RNA干涉实验——采用RNaseⅢ制备siRNA分子实验
实验方法原理首先在体外以长为 200~1000 bp 的 cDNA 为模板转录合成正义与反义的单链 RNA 分子,然后通过退火形成长的 dsRNA 分子,再用Diccr 核酸酶进行切割得到 siRNA 分子的混合物,通过纯化去除没有被切割的双链 RNA 分子和 DNA 模板以后,siRNA 分子就可以用于转染细胞。由于在混合液中含有大量的以目的基因不同位点为靶的 siRNA 分子,因此可以获得对靶基因的高效抑制效果。实验材料DNA 寡核苷酸靶基因 cDNADicer 酶蛋白酶 K试剂、试剂盒DNase Ⅰ单链特异性的 RNase反应缓冲液EDTA水饱和酚氯仿异戊醇仪器、耗材T7 RNA 体外转录试剂盒聚丙烯酰胺凝胶电泳装置实验步骤一、材料与设备1. 合成的 DNA 寡核苷酸。2. 靶基因 cDNA。3. T7 RNA 体外转录试剂盒(Promega 公司)。4. DNase Ⅰ 和单链特异性的 RNase。5. 重组的 Dice......阅读全文
RNA干涉实验——采用RNaseⅢ制备siRNA分子实验
实验方法原理首先在体外以长为 200~1000 bp 的 cDNA 为模板转录合成正义与反义的单链 RNA 分子,然后通过退火形成长的 dsRNA 分子,再用Diccr 核酸酶进行切割得到 siRNA 分子的混合物,通过纯化去除没有被切割的双链 RNA 分子和 DNA 模板以后,siRNA 分子就可
RNA干涉实验——采用RNA聚合酶Ⅲ启动子表达siRNA分子
实验方法原理因为哺乳动物细胞不具备低等真核生物细胞所具有的扩增 RNAi 信号的机制,因此人工合成或体外转录的 siRNA 分子在细胞内的作用是瞬时性的,不适合用于进行靶基因的表达受到抑制后细胞表型的长期变化观察,也不适于进行文库的筛选。此外,体外制备 siRNA 分子的成本比较高,而且 siRNA
RNA干涉实验——体外转录合成siRNA分子实验
实验方法原理采用噬菌体 RNA 聚合酶(T7、T3 或 SP6 RNA 聚合酶)可以很方便地在体外合成 siRNA 分子的正义与反义 RNA 链,然后再通过退火形成双链的 siRNA 分子。体外转录合成 siRNA 分子与化学合成双链 RNA 分子相比,其成本相对要低得多,而且有研究报道前者对靶基因
RNA干涉实验
RNA 干涉(RNA1) 是指在真核细胞中引入双链 RNA ( doubt-stranded RNA,dsRNA ) 分子从而导致具有序列同源性的基因产生特异件基内沉默(gene silencing ) 的现象。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理当确定了靶基因上的 siRN
RNA干涉实验
实验方法原理 当确定了靶基因上的 siRNA 分子作用位点以后,根据靶位点的序列可以很方便地推导得到相应的 siRNA 分子的正义与反义 RNA 链序列。它们包含 19 bp 的互补双链区和两侧的不配对区(每侧为 2 个 U 成 2 个 T ),在合成时用 T 替代 U 可以降低成本并可以提
RNA干涉实验
化学合成siRNA分子实验 体外转录合成siRNA分子实验 采用RNA聚合酶Ⅲ启动子表达siRNA分子 采用RNaseⅢ制备siRNA分子实验 实验方法
用RNase-Ⅲ-消化长片断双链RNA制备siRNA的方法特点
其他制备siRNA的方法的缺陷是需要设计和检验多个siRNA序列以便找到一个有效的siRNA。而用这种方法——制备一份混合有各种siRNAs “混合鸡尾酒” 就可以避免这个缺陷。选择通常是200—1000碱基的靶mRNA模版,用体外转录的方法制备长片断双链dsRNA ,然后用RNase Ⅲ (or
用RNase-Ⅲ-消化长片断双链RNA制备siRNA的技术特点
