微生物所研究发现小RNA中存在自我调控过程

真核生物非编码小RNA分子通过介导mRNA降解、抑制蛋白质翻译和染色质修饰负调控靶标基因的表达。小RNA在植物的生长发育、信号转导以及生物和非生物胁迫反应中起重要调控作用。 植物基因组学国家重点实验室方荣祥院士研究组在对水稻MAIF1(miRNAs regulated and abiotic stress induced F-box gene) 基因的研究中发现:该基因受植物激素脱落酸(abscisic acid,ABA)和干旱、高盐等非生物胁迫因素的诱导启动表达,同时又受小RNA(siR441和siR446)的转录后调控。作为MAIF1的负调控子,siR441和siR446的表达量受ABA和非生物胁迫抑制。但是令人感到意外的是,其前体RNA的积累却显著增加了。深入研究证明:siR441和siR446存在一个自我调控的过程,即当siR441和siR446的前体RNA的表达量升高时会形成一种自我配对现象,该配对影响了其被正确......阅读全文

RNA翻译与蛋白质折叠之间的微妙舞蹈

  在蛋白质的合成过程中,RNA翻译会影响蛋白质的折叠,而蛋白质折叠也会影响RNA的翻译。  在过去的十年里,我们对细胞内蛋白质合成方式的认知取得了快速的增长,其中包括蛋白质合成的各个基本步骤:转运RNA(transfer RNA, tRNA)是如何高保真、高速率地对信使RNA(messenger

Science:蛋白质翻译的真相

  Yeshiva大学的科学家们开发了一个新荧光标记技术,首次确定了蛋白质合成的时间和地点。该技术允许研究者在活细胞中直接观察mRNA分子翻译成蛋白质的过程,有助于揭示蛋白质合成异常引发人类疾病的具体机制。这项研究发表在三月二十日的Science杂志上。  “过去我们一直没能确切查明mRNA翻译成蛋

蛋白质生物合成翻译模板

不同mRNA序列的分子大小和碱基排列顺序各不相同,但都具有5ˊ-端非翻译区、开放阅读框架区、和3ˊ-端非翻译区;真核生物的mRNA的5ˊ-端还有帽子结构、3ˊ-端有长度不一的多聚腺苷酸(polyA)尾。帽子结构能与帽子结合,在翻译时参与mRNA在核糖体上的定位结合,启动蛋白质生物的合成;帽子结构和p

中外学者Nature子刊发文:环状RNA翻译出抑癌蛋白质!

  由中山大学、复旦大学、暨南大学、美国安德森癌症中心等多家单位发表一项发现:使用翻译组测序技术,在脑胶质瘤细胞中发现了数千种可能翻译的环状RNA(circRNA),其中320个有差异表达现象,并具体验证了一种名为LINC-PINT的环状RNA可编码长度为87个氨基酸的蛋白质PINT87aa。  近

人类“垃圾RNA”有重要作用——促进翻译

  过去十年的基因组研究中,最大的惊喜之一是科学家们发现,与以前的信念相反,大多数的基因组并不用于生产蛋白质。最初,许多科学家认为这些长非编码RNAs是非功能的“噪音”,但在最近的研究中,有越来越多的研究发现,这些lncRNAs具有调节功能。延伸阅读:上海生科院发现调控乙酰胆碱酯酶表达的自然存在的反

蛋白质易位之共翻译易位

大多数分泌蛋白和膜结合蛋白是共翻译易位的。驻留在内质网(ER)、高尔基体或内体中的蛋白质也使用共翻译易位途径。这个过程开始于蛋白质在核糖体上合成时,此时信号识别粒子(SRP)识别新生蛋白质的N端信号肽。SRP的结合会暂时停止合成,而核糖体-蛋白质复合物会转移到真核生物ER上的SRP受体和原核生物的质

Cell解析蛋白质翻译调控机制

  一个细胞的内部运作涉及到不计其数的单个分子,它们参与到重复循环的相互作用之中来维持生命。蛋白质形成就是这种生命活动的基础。   宾夕法尼亚大学的Joshua B. Plotkin教授说,由于蛋白质是细胞功能的基础构件,科学家们一直以来对于细胞生成蛋白质的机制都极其地感兴趣。   “蛋白质

