生物新功能和新性状的产生提供了原始遗传材料,通常被认为是进化的加速器。基因组加倍或多倍化,同时复制基因组中所有的基因,是重复基因的一个重要来源。多项研究表明,多倍化后重复基因的保留具有偏好性,且与基因的功能密切相关。特别是一些参与编码

新研究揭示乙肝病毒DNA与人基因组互作景观图

  乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是全球性重大公共卫生健康问题之一,目前,全球乙肝病毒慢性感染者人数较多。HBV属嗜肝DNA病毒科,在人体肝脏细胞核内可形成cccDNA、整合入人体基因组等病毒DNA形式稳定存在,这是HBV维持长期慢性感染的关键。因此,研究乙肝病毒与宿

作科所:基因编辑技术创制出高抗性淀粉小麦新种质

   近日,中国农业科学院作物科学研究所(以下简称作科所)利用CRISPR/Cas9基因编辑技术,定点编辑敲除冬小麦品种“郑麦7698”和春小麦品种“Bobwhite”中的 SBEIIa 基因,分别获得了高抗性淀粉的冬、春小麦新种质,为培育营养功能型小麦新品种提供了新途径。相关研究成果在线发表于《植

Nature:基因编辑+CART强强联手-癌细胞定向清除

  CAR-T细胞疗法一直广为人知,CAR-T细胞在肿瘤免疫治疗方面拥有诸多优势,它可以利用非限制性的形式特异识别和杀伤表达特定抗原的癌细胞,以单链抗体(single chain antibody fragment,scFv)作为抗原识别区段的CAR能够识别不同种类的抗原,包括糖类和脂类等非蛋白抗原

植物介导地上地下互作研究取得进展

  从土壤颗粒到植物叶片,从动物牙齿到肠道表皮,地球上几乎每一个表面都有微生物的存在。这些微生物在诸如养分物质循环、动植物健康、生态多样性等方面起到至关重要的作用。早期的研究发现,植物作为媒介可以像“电话”一样为地上和地下生物传递信息。然而,地上地下微生物组是否也能通过植物进行传递尚不清楚。在近期完

植物介导地上地下互作研究取得进展

  从土壤颗粒到植物叶片,从动物牙齿到肠道表皮,地球上几乎每一个表面都有微生物的存在。这些微生物在诸如养分物质循环、动植物健康、生态多样性等方面起到至关重要的作用。早期的研究发现,植物作为媒介可以像“电话”一样为地上和地下生物传递信息。然而,地上地下微生物组是否也能通过植物进行传递尚不清楚。在近期完

表面等离子共振分子互作BIACORE的原理

首先先了解几个术语和定义:表面等离子共振(Surface Plasmon Resonance,SPR)一、消逝波当光从光密介质入射到光疏介质,入射角增加到某一角度,使折射角达到90°时,折射光将完全消失,而只剩下反射光,这种现象叫做全反射。当以波动光学的角度来研究全反射时,人们发现当入射光到达界面时

各种蛋白互作检测方法优缺点分析

聚焦蛋白质互作研究进展与实验方法研究蛋白-蛋白相互作用是理解生命活动的基础。蛋白质—蛋白质互作网络是生物信息调控的主要实现方式,是决定细胞命运的关键因素。检测蛋白质间相互作用的实验方法有哪些?这些检测方法各有什么优缺点?总结如下。1. 生化方法●共纯化、共沉淀,在不同基质上进行色谱层析(需要补充)●

分子互作江湖(下):主要玩家和新产品

  上篇我们介绍了分子互作的主流派系和市场概况,想必各位看官已心中有数;接下来将细数市场上的主要玩家和新产品,希望为您下次入手前提供参考。主要仪器及厂商  近年来,实时分子互作仪在生命科学基础研究、新药研发等领域的应用与发展愈发成熟,尤其随着生物制药行业高速发展,该领域迎来爆发增长。下表列出了主流品

干细胞和基因编辑强强联手,绘制人类基因组图谱

  胚胎干细胞是一种独特的资源,它们可以变成我们身体中任何成体细胞。它的多才多艺造就了再生医学、疾病模型和新药发现。  与人类胚胎干细胞的发现并行的另一项生物里程碑是人类基因组测序和赋予我们遗传身份的全套基因鉴定。“人类基因组计划”让我们有机会深入了解基因在基因组中的功能。如今,科学家们正在尝试将二

