基于质谱技术蛋白质定量方法的研究进展
朱金蕾1 张锴1*何锡文1 张玉奎1,2 1南开大学化学学院,天津市卫津路94号,300071 2中国科学院大连化学物理研究所,辽宁省大连市中山路457号,116023 摘要 质谱技术已经成为目前蛋白质鉴定的重要工具。定量分析细胞内蛋白质组的动态变化,是当前研究蛋白质功能、揭示细胞生物机理、寻找疾病蛋白标记物和药物靶标的迫切需要。本文综述了基于质谱技术蛋白质定量的策略、方法和应用等方面近年来的进展,评述了几种蛋白质质谱定量方法的特点和应用潜力。 关键词 质谱,蛋白质组学,定量,同位素标记 1 引 言 细胞内蛋白质组丰度的动态变化对各种生命过程有重要影响,当前蛋白质组的定量分析研究已经引起广泛关注,这为分析化学带来了新的挑战和机遇,基于质谱的蛋白质分析技术也从蛋白质组的鉴定发展到定量蛋白质组学(quantitative ......阅读全文
蛋白质组实验全套流程方案1
蛋白质组实验流程双向电泳的样品的制备样品制备原则样品制备是双向电泳中最关键的一步,将直接影响2-DE结果好坏。目前并没有一个通用的样品制备方法,尽管处理方法多种多样,但都遵循几个基本的原则:1)尽可能的提高样品蛋白的溶解度,抽提最大量的总蛋白,减少蛋白质的损失;2)减少对蛋白质的人为修饰;3)破坏
拟南芥叶绿体蛋白质组学分析实验
试剂、试剂盒 HEPES-KOH山梨醇抗坏血酸维生素 C半胱氨酸PF-Percoll仪器、耗材 浓缩离心设备实验步骤 建议在短日照条件下培养材料以诱导营养生长,并在照光的早期收取材料以提高获得完整叶绿体的产率。所以试剂应在收集材料之前准备好,并连同其他一些设备,如离心机转头及离心管等在冰箱或冰上冷却
中国蛋白质组学世界领先
2003年12月15日,由中国科学院院士贺福初牵头的“人类肝脏蛋白质计划”(HLPP)启动,这是我国领导的第一项重大国际合作计划,也是第一个人类组织/器官的蛋白质组计划。 北京蛋白质组研究中心主任、蛋白质组学国家重点实验室副主任秦钧告诉《中国科学报》记者,十余年来,HLPP经历了三代更迭,从第
蛋白质组实验全套流程方案2
聚丙烯酰胺凝胶的配制表1 配制Tris-甘氨酸SDS-PAGE聚丙烯酰胺凝胶电泳分离胶所用溶液溶液成分不同体积(ml)凝胶液中各成分所需体积(ml)5101520253040506% 水2.65.37.910.613.215.921.226.5 30%丙烯酰胺溶液123456810 1.
《自然方法学》:可视蛋白质组学
瑞士联邦技术学院的研究人员开发出一种在问号钩端螺旋体(Leptospira interrogans)这种病原体中定位蛋白复合物的新方法,称为“可视蛋白质组学”。文章发表在本期的《自然-方法学》上。 活细胞中的生化进程分为多个功能单元,它们在细胞内有着特定的时间和空间分布。一般来说,这些单元
蛋白质组的主要功能
蛋白质组学集中于动态描述基因调节,对基因表达的蛋白质水平进行定量的测定,鉴定疾病、药物对生命过程的影响,以及解释基因表达调控的机制. 作为一门科学,蛋白质组研究并非从零开始,它是已有20多年历史的蛋白质(多肽)谱和基因产物图谱技术的一种延伸. 多肽图谱依靠双向电泳(Two-dimensional g
蛋白质组色谱仪分类方法
蛋白质组色谱仪种类有多种。1、按功能可分:分析型蛋白质组色谱仪和制备型蛋白质组色谱仪。2、按分离目的可分:实验室蛋白质组色谱仪和工业蛋白质组色谱仪。3、按应用范围可分:专用型蛋白质组色谱仪和通用型蛋白质组色谱仪。4、按作用可分:蛋白质组定量分析色谱仪和蛋白质组定性分析色谱仪。5、按分离特征可分:高选
蛋白质组学技术的功能介绍
“读”,在字典里的意思是识取、读取,放在蛋白研究中可以理解为对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的筛选、鉴定或者定量检测。自2003年4月14日人类基因组计划(HGP)宣告完成以来,基因组研究取得了举世瞩目的成就。基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力证据,但实际上绝大多数疾病并不是
定量蛋白质组学方法分类介绍
【蛋白研究系列专题】-4丨定量蛋白质组学方法,您值得拥有 1 背景和意义 从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律(特别是疾病防治和病理研究)已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织或器官中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下
总裁专访-|-蛋白质组学新里程
2020年是蛋白质组学发展关键的一年,全球新冠疫情突显了蛋白质组学在应对公共卫生危机中的临床应用。人类可以从这次新冠疫情中汲取许多经验,毫无疑问地,这些将在未来几年内影响蛋白质组学发展。近日,Technology Networks与布鲁克·道尔顿生命科学质谱执行副总裁Rohan Thakur博士
蛋白质组学相关问题与解答
1.为什么通过elisa、WB能检测到的蛋白在itraq实验中没有检测到? 人血浆中的蛋白是有上万种的,而一般质谱只能检测到五六百种,也就是说只占了其中的百分之几,这是普遍现象,说明咱们的方法是不存在问题的;其次,ELISA/WB与质谱相对来说灵敏度不一样,前者具有放大效应,因为其间会用
蛋白质组学研究-可投哪些期刊?
