美国学者:可视化深度学习揭示基因如何影响细胞特征
美国研究人员开发出一种过程可获取的深度学习计算机新算法,能够揭示细胞的内部活动。相关论文3月6日在线发表于《自然—方法》。图片来源于网络 人工智能可以执行多种通常需要人类完成的复杂任务,比如面部识别、语言翻译和玩游戏。深度学习网络也称人工神经网络,它们越来越多地被用于生物数据分析自动化。 深度学习模型的一个挑战是它们的“黑箱”性质,也就是说无法轻易鉴定一个模型执行某项任务时的过程。 在生物应用方面,调查深度学习模型如何识别和处理所分析的数据的能力或许可以帮助研究者更好地理解这些数据背后的生物学。 加州大学圣地亚哥分校的Trey Ideker及同事通过将一个深度学习算法的结构映射在已知细胞内分子系统的结构上,创建了一个“可视的”人工神经网络。研究人员表示,一旦模型完成训练,它便能够预测遗传变化的生理影响。 此外,由于模型的组分均可获取,它也能让科学家更好地理解基因与生理特征关系背后的机制。研究人员指出,一个可视的神经......阅读全文
人工智能“进军”基因检测市场
据加拿大《环球邮报》报道,在利用机器学习检测DNA(脱氧核糖核酸)中的致病突变十多年后,加拿大多伦多大学生物医学工程教授布伦丹·弗雷近日成立了“深基因组学”公司,准备将其团队开发的新技术推向市场。 弗雷将深基因组学技术比喻成基因突变领域的谷歌搜索:研究人员可对一个DNA序列进行查询,系统将鉴别
人工智能进军基因检测市场
据加拿大《环球邮报》报道,在利用机器学习检测DNA(脱氧核糖核酸)中的致病突变十多年后,加拿大多伦多大学生物医学工程教授布伦丹·弗雷近日成立了“深基因组学”公司,准备将其团队开发的新技术推向市场。 弗雷将深基因组学技术比喻成基因突变领域的谷歌搜索:研究人员可对一个DNA序列进行查询,系统将鉴
从百万基因组“驶向”人工智能
导读: 7月28日,王俊接受了Nature和Science网站的专访,畅谈了他现在想将自己的一生都贡献给一项新的“研究计划”的原因,他想构建出一个人工智能健康监测系统,来识别人类个体基因组数据、生理性状(表型)和生活方式之间的关系。 王俊(Jun Wang)是中国最著名的科学家之一。自从16
人工智能设计的基因编辑工具来了
在不断探索以前未知的CRISPR基因编辑系统的过程中,研究人员从温泉、泥炭沼泽、粪便甚至酸奶中搜寻各种微生物。现在,由于生成式人工智能的进步,他们可能只需按一下按钮就可以设计出这些系统。据《自然》报道,日前,研究人员公布了他们如何使用一种名为蛋白质语言模型的生成式人工智能工具设计CRISPR基因编辑
人工智能快速解码脑癌基因组
美国哈佛大学医学院团队设计了一种人工智能(AI)医疗工具,可快速解码脑肿瘤的DNA,以确定其在手术过程中的分子身份,而现有方法需要几天甚至几周的时间才能获得这些关键信息。研究成果7日发表在《医学》杂志上。 脑科手术期间准确的分子诊断(详细描述细胞中DNA的变化)可帮助神经外科医生决定切除多少脑
人工智能快速解码脑癌基因组
美国哈佛大学医学院团队设计了一种人工智能(AI)医疗工具,可快速解码脑肿瘤的DNA,以确定其在手术过程中的分子身份,而现有方法需要几天甚至几周的时间才能获得这些关键信息。研究成果7日发表在《医学》杂志上。 脑科手术期间准确的分子诊断(详细描述细胞中DNA的变化)可帮助神经外科医生决定切除多少脑
人工智能助力癌细胞活体检测
随着人工智能技术的快速崛起,基于人工智能的癌症筛选也获得了长足的进步。科学家们利用人工智能技术,可以高效区分出普通的健康细胞和癌变的细胞,其准确率不亚于一个专业训练的病原学专家。 在过去的近一白年间,研究人员和医生们检测人体病原体的方法并没有太大的变化。通过获取样品,在显微镜下进行镜检,需要在
人工智能和机器学习解决方案将如何加速细胞和基因治疗领域创新
引言:“大鹏一日同风起,扶摇直上九万里。”细胞和基因治疗(CGT)领域在过去几年中取得了显著进步,其管线和批准产品的数量急剧增加。然而CGT市场仍然面临许多挑战,这些挑战阻碍了其增长并延迟了这些疗法的广泛应用,主要包括了对疾病的了解有限、疗法的复杂性以及制造工艺的放大和优化方面的限制。在数字技术
