华人先锋《NatureMethods》利用CRISPRi绘制遗传互作图谱
斯坦福大学亓磊（Lei Stanley Qi）教授早年毕业于清华大学，现任斯坦福大学生物工程学、化学和系统生物学系的助理教授，近年来他在CRISPR研究领域取得了一系列突破性进展，比如第一次采用CRISPR-Cas9系统的变种技术，改变了读取诱导多能干细胞(iPSCs)基因组的方式（由此入选了生物通的2016年生命科学风云人物）。 作为基因组靶向改造（敲除和敲入）的遗传学手段，基因组编辑技术历经ZFN、TALEN和CRISPR/Cas9，已发展成为自20世纪70年代生物技术时代开启以来最重要的基因工程技术。因没有物种限制、简单、高效，以CRISPR/Cas9为代表的基因组编辑技术已广泛应用于人、大鼠、小鼠、斑马鱼、果蝇、猪、羊、水稻、小麦和拟南芥等动植物（细胞）以及细菌等微生物的基因组靶向改造，成为后基因组时代的功能基因组研究、动植物品种改良、疾病模型建立以及基因治疗等不同领域研究与应用的利器。 2013年，亓磊研究组在......阅读全文
华人先锋《Nature－Methods》利用CRISPRi绘制遗传互作图谱
斯坦福大学亓磊（Lei Stanley Qi）教授早年毕业于清华大学，现任斯坦福大学生物工程学、化学和系统生物学系的助理教授，近年来他在CRISPR研究领域取得了一系列突破性进展，比如第一次采用CRISPR-Cas9系统的变种技术，改变了读取诱导多能干细胞(iPSCs)基因组的方式（由此入选了生
Cell：科学家成功绘制出人类癌细胞的全局基因互作网络
癌症是一种异质性疾病(heterogeneous disease)，而且不同的癌症亚型之间也有着不同的遗传根源，因此多种类型的癌症往往会依赖于多种途径得以发展，而且其对抗癌制剂的反应也并不相同，目前对于研究人员最大的挑战就是如何精确地定义癌症利用的多种途径，以及寻找癌症易感性来帮助开发新型抗癌疗
Cell：绘制转移性癌症的互作网络图谱
这一发表在8月4日《细胞》（Cell）杂志上的研究，是加州大学圣克鲁斯分校和加州大学洛杉矶分校研究小组的合作成果。他们一开始从致命转移前列腺癌患者尸体中获得的临床组织样本入手，随后完成了一系列复杂的分析以前所未有的细节确定了来自每位患者的癌细胞特征。对生成的数据集进行一种新颖的计算分析，绘制出
基因的分离独立分配和互作实验
实验方法原理：孟德尔定律包括“分离定律”及“独立分配定律”。根据分离规律，位于一对同源染色体上的一对等位基因在减数分裂形成配子时，要彼此发生分离，互不干扰地分到不同的配子中去。因此对于一对基因的杂合体，在完全显性条件下，其自交子代和测交子代的表现型分离比例分别为3:1和1:1。独立分配规律（自由组合
基因的分离独立分配和互作实验
实验方法原理孟德尔定律包括“分离定律”及“独立分配定律”。根据分离规律，位于一对同源染色体上的一对等位基因在减数分裂形成配子时，要彼此发生分离，互不干扰地分到不同的配子中去。因此对于一对基因的杂合体，在完全显性条件下，其自交子代和测交子代的表现型分离比例分别为3:1和1:1。独立分配规律（自由组合规
Nature－Genetics揭示基因与环境的复杂互作
目前的个性化医疗主要是通过分子分析（尤其是基因测序）来鉴定遗传突变，进而评估个体患上特定疾病的风险。但日内瓦大学（UNIGE）的科学家们指出，真正的个性化医疗远没有这么简单。 研究人员对四百对双胞胎进行了RNA测序，量化了遗传背景和环境背景对基因表达的影响。这项发表在Nature Geneti
Cell：最大规模的蛋白质互作组网络图谱
人类大约有2万个蛋白质编码基因，尽管自十年前首次完成人类基因组测序以来取得了一些显著的进展，对于这些蛋白质如何在细胞内发挥功能，科学家们仍然只详细了解了其中的一小部分。 作为人类基因组计划的延伸，蛋白质组学领域正在致力揭示蛋白质是如何执行由生成它们的基因所编码的过程的。一些先进的工具已帮助鉴别
Nature－Neuroscience:蛋白互作网络图谱助大脑疾病的药物开发
就像儿童有什么问题不能全怪父母一样，根据由USC医学院的神经学家的最新研究成果，自闭症等大脑紊乱疾病并不是由单基因的突变导致的。 为了帮助研究者们看到完整的调控网络，Marcelo P. Coba首次创建了大脑蛋白质相互作用的网络，这一工作首次为开发相关的药物提供了线索。 "我们目前使用的药
