研究揭示环形RNA促进相分离调控肿瘤发展分子机制
环形RNA是由pre-mRNA通过反向剪接形成的闭合环状RNA分子,在生物体内可发挥miRNA海绵、结合蛋白以及翻译成短肽等分子功能来调控各种生理和病理过程。与线性mRNA相比,环形RNA独特的环状结构使其具有更高的稳定性,在细胞内可更稳定地存在。因此,环形RNA更适合作为肿瘤的分子标志物及治疗靶点。目前,大部分环形RNA在肿瘤发生发展中的具体调控功能与分子机制还有待深入研究。 近日,中国科学院北京生命科学研究院研究员赵方庆团队在Advanced Science上发表题为circVAMP3 drives CAPRIN1 phase separation and inhibits hepatocellular carcinoma by suppressing c-Myc translation的研究论文,报道环形RNA circVAMP3通过促进CAPRIN1蛋白相分离,在细胞内形成应激颗粒(stress granules)......阅读全文
研究揭示环形RNA促进相分离调控肿瘤发展分子机制
环形RNA是由pre-mRNA通过反向剪接形成的闭合环状RNA分子,在生物体内可发挥miRNA海绵、结合蛋白以及翻译成短肽等分子功能来调控各种生理和病理过程。与线性mRNA相比,环形RNA独特的环状结构使其具有更高的稳定性,在细胞内可更稳定地存在。因此,环形RNA更适合作为肿瘤的分子标志物及治疗
科学家揭示内含子来源环形RNA新分子及转录调控功能机制
9月27日,国际学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)发表了中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲组与计算生物学所杨力组的最新合作研究论文,发现来源于基因内含子区域的环形RNA新分子,揭示其成环机制及在基因转录调控中的重要功能。 众所周知,人类基因组中存
分子细胞卓越中心发表关于环形RNA的综述文章
5月17日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲团队在Cell上,在线发表了题为Circular RNAs: characterization, cellular roles and applications的综述论文。该论文系统梳理了针对环形RNA研究的生物学技术手段,总结了其以非编码RN
RNAi(RNA干扰)的分子机制
通过生化和遗传学研究表明,RNA干扰包括起始阶段和效应阶段(inititation and effector steps)。在起始阶段,加入的小分子RNA被切割为21-23核苷酸长的小分子干扰RNA片段(small interfering RNAs, siRNAs)。证据表明;一个称为Dic
环形RNA获新研究进展
9月18日,国际著名学术期刊《细胞》在线发表了中科院上海生命科学研究院计算生物学伙伴研究所杨力课题组和生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲课题组关于环形RNA研究的最新进展。该研究成果首次阐明了互补序列对外显子来源环形RNA产生的调节机制,并进一步揭示了互补序列竞争性配对介导的可变环化调控,以全新的
RNA干扰的分子机制首次被发现
日本东京大学官网近日宣布,东京大学和京都大学研究人员发现了核糖核酸干扰(RNAi)的分子机制。所谓核糖核酸干扰,就是单分子RNA分裂时出现的某种蛋白质合成受到抑制的现象。 由于借助RNAi可以关闭特定基因的表达,科学家一直期待RNAi现象在医疗领域得到应用。在先前研究中,科学家已经发现RNAi
复旦大学揭示-DNAzyme-剪切-RNA-分子机制
国际知名学术期刊《自然·通讯》(Nature Communications)日前在线 发表 了复旦大学生命科学学院、遗传工程国家重点实验室甘建华课题组与麻锦彪课题组合作的关于 RNA-cleaving DNAzyme 的研究成果。该研究用 X -射线晶体学方法解析了 8 -17 DNAzyme
环形RNA与线性RNA定量比较分析新系统CLEAR发布
1月15日,国际学术期刊Genomics,Proteomics & Bioinformatics在线发表了中国科学院-德国马普计算生物学伙伴研究所杨力研究组关于环形RNA研究的最新进展“CIRCexplorer3: A CLEAR Pipeline for Direct Comparison o
肿瘤免疫监测的细胞和分子机制