蛋白质作为功能的直接行使者,已经被科研工作这广泛应用于不同领域中,目前蛋白组学有很多优秀的科研成果,在各个领域及期刊上发表,其中也不乏CNS在内的顶级期刊。那我们的蛋白组学文章可以投哪些期刊呢?了解已发表文章的情况可以帮助我们很好的解决这个问题。这里,我们以“Proteomics”为关键词,
蛋白质组的研究进展介绍
2014年5月28日,英国新一期《自然》杂志公布两组科研人员分别绘制的人类蛋白质组草图。这一成果有助于了解各个组织中存在何种蛋白质,这些蛋白质与哪些基因表达有关等,从而进一步揭开人体的奥秘。 上世纪90年代,人类基因组计划开始成形时,有科学家提出了破译人类蛋白质组的想法。其目标是将人体所有蛋白
PNAS揭秘蛋白质组的暗物质
蛋白质通常被称为生命的构建模块,组成了每个人质量的15%,在体内执行各种各样重要的功能。 科学家一直都在推测蛋白质暗物质的性质,即蛋白质中完全未知的领域,但最近澳大利亚联邦科学与工业研究组织(CSIRO)开展的一项研究,定位了这些暗物质区域的界限,使得我们更进一步发现所有蛋白质的完整结构和功能
蛋白质组学技术的功能介绍
“读”,在字典里的意思是识取、读取,放在蛋白研究中可以理解为对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的筛选、鉴定或者定量检测。 自2003年4月14日人类基因组计划(HGP)宣告完成以来,基因组研究取得了举世瞩目的成就。基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力证据,但实际上绝大
蛋白质组学分离分析方法进展
分析测试百科网讯 2015年10月17日,第二届全国质谱分析学术报告会(质谱大会)在浙江大学紫荆港校区体育馆盛大开幕。中国科学院大连化学物理研究所 张玉奎 来自中国科学院大连化学物理研究所的张玉奎院士带来了题为《蛋白质组学分离分析方法进展》的报告。 张玉奎主要介绍了蛋白质样品预处理、蛋白质组
定量蛋白质组学的研究内容
1.蛋白质鉴定:可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术,利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。 2.翻译后修饰:很多mRNA表达产生的蛋白质要经历翻译后修饰如磷酸化,糖基化,酶原激活等。翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式,因此对蛋白质翻译后修饰的研究对
Nature年度技术:定向蛋白质组学
时近岁末,各大杂志接连进行了年终盘点,此前出版的《Nature》杂志也对2012年进行了回顾,评点了2012年的科技进展,科技政策以及重要人物,中国科学家王俊入选了人物篇。同时《Nature Methods》也盘点了今年与明年的技术热点,选出了2012年度技术成果:定向蛋白质组学(targe
蛋白质组的主要功能
蛋白质组学集中于动态描述基因调节,对基因表达的蛋白质水平进行定量的测定,鉴定疾病、药物对生命过程的影响,以及解释基因表达调控的机制. 作为一门科学,蛋白质组研究并非从零开始,它是已有20多年历史的蛋白质(多肽)谱和基因产物图谱技术的一种延伸. 多肽图谱依靠双向电泳(Two-dimensional g
组学期刊三巨头:《基因组、蛋白质组与生物信息学报》
近年来GPB的中国风封面 冯丽妃摄 从编委到现任执行副主编,美国费城儿童医院和宾夕法尼亚大学教授邢毅与《基因组蛋白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics,以下简称GPB)期刊结缘已近10年。前些年,该刊编辑部不时找他约稿子,以解“缺米之炊”
2025蛋白质组学大会之聚焦蛋白质组学“暗物质”,探索生命科学新前沿
