肿瘤细胞的异质性,你了解多少?

由Bellvitge生物医学研究所(IDIBELL)表观遗传学和癌症生物学计划(PEBC)的主任Manel Esteller博士、ICREA研究员和巴塞罗那大学(UB)的遗传学教授领导的一项新研究发现,大肠肿瘤表现出涉及到该病临床过程的后生异质性。描述这一发现的论文已经发表在《胃肠病学》杂志上。 肿瘤异质性是指同一种恶性肿瘤在不同患者个体间或者同一患者体内不同部位肿瘤细胞间从基因型到表型上存在的差异。这种差异发生在不同个体中可表现出不同的遗传背景如染色体量与质的差异,不同细胞病例类型、不同临床阶段不同分化程度细胞演进的多样性,同质肿瘤在分子水平也存在显著差异:比如基因表达谱、网络调控、突变谱等方面的不同。发生在同一肿瘤患者体内可表现出不同部位肿瘤细胞间的突变基因谱和生物学特性等方面的不一致,体现了恶性肿瘤在演进过程中的高度复杂性和多样性。 同一患者体内不同部位的肿瘤细胞间的异质性又包括瘤间(不同病灶,如原发肿瘤与转移瘤)......阅读全文

单细胞的可靠全基因组扩增

目前多种新型分析技术,如新一代测序和芯片,都是为细胞群体而设计的,需要一定的样本量。对于一些临床或法医样本,如肿瘤细胞或循环胎儿细胞等,它们的细胞数量有限,直接限制了其下游应用。例如,在分析肿瘤细胞中的体细胞DNA突变或单个细菌基因组时,单细胞中的DNA无法满足测序的mg级样品量需求。为了从少量样品

单细胞全基因组扩增技术大比武

2013年,权威技术期刊《Nature Methods》将年度技术授予了单细胞测序。正如社论中所说,每个细胞都是独一无二的--它占据了独特的空间位置,它的复制基因组中携带了独特的错误。然而,过去以细胞群体为对象的研究只获得了平均值,而忽略了异质性。目前多种新型分析技术,如NGS,都是为细胞群

单细胞分析揭示癌症异质性

  2013年度基因组生物学大会(The Biology Of Genomes 2013)于5月7日晚在美国纽约冷泉港实验室召开。这是基因组学领域最大的会议之一,吸引了多个著名研究所的大牛参加。会议主题包括高通量基因组学和遗传学、复杂性状的遗传学、功能和癌症基因组学、计算基因组学、进化基因组学以

“863”肿瘤全基因组研究获进展

  7月14日,“十一五”国家“863”重大专项“食管癌全基因组关联分析和药物基因组学研究”和“肺癌全基因组关联分析和药物基因组学研究”成果汇报会在京召开。  日前,遗传学权威期刊《自然—遗传学》刊登了我国科学家食道癌和肺癌研究的重要进展。由中国医学科学院肿瘤研究所分子肿瘤学国家重点实验室教授林东昕

谢晓亮:单细胞全基因组测序曙光初现

   谢晓亮  12月21日出版的美国《科学》杂志发表了题为《单细胞全基因组测序探索精子重组规律和遗传缺陷》的论文。同时,该期《科学》杂志也将单细胞全基因测序列为2013年六大值得关注的科学领域之一。  该论文由美国科学院院士、哈佛大学教授谢晓亮课题组与北京大学生物动态光学成像中心(

肿瘤异质性的分类

广义而言,肿瘤异质性可分为肿瘤间异质性和肿瘤内异质性两类。其中前者指的是不同肿瘤的细胞之间的基因与表型不同,后者指的是相同肿瘤的不同细胞之间的基因与表型也不同。在此,若无特别提及的话,谈及的肿瘤异质性指的是肿瘤内异质性。  肿瘤内异质性又有空间异质性(相同肿瘤不同区域不同)与时间异质性(原发性肿瘤与

如何诊断肿瘤异质性?

