单细胞的可靠全基因组扩增

目前多种新型分析技术,如新一代测序和芯片,都是为细胞群体而设计的,需要一定的样本量。对于一些临床或法医样本,如肿瘤细胞或循环胎儿细胞等,它们的细胞数量有限,直接限制了其下游应用。例如,在分析肿瘤细胞中的体细胞DNA突变或单个细菌基因组时,单细胞中的DNA无法满足测序的mg级样品量需求。为了从少量样品中获得更多信息,全基因组扩增技术(WGA)应运而生。全基因组扩增的目的是在没有序列偏向性的前提下大幅增加DNA的总量。之前常用的技术有DOP-PCR和PEP-PCR等。然而,这些基于PCR的方法会产生非特异的扩增假象,影响实验结果。为此,QIAGEN推出了全基因组扩增产品REPLI-g Single Cell Kit,让研究人员在使用测序和芯片平台时能获得值得信赖的结果。REPLI-g Single Cell Kit能够从单细胞(如分离的肿瘤细胞或细菌)中获得高产量的扩增DNA。它可用在广泛的应用中,使用各种临床和非临床研究样品,包括......阅读全文

Nature发布单细胞基因组学新技术

  胚胎是如何形成我们肺脏、肌肉、神经和其他组织中的细胞的?一种新的方法可以解码使得胚胎万能细胞能够增殖并转变为机体许多特化细胞类型的遗传指令。   一开始是一团相同的细胞,随着增殖不断地改变形状和功能,最终变为我们肺脏、肌肉、神经和机体所有其他特化组织中的细胞。胚胎拥有这种创造奇迹的能力。  

Nature论述:单细胞基因组学揭开“免疫新世界”

  人类对生命的好奇,从来没有减退。一个多世纪以来,科学家们一直试图解析构成我们机体的成千上万亿个细胞,从一米长的神经元到8微米宽的红细胞。他们希望从中找到解析重要生理、病理过程,挖掘重要的细胞类型和信号通路。  但是,过去几十年,包括荧光抗体标记技术、DNA和RNA测序技术等在内的研究工具却不能解

单细胞基因组学:通往个体化医疗之门

  随着第二代测序技术的普及,单细胞测序迎来了迅猛发展。  近日,南方科技大学生物学系副教授贺建奎在美国冷泉港参加了单细胞分析会议后,在科学网博客里写道:“这是一个非常令人激动的前沿学术会议,我深深地体会到了单细胞基因组学时代的来临。”  他对《中国科学报》表示:“单细胞基因测序技术的突破,只是开了

Nature子刊发表单细胞基因组学重要进展

  最近,一种用于RNA序列分析的新方法,可让研究人员确定新的细胞亚型,从看似全然混乱的状态创造出秩序。这项新技术发表在最新一期的Nature旗下子刊《Nature Biotechnology》,是由欧洲生物信息研究所欧洲分子生物学实验室(EMBL-EBI)的科学家开发,标志着我们向单细胞基因组迈进

单细胞测序揭示肺癌肿瘤免疫细胞亚型的细胞图谱

  最近免疫疗法的出现标志着多种癌症的研究和护理发生了巨大变化,给世界各地的患者和家庭带来了新的希望。对于那些对治疗有反应的人来说,结果可能是激动人心的。激活病人的癌症免疫系统可以杀死或缩小肿瘤,在某些情况下,会导致完全缓解。  尽管取得了重大进展,但只有少数人从免疫治疗中获益,原因尚不清楚。  免

Science:构建肿瘤浸润T细胞的泛癌单细胞图谱

  靶向肿瘤特异性T细胞的癌症免疫疗法已使许多癌症患者受益,但是针对不同类型的癌症的临床疗效差异很大。肿瘤浸润T细胞经常进入功能失调状态,这一现象被广泛称为T细胞衰竭(T cell exhaustion),而效应T细胞的抗肿瘤功能受多种因素调节,包括调节性T细胞(Treg细胞)的存在。T细胞的状态和

基于单细胞测序绘制肿瘤微环境相关细胞代谢图谱

  肿瘤作为一个异常复杂的“生态系统”,不同类型的肿瘤细胞与非肿瘤细胞共同构成了肿瘤微环境。肿瘤存在肿瘤间异质性和肿瘤内异质性,可以说肿瘤内每种细胞都存在于不同的微环境中,每种细胞都可能有不同的代谢状态。由于异质性,肿瘤细胞会通过改变自身代谢模式(即“代谢重编程”)来适应不同的微环境,以满足其对能量

人类胸腺单细胞图谱助力肿瘤免疫治疗

  胸腺是T细胞的分化、发育和成熟的场所,是组成免疫系统的重要器官。到目前为止,还不清楚在整个生命过程中,人体胸腺中的早期免疫前体细胞如何发育为T细胞。尽管已通过各种动物模型对胸腺进行了广泛的研究,但是还未有详细的人类胸腺细胞图谱得以报道。  由来自VIB炎症研究中心(VIB Center for

