PLoSNeglTropDis:蚊子tRNA片段帮助其扩散疾病
2018年1月25日,tRNA是负责蛋白合成的关键原件,而根据最近发表在《PLOS Neglected Tropical Diseases》杂志上的一篇文章,转运RNA片段(tRNA fragments)对于蚊子来说有着另外的作用。 很多种不同类型的RNA分子,包括microRNA,siRNA以及最近发现的tRF分子,对于健康与疾病都有重要的意义。它们能够直接与DNA以及RNA分子相互作用,调节其基因表达或者影响RNA的稳定性。 (图片来源:Susanta K. Behura, 2018) 在这项研究中,来自Missouri大学的Susanta K. Behura等人研究了tRF在Ae. aegypti蚊子(传播多种疾病,包括登革热、黄热病等的传播媒介)中的表达丰度。结果显示,蚊子体内存在55种不同类型的tRF的表达,每一种都来源于独特类型的tRNA分子。其中31种分子的表达量存在性别差异,两种tRF分子存在不同发育阶......阅读全文
复旦大学揭示-DNAzyme-剪切-RNA-分子机制
国际知名学术期刊《自然·通讯》(Nature Communications)日前在线 发表 了复旦大学生命科学学院、遗传工程国家重点实验室甘建华课题组与麻锦彪课题组合作的关于 RNA-cleaving DNAzyme 的研究成果。该研究用 X -射线晶体学方法解析了 8 -17 DNAzyme
探索小分子RNA-OsmiR393调节水稻分蘖、耐旱的分子机制
华南植物园探索小分子RNA OsmiR393调节水稻分蘖、耐旱的分子机制 小分子RNA(MicroRNA)是一类内源非编码的单链小分子RNA(21~24nt),以序列特异性的方式在转录、转录后和翻译水平上对靶基因表达进行调控,是生物体内基因表达自我调控的一种重要手段。miR3
新发现RNA分子可令免疫适时“退兵”
26日,《细胞》杂志发表了中国工程院院士、中国医学科学院原院长、南开大学校长曹雪涛团队的研究论文,报道了该团队在机体中发现识别“自我”和“非我(病毒)”的精巧辨别机关,能反馈性地触发消炎效应、控制抗病毒免疫炎性反应的高效适度适时,这个机关的“核心”是一种全新发现的RNA分子。 病毒潜入人体,触
分子杂交RNA探针的技术特点及应用介绍
在DNA序列未知而必须首先进行克隆以便绘制酶谱和测序时,也常应用克隆。克隆探针一般较寡核苷酸探针特异性强,复杂度也高,从统计学角度而言,较长的序列随机碰撞互补序列的机会较短序列少,克隆探针的另一优点是,可获得较强的杂交信号,因为克隆探针较寡核苷酸探针掺入的可检测标记基因更多。但是,较长的探针对于靶序
RNA干涉实验——采用RNaseⅢ制备siRNA分子实验
实验方法原理首先在体外以长为 200~1000 bp 的 cDNA 为模板转录合成正义与反义的单链 RNA 分子,然后通过退火形成长的 dsRNA 分子,再用Diccr 核酸酶进行切割得到 siRNA 分子的混合物,通过纯化去除没有被切割的双链 RNA 分子和 DNA 模板以后,siRNA 分子就可
小条件性RNA分子可让癌细胞自我毁灭
如果癌症治疗能像计算机程序那样,根据条件执行任务,结果会怎样呢?物理学家组织网近日报道,加州理工学院的研究人员开发出一种小条件性RNA(核糖核酸)分子,它可以按照“如果……只有……才……”的逻辑命令来杀死变异细胞,极大程度地减轻了癌症治疗的副作用,研究论文发表在9月6日的美国《国家
分子杂交RNA探针的技术特点及应用介绍
RNA探针是一类很有前途的核酸探针,由于RNA是单链分子,所以它与靶序列的杂交反应效率极高。早期采用的RNA探针是细胞mRNA探针和病毒RNA探针,这些RNA是在细胞基因转录或病毒复制过程中得到标记的,标记效率往往不高,且受到多种因素的制约。这类RNA探针主要用于研究目的,而不是用于检测。例如,在筛
关键非编码RNA分子促进皮肤癌恶化
在最近一项研究中,图尔库大学中心医院和西方癌症中心(FICAN West)的研究人员发现了一种新的RNA分子PRECSIT,它参与调节了皮肤鳞状细胞癌的生长和侵袭过程。将来,PRECSIT可能会成为检测快速进展或扩散的鳞状细胞癌的新标志物,以及有可能成为新疗法的靶标。 皮肤癌是世界上最常见的癌
单细胞测序,解密小RNA分子的未知功能
随着科研人员对各种遗传疾病和癌症的深入挖掘,单细胞基因组方法捕获的信息变得越来越重要。卡罗林斯卡学院( Karolinska Institute)的研究人员近日公布了一种新方法,这种方法可以读取个体胚胎干细胞中短的、非编码RNA序列,有助于人们更好地理解基因如何调控不同细胞类型的发展。相关结