人工智能技术揭示前所未知细胞成分
科技日报北京11月24日电 (实习记者 张佳欣)大多数人类疾病实质上是细胞故障的产物。但要了解细胞的哪些部分出错会导致疾病,科学家首先需要对细胞有完整的了解。美国加州大学圣地亚哥分校医学院的研究人员及其合作者在24日发表于《自然》杂志上的论文中,介绍了尺度集成细胞(MuSIC)技术,这是一种结合
人工智能技术揭示前所未知细胞成分
科技日报北京11月24日电 (实习记者 张佳欣)大多数人类疾病实质上是细胞故障的产物。但要了解细胞的哪些部分出错会导致疾病,科学家首先需要对细胞有完整的了解。美国加州大学圣地亚哥分校医学院的研究人员及其合作者在24日发表于《自然》杂志上的论文中,介绍了尺度集成细胞(MuSIC)技术,这是一种结合了显
人工智能助力新系统揭示细胞行为变化
以色列特拉维夫大学近日发布公报说,该大学研究人员开发出一种基于人工智能的scNET系统,能深入了解细胞在肿瘤等复杂生物环境中的行为变化,有望为疾病治疗研究提供新途径。 公报说,当前单细胞测序技术日益成熟,使研究人员能观察生物样本中不同细胞群体的基因表达特征,并探索其对个体细胞功能的影响。在肿瘤
人工智能加持-基因测序行业打开成长新空间
随着人工智能与基因测序相结合发展,基因测序行业必然迎来更大的发展空间,市场则将保持快速增长。预计到2020年,全球基因测序市场将达到138亿美元,年复合增长率为18.7%。我国有望成为全球第一,人工智能技术的引入正加速这一进程。 我国基因测序发展概况 从上世纪70年代的双脱氧核苷酸末
人工智能新模型实现精准RNA靶向和基因调控
据发表在最新一期《自然·生物技术》杂志上的新研究,美国研究人员开发了一种人工智能模型,可预测RNA靶向CRISPR工具的脱靶活性。该模型可精确地设计向导RNA并调节基因表达,这些精确的基因控制可用于开发基于CRISPR的新疗法。 美国纽约大学、哥伦比亚大学工程学院和纽约基因组中心研究人员进行的
Neurology-Genetics:IBM人工智能-高效分析脑瘤基因组
随着肿瘤靶向治疗和个性化治疗方法的不断进步,越来越多的医生意识到了对肿瘤进行基因组测序的重要性。从肿瘤基因组分析中往往能找到更有针对性和更有效的靶向治疗方案,为患者带来更好的疗效。不过,从大量的基因组数据中迅速找到潜在的治疗方案并不是一件容易的事情,但这却是计算机和人工智能程序能够发挥作用的地方
人工智能助力开发可用于基因疗法的纳米笼
韩国浦项科技大学化学工程系教授Sangmin Lee与美国华盛顿大学教授、2024年诺贝尔化学奖获得者David Baker合作,通过使用人工智能模拟病毒的复杂结构,开发了一种创新的治疗平台。相关研究成果12月18日发表于《自然》。病毒的独特设计是将遗传物质封装在球形蛋白质外壳内,使它们能够复制和侵
细胞化学词汇细胞癌基因
中文名称:细胞癌基因存在位置:正常的细胞基因组激活前作用:促进正常细胞生长增殖分化和发育激活后作用:使细胞发生恶性转化定义:存在于正常的细胞基因组中,与病毒癌基因有同源序列,具有促进正常细胞生长、增殖、分化和发育等生理功能。细胞癌基因:存在于正常的细胞基因组中,与病毒癌基因有同源序列,具有促进正常细
Nat-Commun:人工智能帮助找到导致胃癌的基因突变!
在一项开创性研究中,来自新加坡基因组研究所(GIS)科技研究局的研究人员开发了一种全新的机器学习计算机模型(一种人工智能模型,AI)来准确寻找肿瘤突变。他们还发现了一个非编码DNA的新基因突变可能导致了胃癌。这项研究开发出的新技术将在未来帮助研究人员探索其他肿瘤中非编码DNA突变的影响。图片来源
新人工智能模型和算法揭开肿瘤基因内在交互关系
近日,《自然》子刊 NPJ Precision Oncology发表了中国科学院大学张正军教授团队等关于一类新型人工智能AI模型和算法并应用到结直肠癌关键基因识别的研究成果。研究发现,由组织样本识别出的4个基因及其交互关系就可以完全识别结直肠癌。这四个基因使用了来自与世界不同地区不同人种不同研究目标
突破!人工智能再度建立功勋!顺利找到肿瘤基因变体!