单细胞分析技术在肿瘤学中的应用

肿瘤异质性研究:通过分析肿瘤组织中的单个癌细胞,揭示不同癌细胞之间的基因表达、突变和蛋白水平的差异,为理解肿瘤的发生、发展和耐药机制提供关键信息。例如,在乳腺癌中,发现某些肿瘤细胞具有特定的基因突变,导致对特定治疗药物产生抗性。肿瘤微环境分析:了解肿瘤细胞与免疫细胞、基质细胞等微环境成分之间的相互作

肿瘤基因专家致力挖掘单细胞大数据潜能

  近年来,随着测序技术的迅猛发展,单细胞测序技术已逐渐走入人们视野。2013年,单细胞测序技术成为《自然》评选的“Method of the Year”。大多数的基于NGS的基因检测,都是在大量细胞宏观水平上,对整个细胞群进行遗传分析。单细胞测序技术则是在单个细胞的水平上,对其遗传物质进行检测,从

单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用

单细胞测序技术在肿瘤研究中有以下多方面的应用:肿瘤细胞异质性研究鉴定肿瘤内不同的细胞亚群,包括具有不同基因突变、转录组特征和表型的细胞。揭示肿瘤细胞之间的差异对肿瘤进展、转移和治疗反应的影响。肿瘤微环境分析解析肿瘤微环境中免疫细胞、基质细胞等的组成和功能状态。研究肿瘤细胞与微环境中其他细胞的相互作用

新型基因组学工具ECCITEseq扩展多模态单细胞分析

  单细胞RNA测序是基因组研究的重要领域之一。其能够帮助研究人员深入探索单细胞的特性,有效区分不同的细胞类型,并在单细胞水平下研究多种人类疾病的发病机制。随着对复杂人体组织甚至整个生物体的研究进展,研究人员越来越认识到需要大规模并行技术及数据集才能更加深入地揭示微妙的细胞状态。  近日,一种新型单

PerkinElmer以0.28美元/股现金收购单细胞基因组学公司RHS

  分析测试百科网讯 近日,据外媒报道,PerkinElmer同意支付约1980万美元现金(每股0.28美元)收购澳大利亚细胞基因组学公司RHS Ltd,这项决议得到了RHS公司全体董事会的支持。  RHS董事长David Brookes说:“PKI提案受到了董事会的欢迎,作为奖励股东忠诚度并在重要

单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例

以下是一些单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例:  **案例一:乳腺癌** 研究人员利用单细胞测序技术对乳腺癌肿瘤组织进行分析,发现了不同亚型乳腺癌细胞之间的基因表达差异和肿瘤细胞的异质性。他们鉴定出了具有干细胞特性的肿瘤细胞亚群,这些细胞可能与肿瘤的复发和耐药性有关。这为开发更有针对性的治疗

单细胞分离用于单细胞基因扩增

 单细胞分离连接不同管径大小的毛细玻璃针,可分离捕获各种非贴壁状态的单细胞和微粒等,如细菌、酵母、藻类细胞、植物花粉、原生动物单细胞、悬浮细胞、血液细胞、免疫细胞、卵细胞、各种悬液中单细胞及特殊标记的单细胞等。  单细胞分离用于各种类型的细胞分离培养、纯化、检测;获得单克隆细胞;用于单细胞基因扩增,

广州地化所发展出单细胞SIP反向基因组学技术

  微生物是地球上丰富且分布广泛的生命形式,在生态系统中对有机物的生物地球化学循环发挥着关键作用。微生物降解是有机污染物分解过程中的重要环节。其中,降解功能微生物可将污染物转化为无毒化合物,是有机污染物降解的执行者。因此,研究原位降解功能微生物的种类和代谢特性,并从复杂环境微生物群落中发掘具有“特定

广州地化所发展出单细胞SIP反向基因组学技术

  微生物是地球上丰富且分布广泛的生命形式,在生态系统中对有机物的生物地球化学循环发挥着关键作用。微生物降解是有机污染物分解过程中的重要环节。其中,降解功能微生物可将污染物转化为无毒化合物,是有机污染物降解的执行者。因此,研究原位降解功能微生物的种类和代谢特性,并从复杂环境微生物群落中发掘具有“特定

单细胞组学解码泛癌肿瘤微环境中的T细胞

T细胞是最关键的抗肿瘤免疫细胞。肿瘤微环境中存在“肿瘤浸润T细胞”亚群,能够对肿瘤抗原产生反应,肩负着清除肿瘤细胞的重任,也是摧毁癌细胞的“主力军”。然而,随着肿瘤发展,这些英勇的“战士”常常陷入功能失调状态,“战斗力”大幅下降,被科学家称为“T细胞耗竭”。越来越多的证据表明,不同癌症的肿瘤微环境对

时空分辨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用

时空分辨单细胞测序技术在肿瘤研究中有以下应用:肿瘤发生的早期检测能够追踪肿瘤起始细胞在早期阶段的变化,发现潜在的肿瘤发生标志,从而实现更早期的诊断。肿瘤异质性解析明确肿瘤内部不同细胞在空间位置上的基因表达差异,深入了解肿瘤异质性的形成机制和演化过程。肿瘤微环境研究分析肿瘤微环境中各种细胞(如免疫细胞

