复旦大学周峰团队Cell发文原位染色质互作网络相关研究

近日,德克萨斯州西南医学中心的徐剑教授课题组与复旦大学附属中山医院及生物医学研究院(IBS)周峰研究员课题组合作,首次利用了“biotinylated dCAS9”的方法建立了高分辨率,位点特异原位DNA-蛋白质以及其他元件的互作网络 。8月24日,相关研究成果以《通过dcas9原位捕捉染色质相互作用网络》(“In Situ capture of chromatin interactions by biotinylated dCAS9”)为题在国际顶级学术期刊《细胞》(Cell)杂志上发表,徐剑教授和周峰研究员为共同通讯作者。徐剑教授为该文章的Lead Contact。 随着功能基因组学的飞速发展,对调控基因表达的顺式(cis-)和反式(trans-)作用元件进行系统研究成为当前急需填补的领域空白。此前也有利用3D基因组图谱的方法来研究染色质结构的组学技术:染色质免疫沉淀技术CHIA-PET能够鉴定到全基因组范围内的染色质......阅读全文

肿瘤研究:复旦大学团队让巨噬细胞变得听话

  近期,复旦大学研究团队在《ACS Nano》上发表了题为“Sequentially Triggered Bacterial Outer Membrane Vesicles for Macrophage Metabolism Modulation and Tumor Metastasis Supp

复旦大学细胞焦亡作用机理研究获进展

  复旦大学生命科学学院李继喜课题组在炎性坏死(细胞焦亡)作用机理研究方面取得重要进展。相关成果日前发表于美国《国家科学院院刊》。  细胞焦亡是机体在感知病原微生物侵染后启动的免疫防御反应,在拮抗和清除病原感染危险信号中起着重要作用。细胞焦亡本质上是由GSDMD(gasdermin D)蛋白介导的细

复旦大学《细胞》发文,为肿瘤治疗带来新突破

本报讯(记者唐闻佳)肿瘤免疫治疗有望迎来新的突破。近日,复旦大学上海医学院许杰团队在《细胞》(Cell)杂志发表研究论文,发现CD3的首个配体CD3L1,并揭示了CD3L1在肿瘤免疫逃逸与睾丸免疫豁免中的关键作用。这是肿瘤免疫治疗的全新靶点CD3L1抗体首次被报道。最新消息显示,CD3L1抗体治疗肿

细胞遗传学——原位引物启动技术(PRINS)

·         Hiro Hirai's Primed in Situ Synthesis (Schistosoma Genome Network)The PRINS (Primed in situ) technique uses a specific primer, dNTPs wit

羊水细胞染色体制备方法(原位法)

细胞培养1. 将羊水(约20ml)转移到无菌的离心管中,1000rpm离心10分钟;2. 去除上清液,用于其它分析,保留细胞悬液约0.5~1ml,用培养基混匀到2~2.5ml左右;3. 将细胞悬液平分到3只Chromslide培养皿中;4. 培养24/48小时后,向每只Chromslide培养皿中加

石蜡切片或细胞的原位杂交实验

细胞RNA的原位杂交实验用于在混杂的细胞群体和组织中、定位特异的mRNA在细胞中的存在位置。实验材料石蜡切片试剂、试剂盒HCl二甲苯乙醇SSCPBS链霉蛋白酶甘氨酸DTTRNA酶消化液乙酸铵仪器、耗材染色盘加湿盒载玻片烘箱水浴锅培养箱实验步骤1.  准备脱蜡/再水化系统(可重复使用数次)及0.2 m

石蜡切片或细胞的原位杂交实验

实验材料 石蜡切片试剂、试剂盒 HCl二甲苯乙醇SSCPBS链霉蛋白酶甘氨酸DTTRNA酶消化液乙酸铵仪器、耗材 染色盘加湿盒载玻片烘箱水浴锅培养箱实验步骤 1.  准备脱蜡/再水化系统(可重复使用数次)及0.2 mol/l HCl同时,将载有切片样品的载玻片(玻片盒中,于-20℃或-70℃贮存)置

石蜡切片或细胞的原位杂交实验

            实验材料 石蜡切片 试剂、试剂盒 HCl 二甲苯 乙醇 SSC

科学家揭示体外组装和体内染色质纤维普遍折叠模式

  9月13日,中国科学院生物物理研究所朱平研究组在国际期刊《细胞报告》(Cell Reports)在线发表论文,利用冷冻电子断层三维成像方法,揭示了体外组装和体内染色质纤维一种普遍存在的双螺旋折叠模式。  在高等生物个体的发育和分化过程中,生命体通过各种表观遗传调控染色质高级结构的动态变化,进而调