  肿瘤的准确诊断和精准治疗依据单一肿瘤标本活检是不全面的,因其代表不了整块肿瘤。并且病理医师对肿瘤样品取材时,常关注晚期及最坏的瘤组织,而对最具进展性、侵袭性区域则可能漏检。  同样由于免疫标记物在肿瘤中异质性表达,所以以免疫组化为基础的检查更可能导致对病情了解不全面。  随着对肿瘤异质性的深入研

单细胞基因组测序:从实验到分析,步步解析

随着生命科学研究的微观化,基于细胞群体的研究方法已不适用于某些研究领域(如肿瘤异质性、早期胚胎发育等)。单细胞基因组测序通过在单个细胞水平上进行测序,解决了用组织样本无法获得不同细胞间的异质性信息或样本量太少无法进行常规测序的难题,为科学家研究单个细胞的行为、机制等提供了新的方向。【应用概览】从20

单细胞基因组测序如何实现:从实验到分析,步步解析

  随着生命科学研究的微观化,基于细胞群体的研究方法已不适用于某些研究领域(如肿瘤异质性、早期胚胎发育等)。单细胞基因组测序通过在单个细胞水平上进行测序,解决了用组织样本无法获得不同细胞间的异质性信息或样本量太少无法进行常规测序的难题,为科学家研究单个细胞的行为、机制等提供了新的方向。  【应用概览

单细胞测序有望揭示胃癌异质性

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514613.shtm

新型CUT&RUN技术实现单细胞全基因组定位

  在一项新的突破性研究中,来自美国匹兹堡大学和马萨诸塞大学医学院的研究人员对一种称为CUT&RUN(cleavage under targets and release using nuclease)的方法进行改进,使得在使用少量细胞(包括单细胞和单个植入前胚胎)的情形下,它适合用来研究转录因子和

揭示了磷硫酰化修饰在全基因组水平上的异质性

   DNA是重要的遗传物质,储存着所有蛋白质和RNA的全部遗传信息。DNA上的任何一个微小的变化都有可能改变生命的遗传信息,影响生命活动,如经典的DNA甲基化修饰在生物界具有保护遗传稳定,调控DNA复制、转录以及翻译过程等重要功能。DNA磷硫酰化修饰是由邓子新发现的,DNA骨架上硫原子取代磷原子上

肿瘤异质性的诊断方法

诊断:肿瘤的准确诊断和精准治疗依据单一肿瘤标本活检是不全面的,因其代表不了整块肿瘤。并且病理医师对肿瘤样品取材时,常关注晚期及最坏的瘤组织,而对最具进展性、侵袭性区域则可能漏检。同样由于免疫标记物在肿瘤中异质性表达,所以以免疫组化为基础的检查更可能导致对病情了解不全面。随着对肿瘤异质性的深入研究,科

肿瘤异质性的治疗方法

治疗:如果肿瘤呈同质性,则所有肿瘤细胞对所给治疗具相同敏感性,因此只要对瘤细胞的杀灭胜过新生则可根治。但肿瘤异质性的存在,使不同亚群对化疗药物的敏感程度不同,如应用依维莫司治疗转移性肾癌后发现,2个转移灶较用药前在CT上大小呈相反方向变化。使用化疗药物,可能对肿瘤实施短暂压制,但其所形成的选择性压力

关于肿瘤异质性的概述

  肿瘤异质性指肿瘤内既有致瘤细胞亚群,也有非致瘤细胞亚群。同时,它也指肿瘤既起因于遗传不稳定性,也起因于表观遗传不稳定性。此外,它还应该涵盖良性肿瘤与恶性肿瘤的概念。除极个别情况外,肿瘤发生通常只涉及体细胞而不涉及性细胞。因此,人体的绝大多数肿瘤都不会遗传给后代,但种系基因缺陷所致肿瘤遗传倾向例外

肿瘤的异质性的概念

肿瘤的异质性是恶性肿瘤的特征之一,是指肿瘤在生长过程中,经过多次分裂增殖,其子细胞呈现出分子生物学或基因方面的改变,从而使肿瘤的生长速度、侵袭能力、对药物的敏感性、预后等各方面产生差异。

肿瘤的异质性的定义

肿瘤异质性是指肿瘤在生长过程中,经过多次分裂增殖,其子细胞呈现出分子生物学或基因方面的改变,从而使肿瘤的生长速度、侵袭能力、对药物的敏感性、预后等各方面产生差异。它是恶性肿瘤的特征之一。