人体免疫系统对恶性细胞的排斥与人体内病原微生物感染的免疫反应大致相同,需要先天免疫和获得性免疫的结合。先天免疫效应的激活和放大可导致肿瘤细胞死亡,从而释放大量肿瘤抗原。相关研究证实获得性免疫具有重要的抗肿瘤作用。由此可见,先天免疫和获得性免疫的协同作用可以监测人体内的肿瘤免疫。临床证据表明,当艾滋病
我国科学家发现环形RNA新功能
基因“暗物质”间接参与免疫调节 人类基因“暗物质”环形RNA (核糖核酸)又被“发掘”一项新功能。中科院生物化学与细胞生物学研究所与中科院—马普计算生物学研究所科研人员,合作研究发现了环形RNA及其生成调控过程参与抗病毒免疫反应,为环形RNA的功能和抗病毒免疫相关研究提供了新视角。日前,相关成
林文楚课题组等发现环形RNA具有抑制胃癌转移的新功能
近日,中国科学院合肥物质科学研究院强磁场科学中心林文楚课题组在环形RNA参与胃癌转移研究中取得重要进展,相关研究成果以CircURI1 interacts with hnRNPM to inhibit metastasis by modulating alternative splicing i
水生所非编码RNA分子机制研究取得进展
非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)是指不能编码产生蛋白质的RNA分子,种类众多。具有调控作用的非编码RNA包括微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)以及环状RNA(circRNA)等。越来越多的研究表明,非编码RNA具有重要且复杂的生物学功能。中国科学
研究提出核酸内切酶DIS3介导的环形RNA降解机制
2月17日,《分子细胞》(Molecular Cell)在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲研究组与复旦大学杨力研究组合作完成的关于内源环形RNA降解的最新研究成果。该研究解析了生理条件下环形RNA被核酸内切酶DIS3监控降解的新机制,实现了对环形RNA“生老病死”过程中特异调控及
Front-Oncol:抑制肿瘤扩散的新型分子机制
为何有些癌症患者的疾病会发生转移,而其他患者则不会?这一点在很大程度上研究人员并不清楚。近日,一篇发表在国际杂志Frontiers in Oncology上题为“The Solute Carrier MFSD1 Decreases the Activation Status of β1 Inte
科学家揭示肿瘤细胞迁移分子机制
中科院生物物理所阎锡蕴课题组与中科院动物所刘峰小组合作发现,细胞黏附分子CD146作为Wnt5a的受体,激活了非经典Wnt通路,从而促进肿瘤细胞的迁移。相关成果日前发表于《自然―通讯》杂志。 自阎锡蕴课题组首次报道CD146是肿瘤血管新靶点以来,CD146已逐渐成为肿瘤靶向治疗领域
揭示RNA-m6A修饰调控抗肿瘤免疫机制
免疫治疗是对抗肿瘤的前沿阵地,其治疗成功的关键是引发针对肿瘤抗原的自发性T细胞反应。许多病人的免疫系统无法有效识别肿瘤抗原,难以引发持续性的T细胞应答并清除肿瘤。研究免疫系统识别肿瘤抗原的分子机制有望发现新型药物靶点,提高免疫治疗效果。 中国科学院北京基因组研究所韩大力团队与清华大学徐萌团队、
小分子RNA
RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”,但越来越多的证据清楚的表明,RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设想的更为重要。RNA 干扰(RNA interference)的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识,更因为可以简化/替代基因敲除而成为研究基因功能的有力工具,
北京生科院发表环形非编码RNA识别新技术
2月28日,国际学术期刊Briefings in Bioinformatics 发表了中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队题为Circular RNA identification based on multiple seed matching 的最新研究成果。因为目前在环形RNA识别方面存
北京生科院提出环形RNA识别的新方法
环形RNA是一类新报道的结构特殊的非编码RNA。近两年的研究发现,环形RNA在动物细胞内广泛存在,且大多位于基因的外显子区域。另有研究表明,少数环形RNA分子可以充当microRNA“海绵”,在转录后水平对基因表达进行调控。然而,目前绝大多数的环形RNA功能仍不明确,科学家们推测其可能与蛋白质及