分子互作方法之BIAcore！
BIAcore是一种基于光学表面等离子共振(Surface Plasmon Resonance，简称SPR）原理的用于分子互作分析的常用方法。因为其准确性高、重复性好、应用广泛，目前SPR原理用于药物分析的方法已经被录入中国、美国、日本的药典，基于BIAcore方法的文献也已经超过了15000篇。那
分子互作仪选择宝典
在现代生物学、医学及转化医学、药物学等研究中，随着功能基因组研究的深入，生物大小分子的生物学功能研究占具着非常重要的地位；生物大小分子的相互作用分析成为目前分子功能学研究中不可缺少的重要手段，因此一个好的分子互作研究工具，无疑将对我们的科研起到极大的促进作用。目前研究分子互作的检测技术层出不穷，从传
张强峰博士Nature解析全基因组蛋白互作
来自美国哥伦比亚大学，同济大学等处的研究人员发表了题为“Structure-based prediction of proteinCprotein interactions on a genome-wide scale”的文章，提出了一种基于三维结构信息的全基因组蛋白质相互作用计算预测方
分子生态学词汇基因型与环境互作
中文名称：基因型与环境互作英文名称：genotype-environment interaction定 义：可供选择的遗传因子(等位基因)的相对表达依赖于环境的变化。应用学科：生态学（一级学科），分子生态学（二级学科）
乳腺癌细胞与基因关系图谱绘出
英国研究人员日前在美国《基因组研究》杂志上报告说，他们绘制出可清晰展示乳腺癌细胞形态与基因之间关系的图谱，未来有望帮助医生更准确地选择治疗方案，提升治疗乳腺癌的效果。 英国癌症研究所的研究人员利用大数据技术，分析了大量图片展示的超过30万个乳腺癌细胞的细胞形态，以及超过2.8万个基因的数据，绘
基因编辑疗法或使癌细胞永久失活
据《科学进展》杂志日前报道，以色列特拉维夫大学的一项研究证明，CRISPR/Cas9系统在治疗侵入性癌症方面非常有效，这是在寻找癌症治愈方法迈出的重要一步。 研究人员开发的一种基于脂质纳米颗粒的新型递送系统CRISPR—LNP，可专门针对癌细胞并通过基因操作将其破坏。该系统携带的一个遗传信使（信
基因编辑技术将癌细胞变身为健康细胞
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507993.shtm 转化的肿瘤细胞失去了所有癌症特征，类似于正常肌肉细胞。图片来源：冷泉港实验室 科技日报记者 刘霞 美国冷泉港实验室科学家在一项新研究中，使用CRISPR基因
Nature－Methods－可在体内大规模研究基因互作新方法
肿瘤转移是一个复杂的过程，受到多基因的调控，也是实体瘤患者死亡的主要原因之一【1】。目前系统性理解影响肿瘤转移的基因间相互作用仍是一个挑战。相比于Cas9系统，CRISPR-Cas12a（Cpf1）不需要tracrRNA（trans-activating CRISPR RNA），可同时在多位点进
通过TFEB激活吞噬溶酶体线粒体互作
巨噬细胞是我们先天免疫反应的关键细胞，这些细胞几乎遍布我们身体的所有组织，在维持我们器官的健康状态方面起着至关重要的作用。巨噬细胞特别擅长吸收、消化和破坏外来物质，它们会不断清除死亡细胞或入侵组织的微生物或病原体。然而，某些微生物和细菌，如沙门氏菌或分枝杆菌，已经发展出保护自己免受巨噬细胞消化的策略
怎么理解蛋白与核酸的互作
如果是相互作用的话。我的理解是，核酸是细胞内携带遗传信息的物质。在生物蛋白质的合成中占有重要的作用。这就是为什么我们吃了猪肉没有长成猪，而是合成了自己的蛋白质。
编辑HPV病毒基因－导致癌细胞自我毁灭
利用基因组编辑工具CRISPR，杜克大学研究人员们能够有选择性地破坏负责宫颈癌细胞生长和生存的两种乳头瘤病毒（HPV）基因，导致癌细胞的自我毁灭。 结果发表在病毒学Journal of Virology杂志上，新研究铺平了开发有针对性的抗病毒策略，来抵抗DNA病毒如B型肝炎病毒和单纯疱疹等的方
Cell绘制广泛的人类基因组互作图谱
