揭示了磷硫酰化修饰在全基因组水平上的异质性
DNA是重要的遗传物质,储存着所有蛋白质和RNA的全部遗传信息。DNA上的任何一个微小的变化都有可能改变生命的遗传信息,影响生命活动,如经典的DNA甲基化修饰在生物界具有保护遗传稳定,调控DNA复制、转录以及翻译过程等重要功能。DNA磷硫酰化修饰是由邓子新发现的,DNA骨架上硫原子取代磷原子上的非桥联氧原子形成一种新型DNA修饰。 它突破了DNA由碳、氢、氧、氮、磷五种元素构成的结论,拓展了经典的DNA组成,引起了国内外广泛关注。多年来,围绕这一新型DNA修饰的探索已逐步形成了一个全新的研究方向,是中国在基础生命科学研究领域的一个重要的原创性贡献。 上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室邓子新院士团队由德林教授研究组与张大兵教授团队杨立桃教授研究组合作,在DNA磷硫酰化修饰研究方面取得新进展,发展了PT-IC-seq和PT-IC-ddPCR两种技术,首次定量地检测了基因组上DNA磷硫酰化修饰位点,揭示了......阅读全文
研究发现全新DNA单链磷硫酰化修饰系统
DNA单链磷硫酰化修饰-感应修饰限制系统的工作机理 近日,武汉大学药学院教授王连荣课题组在《自然·微生物学》在线发表了细菌DNA磷硫酰化领域的最新研究成果,首次揭示了一套全新的磷硫酰化限制-修饰系统——DNA单链磷硫酰化修饰Ssp系统,并解析了感应基因组修饰抗噬菌体系统的分子机制。 细菌磷硫酰化
上海交大破译DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱
近日,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室在DNA磷硫酰化修饰方面取得突破,《Nature Communications》在线发表了由德林教授研究小组的最新进展《Genomic mapping of phosphorothioates reveals partial modif
由德林等破译DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱
记者日前从上海交通大学获悉,该校微生物代谢国家重点实验室由德林研究小组在DNA磷硫酰化修饰方面取得突破。相关成果在线发表于《自然—通讯》杂志。 DNA是生命的遗传物质,由碳、氢、氧、氮、磷五种元素组成。中科院院士邓子新领衔的团队在前期工作中发现了DNA上存在一种全新的修饰——磷硫酰化
上海交大赵一雷教授Sci-Rep解析DNA磷硫酰化修饰新机制
上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室等处的研究人员发表了题为“Mechanistic investigation on ROS resistance of phosphorothioated DNA”的文章,通过体内/体外实验和理论计算相结合的方法,揭示了磷硫酰化修饰DNA抵抗
揭示了磷硫酰化修饰在全基因组水平上的异质性
DNA是重要的遗传物质,储存着所有蛋白质和RNA的全部遗传信息。DNA上的任何一个微小的变化都有可能改变生命的遗传信息,影响生命活动,如经典的DNA甲基化修饰在生物界具有保护遗传稳定,调控DNA复制、转录以及翻译过程等重要功能。DNA磷硫酰化修饰是由邓子新发现的,DNA骨架上硫原子取代磷原子上
上海交大研究组揭示细菌DNA新型限制修饰机制
细菌DNA新型限制修饰机制 近日,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室在DNA磷硫酰化修饰研究方面取得新进展,由德林教授研究小组与美国麻省理工学院Peter C. Dedon教授课题组合作,以博士生曹博为第一作者,在微生物领域顶级期刊《Molecular Mi
DNA骨架硫修饰研究又获新成果
上海交通大学、武汉大学与美国麻省理工学院共同合作,以王连荣为第一作者、陈实和彼得·帝丹为共同通讯作者联合完成的论文《DNA磷硫酰化修饰在细菌基因组中广泛分布且量化存在》日前在美国《国家科学院院刊》上发表,这是DNA骨架上硫修饰研究领域又一个新的重大进展,也是邓子新团队与彼得·帝丹合
邓子新院士团队揭示DNA抗氧化新机制
近日来自上海交通大学生命学院的研究人员在DNA骨架硫修饰科学领域又取得新进展,揭示了DNA抗氧化损伤的新机制。相关论文 “Phosphorothioate DNA as an antioxidant in bacteria”发表在公布在国际知名分子生物学刊物《Nucleic Acids
