《自然—方法学》:一种分子海绵可吞食调控性RNA
研究人员在8月在线出版的《自然—方法学》上报告,通过基因工程合成的一种抑制剂能够吞食哺乳类动物细胞中的小分子RNA。抑制小分子RNA的活性有助于深入认识它们在正常发育和疾病中的功能。 与更长的信使RNA不一样,小分子RNA没有含有制造蛋白质的信息,它只拥有21个核苷酸,但这种序列却能调控信使RNA的表达。小分子RNA的序列与其目标物——信使RNA的序列部分相连,结果令信使RNA的或是分解或是蛋白质转录的过程被中止。科学家们早已将某种小分子RNA的过度表达与癌症和其他疾病联系起来,因此,深入认识这些小分子RNA的功能非常重要。 Philip Sharp和同事研制出一种可目标阻断小分子RNA的特殊工具,这个工具的基本原理是:用一种补充的假序列来吞食全部的小分子RNA,让信使RNA不受阻挡地表达出蛋白质。与以前描述的化学合成小分子RNA抑制剂的方法相反,这些吞食小分子RNA的“海绵”是通过基因工程编码的,它们提供给......阅读全文
小分子RNA的特征介绍
已经被鉴定的miRNAs据推测大都是由具有发夹结构,约70个碱基大小形成发夹结构的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成的,有5’端磷酸基和3’羟基,大小约21—25nt的小分子RNA片段,定位于RNA前体的3’端或者5’端。 3个研究小组分别从线虫、果蝇和Hela细胞中鉴定的100个新mi
小分子RNA——microRNA综述(2)
未来要解决的问题miRNAs在多个物种中广泛被发现,而且在进化上高度保守。这些“小玩意儿”留给我们一大堆谜团:miRNA的确切功能是什么?它的目标靶是什么?作用机制是什么?也许需要对植物或者线虫的基因组进行miRNAs突变株的筛选,在果蝇中可以用targeted-disruption缺失miRNA序
小分子RNA——microRNA综述(1)
RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”,但越来越多的证据清楚的表明,RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设想的更为重要。RNA 干扰(RNA interference)的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识,更因为可以简化/替代基因敲除而成为研究基因功能的有
RNAi(RNA干扰)的分子机制
通过生化和遗传学研究表明,RNA干扰包括起始阶段和效应阶段(inititation and effector steps)。在起始阶段,加入的小分子RNA被切割为21-23核苷酸长的小分子干扰RNA片段(small interfering RNAs, siRNAs)。证据表明;一个称为Dic
科学家揭示了竞争性内源RNA作用于经典的双负反馈回路
4月9日,中国科学院上海营养与健康研究所王鹏课题组、中国科学院上海生物化学与细胞生物学研究所陈洛南课题组及复旦大学胡欣课题组的研究人员在国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表了题为Competitive endogenous RNA is an intr
环状RNA研究深度剖析
1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣? 2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀
2018国自然研究热点一:环状RNA研究深度剖析
1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣? 2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀
Nature新文章解析小RNA调控机制
来自波士顿儿童医院和哈佛大学医学院的研究人员,在新研究中揭示了在Lin28介导的let-7选择性调控中起关键作用的一种核酸酶,相关论文“A role for the Perlman syndrome exonuclease Dis3l2 in the Lin28–let-7 pathwa
微型RNA调控眼睛干细胞生物过程
据物理学家组织网28日报道,美国科学家研究发现,微型RNA-103/107家族(miRs-103/107)在调控眼角膜边缘上皮细胞内干细胞的生物过程中扮演着重要角色。发表在《细胞生物学杂志》上的最新研究首次在自噬和巨胞饮这两种重要的细胞过程间建立了关联。 细胞自噬是细胞应对生存压力而降解其内
长链非编码RNA调控肿瘤生长
人类基因组能够产生10000多种长链非编码RNA(lncRNA),但是至今为止,人们只知道几十种lncRNA分子的功能。 加州大学圣地亚哥分校的Liuqing Yang等人发表在Nature上的一项研究成果表明,两种lncRNAs可以与雄激素受体结合并控制其功能。雄激素受体是一种转录因
浙大Nature子刊解析RNA剪切调控
近日来自浙江大学生命科学学院的研究人员在新研究中揭示了一个与Dscam互斥剪切有关RNA结构性基因座控制区域(locus control region),相关论文“An RNA architectural locus control region involved in Dscam mu
用T4-RNA-连接酶连接-RNA-分子
实验材料 T4RNA连接酶供体RNA受体RNA试剂、试剂盒 10XT4RNA连接酶缓冲液无核酸酶的水FEGRNA酶抑制剂实验步骤 一材料与设备1)10XT4RNA 连接酶缓冲液:50 mmol/LTris (pH7,8),l0 mmol/L MgCl2,5 mmol/LDTT,1 mmol/L AT
用T4-RNA-连接酶连接-RNA-分子
实验材料 T4RNA连接酶 供体RNA 受体RNA 试剂、试剂盒 10XT4RNA连接酶缓冲液
控制分散液粘度,海绵材料变得更“强大”