复旦大学冯建峰:揭示抑郁症与睡眠问题的共病病理机制

  复旦大学类脑智能科学与技术研究院院长冯建峰教授与英国华威大学、牛津大学等合作,首次发现了抑郁症与睡眠问题的共病病理机制,有望为改善大众尤其是抑郁症患者睡眠质量问题,甚至为治疗抑郁症带来革命性突破。7月26日凌晨,相关研究论文在线发表于《美国医学会杂志—精神病学卷》。  临床上,70%的抑郁症患者

单细胞染色质图谱|揭示转录因子网络和细胞谱系关系

  2019年10月8日,美国圣地亚哥的Salk研究所的Geoffrey Wahl团队在Cell Reports杂志上发表文章“Single-Cell Chromatin Analysis of Mammary Gland Development Reveals Cell-State Transcr

流式细胞术直峰图-只有一峰算阳性么

流式细胞仪检测的都是相对值。不管几个峰,都要有阴性对照,其他的样品都和阴性对照的比较,只要荧光强度大于阴性对照的,就算是阳性

肝脏上皮样血管周细胞瘤

患者男性,65岁。主诉因“丙肝抗体阳性15年余,间断肝区不适3年余,加重1个月”入院。患者15年前体检时发现肝功能异常,丙肝抗体阳性,查病毒复制活跃,予干扰素抗病毒治疗6个月,丙肝RNA转阴。其后每年定期复查肝功能正常、丙肝RNA<测定值。3年前患者无明显诱因出现肝区隐痛不适,呈间断发作,持续约数秒

周琪谈国内干细胞研究

  近10年不问收获的基础研究终于有了回报,2014年2月中国食品药品检定研究院为北京干细胞库出具了中国第一株临床级“人胚胎干细胞系”的检验报告;2017年9月,世界上首次由胚胎干细胞分化来源的神经细胞移植治疗帕金森氏症的临床研究在中国正式启动; 2019年5月,北京干细胞库通过ISO20387国际

周峰等制备出仿生毛毛虫结构自爬行驱动装置

  5月11日,记者从中科院兰州化学物理研究所获悉,该所研究员周峰及其合作者利用仿生毛毛虫结构,通过在具有褶皱结构的聚二甲基硅氧烷(PDMS)表面接枝响应性的聚电解质刷,实现了具有各向异性、瞬间响应性等性能的驱动器装置,从而开辟了制备驱动器的新思路。相关成果日前发表于《微尺度》(Small)杂志。

Cell:绘制人类单细胞染色质可及性图谱

  在人类细胞中,总长约2米的基因组DNA通过与组蛋白缠绕形成核小体,并经过螺旋折叠等方式盘绕形成染色体进而团聚于直径10微米的细胞核中。在细胞内的DNA需要进行转录等活动的时候,DNA才会从组蛋白中释放出来,裸露出需要与转录因子结合的位点从而便于转录,染色质的这种特性叫做染色质可及性,暴露的区域被

血液的化学检验项目红细胞染色质小体介绍

红细胞染色质小体介绍:  该细胞中含有紫红色圆形小体,大小不等,数量不一。此小体可能是幼红细胞在核分裂过程中出现的一种异常染色质,或是核染色质的残留部分。常见于溶血性贫血、巨幼红细胞性贫血、脾切除术后、红白血病或其他增生性贫血。红细胞染色质小体正常值:  无(阴性)。红细胞染色质小体临床意义:  异

临床化学检查方法介绍红细胞染色质小体介绍

红细胞染色质小体介绍:  该细胞中含有紫红色圆形小体,大小不等,数量不一。此小体可能是幼红细胞在核分裂过程中出现的一种异常染色质,或是核染色质的残留部分。常见于溶血性贫血、巨幼红细胞性贫血、脾切除术后、红白血病或其他增生性贫血。红细胞染色质小体正常值:  无(阴性)。红细胞染色质小体临床意义:  异

Cell-Stem-Cell:细胞命运变化中染色质开关规律

  信息时代是计算机语言的二进制码(0-1)驱动的,0与1二进制演绎出丰富多彩的虚拟世界,包括热门的人工智能AI。那么,生命科学是否也存在类似的0-1二进制规律的密码?  中国科学院广州生物医药与健康研究院裴端卿、陈捷凯课题组通过对干细胞命运诱导过程的研究,发现细胞命运转换也遵循一个二进制规律。科学