近年来,人工智能(AI)发展迅速,从AlphaGo击败人类棋手,到商场里随处可见的智能机器人,人工智能已经从实验室走向了大众。而创新型的AI技术也给医疗领域带来了新的机会。 Casey Greene和Way作为人工智能的研究者,将来自肿瘤患者的DNA与治疗方法相匹配,他们使用人工智能来鉴别肿瘤
基因组研究的“98K”——人工智能算法
每个分子遗传学家都希望找到一个易于使用的程序,可以比较来自不同细胞条件的数据集,识别增强子区域,然后将其分配给目标基因。 如今,柏林马克斯·普朗克分子遗传学研究所的马丁·温格隆(Martin Vingron)领导的研究小组现已开发出一个掌握所有这些内容的程序。 “ DNA非常无聊,因为它在每个
基因编辑细胞疗法
17日,Sangamo Therapeutics公司宣布,欧洲药品管理局(EMA)孤儿药委员会(COMP)公布了详细资料,支持授予其在研体外基因编辑细胞疗法BIVV003孤儿药资格,治疗镰刀型细胞贫血病(SCD)。
当基因编辑插上人工智能的翅膀,“大礼包”来了
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503661.shtm给基因编辑插上人工智能的翅膀会发生什么?中国科学院遗传与发育生物学研究所(以下简称遗传发育所)研究员高彩霞和团队进行了一次试水,意外为基因编辑新“利器”的挖掘开辟了一片崭新的天地。基因
“基因剪刀”让皮肤细胞“变身”干细胞
美国科学家用“基因剪刀”编辑实验鼠细胞的基因组,成功使皮肤细胞转变成干细胞,为培育诱导多能干细胞开辟了新路。 诱导多能干细胞是对成熟细胞“重编程”得到的,像胚胎干细胞一样具备分化成多种细胞的潜力,可用于修复受损的组织和器官。“基因剪刀”指CRISPR基因编辑技术,用它能像在电脑上编辑文章一样,
“基因剪刀”让皮肤细胞“变身”干细胞
美国科学家用“基因剪刀”编辑实验鼠细胞的基因组,成功使皮肤细胞转变成干细胞,为培育诱导多能干细胞开辟了新路。诱导多能干细胞是对成熟细胞“重编程”得到的,像胚胎干细胞一样具备分化成多种细胞的潜力,可用于修复受损的组织和器官。 “基因剪刀”指CRISPR基因编辑技术,用它能像在电脑上编辑文章一
单细胞分离用于单细胞基因扩增
单细胞分离连接不同管径大小的毛细玻璃针,可分离捕获各种非贴壁状态的单细胞和微粒等,如细菌、酵母、藻类细胞、植物花粉、原生动物单细胞、悬浮细胞、血液细胞、免疫细胞、卵细胞、各种悬液中单细胞及特殊标记的单细胞等。 单细胞分离用于各种类型的细胞分离培养、纯化、检测;获得单克隆细胞;用于单细胞基因扩增,
《细胞》:单细胞测序助力基因重组图谱
来自斯坦福大学医学院等处的研究人员发表了题为“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了来自一个成人男子91个
细胞化学词汇结瘤基因
中文名称:结瘤基因英文名称:nodulation gene;nod gene定 义:根瘤菌与豆科植物共生时宿主根部生结节所必需的基因。应用学科:遗传学(一级学科),经典遗传学(二级学科)
细胞化学词汇时序基因
中文名称:时序基因英文名称:temporal gene定 义:按照发育阶段的顺序进行表达的基因。应用学科:遗传学(一级学科),发育遗传学(二级学科)
细胞化学词汇基因扩增
基因扩增是指某一个特定基因的拷贝数选择性地增加而其它基因的拷贝数并未按比例增加的过程。
细胞化学词汇裸基因
中文名称:裸基因英文名称:naked gene定 义:(1)无蛋白质外壳的类病毒,其暴露的基因通常是RNA。(2)基因治疗或基因疫苗采用外源具功能性的纯DNA,可直接注入生物机体内产生效应。(3)生命起源过程中出现最初的生命形态,仅有能自我复制的核酸。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核