细胞化学词汇氨酰化
中文名称:氨酰化英文名称:aminoacylation定 义:转移核糖核酸在氨酰tRNA合成酶和ATP存在下,与氨基酸相互作用进行两步反应,得到氨酰tRNA的过程。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
二十年磨一剑-打开DNA研究新天地-邓子新院士访谈
中国科学院院士、上海交通大学教授邓子新说:“我们有一百个一千个理由可以放弃:拿不到研究基金、不被人认可……但我们从来没有放弃过,一直做下来了。” 2007年8月,邓子新应邀出席在英国纽卡斯尔召开的第十四届国际放线菌生物学大会,并作了DNA大分子上一种新的硫修饰的研究报告。 2005年9月
关于致突变试验—哺乳动物细胞基因突变试验的介绍
哺乳动物细胞基因突变试验—哺乳动物体外培养细胞的基因正向突变试验常用的测试系统有小鼠淋巴瘤L5178Y细胞,中国仓鼠肺V79细胞和卵巢CHO细胞的三个基因位点的突变,即次黄嘌呤磷酸核糖转移酶(HGPRT)、胸苷激酶(TK)及Na+/K+ATP酶(OUA)位点。HGRPT和Na+/K+ATP酶位点
哺乳动物细胞基因突变试验
哺乳动物体外培养细胞的基因正向突变试验常用的测试系统有小鼠淋巴瘤L5178Y细胞,中国仓鼠肺V79细胞和卵巢CHO细胞的三个基因位点的突变,即次黄嘌呤磷酸核糖转移酶(HGPRT)、胸苷激酶(TK)及Na+/K+ATP酶(OUA)位点。HGRPT和Na+/K+ATP酶位点突变可用于上述三种细胞,O
细胞化学词汇基因组DNA
中文名称:基因组DNA英文名称:genomic DNA定 义:组成生物基因组的所有DNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
马拉硫磷液相分析方法
马拉硫磷液相分析方法:采用反相液相色谱外标法测定马拉硫磷原药中马拉硫磷的含量。马拉硫磷,又名马拉松、杀虫剂4049,学名O,O-二甲基-S-(1,2-二羟乙氧基乙基)二硫代磷酸酯,是一种有机化合物,化学式为C10H19O6PS2,为无色至淡黄色油状液体,为高效低毒虫、杀螨剂。2017年10月27日,
癌基因转化细胞:基因组DNA转染法
实验概要 癌基因转化细胞实验步骤1.提取基因DNA(含癌基因)。2.DNA准备:取供体DNA50~100微克,加3M NaCl或醋酸钠使最终浓度至0.3M混匀。3.再加2倍体积无水乙醇,3000转/分离心10分钟,去上清。4.加入转染缓冲液,待DNA充分融解后,再加入2.5M CaCl2,令最终浓度
真核细胞基因组DNA的提取
实验概要高等动物,高等植物的基因组相当庞大,如人类细胞基因组由30亿个碱基对组成,果蝇基因组有1.4×108个碱基对,水稻基因组有1.4×109个碱基对。真核细胞基因组中,约1万-1.5万个可表达的结构基因,其它大量存在的是调控序列和内含子序列。可以说某特定物种的基因组,包含了该物种生长,发育,繁殖
碳硫硅锰磷分析仪简介
碳硫硅锰磷分析仪:国内先进的综合材料分析仪,能同时分析金属元素和非金属元素。是采用计算机技术、传感技术、根据国家标准分析方法,研制成功的新一代碳硫硅锰磷分析仪,可检测黑色金属中各种元素的含量,如普碳钢、低合金钢、中合金钢、高合金钢、生铸铁、球铁、合金铸铁、耐磨铸铁等多种材料。
动物细胞基因组DNA的制备
实验概要本实验介绍了动物细胞基因组DNA的制备原理及操作流程。本方法一般可从5×107培养的非整倍体细胞(如HeLa细胞)中获得大约200μg DNA。DNA的长度可达到100~150kb。20ml正常血的DNA产量约为250μg。实验原理真核生物的一切有核细胞(包括培养细胞)都能用来制备基因组
动物组织细胞基因组DNA提取
一、实验原理真核生物的一切有核细胞(包括培养细胞)都能用来制备基因组 DNA.真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内,因此,制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持DNA分子的完整。提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS(十二烷基硫酸钠)和蛋白酶K的溶液
动物组织细胞基因组DNA提取
一、实验原理真核生物的一切有核细胞(包括培养细胞)都能用来制备基因组 DNA。真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内,因此,制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持DNA分子的完整。提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS(十二烷基硫酸钠)和蛋白酶K的溶液