单细胞测序技术在肿瘤研究中的发展趋势

单细胞测序技术在肿瘤研究中的发展趋势包括以下几个方面:多组学整合分析不仅局限于对肿瘤细胞的基因组和转录组测序,还将结合表观基因组、蛋白质组、代谢组等多组学数据,更全面地揭示肿瘤细胞的特征和调控机制。更高的分辨率和精度不断改进技术,以检测更微量的核酸物质,更准确地识别低频突变和罕见的细胞亚群,提高对肿

单细胞分离用于单细胞基因扩增介绍

单细胞分离连接不同管径大小的毛细玻璃针,可分离捕获各种非贴壁状态的单细胞和微粒等,如细菌、酵母、藻类细胞、植物花粉、原生动物单细胞、悬浮细胞、血液细胞、免疫细胞、卵细胞、各种悬液中单细胞及特殊标记的单细胞等。  单细胞分离用于各种类型的细胞分离培养、纯化、检测;获得单克隆细胞;用于单细胞基因扩增,用

Namocell单细胞分离仪应用——单细胞测序

2018年11月,Namocell与CZ-Biohub(Chan Zuckerburg Biohub)合作,在单细胞测序领域做出了新的尝试。CZ-Biohub利用Namocell单细胞分离仪分选出目的B细胞,并且将其进行单细胞测序,为抗体新药的发现迈出了重要一步。单细胞RNA测序(scRNA-s

微流控芯片技术的肺癌循环肿瘤细胞检测及单细胞分析

我国是肺癌高发国家,近十年肺癌的发病率分别占男性和女性恶性肿瘤的第一和第二位,并且发病年龄有下降的趋势。肺癌的死亡率在恶性肿瘤中始终居于首位,根本原因是肺癌的高转移能力。因为肺癌具有极强的侵袭性及转移能力,大多数患者就诊时已处于晚期(III期、IV期),失去最佳的治疗机会。因此,提高肺癌检出率、控制

CloneSelect 单细胞分离系统 OR 传统单细胞克隆方法

CloneSelect™ Single-Cell Printer™ f.sight™ ( f.sight )被开发用于满足这些需求, 它可以柔和地接种单个细胞至微孔,同时记录整个细胞接种过程,提供单克隆性的图像证据以及优异的接种后细胞生长用于细胞株开发在这个研究中,我们开展了六组实验,用无血清培养基

单细胞分离对单细胞测序领域的作用

单细胞分离可以采用特制的毛细管在载玻片的琼脂涂层上选取单孢子并切割下来,然后移到合适的培养基进行培养,分离法对操作技术有比较高的要求,多限于高度专业化的科学研究中采用。  它不仅仅可以用于分离单细胞,还可以用于nl级别试剂的分配和磁珠的分选,对于单细胞测序领域有着很大的帮助。快速高效接种单个活细胞至

单细胞分离系统 OR 传统单细胞克隆方法对比

随着监管机构对细胞株开发的要求愈加严格,研究人员被要求开展单细胞克隆并提供细胞株源于单个细胞的证据( 即单克隆性的证据 )。 有限稀释是一个普遍接受的建立单克隆性的方法,它基于统计概率因此只有很少一部分( 10-30% )的微孔能被接种单个细胞。流式细胞分选是另一种传统的克隆方法,它可以高效地接种单

时空分辨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例

时空分辨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例:乳腺癌研究通过时空分辨单细胞测序,研究人员发现了肿瘤细胞在不同部位的异质性,以及与肿瘤微环境中免疫细胞和基质细胞的动态相互作用。这有助于理解肿瘤的进展和转移机制,并为治疗策略的制定提供依据。黑色素瘤研究该技术揭示了黑色素瘤细胞在原发灶和转移灶中的基因表达

循环肿瘤细胞捕获及单细胞分析样机在大连研制成功

  由大连医科大学牵头,与中国科学院深圳先进技术研究院等多家单位合作,在国家科技计划支持下,历经三年研发,成功构建了具有自主知识产权的循环肿瘤细胞(circulating tumor cell,CTC)捕获及单细胞分析样机,显示出较好的应用前景。  CTC是存在于患者外周血中的各类肿瘤细胞的统称,对

基因组学推进肿瘤研究未来发展

  ——访亿明达肿瘤业务营销副总裁约翰·莱特  基因组学正在改变肿瘤研究,其最终目标是推进癌症的诊断、治疗、监控及最终的筛查方式。  癌症通常按照形态进行分类,这指的是病理学家在显微镜下看到的内容。“如今,癌症分类依据已经开始从形态特征转变为更有效的治疗方式,其中的主要转变在很大程度上归功于基因组研

单细胞凝胶电泳法检测单细胞DNA损伤

单细胞凝胶电泳(single-cell gel eiectrophoresis,SCGE)又称慧星试验(comet assay)是一项较新的电泳方法。自1978年被Rydcbert B.等人成功地用于检验DNA单链断裂以来,经过不断的改进,已成为一种快速、灵敏、简便的检测DNA损伤的方法,广泛地应用