研究开发出高效环形RNA检测与定量工具
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)高远团队与动物研究所赵方庆团队,开发出面向TB级转录组数据的高效环形RNA检测与定量工具CIRI3,通过反向剪接序列比对与跨样本整合算法设计,实现了TB级数据的超高速处理,并可高灵敏识别低丰度及非传统剪接信号的新型环形RNA,突破了环形RNA大规模
北京生科院提出环形RNA全长转录本解析技术
4月12日,中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-实验手册》(Nature Protocols)上,发表了题为Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究论文,建立了环形RNA全长
环形RNA:从“无名之辈”到“明日之星”
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516892.shtm动植物体内存在种类繁多的环形核糖核酸(circular RNA),其中以反向剪接产生的环形RNA含量最为丰富,因其具有独特的闭环结构,近期引发全世界科学家的关注。在国家自然科学基金重大
科研家提出环形RNA全长转录本解析技术
近日,中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-实验手册》(Nature Protocols)上,发表了题为Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究论文,建立了环形RNA全长转录本解析
科学家首次阐述了环形RNA在细胞受病毒感染时的降解机制
4月25日,国际学术期刊《细胞》(Cell)在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于环形RNA的最新研究进展:Structure and degradation of circular RNAs regulate PKR activation in innate immun
探索小分子RNA-OsmiR393调节水稻分蘖、耐旱的分子机制
华南植物园探索小分子RNA OsmiR393调节水稻分蘖、耐旱的分子机制 小分子RNA(MicroRNA)是一类内源非编码的单链小分子RNA(21~24nt),以序列特异性的方式在转录、转录后和翻译水平上对靶基因表达进行调控,是生物体内基因表达自我调控的一种重要手段。miR3
J-Immunol:IL33抗肿瘤活性分子机制
细胞因子被认为能够通过调节免疫系统进而识别并摧毁癌细胞。目前已经有多种细胞因子被批准作为治疗癌症患者的药物,其中包括Th1型细胞因子(IL-2, IFN-g, TNF-a, and GM-CSF),另外,Th2型细胞因子(IL-4 and IL-13)目前在动物试验中也被证明具有一定的抗肿瘤活性
病毒诱导水稻肿瘤细胞分化轨迹的分子机制
近日,中国农业科学院植物保护研究所作物病毒病害监测与防控创新团队解析了水稻黑条矮缩病毒影响寄主细胞发育进程导致症状形成的机理,相关研究成果发表在《植物生物技术(Plant Biotechnology Journal)》上。植物病毒往往通过改变寄主的细胞分化造成植株矮化、叶片卷曲等病症。然而,病毒如何
研究揭示特殊蛋白调节肿瘤生长的分子机制
免疫检查点是癌细胞表面的特殊蛋白,其能被癌细胞用来躲避宿主机体的免疫反应,这些表面蛋白对于癌细胞的生长非常重要,靶向作用这些蛋白的药物能够彻底改变多种癌症患者的治疗,而阐明降解这些免疫检查点的机制或能帮助宿主机体免疫系统来杀灭癌细胞。 图片来源:CC0 Public Domain 近日,一项
分子细胞卓越中心实现环形RNA适配体在银屑病小鼠模型中的干预治疗
4月23日,《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲研究组完成的关于环形RNA的研究成果(Therapeutic application of circular RNA aptamers in a mouse model o
北京生科院在环形RNA研究领域取得新进展
6月28日,国际学术期刊Nature Communications 在线发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组实验室赵方庆团队题为Comprehensive identification of internal structure and alternative splicing even