好消息美研究人员开源了脂质质谱鉴定软件LIQUID
分析测试百科网讯 近日,一份基于LC-MS/MS ,针对脂质鉴定的开源软件被发布出来。 脂多糖在许多代谢疾病中起关键作用,包括高血压,糖尿病和中风。因此,身体的脂质-其“脂质体”的完整概况非常重要。 脂质体研究通常基于与串联质谱联用的液相色谱(LC-MS / MS)。但是研究人员很难快速处理数据,并且无法自信地识别和准确定量检测到的脂质。 不正确的识别可能导致误导性的生物学解释。然而,现有的工具不是为了大量的鉴定验证而设计的,并且必须手动验证以确保准确性。由于科学家越来越想要更大规模的脂质组学研究,分析人员需要改进的用于鉴定脂质的软件。LIQUID软件界面 太平洋西北国家实验室(PNNL)的主要作者Jennifer E. Kyle和八位合着者最近的一篇文章介绍了一种开源脂质鉴定软件Lipid Quantification and Identification(LIQUID)。该软件的评分可训练,搜索数据库可定制,并且......阅读全文
好消息-美研究人员开源了脂质质谱鉴定软件LIQUID
分析测试百科网讯 近日,一份基于LC-MS/MS ,针对脂质鉴定的开源软件被发布出来。 脂多糖在许多代谢疾病中起关键作用,包括高血压,糖尿病和中风。因此,身体的脂质-其“脂质体”的完整概况非常重要。 脂质体研究通常基于与串联质谱联用的液相色谱(LC-MS / MS)。但是研究人员很难快速处理
质谱鉴定,常见疑问解答
问题1、一级质谱和二级质谱有什么区别?什么时候做一级,什么时候做二级?答:一级质谱鉴定的方式主要为胎指纹图谱(PMF),即利用质谱仪精确测量酶解片段的分子量并搜库比较实现蛋白质的鉴定;二级质谱是在一级质谱的基础上再选择部分肽段做进一步的破碎并对碎片进行深入分析和比较,鉴定出该肽段的序列并结合PMF的
色谱质谱联用仪软件相关特点
软件 实时采集功能提供了全扫描与选择离子扫描的数据采集,可获得准确的定性、定量结果数据 提供自动调谐与手动调谐功能 数据处理模块提供定量方法创建功能 集成NIST谱图检索功能,可以方便、准确检索目标分析物 用户界面友好、易操作。
用什么软件可以处理质谱图
每一个品牌的质谱仪软件都不一样,出来的数据也就不一样,但是所有的质谱仪一定都是可以导出一个文本文件,里面包含数据的。我们实验室要求用Igor pro,用matlab, origin, python甚至excel都可以迅速的导入数据然后出图。因为我们仪器是自己定制的,所以的到的就是原始数据,有些质谱仪
Waters质谱masslynx软件使用说明
Waters质谱masslynx软件使用说明
布鲁克收购质谱软件企业SCiLS-GmbH
分析测试百科网讯 2017年1月4日,布鲁克宣布对德国不来梅SCiLS GmbH进行收购,本次收购的具体财务细节未披露。 据介绍,SCiLS的主要业务是开发软件工具,如统计分析软件、复杂的可视化观察,并为复杂的质谱成像(MSI)的数据集提供基于云的安全服务。 SCiLS的创始人来自于不来梅大
质谱鉴定微生物的原理
在应用MALDI-TOF MS时,通常将微生物样本与一种饱和的低分子量无机化合物溶液(称为基质)进行混合加在靶板上,待干后样本与基质共结晶后形成了以基质包裹构架的样本固体沉淀。样本基质结晶体经激光辐射,基质从激光中吸收能量使样品吸附,基质与样品之间发生电荷转移使得样品分子电离,离子在加速电场下获
蛋白鉴定方法之质谱相关技术
质谱已成为连接蛋白质与基因的重要技术,开启了大规模自动化的蛋白质鉴定之门。 用来分析蛋白质或多肽的质谱有两个主要的部分,1)样品入机的离子源,2)测量被介入离子的分子量的装置。 首先是基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱(MALDI-TOF)为一脉冲式的离子化技术。 它从固相标本中产生离子,并在飞
PB反应结缘小型质谱,脂质组学研究再添利器
