我国科学家绘制出首个哺乳动物细胞图谱

浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队研发出低成本、高效率、完全国产化的高通量单细胞测序平台“Microwell-seq”,并在短时间内利用这一平台构建全球首个哺乳动物的细胞图谱。该成果于23日刊登在国际学术期刊《细胞》杂志上。 细胞是生命最小的独立遗传单位。传统的测序技术“看”的是一组一组、成群的细胞,“读”的是一堆细胞遗传信号的均值,因此单个细胞的特异性表现容易被忽略。郭国骥认为,单细胞组学技术使人类能够从单个细胞的视角,精确解析细胞的分化、再生、衰老以及病变,“这类技术正带来一场细胞检测、分类和鉴定的方法学革命”。 “我们利用微孔矩阵、分子标记和扩增技术,高通量、高精度地实现单细胞水平分析,解决了传统测序中单个细胞核酸物质少、容易丢失、分析成本高的难题。”郭国骥说。 研究人员向记者展示了一块边长三厘米的正方形薄片,这是一块有10万个直径30微米“小坑”的琼脂糖微孔板。实验中,科学家用消化酶将一团相对紧实......阅读全文

基因测序的云计算平台

   自二代测序的技术问世以来,就一直是研究和临床领域关注的重点。随着整个行业的技术发展,二代测序也带动了整个基因研究的产业链。在二代测序的产业链中,上游做检测,中游做分析,下游做应用。在测序价格持续下降的情况下,中游测序数据的生物信息学分析成为了提高效率最大的瓶颈。  传统的测序数据分析依赖于本地

九大测序平台对比(二)

2.454企业: Roche推出时间: 2005年主流型号: Genome Sequencer FLX Titanium(2008年推出)样品要求: 5 μg of DNA,浓度≥300 ng/μL测序原理:焦磷酸测序在测序时,使用了一种叫做“Pico TiterPlate”(PTP)的平板,它

九大测序平台对比(一)

1.Sanger2.4543.Solid 4.HiSeq20005.Helicos6.DNA Nanoball array7.The PacBio RS system8.PGM9.MiSeq  sanger企业:Life Technology推出时间:1977年发明,1986年第一台商业化测序仪主流

九大测序平台对比(四)

5.Helicos企业: Helicos Biosciences推出时间: 2008年主流型号: HeliScope™ Single Molecule Sequencer(2008年推出)样品要求: 1-3 μg,起始DNA体积不超过100 μL.测序原理: 边合成边测序,可逆阻断测序待测DNA被随

九大测序平台对比(三)

4.HiSeq2000企业: Illumina推出时间: 2010/1/1主流型号: Illumina HiSeq2000样品要求: 6ug/sample,无RNA、蛋白污染,无降解,OD260/OD280=1.8-2.0测序原理: 边合成边测序这种测序技术通过将基因组DNA的随机片断附着到光学透明

九大测序平台对比(五)

7.The PacBio RS system企业: Pacific Biosciences推出时间: 2010年2月开始早期试用主流型号: PacBio RS样品要求: 1kb以下500ng,纯化的基因组 DNA, BACs, cDNA 文库 或PCR 产物测序原理: 边合成边测序,single m

九大测序平台对比(一)

1.sanger企业:Life Technology推出时间:1977年发明,1986年第一台商业化测序仪主流型号:3730XL样品要求:PCR产物:浓度≥50ng/ul 体积≥10ul;质粒:含量≥5ug;菌液:体积≥1ml。测序原理:双脱氧链终止法:Sanger法测序的原理就是,每个反应含有所有

九大测序平台对比(六)

8.PGM企业: Ion Torrent推出时间: 2010年主流型号: Ion Personal Genome Machine™(2010年)样品要求: 5 μg DNA,起始DNA体积不超过130μL测序原理: 半导体芯片测序该测序仪使用了一种高密度半导体小孔芯片。该芯片置于一个离子敏感层和离子

九大测序平台对比(二)

Helicos企业: Helicos Biosciences推出时间: 2008年主流型号: HeliScope™ Single Molecule Sequencer(2008年推出)样品要求: 1-3 μg,起始DNA体积不超过100 μL.测序原理: 边合成边测序,可逆阻断测序待测DNA被随机打

llumina高通量测序平台的应用

  Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收

llumina高通量测序平台的应用

  Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收

测序平台多样化成为发展障碍

2016年1月12日,奥巴马提出了癌症“登月计划”,将精准医疗、个性化医学或癌症医学推向了另一高度。事实上,精准医疗是一个美好的愿景:即能详细读取肿瘤患者的缺陷,并开发出靶向缺陷的新一代药物,医生给患者最有效的治疗方案。使用新型靶向药物如厄洛替尼(erlotinib)和西妥昔单抗(cetuximab

llumina高通量测序平台的应用(一)

Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收购了

llumina高通量测序平台的应用(二)

3、可逆化学阻断技术测序        利用边合成边测序(Sequencing by synthesis)的原理,加入改造过的DNA聚合酶和带有4种荧光标记的dNTP。这些核苷酸是“可逆终止子”,因为3’羟基末端带有可化学切割的部分,每个循环它只容许掺入单个碱基。去除其他多余的dNTP后,用激光扫描

法国拟建高速基因组测序分析平台

  法国总理菲利普17日在巴黎宣布,法国在法兰西岛大区(又称“巴黎大区”)和中部奥弗涅—罗讷—阿尔卑斯大区启动建设两个高速基因组测序分析平台,以推动法国基因组相关研究的发展。  法国政府去年6月提出“法国基因组医学2025”计划,这两个基因组测序分析平台的建设就隶属该计划,预计将于2018年正式开始

