程晓东《自然》文章揭示表观遗传学研究的新线索
来自美国Emory大学华裔教授程晓东（Xiaodong Cheng）领导的研究组发现了小鼠基因组中DNA序列的一种特殊模式，该模式在DNA分子调节基因表达的方式中起到基础性作用。该研究组与来自德国Jacobs大学的同事在8月22日的的《自然》杂志网络版上公布了这些发现。 自从科学家破解了构成人类和动物基因组的碱基密码以来，研究人员正在研究基因功能的其他化学修饰层次，即表观遗传学。表观遗传学与基因序列本身一样重要，因为它控制基因是否被开启或关闭，从而决定它们是否制造蛋白质。 在故去的几十年里，研究人员已经知道DNA甲基化作用（一种将甲基添加到DNA上的生化反应）是这些标记基因沉默的表观遗传修饰过程中其中一种类型，这种修饰导致靶标基因不能生产蛋白质。另外一种修饰叫做组蛋白甲基化作用，该反应也能标记包裹DNA的组蛋白。 但是，这种关键的选择性作用过程如何以及何时完成沉默或表达则仍然是一个谜团。DNA甲基化作用发烧在动物基因......阅读全文
程晓东教授Nature解答表观遗传谜题
来自埃默里大学医学院和新英格兰生物实验室(New England Biolabs)的科学家们，成功地获得了一个Tet酶家族成员的首个详细分子结构。由于Tet酶能够对DNA进行化学修饰，改变告知细胞机器的表观遗传标记，使得“本应关闭的基因”转为“准备发生改变”，因此这一研究发现对于表
程晓东《自然》文章揭示表观遗传学研究的新线索
来自美国Emory大学华裔教授程晓东（Xiaodong Cheng）领导的研究组发现了小鼠基因组中DNA序列的一种特殊模式，该模式在DNA分子调节基因表达的方式中起到基础性作用。该研究组与来自德国Jacobs大学的同事在8月22日的的《自然》杂志网络版上公布了这些发现。 自从科学家破解了构成人类
程晓东教授等人PNAS发表cAMP新成果
立克次氏体(Rickettsiae)为革兰氏阴性菌，是一类介于最小的细菌——巴尔通氏体属(Brtonell)与病毒之间的原核细胞型微生物。一些立克次体可引起高度传染性的严重疾病，使其成为生物恐怖主义威胁。本疾病存在于世界各地，在热带和亚热带一些国家，尤其是第三世界国家发病率仍较高，是造成死亡的主
NIBS王晓东最新Nature子刊文章
来自北京生命科学研究所，德州大学西南医学中心，天津大学的研究人员发现通过化学生物学方法所发现的死亡受体(Death Receptor 5, DR5)的第一个小分子激动剂Bioymifi，并且针对这一作用因子对癌细胞凋亡的作用进行了深入探讨，相关研究成果公布在12月的Nature Chemic
程晓：为“雪龙”带路
白皑皑的冰川中，“雪龙”号困在那里。 上万公里外的北京，程晓心急如焚。不时比对卫星遥感图，观察着冰川的变化，为“雪龙”号寻找着出路。 因营救俄罗斯航船，“雪龙”号已被困十来天。 1月7日，西风，“雪龙”号终于等到了脱困的机会。但到底向哪个方向走?专家仍有争论。 “向东南，
小鼠肝基因组DNA制备
原理DNA 以核蛋白形式存在于细胞核中，制备 DNA 的原则是既要将 DNA 与蛋白质、脂类和糖类等分离，又要保持 DNA 分子的完整。蛋白酶K 及链霉蛋白酶 E 的应用使这两个原则得到了保证。蛋白酶K 或链霉蛋白酶 E 均为广谱蛋白酶，其重要特性是能在 SDS 和 EDTA 存在下保持很高的活性。
小鼠肝基因组DNA制备
原理DNA 以核蛋白形式存在于细胞核中，制备 DNA 的原则是既要将 DNA 与蛋白质、脂类和糖类等分离，又要保持 DNA 分子的完整。蛋白酶K 及链霉蛋白酶 E 的应用使这两个原则得到了保证。蛋白酶K 或链霉蛋白酶 E 均为广谱蛋白酶，其重要特性是能在 SDS 和 EDTA 存在下保持很高的活性。
Nature：科学家发现最古老DNA序列
动物的遗传信息最长可以保存多久？一百万年！ 2月17日，据《自然》上线的一项研究报道，古生物学家在西伯利亚东北部的永久冻土层中提取并解析了3头猛犸象的遗传物质，它们分别来自于70万年、100万年和120万年前。研究者解析了西伯利亚冻土中的猛犸象遗传信息，这刷新了古动物DNA的年代纪录。（图片来
《自然》：美首次对老鼠基因组调控序列测序
美国科学家在7月1日出版的英国《自然》杂志上撰文表示，他们首次详细标示出了老鼠基因组功能序列中一个重要部分——调控序列的详细情况。老鼠是生物医学研究中最广泛使用的哺乳动物模型，因此，最新研究也将有助于我们进一步解读人类基因组。 加州大学圣地亚哥分校路德维格癌症研究所基因调控实验
三篇Nature－Methods：定位基因组的调控序列
科学家们利用染色质对DNase消化和Tn5转座的敏感性，对基因组的调控序列进行定位和解读。 近来越来越多的证据显示，许多遗传学差异并非直接影响基因，而是改变控制基因开/关的调控序列。近期Nature Methods杂志上发表了三篇文章，介绍了在基因组中定位调控序列的新技术，阐述了进行数
卢晓东：不争状元争什么
