ASHG2017|基因组中的大片段重复让人类与众不同
美国人类遗传学协会(ASHG)2017年会于本周在佛罗里达州奥兰多举行。这是遗传学界的一大盛事,每年吸引数千名科学家参加。在会议上,他们介绍遗传学各个方面的研究进展。 10月17日,加州大学戴维斯分校的Paulina Carmona-Mora介绍称,人类基因组中的大片段非编码DNA的重复可能造成人类与非人灵长类动物之间的差异。鉴定这些重复及其对性状和行为的影响,也许有助于解释遗传对人类疾病的贡献。 Paulina Carmona-Mora、Megan Dennis博士及其同事研究了人类特异重复(HSD)的历史,这些超过1,000 bp的DNA片段在人类中重复出现,而灵长类动物或其他动物却没有。在这项研究中,他们重点关注不编码基因但调控其他基因表达的HSD区域。 “这些调控元件的独特之处在于,它们往往影响同一染色体上附近基因以及基因组中其他区域的表达,”Dennis博士说。“这意味着一个重复可能影响许多基因,扩大其影响。......阅读全文
中科院植物所阐明重复基因表达分化分子机制
中国科学院植物研究所孔宏智研究组对重复基因表达分化的模式、过程和机制进行了研究,并取得重要突破。相关论文日前在线发表于《植物生理学》。 研究人员以拟南芥中的APETALA1(AP1)和CAULIFLOWER(CAL)基因为例进行了研究,这两种基因在表达的时、空、量上均有差异,且差异与其调控区一
Science:新研究揭示短串联重复序列如何影响基因表达
几十年来,科学家们已经知道,“垃圾 DNA(junk DNA)”实际上起着至关重要的作用:尽管基因组中的蛋白编码基因提供了构建蛋白的蓝图,但是基因组中的一些非编码部分,包括以前被认为是 “垃圾DNA”的基因组区域,似乎可以提高或降低这些基因的表达。但人们一直不清楚某些非编码区域如何影响基因表达水
遗传发育所等发现植物重复基因对的进化规律和机制
全基因组重复事件是生物界中的一个普遍现象,目前在很多物种中都有报道。重复基因对的功能分化是植物产生新基因的来源,为植物基因组进化注入新的动力,但是目前重复基因对的进化规律和机制并不是十分清晰。 为了研究重复基因对的进化机制,中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜课题组与美国普渡大学教授马渐新以
真核基因组的中度重复顺序—KpnⅠ家族的基本介绍
KpnⅠ家族是中度重复顺序中仅次于Alu家族的第二大家族。用限制性内切酶KpnⅠ消化人类及其它灵长类动物的DNA,在电泳谱上可以看到4个不同长度的片段,分别为1.2,1.5,1.8和1.9kb,这就是所谓的KpnⅠ家族。KpnⅠ家族成员顺序比Alu家族更长(如人KpnⅠ顺序长6.4kb),而且更
ASHG-2017-|-基因组中的大片段重复让人类与众不同
美国人类遗传学协会(ASHG)2017年会于本周在佛罗里达州奥兰多举行。这是遗传学界的一大盛事,每年吸引数千名科学家参加。在会议上,他们介绍遗传学各个方面的研究进展。 10月17日,加州大学戴维斯分校的Paulina Carmona-Mora介绍称,人类基因组中的大片段非编码DNA的重复可能造
动物中DNA转座子通过两种机制介导基因重复
转座子被认为是宿主基因组演化的重要推动力。其类型众多,包含non-LTR(Long Terminal Repeat)型逆转座子、LTR型逆转座子、Helitron型DNA转座子、TIR(Terminal Inverted Repeat)型DNA转座子等,可引起包含基因重复(gene duplic
研究揭示苔藓植物古多倍化历史及重复基因保留特征