来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)、斯坦福大学的科学家们阐明了，我们的基因表达在DNA中受控的机制。发表在《细胞》(Cell)杂志上的这项新研究，将促成更好地了解某些遗传变异可以开启或关闭控制基因表达的调控元件，最终表现为个体特征和疾病易感性的机制。 这些变异存在于非直接负责编码基因，而是发
解析了直立穗基因和粒形基因间的分子和遗传互作效应
水稻品种产量潜力的提高，归功于株型的改良。而粳稻育种中，由弯曲穗型到直立穗型是十分重要的株型转变，但直立穗品种一般表现出外观品质较差等不良效应。水稻粒形、垩白等外观品质性状均属于复杂的数量性状。育种家很难通过传统方法来高效地改良水稻外观品质。通过分子标记辅助选择得到含有优异等位基因的近等基因系，
Cell重大成果：绘制癌症药物基因组互作景观图
在发表于7月7日《细胞》（Cell）杂志上的一项研究证实，患者来源的癌细胞系中包含存在于患者肿瘤中大多数同样的遗传改变，可以利用来了解肿瘤对新药可能产生的反应，提高开发新型个体化癌症疗法的成功率。 由来自韦尔科姆基金会桑格研究所、欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)和荷兰癌症研究所的科学家
Cell：首次构建出人癌细胞依赖的基因图谱
在一项新的研究中，来自美国哈佛大学-麻省理工学院布罗德研究所（以下称布罗德研究所）和达纳-法伯癌症研究所的研究人员构建出肿瘤细胞存活所依赖的基因的综合图谱。相关研究结果发表在2017年7月27日的Cell期刊上，论文标题为“Defining a Cancer Dependency Map”。
棉花与黄萎病菌互作研究取得进展
棉花黄萎病是由大丽轮枝菌引起的土传维管束病害，是制约我国棉花生产的首要病害。从棉花黄萎病抗性品种中发掘关键抗病基因，进而通过分子育种与传统育种相结合的方法提高主栽品种的黄萎病抗性，是当前棉花领域基础和应用研究的重点。 质外体是植物细胞膜外由细胞壁和细胞间隙组成的系统，是植物抵御病原菌侵染的第一
植物与病原互作研究获重要进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519114.shtm
分子互作江湖（上）：门派林立－市场火爆
认知自然界的本质一定要了解相互作用，先辈们已总结了4种基本相互作用：引力相互作用、电磁相互作用、强相互作用和弱相互作用。就生命科学涉及的分子研究尺度而言，主要研究的是后两种相互作用。人们已经发展了ELISA、免疫共沉淀等一些经典的分子互作方法，但其只能描述终点。新型的分子互作仪器可以研究实时、动
新研究揭示胚胎早期细胞互作关系
12月4日，Cell在线发表研究，科学家在同种培养条件下建立了小鼠和食蟹猴来源的早期胚胎三种干细胞系，这有助于探索早期发育时期细胞互作关系，助力疾病机制解析。 哺乳动物的生命由单细胞受精卵发育而来。受精卵卵裂形成桑葚胚，桑葚胚细胞极化，进一步发育形成具有不同谱系细胞类型的囊胚。囊胚中包含胚内组
蛋白互作研究技术：「FRET」VS「Duolink－PLA」
荧光能量共振转移 （FRET）检测活体中生物大分子纳米级距离和纳米级距离变化的有力工具，广泛应用于生物大分子相互作用分析、细胞生理研究、免疫分析等。原理当供体荧光分子的发射光谱与受体荧光分子的吸收光谱重叠，并且两个分子的距离在 10nm 范围以内时，就会发生一种非放射性的能量转移，即 FRET 现象
NatureMethods公布最大人类蛋白互作网络
一个国际研究小组公布了迄今为止最大的蛋白互作数据库资源，这将有助于解析众多疾病相关的基因如何促发疾病发生和进程的。这项研究由麻省总医院MGH和Broad研究院领衔完成，相关数据库： InWeb_InBioMap (InWeb_IM) 在线公布在11月28日Nature Methods杂志上。“现代遗
Cell、Nature共绘遗传互作图谱
在遗传学中，总体并不总是组成部分的总和。有时，两个基因共同作用所产生的一种表型，会不同于预期的简单地将两个基因的效应相加。近期来自加州大学旧金山分校的 Jonathan Weissman和Nevan Krogan研究小组在独立研究中首次系统地探索了酵母中的遗传互作。相关论文分别发表在《细