蛋白质易位之翻译后易位

尽管大多数分泌蛋白是共翻译易位的,但有些分泌蛋白在胞质溶胶中翻译,然后通过翻译后系统转运到ER/质膜。在原核生物中,这一过程需要某些辅助因子,例如SecA和SecB,并由Sec62和Sec63(两种膜结合蛋白)促进。嵌入ER膜中的Sec63复合物导致ATP水解,使伴侣蛋白与暴露的肽链结合,并将多肽滑

关于基因表达的RNA输出和翻译的介绍

  1、基因表达的RNA输出  真核生物中,虽然一些RNA在细胞核中起作用,但大多数成熟的RNA必须通过核孔从细胞核输出到细胞质中。这些RNA包括蛋白质合成中涉及的所有RNA类型。在某些情况下,RNA被另外转运到细胞质的特定部分,如突触。  2、基因表达的翻译  成熟RNA是非编码RNA的最终基因表

蛋白质染色

  二维凝胶电泳(2-DE)是广为蛋白质组学科学家们应用的经典技术之一,蛋白混合物在两个维度上被分离。第一步是常规的等电聚焦,此过程中蛋白质根据其等电点被分离。接着,第二维使用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),将蛋白质按分子量进一步分离。上述两步操作在互相垂直的两个方向上,使分离的蛋白

蛋白质翻译后修饰的验证问题

Why are proteins, detected by mass spectrometry, not validated by site-specific antibodies?The modified motif could be detected by mass spectrometry (

关于翻译后修饰蛋白质的介绍

  前体蛋白是没有活性的,常常要进行一个系列的翻译后加工,才能成为具有功能的成熟蛋白。加工的类型是多种多样的,一般分为以下几种:N-端fMet或Met的切除、二硫键的形成、化学修饰和剪切。当合成蛋白质时,20种不同的氨基酸会组合成为蛋白质。蛋白质的翻译后蛋白质其他的生物化学官能团(如醋酸盐、磷酸盐、

健康所在RNA结合蛋白调节信使RNA翻译研究中取得新进展

  近日,国际学术期刊Molecular and Cellular Biology在线发表了中科院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康所核酸与分子医学研究组的最新研究进展:AU-Rich Element-Dependent Translation Repression Requires the

蛋白质合成翻译阶段的基因调控介绍

  蛋白质合成翻译阶段的基因调控有三个方面:  ① 蛋白质合成起始速率的调控;  ② MRNA的识别;  ③ 激素等外界因素的影响。蛋白质合成起始反应中要涉及到核糖体、mRNA蛋白质合成起始因子可溶性蛋白及tRNA,这些结构和谐统一才能完成蛋白质的生物合成。mRNA则起着重要的调控功能。  真核生物

蛋白质染色实验

考马斯亮蓝染色 银染法 非氨盐银染法 快速银染法             实验方法原理 1. 凝胶中蛋白质的定位可用考马斯亮蓝染料染色或银染色。前者简便

蛋白质染色实验

实验材料 蛋白质试剂、试剂盒 聚丙烯酰胺凝胶固定液染色液脱色液仪器、耗材 滤纸培养箱实验步骤 1.  将聚丙烯酰胺凝胶放在塑料容器并以3~5倍体积的固定液覆盖,在旋转摇床中缓慢揺动2 h。 2.  倾去固定液,以考马斯亮蓝染色液覆盖凝胶,并缓慢摇动4 h。3.  倾去染色液,用约50 ml 固定液冲

蛋白质染色介绍

染色液种类繁多,各种染色液染色原理不同,灵敏度各异。使用时可根据需要加以选择。常用的染色液有:1.氨基黑10B(amino black 10B又称为amidoschwarz 10B或naphthalene blueblack,2B 200)氨基黑10B分子式为C22H13N6S3Na3,MW=7

一种调控蛋白质翻译的新方式

  Sci Adv | RAS信号通路在肿瘤细胞中一种调控蛋白质翻译的新方式  蛋白质翻译是肿瘤发生、发展的关键过程。许多致癌信号通路针对性作用于蛋白质翻译的起始阶段,以满足癌细胞中合成代谢增强的需求。  近日,来自美国康奈尔大学Shu-Bing Qian(钱书兵)课题组在Science Advan