冷冻细胞精准减薄技术路线:细胞原位研究新进展

  细胞内部的纳米机器与超微结构是参与生命活动的基本单元,通过彼此之间的紧密协作执行特定的生理功能。在细胞原位研究这些复杂精密的纳米结构的组装与功能是生命科学的前沿热点。冷冻电子断层扫描成像(cryo-ET)是目前主要的原位结构解析技术,但受电子束穿透能力限制,需要利用聚焦离子束将细胞和组织样品减薄

复旦大学细胞免疫治疗临床研究中心揭牌

  2月5日下午,中国科学院院士、复旦大学校长、复旦大学上海医学院院长金力与浦东新区副区长张娣芳一起,在上海市浦东医院(复旦大学附属浦东医院),为复旦大学细胞免疫治疗临床研究中心揭牌。至此,浦东医院依托复旦大学已经成立了三大中心,即复旦大学大动物实验中心、复旦大学上海医学院药物临床研究(浦东)中心以

复旦大学细胞免疫治疗临床研究中心揭牌

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517284.shtm2月5日下午,中国科学院院士、复旦大学校长、复旦大学上海医学院院长金力与浦东新区副区长张娣芳一起,在上海市浦东医院(复旦大学附属浦东医院),为复旦大学细胞免疫治疗临床研究中心揭牌。至此

复旦大学PNAS新文章解析癌干细胞标记物

  来自复旦大学医学院、山东大学等处的研究人员在新研究中,探讨了癌干细胞标记物CD133在神经胶质瘤行为中的基本作用,揭示出一个CD133/PI3K/Akt信号轴,证实其促进了神经胶质瘤干细胞的致瘤能力。相关研究论文发表在4月8日的《美国科学院院刊》(PNAS)上。   论文的通讯作者是复旦大学医

间接原位PCR(原位杂交PCR)

与直接原位PCR所不同的是,靶基因在扩增时不进行标记基团的掺入,而是标记一段与扩增片段互补的探针,在扩增结束后,应用此探针进行原位杂交。因此,此处主要介绍原位杂交,其余方法同原位PCR。实验材料组织或细胞样品试剂、试剂盒SSC硫酸葡聚糖甲酰胺脱脂奶粉Denhardt’s 液SDS变性的鲑鱼精DNAR

间接原位PCR(原位杂交PCR)

间接原位PCR(原位杂交PCR)             实验材料 组织或细胞样品 试剂、试剂盒

间接原位PCR(原位杂交PCR)

与直接原位PCR所不同的是,靶基因在扩增时不进行标记基团的掺入,而是标记一段与扩增片段互补的探针,在扩增结束后,应用此探针进行原位杂交。因此,此处主要介绍原位杂交,其余方法同原位PCR。一、预杂交1. 试剂与配制2×SSC50%去离子甲酰胺:用4×SSC配制(v/v)预杂交液:2×SSC,5%硫酸葡

常染色质与异染色质的功能差异

常染色质区域的基因可以被转录为信使RNA。常染色质区域非折叠的结构允许基因调控蛋白和RNA聚合酶与其上的DNA序列结合,从而开启转录过程。在转录过程中,并非所有的常染色质都会被转录,但基本上非转录的部分会折叠为异染色质以保护暂时其上不用的基因。因此细胞的活性与细胞核中的常染色质数目有直接关系。常染色

异染色质和常染色质的结构差异

染色质可以分为两种类群,异染色质和常染色质。最开始,这两种形式是通过其在染色之后的颜色深浅区分的,常染色质一般着色较浅,而异染色质着色很深,表明其紧密聚集。异染色质通常集中在细胞核的边缘区域。然而,不同于这种早期的二分法,最近的研究表明在动物和植物体内都拥有不止这两种染色体结构,可能会有四到五种,区

原位鉴定细胞或组织内生物大分子

原位鉴定细胞或组织内生物大分子、观察细胞及亚细胞形态结构:检测核酸、检测蛋白质细胞定位、检测细胞凋亡、细胞器的观察及测定、检测细胞融合、观察细胞骨架、检测细胞间缝隙连接通讯、检测细胞内脂肪;

我国科学家发现新冠患者T细胞变化机制

   上海市公共卫生临床中心教授卢洪洲、周晓辉传染病医学科研团队,应用国际先进的单细胞转录组测序技术和单细胞染色质可及性分析技术,揭密了新冠患者体内T细胞特性和变化规律,他们剖析了入组的新冠重症、危重患者,普通型患者和健康志愿者(共3组)的外周血T细胞的表观遗传特征和免疫转录图谱,并对数据进行分析后