清华大学-中科院Nature子刊-CRISPRi多重基因条件性敲低平台

   CRISPR应用广泛,其中一种叫做CRISPRi的方法利用了无酶活性的Cas9 (dCas9)融合KRAB转录抑制结构域,CRISPRi不切割靶基因,而是在dCas9靶向转录起始位点(TSS)时降低靶基因的表达。利用测序来读取sgRNA的相对富集/或耗竭,这一技术也被应用于全基因组范围内调查基

基因编辑技术可以编辑所有基因吗

即便当前不能,以后会能的。基因编辑技术指能够让人类对目标基因进行“编辑”,实现对特定DNA片段的敲除、加入等。在过去几年中, 以ZFN (zinc-finger nucleases)和TALEN (transcription activator-like effector nucleases)为代表

纳米马达让CRISPRCas9钻进癌细胞心窝进行基因编辑

  在癌症研究领域,“Cas-9–sgRNA”复合物是一种有效的基因编辑工具,但是其穿过细胞膜接触肿瘤细胞基因组的能力非常低。来自美国和丹麦的科学家们现在开发了一种可以运动的纳米马达,可以有效输送并释放这种基因魔剪系统。在这篇发表于《Angewandte Chemie》的文章中,研究人员详细描述了他

齐磊博士Cell发布CRISPRi研究新成果

  来自斯坦福大学、加州大学旧金山分校的研究人员报告称,他们利用CRISPR干扰(CRISPRi)技术,对枯草杆菌的必需基因进行了全面的功能分析。这项研究发布在5月26日的《细胞》(Cell)杂志上。  斯坦福大学的齐磊(Lei S. Qi)博士、Kerwyn Casey Huang博士,以及加州大

齐磊博士Cell发布CRISPRi研究新成果

  来自斯坦福大学、加州大学旧金山分校的研究人员报告称,他们利用CRISPR干扰(CRISPRi)技术,对枯草杆菌的必需基因进行了全面的功能分析。这项研究发布在5月26日的《细胞》(Cell)杂志上。  斯坦福大学的齐磊(Lei S. Qi)博士、Kerwyn Casey Huang博士,以及加州大

Nature发表蛋白质互作里程碑成果

  德克萨斯大学和多伦多大学的科学家们日前绘制了超大规模的蛋白质互作图谱。这项研究发表在九月七日的Nature杂志上,为研究阿尔茨海默症、帕金森症和癌症等疾病的提供了强大的新工具。  细胞中的蛋白通常以蛋白复合体的形式,执行特异性的生物学功能。研究人员发现,海葵、线虫、小鼠和人类共享近千种关键的蛋白

类器官芯片实现人体肝脏—胰岛互作仿生模拟

近日,中科院大连化学物理研究所研究员秦建华团队利用类器官芯片,建立了人诱导多能干细胞(hiPSC)来源的肝—胰岛类器官互作体系,在体外模拟人体肝脏—胰岛轴及其在生理和病理条件下的糖刺激响应,为糖尿病等复杂代谢性疾病研究和新药发现等提供了新策略和新技术。相关研究发表在《先进科学》上。糖尿病是一种以慢性

揭示果蝇行为免疫防御真菌感染的互作机制

  11月23日,Current Biology期刊在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心王成树研究组完成的研究论文,揭示了果蝇通过一个化学感知蛋白识别昆虫病原真菌孢子表面蛋白而触发行为免疫,诱导清除体表孢子而拮抗真菌感染。  除了先天免疫途径抗菌外,蜜蜂、白蚁和蝇类等昆虫可通过梳理行为进行行

水稻养分互作机制研究中取得新进展

  近日,华中农业大学资源与环境学院植物营养生物学团队解析了水稻中微量元素锌与大量元素氮和磷的相互作用,揭示了锌与氮、磷互作的生理生化机制。该研究为农业生产中锌肥与氮肥、磷肥合理配施提供了重要的理论依据。  无论是在土壤系统中还是在作物系统中均存在养分间的相互作用,养分间的相互作用是影响作物养分高效

非标记检测(分子互作)市场概况-年增速8.3%

非标记检测(Lable-free detect,LFD)市场主要由仪器和消耗品构成,仪器技术包括:SPR表面等离子体共振,BLI生物层干涉测量,ITC等温滴定量热,DSC差示扫描量热法和其它非标记检测技术。其应用包括:结合动力学,结合热力学,内源性受体检测,活性样品确定,先导物生成和其它应用,最终用