藓类植物,作为陆地植物早期演化中的重要分支,在陆地植物的演化谱系中占有重要位置,但是学界对该类群本身演化历史的研究有限.此前,科学家研究对植物基因组发现,古多倍化事件广泛存在于种子植物和蕨类植物类群中,且此类事件多伴随植物类群的迅速扩张和对古气候剧烈变化的适应.然而,在过去四亿多年的演化历史中,
南京农大构建世界首个植物重复基因数据库
图片说明:植物界不同类型重复基因含量分布及其随时间变化规律 2月21日,南京农业大学园艺学院教授张绍铃团队在国际著名学术期刊Genome Biology在线发表研究论文,系统鉴定了梨等141种植物基因组中不同类型重复基因,构建世界首个植物重复基因数据库,揭示重复基因进化的普遍规律。 植物在千百年
真核基因组的中度重复顺序—Alu家族的基本介绍
Alu家族是哺乳动物包括人基因组中含量最丰富的一种中度重复顺序家族,在单倍体人基因组中重复达30万-50万次,约占人基因组的3-6%。Alu家族每个成员的长度约300bp,由于每个单位长度中有一个限制性内切酶Alu的切点(AG↓CT)从而将其切成长130和170bp的两段,因而定名为Alu序列(
重复感染的特点
重复感染(superinfection)是指感染尚在进行中,同一种病原体再度侵袭而又感染。
如何诊断重复肾?
1.如无异位开口及并发症,常无症状,不易发现。 2.如女性患者有正常排尿,兼有尿失禁,应考虑输尿管异位开口而作进一步检查。 3.膀胱镜检查在完全型者常可看到患侧多一个输尿管口,位于外上方的常是低位肾盂来的输尿管。 4.静脉尿路造影,如重复肾有功能,造影时可显示两个肾盂肾盏;如无功能,则仅显
日科学家发现物种重复基因越多-适应环境能力越强
一些物种适应能力非常强,一些物种到了陌生环境则很难生存。日本东北大学研究人员发现,这可能与它们体内重复基因的个数有关:重复基因越多的物种,生存和适应能力就越强,分布范围也更广。 东北大学研究生院生命科学研究科的新闻公报说,一个基因拷贝形成两个基因称作基因的重复,重复形成的基因则称作重复基因
真核基因组的中度重复顺序的长分散片段介绍
(Long interspersed repeated segments, LINES)这类重复顺序的长度大于1000bp,平均长度为3500-5000bp,它们与平均长度为13000bp(个别长几万bp)的单拷贝顺序间隔排列。也有的实验显示人基因组中所有LINES之间的平均距离为2.2kb,拷
真核基因组的中度重复顺序—多聚家族的基本介绍
多聚家族的基本单位是dT-dG双核苷酸,多个dT-dG双核苷酸串联重复在一起,分散于人体基因组中。已经发现,这个家族的一个成员位于人类δ和β珠蛋白基因之间,含有17个dT-dG双核苷酸组成的串联重复顺序。在人基因组中,dT-dG交替顺序达106拷贝,这些顺序的平均长度为40bp。人们推测,这样一
体内基因疗法可重复给药?一项临床数据表示“可以”
·Intellia在新闻稿中称,这是显示体内CRISPR/Cas9基因编辑疗法可有效重复给药的首个临床数据,表明体内基因编辑重复给药完成概念验证。NTLA-2001并无针对转甲状腺素蛋白淀粉样变性的重复给药计划,但这些数据表明体内基因编辑可以在必要时重复给药用于治疗其他疾病。目前,大多数CRISPR
揭示重复序列对三维基因组区隔化的调控作用
Cell Research | 沈晓骅/孙育杰课题组合作揭示重复序列对三维基因组区隔化的调控作用 哺乳动物基因组DNA全长近2 m,经过多层有序组织与折叠后分布于直径5-10 μm的细胞核中。染色质高级结构对基因表达,细胞分化和胚胎发育起着至关重要的作用。其中,基因组A/B区隔化(A/B c
什么是重复子?