近日,《先进功能材料》以《基于分散液粘度的结构调控策略制备用于RNA分离纯化的纳米纤维海绵材料》为题,在线发表武汉纺织大学技术研究院教授王栋、刘轲团队的研究成果。该团队在构筑用于RNA分离纯化的纳米纤维海绵材料方面取得的重要进展,提出了基于分散液粘度调控海绵材料孔道结构的新策略。 构筑纳米纤维
云序生物环状RNA研究文章汇总
环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。迄今为止,云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病,客户发表文章达
《自然》子刊:大脑信史可被调控
在9月16日的《自然·神经学》的网络版上,来自美国麻省理工学院皮考尔学习和记忆中心的研究人员发现,大脑主要化学信息携带者(神经递质)的微量自发释放是可以被调整的。这项发现可能首次赋予研究人员控制大脑信息传递的能力。这项研究将可能有助于更好地了解精神分裂症等神经系统疾病。 相对于主要的细胞与细胞互
南海海洋所在海绵真菌中发现“皇冠”分子
近日,中国科学院南海海洋研究所刘永宏研究团队在英国皇家化学学会期刊Organic Chemistry Frontiers(《有机化学前沿》)上以封面文章发表最新研究论文:Phloroglucinol heterodimers and bis-indolyl alkaloids from the
环状RNA研究深度剖析(二)
目标circRNA的机制研究 a RIP-qPCR:挑选功能最为明显的1个circRNA做RIP-qPCR实验,检测circRNA是否与AGO2蛋白结合。(AGO2是circRNA发挥海绵作用的指示蛋白) b RNA pull down:对上述circRNA进行RNA pull down实验,拉
Science:小RNA分子的大作用
如果我们的神经系统发育被扰乱,我们便会有罹患上严重神经系统疾病,造成感觉系统、运动控制和认知功能受损的风险。从人类到线虫,对于所有具有发达神经系统的生物都是这种情况。 现在来自哥本哈根大学的一项新研究,揭示了线虫中一个叫做mir-79的小分子调控神经发育的机制。这一分子是发育过程中特异神经
Cell:小分子RNA的大作用
所有有性繁殖多细胞生物体都依赖于卵子来支持早期的生命。加州大学圣地亚哥医学院及Ludwig癌症研究所的研究人员利用微小线虫作为模型,更好地了解了卵子仅借助于已存在的物质实现胚胎发育的机制。发表在3月24日《细胞》(Cell)杂志上的这项研究,揭示出了小分子RNA(Small RNAs)和辅助蛋白
调节细胞衰老的RNA分子发现
美国得克萨斯大学西南医学中心科学家发现了一种新的衰老调节因子SNORA13。当这种非编码RNA被抑制时,细胞衰老过程显著减缓,表明它可能是治疗与衰老相关疾病的潜在靶点。研究团队指出,这一发现有望为神经退行性疾病、心血管疾病和癌症等与衰老密切相关的疾病提供新的干预手段,也有望为治疗核糖体病开辟新途径。
分子遗传学词汇互补RNA
中文名称:互补RNA英文名称:complementary RNA定 义:能与另一条核酸(DNA或RNA)链互补的RNA分子。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
分子遗传学词汇引物RNA
中文名称:引物RNA外文名称:primer定义:引物RNA是一小段单链DNA或RNA,作为DNA复制的起始点,存在于自然中生物的DNA复制。
细胞化学词汇核仁小分子RNA
中文名称:核仁小分子RNA外文名称:small nucleolar RNA定 义:核仁小RNA(small nucleolar RNA),是近来生物学研究的热点,由内含子编码,分布于真核生物细胞核仁的小分子非编码RNA,具有保守的结构元件。已证明有多种功能,主要参与rRNA的加工;反义s
调节细胞衰老的RNA分子发现
美国得克萨斯大学西南医学中心科学家发现了一种新的衰老调节因子SNORA13。当这种非编码RNA被抑制时,细胞衰老过程显著减缓,表明它可能是治疗与衰老相关疾病的潜在靶点。研究团队指出,这一发现有望为神经退行性疾病、心血管疾病和癌症等与衰老密切相关的疾病提供新的干预手段,也有望为治疗核糖体病开辟新途
复旦大学Nature子刊发布环状RNA重要发现
来自复旦大学、上海交通大学医学院的研究人员借助分析环状RNA,揭示出了丰富的circHIPK3通过像海绵般结合多种miRNAs调控了细胞生长。这一重要的研究发现发布在4月6日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 复旦大学的黄胜林(Shenglin Huang)研
3.6.2-用T4-RNA-连接酶连接-RNA-分子
T4RNA 连接酶已经用来生成很多位点特异修饰的 RNA,尤其是寡核苷酸修饰和用反义密码 tRNA 修饰的 RNA。另外,T4RNA 连接酶还可用于 RNA/DNA 分子内/分子间连接、甲链寡脱氧核苷酸的连接、克隆全长 cDNA 及将非天然氨基酸掺入蛋白分子中。实验材料T4RNA连接酶供体RNA受体
“糖海绵”:不依赖胰岛素,使血糖调控更有弹性
糖尿病是一组以高血糖为特征的代谢性疾病。高血糖则是由于胰岛素分泌缺陷或其生物作用受损,或两者兼有引起。糖尿病时长期存在的高血糖,导致各种组织,特别是眼、肾、心脏、血管、神经的慢性损害、功能障碍。许多糖尿病患者必须注射胰岛素,有时每天注射几次,而其他糖尿病患者口服药物以控制血糖。这两种治疗方案的副
中国科技大学Nature子刊聚焦环状RNA
来自中国科技大学、华中师范大学等处的研究人员报告称,他们鉴别出了一类与RNA聚合酶Ⅱ相关的环状RNA(circRNAs),将之命名为外显子-内含子circRNAs(EIciRNAs)。并证实这些EIciRNAs调控了细胞核中的转录。这些研究成果在线发表在2月9日的《自然结构与分子生物学
出人意料的非编码RNA调控
为了将六英尺多的DNA塞进细胞核里,细胞将基因组紧紧缠绕在组蛋白核心上形成核小体,并最终将其包装成紧密的染色质。DNA转录的时候需要打开核小体,而胚胎干细胞的染色质重塑复合体esBAF可以做到这一点。它不仅会打开需要转录的DNA,还暴露了促进转录的启动子和增强子。 基因组测序研究最近显示,增强