其他制备siRNA的方法的缺陷是需要设计和检验多个siRNA序列以便找到一个有效的siRNA。而用这种方法——制备一份混合有各种siRNAs “混合鸡尾酒” 就可以避免这个缺陷。选择通常是200—1000碱基的靶mRNA模版,用体外转录的方法制备长片断双链dsRNA ,然后用RNase Ⅲ (or
用RNase-III制备siRNA库来诱发RNAi(2)
Figure 1. Silencing Gene Targets by RNase III Derived siRNA Cocktails. A 200 bp dsRNA (15 µg) for each gene of interest was digested with 2.5 U RN
用RNase-III制备siRNA库来诱发RNAi(1)
小分子干扰RNA (Small interfering RNA ,siRNA ) 是一种非常有效的工具,能够在包括哺乳动物细胞在内的多个体系中抑制特定基因的表达,从而研究某个基因的功能或者是相关信息。但是这种强有力的方法的难题之一是需要设计,合成siRNA s 和验证其效果,从而找到最有效的
RNA酶保护实验(RNase-Protection-Assay,RPA)简介
简介:RNA酶保护试验(RNase Protection Assay,RPA)是通过液相杂交的方式,用反义RNA探针与样品杂交,以检测RNA表达的技术。1. 原理:双链RNA(杂交的)能够抵抗RNA酶的降解。2. 应用:检测RNA表达3. 与Northern杂交和RT-PCR比较,RPA有以下几个优
RNA酶保护实验(RNase-Protection-Assay,RPA)简介
简介: RNA酶保护试验(RNase Protection Assay,RPA)是通过液相杂交的方式,用反义RNA探针与样品杂交,以检测RNA表达的技术。 1. 原理:双链RNA(杂交的)能够抵抗RNA酶的降解。 2. 应用:检测RNA表达 3. 与Northern杂交和RT-PCR比较
细菌RNA制备实验
实验材料 RNA试剂、试剂盒 STET氯仿乙酸钠氯化铯无水乙醇EDTA仪器、耗材 离心机分光光度计摇床实验步骤 1. 培养100 ml 大肠杆菌或500 ml 蓝细菌至对数生长期,加入1/20体积终止缓冲液,置于冰上。2. 于4℃用JA-10转子17 700 g 离心5 min 收集细胞。3.
细菌RNA制备实验
革兰氏阴性细菌中提取 革兰氏阳性细菌中提取 实验材料 RNA 试
RNAi的实验原理和操作实用技术(1)
几十年来生物学上最重要的进展,也许是关于RNA分子能调节基因表达的发现。RNA干涉(RNAi)是指双链RNA分子使基因表达沉寂的现象,是在线虫中发现的,在 1998年的一篇Nature论文中被公诸于众。此后,科学家们明白,RNAi还有其他形式,它既是一种了解基因功能的强大工具,又是很多生物的基因组所
植物RNA的制备实验
实验材料 RNA试剂、试剂盒 TELiCl无水乙醇乙酸钠氯仿仪器、耗材 匀浆器离心管离心机水浴锅实验步骤 1. 研钵和研棒先用液氮冷却,称出15 g 冻结植物组织于研钵中(加液氮保持冻结)。2. 用研棒磨成粉末,立即转移到一个盛有150 ml,研磨缓冲液和50 ml TLE缓冲液平衡酚的500
反义RNA的制备实验
实验材料 限制性内切核酸酶酶水解 模板 DNA 大肠杆菌 DNA 多聚酶 胰 DNaseⅠ 试剂、试剂盒
poly(A)+-RNA的制备实验
利用cND A微阵列技术可用于:(1)并行分析检测成千上万个基因的表达情况;(2)在新基因的发现、基因组功能的研究、疾病的预测和诊断、药物靶标的确定和药物毒性预测等多方面发挥着重要的作用。实验方法原理大多数的信使RNA(mRNA)都带有poly(A)尾,而结构RNA没有。使用本工作方案,可以将带po
poly(A)+-RNA的制备实验
实验方法原理 大多数的信使RNA(mRNA)都带有poly(A)尾,而结构RNA没有。使用本工作方案,可以将带poly(A)的RNA从rRNA和tRNA中分离出来。 实验材料
反义RNA的制备实验