水生所非编码RNA分子机制研究取得进展
非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)是指不能编码产生蛋白质的RNA分子,种类众多。具有调控作用的非编码RNA包括微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)以及环状RNA(circRNA)等。越来越多的研究表明,非编码RNA具有重要且复杂的生物学功能。中国科学
Journal-of-Neurosci:微小RNA分子调节应激的行为反应
慢性压力会影响我们的情绪和行为。神经精神科和行为神经遗传学的科学家们研究了大脑如何响应应激的分子机制。对于第一次,他们可以将应力相关的脑区域中微小RNA分子miR19b水平的变化,与小鼠异常行为联系起来。这些发现有助于更好地了解我们的大脑应对压力的办法。 各地阿龙Alon Chen陈导演的“马
分子细胞卓越中心等发现RNA互补抑制Cas13活性的分子机制
近日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)研究员杨荟研究组、美国纪念斯隆凯特琳癌症中心教授Dinshaw J. Patel研究组和分子细胞卓越中心研究员丁建平研究组合作,在Molecular Cell上,在线发表了题为Structural basis for self
用-T4-DNA连接酶连接RNA分子
实验材料 T4DNA 连接酶 T4 多聚核酸激酶 RNA 供体 受体 寡核苷酸 cDNA 模板试剂、试剂盒 10X 连接缓冲液 [Y32P]ATP 无 RNase 水 l0 mmol LATP RNasin。 无 RNase 的 DNase。 5XTBE 2X 变性胶上样缓冲液 TE仪器、耗材 真空
分子细胞卓越中心发表关于环形RNA的综述文章
5月17日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲团队在Cell上,在线发表了题为Circular RNAs: characterization, cellular roles and applications的综述论文。该论文系统梳理了针对环形RNA研究的生物学技术手段,总结了其以非编码RN
Nat-Commun:基于RNA分子的新型疗法有望治疗肺癌
近日,一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自瑞典的科学家们表示,通过降低特殊RNA分子的活性就能使得小鼠肺部肿瘤缩小40%至50%,这或许是研究中的冰山一角,此外研究人员还从14类不同癌症中鉴别出了633个新型的生物标志物。图片来源于网络 文章中,研究
RNA干涉实验——体外转录合成siRNA分子实验
实验方法原理采用噬菌体 RNA 聚合酶(T7、T3 或 SP6 RNA 聚合酶)可以很方便地在体外合成 siRNA 分子的正义与反义 RNA 链,然后再通过退火形成双链的 siRNA 分子。体外转录合成 siRNA 分子与化学合成双链 RNA 分子相比,其成本相对要低得多,而且有研究报道前者对靶基因
清华大学张雅鸥教授:癌症小分子RNA
来自清华大学生科院,深圳研究生院,加拿大多伦多大学的研究人员分析了一种重要的癌症相关小分子RNA:miR-210在细胞周期调控中靶基因,从中发现了一系列的靶基因,并深入分析了miR-210对有丝分裂的影响,指出miR-210能干扰有丝分裂过程,这也许解释了其对肿瘤形成的抑制作用。相关成果公布在N
叶绿体核糖体RNA加工分子机制研究获进展
RNA操作是目前研究的热点之一。要实现精确的RNA操作,需要特异地识别靶向目标RNA分子并对其进行剪切。但到目前为止,这类序列特异的RNA内切酶在自然界中还没有被发现。因此,寻找一类序列特异的RNA内切酶显得尤为重要。中科院植物研究所卢从明研究组日前在相关领域取得进展,相关论文2月6日在线发表于
新型工具在细胞中发现大量新的RNA亚型分子
从指甲到眉毛,基因组是机体所有部分的“总体规划”,但并不仅仅是蓝图决定建造什么,所有根据蓝图绘制指令的细胞成员都会在设计中加入自己的解释,而如今研究人员在不断发现新的成员;近日,一项刊登在国际杂志PLoS Genetics上的研究报告中,来自托马斯杰斐逊大学等机构的科学家们通过研究利用他们所开发