肿瘤异质性的形成原因

肿瘤异质性指肿瘤内既有致瘤细胞亚群,也有非致瘤细胞亚群。同时,它也指肿瘤既起因于遗传不稳定性,也起因于表观遗传不稳定性。此外,它还应该涵盖良性肿瘤与恶性肿瘤的概念。除极个别情况外,肿瘤发生通常只涉及体细胞而不涉及性细胞。因此,人体的绝大多数肿瘤都不会遗传给后代,但种系基因缺陷所致肿瘤遗传倾向例外。一

单细胞测序技术应用和发展现状研究

一背景概况单细胞测序技术是指能够在单个细胞的水平上,对基因组或转录组进行高通量测序分析的一项新技术。与传统高通量测序相比,单细胞测序不仅能够分析相同表型细胞的异质性,还能获取难以培养微生物的遗传信息以及珍贵的临床样本的信息,具有广阔的应用前景。细胞是生命的单位,目前大部分的基因检测均是从组织中抽提D

关于肿瘤异质性的基本介绍

  肿瘤的异质性是恶性肿瘤的特征之一,是指肿瘤在生长过程中,经过多次分裂增殖,其子细胞呈现出分子生物学或基因方面的改变,从而使肿瘤的生长速度、侵袭能力、对药物的敏感性、预后等各方面产生差异。  同一肿瘤中可以存在有很多不同的基因型或者亚型的细胞。因此同一种肿瘤在不同的个体身上可表现出不一样的治疗效果

Science提出肿瘤异质性新概念

  根据发表在《科学》(Science)杂志上的一项新研究,在局限性肺癌中一些已知的癌症驱动基因组畸变似乎一致存在于整个肿瘤之中,对肿瘤的某一区域进行单次活检就有可能鉴别出其中的大多数畸变。  由德克萨斯大学MD安德森癌症中心的科学家们领导的这项研究,解决了科学家们称之为基因组异质性的这一挑战。基因

关于肿瘤异质性的展望介绍

  肿瘤异质性的广泛存在已基本被证实,但瘤内不同克隆亚群间和克隆与微环境间的生物学关系仍不清楚,但可以肯定的是肿瘤是一个非常复杂的整体,目前的诊断及治疗是不全面的。部分学者已开始从肿瘤异质性方面探索肿瘤的诊治,并不断取得进展,争取实现精确诊断和精准治疗。

关于肿瘤异质性的治疗介绍

  如果肿瘤呈同质性,则所有肿瘤细胞对所给治疗具相同敏感性,因此只要对瘤细胞的杀灭胜过新生则可根治。但肿瘤异质性的存在,使不同亚群对化疗药物的敏感程度不同,如应用依维莫司治疗转移性肾癌后发现,2个转移灶较用药前在CT上大小呈相反方向变化。使用化疗药物,可能对肿瘤实施短暂压制,但其所形成的选择性压力使

单细胞测序保证了测量的准确性和稳定性

  单细胞测序与普通测序不同在于普通测序所提取的RNA源于样本中的多个细胞,所以普通测序的结果不可避免的会受到不同细胞间异质性的影响,而单细胞测序则是针对单个细胞的基因组进行测序,能够更好地帮助我们认识细胞与细胞之间的差异。   同一组织中的细胞间都是存在异质性的,更不必提不同组织、不同系统中细胞的

-NIH鼓励科学家在单细胞测序领域创新

  8月19日,美国国立卫生研究院(NIH)的Common Fund 基金会向单细胞测序领域发出挑战,Common Fund 称,愿意提供2项50万美元的奖金奖励那些在单细胞测序领域中有所突破的科学家或科研团队。  通过该技术,NIH称,希望能够了解细胞在发育过程中的各个阶段的变化以及行为,NIH要

单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里

单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin

单细胞测序这样的高通量技术的优势

单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin

单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里

单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin

单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里

单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin

复杂肿瘤全基因组异常的检测难题得以解决

  中国科学技术大学信息科学与技术学院副教授李骜研究组以原创性论文(Original paper)的形式,在Bioinformatics上在线发表了最新研究成果。论文的第一作者是博士生余振华。  基因组异常是多种恶性肿瘤的标志性特征,在肿瘤发病机理、临床诊断和治疗等研究中具有极为重要的作用。传统的肿