RNA 也可以由线状 DNA 为模板,通过 RNA 聚合酶(如T3、T7 或 SP6 ) 在体外合成。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验材料限制性内切核酸酶酶水解模板 DNA大肠杆菌 DNA 多聚酶胰 DNaseⅠ试剂、试剂盒氯仿苯酚乙醇DTTrNTP溶液转录缓冲液Tris-Cl盐
poly(A)+-RNA的制备实验
实验材料 RNA试剂、试剂盒 NaOH寡聚脱氧胸苷纤维素poly(A)样品缓冲液LiClEDTATE乙酸钠仪器、耗材 离心机分光光度计摇床实验步骤 1. 先用10 ml 5 mol/l NaOH清洗硅化的层析柱,然后用水冲洗。2. 取0.5 g oligo(dT)纤维素干粉加1 ml 0.1 m
反义RNA的制备实验
实验材料 限制性内切核酸酶酶水解模板 DNA大肠杆菌 DNA 多聚酶胰 DNaseⅠ试剂、试剂盒 氯仿苯酚乙醇DTTrNTP溶液转录缓冲液Tris-Cl盐酸亚精胺NaCl胎盘RNase抑制物牛血清白蛋白RNA聚合酶DEPC仪器、耗材 DNA合成仪琼脂糖凝胶电泳微量离心管实验步骤 一、化学合成的 RN
植物RNA的制备实验
酚/SDS法 实验材料 RNA 试剂、试剂盒
RNase-A/Tl保护和-RNase-H-聚焦法实验
实验方法原理 RNA与互补的 [ 32P ] 标记的探针在溶液中复件后形成的 RNA-RNA 杂合分子对单链专一的 RNase 具有抗性。此法可以对 RNA 分子末端进行定位或对含内含子的交界定位。与 Northern blot 相比,它是一种十分有效而且灵敏度很高的并可用于测定 mRNA
RNase-A/Tl保护和-RNase-H-聚焦法实验
RNase保护法 RNase H 聚焦法 实验方法原理 RNA与互补的 [ 32P ] 标记的探针在溶液中复件后形成的 RNA-RNA 杂合分子对单
RNAi制备小分子干扰RNA(small-interfering-RNAs,siRNAs)的方法2
越来越多的研究人员开始采用小分子干扰RNA(small interfering RNAs,siRNAs)来抑制特定的哺乳动物基因表达。siRNA是一种短片断双链RNA分子,能够以同源互补序列的mRNA为靶目标降解特定的 mRNA,这个过程就是RNA干扰途径(RNA interference
RNase-A/Tl保护和-RNase-H-聚焦法实验——RNase保护法
基因分子鉴定的一个重要方面就是其 RNA 转录物 5' 和 3' 端的精确作图。首先被 Maniatis 研究组使用的 RNase 保护测定法就是基于这个目的发展起来的。由于杂交是在溶液中实现的,因此也称为溶液杂交。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理RNA与
RNase-A/Tl保护和-RNase-H-聚焦法实验——RNase-H-聚焦法
实验方法原理RNA与互补的 [ 32P ] 标记的探针在溶液中复件后形成的 RNA-RNA 杂合分子对单链专一的 RNase 具有抗性。此法可以对 RNA 分子末端进行定位或对含内含子的交界定位。与 Northern blot 相比,它是一种十分有效而且灵敏度很高的并可用于测定 mRNA 丰度的方法
RNAi实验原理与方法
实验概要进行RNAi实验实验原理通过生化和遗传学研究表明,RNA干扰包括起始阶段和效应阶段(inititation and effector steps)。在起始阶段,加入的小分子RNA被切割为21-23核苷酸长的小分子干扰RNA片段(small interfering RNAs, siRNAs
酵母菌RNA制备实验
实验材料 酵母菌试剂、试剂盒 TES酸性酚氯仿乙酸钠乙醇仪器、耗材 离心管离心机摇床实验步骤 1. 酵母细胞在10 ml 培养基中生长至指数中期(OD600=1.0)。 2. 将培养液转移到50 ml,离心管,于4℃,1 500 g 离心3 min。 3. 弃上清,菌体沉淀用1 ml 冰冷的水