研究揭示蛋白质翻译调控衰老新机制

近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员王涛课题组和研究员王杰课题组合作,研究揭示了甲基转移样蛋白-1和WD重复结构域4(METTL1/WDR4)介导转运RNA(tRNA)的N7-甲基鸟苷(m7G)修饰对于维持衰老过程中蛋白质组稳态的重要作用,研究结果阐明了tRNA修饰对于衰老的调控作用。相关

关于翻译后修饰的蛋白质的基本介绍

  前体蛋白是没有活性的,常常要进行一个系列的翻译后加工,才能成为具有功能的成熟蛋白。加工的类型是多种多样的,一般分为以下几种:N-端fMet或Met的切除、二硫键的形成、化学修饰和剪切。当合成蛋白质时,20种不同的氨基酸会组合成为蛋白质。蛋白质的翻译后蛋白质其他的生物化学官能团(如醋酸盐、磷酸盐、

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验

蛋白质翻译后修饰 (PTM) 在细胞生物调节中发挥着基本作用。PTM 是 mRNA 翻译后蛋白质的酶促共价化学修饰。蛋白质化学修饰非常重要,因为它们会潜在地改变蛋白质的物理或化学性质、组成、活性、细胞定位或稳定性。实际上,在氨基酸或蛋白质的 N 端或 C 端加入或移除化学基团会导致大部分蛋白质发生变

研究揭示蛋白质翻译调控衰老新机制

  日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员王涛课题组和研究员王杰课题组合作,研究揭示了甲基转移样蛋白-1和WD重复结构域4(METTL1/WDR4)介导转运RNA(tRNA)的N7-甲基鸟苷(m7G)修饰对于维持衰老过程中蛋白质组稳态的重要作用,研究结果阐明了tRNA修饰对于衰老的调控作用。相

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验             实验步骤 一、引言 蛋 白 质 翻 译 后 修 饰 (P T

蛋白质染色实验——考马斯亮蓝染色

蛋白质染色可用于(1)蛋白质的观测(2)蛋白质含量的测定。实验方法原理1. 凝胶中蛋白质的定位可用考马斯亮蓝染料染色或银染色。前者简便且快捷,而银染法具有相当高的灵敏度,能用于检出更少量的蛋白质。2. 蛋白质的存在影响酸碱滴定中所用某些指示剂的颜色变化,从而改变这些染料的光吸收。在些基础上发展了蛋白

基因表达的调控

转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合位点,具有调

基因表达的调控模式介绍

转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合位点,具有调

关于蛋白质合成真核生物翻译起始的特点

  一、真核生物翻译起始的特点:  1.真核起始甲硫氨酸不需甲酰化。  2.真核mRNA没有S-D序列,但5'端帽子结构与其在核蛋白体就位相关。帽结合蛋白(CBP)可与mRNA帽子结合,促进mRNA与小亚基结合。  3.肽链的延长 :延长阶段为不断循环进行的过程,也称核蛋白体循环。分为进位、

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验(三)

2.2 糖基化糖 基 化 是 一 种 常 见 的 P T M , 并 且 已 经 证 明 能 够 影 响 酶 的 活 性 、蛋 白 质 定 位 、稳 定 性 、信 号 转 导 、细 胞 黏 附 和 蛋 白 质 相 互 作 用 (Spiro, 2002k 目 前 已 经 发 现 在 肿 瘤 恶

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验(五)

六、CID、ECD和 ETD的对比基于质谱的蛋白质组学分析依赖于气相中肽段在低碰撞能量下断裂, 在质量谱图中形成峰。进而通过峰图确定肽段序列,再推断出相关蛋白质。完成肽段断裂最主要的方法就是碰撞诱导解离(collision induced dissociation,C I D ) ( S w

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验5

六、CID、ECD和 ETD的对比基于质谱的蛋白质组学分析依赖于气相中肽段在低碰撞能量下断裂, 在质量谱图中形成峰。进而通过峰图确定肽段序列,再推断出相关蛋白质。完成肽段断裂最主要的方法就是碰撞诱导解离(collision induced dissociation,C I D ) ( S w a n