中文名称重复子英文名称duplicon定 义发生重复性畸变的染色体所具有的最小重复单位。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
高度重复DNA的定义
中文名称高度重复DNA英文名称highly repetitive DNA;hyperreiterated DNA定 义真核生物基因组中存在的拷贝数可达数千以上的短核苷酸重复序列,不负责编码蛋白质或RNA,它们在基因组中发挥着各种不同的功能。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级
低度重复DNA的结构
中文名称低度重复DNA英文名称lowly repetitive DNA定 义在单倍体基因组中含1至10个拷贝的重复DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
小肠重复畸形的诊断
患儿多因肠梗阻、消化道出血或腹膜炎来就诊。患儿反复腹痛、便血、腹部包块或原因不明的肠梗阻考虑肠道重复畸形。钡餐检查或钡剂灌肠可显示肠腔有钡剂充盈缺损,或肠壁有受压切迹。有时钡剂进入异常囊腔,显示其形状、部位和范围,正常肠管受压移位。B超也能判断重复畸形的部位、大小和性质,了解囊肿内有无分泌物充盈
串联重复[序列]的定义
中文名称串联重复[序列]英文名称tandem repeat定 义首尾相连的重复序列。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
简单重复序列的概念
简单重复序列(Simple Sequence Repeat,简称SSR),是指重复单位长度和碱基组成基本一致,只 有少数基因出现微小的差异的一类短串联重复序列。
高度重复序列的概念
高度重复序列是一组基因序列,在基因组中重复频率高,可达百万(10^6)以上,因此复性速度很快。在基因组中所占比例随种属而异,约占10-60%,在人基因组中约占20%。
Alu重复序列的概念
中文名称Alu重复序列英文名称Alu repetitive sequence;Alu family定 义哺乳动物和人基因组中的一种中等重复序列,因该序列中有限制性内切酶Alu的切点而得名。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
细胞化学词汇重复DNA
中文名称:重复DNA英文名称:repetitive DNA定 义:真核生物染色体基因组中含有不同拷贝数的核苷酸序列。这些序列一般不编码多肽,在基因组内可成簇排布,也可散布于基因组。按序列的重复程度和特点可分为低度重复DNA、中度重复DNA和高度重复DNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科)
顶级癌症论文能否重复?
2013年10月,Richard Young收到了一封措辞礼貌,但态度强硬的邮件。寄信人是“调查癌症生物学领域近期一些论文可重复性的研究者团队”中的一员。Young是麻省理工学院(Massachusetts Institute of Technology)的生物学家,他于2012年在《细胞》(C
中度重复DNA的定义
中文名称中度重复DNA英文名称middle repetitive DNA;moderately repetitive DNA定 义在真核细胞中存在的,以含有大量拷贝的不同核苷酸序列为特征的重复DNA的一种,其重复度为10个至几千个,通常占整个单倍体基因组的1%~30%。如核糖体核糖核酸(rRNA)
顶级癌症论文能否重复?
2013年10月,Richard Young收到了一封措辞礼貌,但态度强硬的邮件。寄信人是“调查癌症生物学领域近期一些论文可重复性的研究者团队”中的一员。Young是麻省理工学院(Massachusetts Institute of Technology)的生物学家,他于2012年在《细胞》(C
反向重复[序列]的定义
存在于双链核酸分子中排列顺序方向相反的一段核苷酸序列。
低度重复序列的概念
低度重复序列在单倍体基因组中只出现一次或数次,因而复性速度很慢。单拷贝顺序在基因组中占50-80%,如人基因组中,大约有60-65%的顺序属于这一类。单拷贝顺序中储存了巨大的遗传信息,编码各种不同功能的蛋白质。尚不清楚单拷贝基因的确切数字,但是是有其在单拷贝顺序中只有一小部份用来编码各种蛋白质,其他