Nature子刊:揭示蛋白互作的链式反应

  科学家们开发了一种新方法,不需要用酶就可以在固定样本中鉴定蛋白之间的互作。  细胞内的所有生物学过程基本上都是蛋白质控制的,蛋白一般通过互作来执行其正常功能。可想而知,研究蛋白互作是理解细胞生物学的关键。不过,灵敏可靠的检测蛋白质互作并不是一件容易的事。  举例来说,用荧光标记的两种抗体对蛋白互

研究分子互作——Nicoya-SPR-技术的新应用案例

Nicoya SPR数据让您的文章更上一层楼!2016年,加拿大滑铁卢大学的Dr. Dieckmann和他的团队用核磁共振波谱法检测最低CaM浓度和逐渐增加的CaM浓度与NOS肽结合的构象,并结合SPR技术,发现当CaM浓度增加时,相互作用的强度也增强了,并导致了蛋白构象变化。SPR数据在确定相互作

布鲁克收购单细胞互作分析先驱公司Dynamic-Biosensors

布鲁克公司(Nasdaq:BRKR)宣布收购Dynamic Biosensors GmbH公司。该公司以其在生物传感器技术领域取得的创新突破而闻名,其总部位于德国慕尼黑。此次收购加强了布鲁克在分子相互作用和动力学分析方面的生物物理产品组合,为药物发现或基础研究中的分子间和分子——单细胞相互作用提供更

看得见的蛋白互作新技术Duolink-PLA

  现今,科技发展的齿轮正在高速运转,每隔2-3年就会出现一个重大的技术变革引领生命科学走向更精细、更微观、更真实的水平,这其中也包括蛋白的研究。在疾病的致病机理、分子机制、信号通路、药物筛选以及新型诊断标志物的发现中,传统的蛋白研究“金标准”方法如Co-IP、Western blot、ELISA、

BLT小课堂丨植物蛋白互作技术(一)

植物蛋白互作技术我们的世界物种多种多样,而与我们人类生存关系最密切的就是植物。随着时间的推移与科技的进步,人类在逐步揭示自身基因真相的同时,也在不断探寻植物基因的种种功能。其中,蛋白质是植物生命活动的主要承担者。因此,在植物学相关研究中,蛋白质之间的相互作用是研究的重要基础和手段。目前,研究蛋白质-

荔枝活性组分互作与营养研究获重要进展

近日,华南农业大学食品学院岭南特色果蔬加工与营养团队成员、副教授刘旭炜在国家自然科学基金、广东省自然科学基金等项目的支持下,在荔枝活性组分互作与营养领域取得重要进展。相关成果以封面文章形式发表于《农业与食品化学杂志》。当期期刊封面。研究团队供图,下同“一骑红尘妃子笑,无人知是荔枝来”,这一千古名句描

Biacore分子互作技术加速抗体药研发和申报

【导语】抗体药研发涉及筛选、活性检测、表位作图、一致性评价、免疫原性和质量控制等环节——Biacore 作为药物活性检测平台,可以满足药物研发多个环节的需求,加快研发速度,其准确稳定的数据质量已经得到了药企和监管部门的广泛应用和认可。本文将利用抗体研发与质控中的几个重要环节来展示Biacore 分子

BLT小课堂丨植物蛋白互作技术(二)

免疫共沉淀技术(CoIP):借助抗体和抗原之间的专一性,确定两种蛋白质在完整细胞内生理性的相互作用。当用预先固化在argarose beads上的蛋白质A的抗体免疫沉淀A蛋白,那么与A蛋白在体内结合的蛋白质B也能一起沉淀下来。再通过蛋白变性分离,对B蛋白进行检测,进而证明两者间的相互作用。优

类器官芯片实现人体肝脏胰岛互作仿生模拟

近日,大连化物所微流控芯片研究组(1807组)秦建华研究员团队利用类器官芯片,建立了人诱导多能干细胞(hiPSC)来源的肝-胰岛类器官互作体系,在体外模拟人体肝脏-胰岛轴及其在生理和病理条件下的糖刺激响应,为糖尿病等复杂代谢性疾病研究和新药发现等提供了新策略和新技术。  糖尿病是一种以慢性高血糖为主

揭示了光和营养信号之间的新互作机制

  2021年6月5日,中科院分子植物科学卓越创新中心的晁代印团队在Molecular Plant 发表了题为“Long-distance blue light signalling regulates phosphate deficiency-induced primary root growth