Nature:小分子RNA调控免疫系统抗击乳腺癌
日前,英国科学家在《自然》杂志上发表论文称,人体自身免疫系统对抗乳腺癌是由小分子RNA控制,后者对不同乳腺癌亚型的影响是不一样的。 此前剑桥大学在2012年发表的一项研究表明,乳腺癌可以细分成十个不同的遗传亚型,此后研究人员一直在寻找这些不同类型乳腺癌与小分子RNA行为模式之间的关系。
急性骨髓性白血病小分子RNA疗法效果初显
4月26日发表在英国《自然·通讯》杂志上的一则生物学研究显示,携带有一类可调控基因表达的非编码RNA小分子miR-22的纳米颗粒,对于急性骨髓性白血病的小鼠模型显示出一定的治疗潜力。 急性骨髓性白血病是一种血细胞癌症,特点是骨髓内异常细胞的快速增殖影响了正常血细胞的产生。这是成年人最常见的急
急性骨髓性白血病小分子RNA疗法效果初显
26日发表在英国《自然·通讯》杂志上的一则生物学研究显示,携带有一类可调控基因表达的非编码RNA小分子miR-22的纳米颗粒,对于急性骨髓性白血病的小鼠模型显示出一定的治疗潜力。 急性骨髓性白血病是一种血细胞癌症,特点是骨髓内异常细胞的快速增殖影响了正常血细胞的产生。这是成年人最常见的急性白血
研究揭示环形RNA促进相分离调控肿瘤发展分子机制
环形RNA是由pre-mRNA通过反向剪接形成的闭合环状RNA分子,在生物体内可发挥miRNA海绵、结合蛋白以及翻译成短肽等分子功能来调控各种生理和病理过程。与线性mRNA相比,环形RNA独特的环状结构使其具有更高的稳定性,在细胞内可更稳定地存在。因此,环形RNA更适合作为肿瘤的分子标志物及治疗
3.6.1-用-T4-DNA连接酶连接RNA分子
T4 DNA 连接酶可将双链复合物缺刻连接,其中包括 RNA-DNA 杂合链及 RNA-RNA 杂合链。实验材料T4DNA 连接酶T4 多聚核酸激酶RNA 供体受体寡核苷酸 cDNA 模板试剂、试剂盒10X 连接缓冲液[Y32P]ATP无 RNase 水l0 mmol LATPRNasin。无 RN
分子实验方法4:RNA的提取和cDNA合成
第一节 概 述 从真核生物的组织或细胞中提取mRNA,通过酶促反应逆转录合成cDNA的第一链和第二链,将双链cDNA和载体连接,然后转化扩增, 即可获得cDNA文库,构建的cDNA文库可用于真核生物基因的结构、表达和调控的分析;比较cDNA和相应基因组DNA序列差异可确定内含子存在和了解转录后加工
研究揭示锌指抗病毒蛋白ZAP识别RNA的分子机制
锌指抗病毒蛋白(Zinc-finger Antiviral protein,ZAP)是一种由宿主编码的重要抗病毒因子,ZAP特异能够抑制包括小鼠白血病病毒、艾滋病病毒、埃博拉病毒等在内的多种病毒复制。ZAP特异结合病毒的靶RNA序列,干扰靶mRNA的翻译起始。而ZAP识别RNA的序列特征和作用分
俄罗斯科学家绘制出小分子RNA完整基因图
俄罗斯科学院普通基因研究所与莫斯科物理技术学院联合课题组共同绘制了人和鼠的小分子RNA完整基因图,相关成果刊登在《Nature Biotechnology》科学期刊上。 该课题组研发出专门的算法,不仅可用于寻找新型小分子RNA,而且还可确定不同组织上小分子RNA的活性。课题组收集和分析了人和
研究揭示锌指抗病毒蛋白ZAP识别RNA的分子机制
2020年1月7日,Cell Reports 杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所高璞课题组与高光侠课题组合作的研究论文“Molecular Mechanism of RNA Recognition by Zinc-finger Antiviral protein”。该研究工作解析了锌指抗病毒
NA--RNA-寡聚核苷酸的准确分子质量测定(三)
与低分辨的实验相比,在保持上样量和色谱条件不变的前提下,仅仅改变质谱采集的分辨率,可以看到寡聚核苷酸的色谱保留时间不变,基本在 3.52 min 出峰,不过随着质谱检测器分辨率的提高,原始质谱图发生了显著的变化,如下所示,当使用线性离子阱 LTQ 作为质量检测器时,只检测到一个大包峰,无法分
DNA--RNA-寡聚核苷酸的准确分子质量测定(一)
1. 前言随着人们对核酸结构和功能的深入了解,特异性结合或者裂解致病基因的核酸药物也逐渐成为了药物研究的新热点, 核酸药物的作用效率高、应用范围广,可以对传统药物进行补充,并且在前期的临床诊断中也可以起到重要的指示作用。核酸药物主要是指各种具有不同功能的寡聚核糖核苷酸(RNA)或者寡聚脱氧核糖核