近日,Nature Methods杂志(IF25.06)报道了清华大学欧阳证教授和瑕瑜教授在质谱小型化及脂质同分异构体研究领域取得的研究进展。图片来源于Nature Methods PB反应解锁脂类C=C双键位置 哺乳动物细胞脂质组中含有较多的同分异构体,这对于脂质的定量和分析是一个挑战。近
Spectronaut™软件支持Q-Exactive™质谱IDA采集模式
新型Spectronaut™软件支持赛默飞Q Exactive™质谱采集的DIA数据 2013年8月28日—瑞士蛋白质组学公司Biognosys AG今天宣布推出新版Spectronaut™软件,可进行超级反应监测(HRM)数据分析。HRM技术能够在一次进样分析中,重复并精确
安捷伦质谱软件平台支持所有安捷伦质谱仪器
丹佛,ASMS,2008年6月2日 安捷伦科技在ASMS上宣布,它扩展了MassHunter工作站软件,增加了许多新功能、新模块,并支持所有安捷伦的质谱仪器。 安捷伦的质谱产品线现在包括:四款单级四极杆液质联用仪(LC/MS),两款精确质量测定的飞行时间LC/MS,三款精确质量测定的Q-TOF
GCMS质谱联用仪软件性能特点
1、实时采集功能提供了全扫描与选择离子扫描的数据采集,可获得准确的定性、定量结果数据;2、提供自动调谐与手动调谐功能;3、数据处理模块提供定量方法创建功能;4、集成NIST谱图检索功能,可以方便、准确检索目标分析物;5、用户界面友好、易操作。
质谱及质谱的目的
质谱,是一种分析方法,原理就是让带电原子、分子或分子碎片按质荷比的大小顺序排列,打出相应的谱线。待分析的样品分子在离子源中离化成具有不同质量的单电行分子离子和碎片离子,这些单电荷离子在加速电场中获得相同的动能并形成一束离子,进入由电场和磁场组成的分析器中;其中离子束中速度较慢的离子通过电场后编转大,
气体分析质谱质谱原理
质谱仪配备QuaderaTM 分析软件, 操作简单, 功能强大, 有128 个检测通道,可生成用户特殊应用软件界面. 在参数设置, 多种实测方式, 谱库, 数据统计, 谱图放大, 光标, 输入输出模块等性能的支持下, 可以更方便地进行定性定量分析以及在线离线分析. Omnistar/
质谱鉴定常见问题解答
1. 一级质谱和二级质谱有什么区别?什么时候做一级,什么时候做二级? 答:一级质谱鉴定的方式主要指胎指纹图谱(PMF),即利用质谱仪精确测量酶解片段的分子量并搜库比较实现蛋白质的鉴定,二级质谱是在一级质谱的基础上再选择部分肽段做进一步的破碎并对碎片进行深入分析和比较,鉴定出该肽段的序列并结合PMF
质谱鉴定常见问题解答
1. 一级质谱和二级质谱有什么区别?什么时候做一级,什么时候做二级? 答:一级质谱鉴定的方式主要指胎指纹图谱(PMF),即利用质谱仪精确测量酶解片段的分子量并搜库比较实现蛋白质的鉴定,二级质谱是在一级质谱的基础上再选择部分肽段做进一步的破碎并对碎片进行深入分析和比较,鉴定出该肽段的序列并结合
质谱立大功!首张人体肺部的脂质组图谱出炉
美国太平洋西北国家实验室和罗切斯特大学领导的研究团队近日利用质谱分析技术,绘制出第一张人体器官特异的脂质组图谱–肺部。 近年来,不同类型细胞的转录组和蛋白质组已经陆续发布,包括大脑、心脏和肝脏中的主要细胞类型,这些有助于我们更好地了解人体每个器官的功能。不过到目前为止,还没有类似的脂质组(li
脂质染色实验
实验方法原理 实验材料 冰冻切片试剂、试剂盒 油红 O乙醇二甲苯蒸馏水甘油明胶苏丹 III仪器、耗材 弯钩玻璃棒5 ml 染色缸载玻片插板实验步骤 油红 O-乙醇染色液:油红 O(oil red O,上海试剂三厂)2.5 g,70% 乙醇 500 ml,混合后间隔摇动多次,待 24 h 形成饱和液,
复合脂质糖脂
糖脂(glycolipids)这是一类含糖类残基的复合脂质化学结构各不相同的脂类化合物,且不断有糖脂的新成员被发现。糖脂亦分为两大类:糖基酰甘油和糖鞘脂。糖鞘脂又分为中性糖鞘脂和酸性糖鞘脂。脂类代谢1.糖基酰基甘油(glycosylacylglycerids),糖基酰甘油结构与磷脂相类似,主链是甘油