北京希望组新购5台Sequel测序平台

   北京希望组生物科技有限公司(GrandOmics Biosciences, Co., Ltd., 以下简称“希望组”)与美国太平洋生物公司(Pacific Biosciences of California, Inc.,以下简称称“PacBio”)今日宣布达成战略合作,希望组与旗下科技服务公司

单细胞多组学高通量测序平台(一)

一单细胞多组学高通量测序技术简介通过测序手段检测细胞多层次信息,如基因组、表观组、转录组甚至蛋白组已经成为生物学研究的重要手段。几乎一切生命体的活动都围绕着DNA->RNA->蛋白质的过程,而现有的组学技术也围绕这一过程获取信息(如DNA层面的基因序列),从而解读生物体运行机制,应用于疾病的诊断和治

单细胞多组学高通量测序平台(二)

虽然single-cell sequencing的方法仍在不断推出,但是目前使用最为广泛、商业化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系统。1.2以RNA-seq为例介绍高通量单细胞测序技术单细胞测序的最主要难点是如何在短时间内分离得到最可能多的单个细胞,早期的技术代表F

ABI-3730XL测序平台的原理及特点

  Applied Biosystems 3730XL测序仪是高质量的长片段读取和序列分析的测序平台,应用灵活而广泛。3730XL可同时分析96个样品,该仪器采用4色荧光同时检测,可不间断24小时运行,自动灌胶,上样,电泳分离,检测及数据分析。本仪器除了能够完成新基因测序工作或比较测序工作外,还可进

测序黑马10X-Genomics正式发售GemCode平台

  2015年7月3日,10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,引起业界关注。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,产生长片段信息(10-100 kb),实现结构变异和单体型等分析。GemC

测序平台的读长真的很重要吗?

  在EdgeBio,我们一直关注如何提高效率,降低成本,并为我们的客户提供整体上更优质的服务。随之而来的是大量的R&D和新技术开发(NTD)费用。一个很好的例子是我们近期发布的一系列技术白皮书(共五篇),是关于定向重测序应用的,包括外显子组。您可以在这里找到。今天我将与大家分享一些使用Illumi

DNA三代测序技术原理、平台、特点介绍

人类基因组计划、基因芯片、个性化分子诊断、生物云计算……这些在21世纪第一个十年里吸引无数眼球的热门词汇,都和一个产业颇有渊源——DNA测序。生物技术和信息技术在这片创意新天地里水乳交融,如果用一句诗来形容坐拥两大技术护航的DNA测序产业,那就是——天生丽质难自弃。随着人类基因组计划的完成,人类对自

数十个测序平台技术参数盘点

1.第二代测序技术1.1 Roche 454 测序平台Roche 454(Genome Sequencer 20 System)是第一个NGS测序平台,由美国454 Life Sciences公司于2005年推出,2007年被瑞士Roche公司收购。此后Roche公司在此基础上开发了Roch

ABI-3730XL测序平台的原理及特点

Applied Biosystems 3730XL测序仪是高质量的长片段读取和序列分析的测序平台,应用灵活而广泛。3730XL可同时分析96个样品,该仪器采用4色荧光同时检测,可不间断24小时运行,自动灌胶,上样,电泳分离,检测及数据分析。本仪器除了能够完成新基因测序工作或比较测序工作外,还可进行多

ABI-3730XL测序平台的原理及特点

  Applied Biosystems 3730XL测序仪是高质量的长片段读取和序列分析的测序平台,应用灵活而广泛。3730XL可同时分析96个样品,该仪器采用4色荧光同时检测,可不间断24小时运行,自动灌胶,上样,电泳分离,检测及数据分析。本仪器除了能够完成新基因测序工作或比较测序工作外,还可进

测序技术再现新进展,已开发基于单分子测序平台的单细胞多组学测序技术

  单细胞多组学测序技术是指对一个单细胞同时检测多个组学层面(例如基因组、表观基因组和转录组)的测序技术。这类技术可以更系统、全面地探索细胞异质性以及同一个细胞内的不同组学层面之间的互动关系,有利于更深入地解析复杂的生理、病理过程中细胞类型特异性的分子调控机制1, 2。2019年,Nature Me

中科院基因组测序平台联盟成立

  2月12日上午,在中国科学院条件保障与财务局的支持和推动下,中科院基因组测序平台联盟成立大会暨签约仪式在中科院北京基因组研究所召开。条财局副局长曹凝及中科院广州、武汉、上海、昆明及北京各区域中心专家代表和部分研究所代表共计20余人出席会议。   会上,北京基因组所副所长、党委

Paragon-Genomics-推出与华大智造测序平台兼容产品

  2019年6月13日,Paragon Genomics宣布首批与华大智造测序平台兼容的CleanPlex®产品正式推出,并将于6月15-6月18日举办的欧洲人类遗传学大会(ESHG 2019)上正式发布。在本次大会上,华大智造将主办卫星会,届时也将专门介绍华大智造测序平台兼容的CleanPlex

Paragon-Genomics推出与华大智造测序平台兼容产品

  2019年6月13日,Paragon Genomics宣布首批与华大智造测序平台兼容的CleanPlex®产品正式推出,并将于6月15-6月18日举办的欧洲人类遗传学大会(ESHG 2019)上正式发布。在本次大会上,华大智造将主办卫星会,届时也将专门介绍华大智造测序平台兼容的CleanPlex

投资车联网和基因测序云平台,拓展未来空间

  国内领先的数据中心建设和综合服务的提供商:荣之联是国内领先的数据中心建设和综合服务的提供商。公司专注于数据中心领域,提供从咨询、设计、系统部署、集成、软件开发、到运维管理及后续升级改造等全套解决方案和专业服务。主要围绕大中型企事业单位,致力于融合云计算、大数据技术,推动企业信息资源的创新应用。公