2025年10月13日上午,主题为 “未充分研究的蛋白质组与肽组学” (Understudied Proteomics and Peptidomics) 的分会场座无虚席。多位海内外知名学者围绕这一前沿领域分享了最新的研究工作,携手与会者共同探索蛋白质组世界中广阔的未知地带,揭示其在肿瘤、遗传、食品
鲁克在-timsTOF-4D蛋白质组学和表观蛋白质组学平台上扩展
在蛋白质组论坛| EuPA 2022,布鲁克公司(纳斯达克股票代码:BRKR)宣布扩展了更深层次的蛋白质组学和表观蛋白质组学覆盖的能力,包括使用创新的 TIMScore 算法增强磷酸肽分析,该算法现在是基于 GPU 的新 PaSER 2022 平台的一部分。新的 TIMScore 算法利用机器学
2025蛋白质组学大会之聚焦化学蛋白质组学,开启精准药物发现新纪元
2025年10月13日下午14点在广州白云国际会议中心岭南国际会堂,第12届AOHUPO大会暨第8届AOAPO大会暨π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会“Chemoproteomics and Drug Discovery”(化学蛋白质组学与药物发现)分会场7精彩开启
大化所高通量多重蛋白质组定量分析方法研究获进展
近日,中科院大连化学物理研究所王方军博士、邹汉法研究员等人在高通量多重蛋白质组定量分析方法研究方面取得新进展,发展了一级质谱(MS1)谱图中六种不同蛋白质样品同时规模化定量分析的同位素标记方法,并将该方法应用于细胞蛋白质合成-降解周转更新分析,分析通量是常规同位素标记方法的三倍,研究成果发表在自
蛋白质组和转录组的表达谱分析方法相同吗
不相同。对生物体特定状态下的基因和蛋白质表达水平进行全方位分析,或得一个表达谱的“全景图”;挖掘受转录后调控的关键蛋白或关键基因,寻找某些关键的代谢通路或者调控因子;对于一些蛋白数据库不完整的物种,通过转录组数据构建蛋白质库,可以大幅度提高蛋白质的鉴定数。
Aebersold研究组发布用于全蛋白质组的高通量定量方法
瑞士苏黎世联邦理工学院的研究人员领导的一个研究小组,已制定了一个质谱工作流,用于对整个蛋白质组进行高通量的绝对定量。 据ETH的研究者、该研究的领头人Ruedi Aebersold说,对于多种形态,该技术实现了目标蛋白质组的重现性定量,提供用于
稳定同位素标记技术的原理
高中生物实验中涉及的同位素标记主要有3H、18O、14C、42K、131I、35S、32P、15N等,那么这些元素是否都具有放射性呢?其实不然!所谓同位素是指具有相同原子序数(即质子数相同,因而在元素周期表中的位置相同),但质量数不同,亦即中子数不同的一组核素。如果某同位素能够自发地从原子核内部放出
稳定同位素标记技术的原理
高中生物实验中涉及的同位素标记主要有3H、18O、14C、42K、131I、35S、32P、15N等,那么这些元素是否都具有放射性呢?其实不然!所谓同位素是指具有相同原子序数(即质子数相同,因而在元素周期表中的位置相同),但质量数不同,亦即中子数不同的一组核素。如果某同位素能够自发地从原子核内部放出
介绍DNA探针的同位素标记方法
1.缺口平移法(nick translation)缺口平移法是最常用的探针标记法,反应体系的主要成分有DNA酶I(DNase I)、大肠杆菌DNA聚合酶I(DNA polymerase I)、三种三磷酸脱氧核糖核苷酸、一种同位素标记的核苷酸(如dATP、dTTP、dCTP,”P—dGTP),其原理如
稳定同位素标记技术的原理
高中生物实验中涉及的同位素标记主要有3H、18O、14C、42K、131I、35S、32P、15N等,那么这些元素是否都具有放射性呢?其实不然!所谓同位素是指具有相同原子序数(即质子数相同,因而在元素周期表中的位置相同),但质量数不同,亦即中子数不同的一组核素。如果某同位素能够自发地从原子核内部放出