简单脂质蜡
蜡(waxes)是不溶于水的固体,是高级脂肪酸和长链一羟基脂醇所形成的酯,或者是高级脂肪酸甾醇所形成的酯。常见有真蜡、固醇蜡等。真蜡是一类长链一元醇的脂肪酸酯。固酯蜡是固醇与脂肪酸形成的酯,如维生素A酯、维生素D酯等。
复合脂质磷脂
磷脂(phospholipid)是生物膜的重要组成部分,其特点是在水解后产生含有脂肪酸和磷酸的混合物。根据磷脂的主链结构分为磷酸甘油反和鞘磷脂。1.磷酸甘油酯(phosphoglycerides)主链为甘油-3-磷酸,甘油分子中的另外两个羟基都被脂肪酸所酯化,磷酸基团又可被各种结构不同的小分子化合物
质谱
不同质荷比的离子经质量分析器分离,而后被检测并记录下来的谱图叫作质谱图。简称质谱。质谱图的横坐标是质荷比(m/z) ,纵坐标是离子强度;质谱法(Mass Spectrometry) 即质谱分析法, 一般亦简称为质谱;质谱计(Mass Spectrometer): 采用顺次记录各种质荷比离子的强度的方
我所开发N糖肽质谱谱图解析新软件
近日,我所生物分离分析新材料与新技术研究组(1809组)叶明亮研究员团队开发了一款具有高灵敏度的N-糖肽质谱谱图解析新软件——Glyco-Decipher。该软件可实现在解析谱图的过程中不依赖糖库,利用不同糖肽的同一肽段骨架具有相似碎裂规律的特点,发展出基于“模式识别”的肽段序列鉴定新方法,实现
什么是质谱及质谱图
质谱(又叫质谱法)是一种与光谱并列的谱学方法,通常意义上是指广泛应用于各个学科领域中通过制备、分离、检测气相离子来鉴定化合物的一种专门技术。质谱法在一次分析中可提供丰富的结构信息,将分离技术与质谱法相结合是分离科学方法中的一项突破性进展。在众多的分析测试方法中,质谱学方法被认为是一种同时具备高特异性
赛默飞收购斯洛伐克质谱软件公司HighChem
分析测试百科网讯 近日,赛默飞已经收购了位于斯洛伐克的质谱软件开发商HighChem。本次收购的财务和其他条款尚未披露。 总部位于斯洛伐克布拉迪斯拉发的HighChem公司是为药物和代谢组学实验室提供用于分析复杂数据和识别小分子的软件。 “客户依靠我们提供的先进的软件解决方案,能快速准确地解
清华教授Nat-Commun发表论文:质谱的单细胞脂质组学分析
单细胞分析是研究细胞异质性的关键技术,对生物学过程研究及新药研发有着重要意义。目前,单细胞基因组学技术较为成熟,单细胞转录组学和蛋白组学分析技术近年来获得较多关注和投入。与其他组学相比,单细胞脂质组学分析刚刚起步,面临诸多技术难点。由于脂质数量庞大,结构复杂,其在单细胞层面的结构表征和定量分析颇
林金明ChemComm发文:新测序系统联用质谱检测单细胞脂质
近日,清华大学化学系教授林金明在《CHEM COMMUN》(影响因子6.319)发表了《Dean flow assisted cell ordering system for lipid profiling in single-cells using mass spectrometry》。清华大
液质联用中的质谱——串联质谱篇(中)
本文举几例常见的串联质谱仪,篇幅较长分为上、中、下三篇。 线性离子阱LIT/FTICR和LIT/Orbitrap QqQ和QTOF都是串联两个“离子束”型分析器,近年来还有一种趋势是串联两个离子捕获型分析器,线性离子阱LIT/FTICR是此类最早的类型,由于维护困难,近年来慢慢被LIT/Or
液质联用中的质谱——串联质谱篇(下)
本文举几例常见的串联质谱仪,篇幅较长分为上、中、下三篇。 串联质谱扫描方式 串联质谱的扫描方式包括以下几种: 1、子离子扫描/产物离子扫描/碎片离子扫描(Product Ion Scan/Fragment Ion Scan): 选择某一质量的母离子进入碰撞室,与碰撞室内的碰撞气体发生解离