动物细胞基因组DNA提取实验
实验原理真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内,制备DNA将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离,同时保持DNA分子的完整。提取DNA的过程是指将分散好的组织细胞在含SDS(十二烷基硫酸钠)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质,再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质,得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从
知识分享:动物细胞基因组DNA提取
实验原理 真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内,制备DNA将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离,同时保持DNA分子的完整。提取DNA的过程是指将分散好的组织细胞在含SDS(十二烷基硫酸钠)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质,再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质,得到的DNA溶液经乙醇沉
湖北抽检信阳芽毛尖检出水胺硫磷超标
6月20日,湖北省市场监督管理局发布最新一期食品安全抽检信息,组织抽检饼干、茶叶及相关制品、蛋制品、糕点、食盐、保健食品共6类食品281批次,抽样检验项目合格样品280批次,不合格样品1批次。 抽检信息显示,不合格产品为:中百仓储咸宁购物广场有限公司通城店销售的标称武汉陆羽茶业有限责任公司生产的信阳
表观遗传学修饰
组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节,这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映,这些表观遗传学因素相互作用以调节基因
组蛋白去乙酰化酶Rpd3S核小体去乙酰化和DNA-linker收紧的分子机制
近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院联合澳门大学,在《细胞研究》(Cell Research)上,在线发表了题为Structural basis of nucleosome deacetylation and DNA linker tightening by Rpd3S histone de
细胞总乙酰化水平的快速测定方法
细胞总乙酰化水平的快速测定方法 -------免疫亲和色谱-ELISA 方法 步骤一:亲和色谱分离提纯乙酰化蛋白 1. 用细胞裂解液裂解细胞,10000rpm 离心2 分钟,取上清备用。 2. 取20-40ul 抗乙酰化赖氨酸抗体填料(Anti-acetylated
细胞总乙酰化水平的快速测定方法
步骤一:亲和色谱分离提纯乙酰化蛋白 1. 用细胞裂解液裂解细胞,10000rpm 离心2 分钟,取上清备用。 2. 取20-40ul 抗乙酰化赖氨酸抗体填料(Anti-acetylated lysine Agarose,ICP0388,如右图所示), 用PBS 洗2 次,每次1
细胞总乙酰化水平的快速测定方法
步骤一:亲和色谱分离提纯乙酰化蛋白 1. 用细胞裂解液裂解细胞,10000rpm 离心2 分钟,取上清备用。 2. 取20-40ul 抗乙酰化赖氨酸抗体填料(Anti-acetylated lysine Agarose,ICP0388,如右图所示), 用PBS 洗2 次,每次1ml。
酰化的概念
如光化学烟雾形成过程中大气中的碳氢化合物经氧化、硝化化及酰化而生成过氧酰基硝酸酯,它们是大气氧化剂污染物。
什么是酰化?
酰化,又称酰基化,酰化作用。是指底物与酰化试剂在一定的条件下将酰基引入底物分子中的过程。酰化试剂的种类比较多,例如羧酸,羧酸酯,酸酐,酰氯等。根据酰化试剂酰化能力的大小选择不同的条件进行酰化反应。酰化之后的产物是酮(醛)、酰胺和酯等化合物,其机理包括双分子亲核取代反应和单分子亲核取代反应。常见的