今年5月11日笔者在《大学周刊》撰文《破除状元招生观，清华北大谁为先》，衷心希望两校在今年的招生中不再“骄傲地宣布，他们录取了各省区多少个状元”，以此“为中国教育的改革发展作出与其目前地位和人们的期待相称的贡献”。然而事与愿违，“杯具”仍然发生了，两校骄傲地公布的状元人数加起来竟然超过
卢晓东：反思“因材施教”
教育中有两个元素，一是老师的“教”，二是学生的“学”。对这两个因素的关系进行分析，我们会发现教育的目的不是“教”，而是如何促进学生“学”;教师的“教”只有通过学生的“学”才能真正转化为教育生产力。也就是说，学生的“学”是决定因素。陶行知先生将这种关系概括为“好的先生不是教书，不是教学生，乃是教学
Nature：DNA重复序列是否致病取决于什么？
DNA重复序列在人类基因组中是很常见的。重复序列已经被提出作为一种进化机制，但是它们可能与人类疾病相关。现在，马克斯-普朗克分子遗传学研究所和Charité – Universitätsmedizin Berlin的科学家已经证明，DNA重复序列是否与人类疾病相关，取决于它们在基因组中的位置，序
《自然》：2种疟疾寄生虫基因组序列测定
疟疾裂殖子 一个由美英等国科学家组成的国际研究小组近日测定了两种致命疟疾寄生虫的基因组序列。这两种疟疾寄生虫分别名为Plasmodium knowlesi和Plasmodium vivax，其中P. knowlesi最近被认为是感染人类的一个主要疟疾病原体，而P. vivax则会致人极度虚弱，
《自然》：美开发DNA序列分拣碳纳米管新法
碳纳米管为长形细小的石墨圆筒，具有电子学和热力学等多方面的特征，这些特征随着碳纳米管的形状和结构变化而有所不同。人们发现，碳纳米管多重性特征致使其本身有能力应用于电子学、激光器、传感器和生物医学，同时也能作为复合材料中的增强元素。 目前用于生产碳纳米管的方法所获得的是由粗细各异和对
小鼠基因组DNA抽提操作规程
一、原理与意义先用细胞裂解液对已制备好的组织匀浆充分裂解，然后用蛋白酶去除其中的蛋白，再用氯仿一次抽提（无需用酚抽提）、预备液沉淀、RNase去除RNA、乙醇再沉淀即可得到完整DNA。该方法适用于从人或动物的各种组织、血液、培养细胞、G+/G-细菌中快速抽提基因组DNA。抽提出来的DNA能用于几乎所
Nature－突破丨刘晓东/陈家斌等首次构建人类胚胎样结构
一直以来，我们对人类生命起源的探索从未停止，但是由于人类胚胎资源的限制，我们对胚胎细胞的增殖分化以及组织器官发育的了解非常局限。 人类早期胚胎主要由上胚层(epiblast, EPI)、原始内胚层(primitive endoderm, PE)及滋养外胚层(trophectoderm, TE)
－王晓东博士入选EMBO外籍成员
当地时间5月7日，欧洲分子生物学组织(EMBO, European Molecular Biology Organization)公布了新当选成员名单，北京生命科学研究所王晓东博士入选EMBO外籍成员。 在成立50周年之际,EMBO今年战略性地扩充了106位优秀的生命科学家成员，以向该
Nature－Methods：De－Novo基因组序列组装的新方法
对于de novo人类基因组序列组装而言，短读长简直意味着不可能的任务。不过，加州大学旧金山分校、BioNano Genomics和10X Genomics的研究人员近日开发出一种新的组装方法，它将short-read测序与10X的linked-read测序相结合。这项成果于近日发表在《Natu
卢晓东：异地高考方案需要提问发改委
两会之前，山东省对放开异地高考有所表态，预计2014年将允许非户籍考生在山东参加高考。山东省的表态表面看似积极，但由于该省高等教育资源相对稀缺，高考成绩已经很高，非户籍考生理智上不会选择在山东高考，因此这个表态虽然积极，并无特别的代表性，对其他省市特别是京沪以及西部省区没有什么示范作用
王晓东和他的生物学“舰队”
王晓东（左四）指导科研团队 冬日午后，暖阳化作一片金黄，轻轻地爬上北京生命科学研究所（以下简称北生所）的大楼。北生所所长王晓东坐在窗边，用他那醇厚而富有磁性的嗓音与记者交谈，面孔也染上了这抹金黄。 这位谦谦君子有着多重身份：除了北生所所长一职，他还是美国科学院院士、中国科学院外籍院士。已天
王晓东和他的生物学“舰队”
王晓东（左四）指导科研团队 北生所供图 冬日午后，暖阳化作一片金黄，轻轻地爬上北京生命科学研究所（以下简称北生所）的大楼。北生所所长王晓东坐在窗边，用他那醇厚而富有磁性的嗓音与记者交谈，面孔也染上了这抹金黄。 这位谦谦君子有着多重身份：除了北生所所长一职，他还是美国科学院院
Nature子刊构建小鼠基因组CRISPR导向RNAs文库
研究人员开发出一种方法，构建出了一个可诱导小鼠基因组全基因靶向突变的CRISPR导向RNA(gRNAs)综合文库。人们可利用这一文库来调查不同细胞类型中每个基因的作用。这一突破性的研究成果在线发表在12月23日的《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上。 CR
程耿东院士：我觉得，这是我的责任
程耿东 在世界结构与多学科优化领域，国际结构与多学科优化学会是一个响当当的组织。自1991年创立以来，该学会已经发展成了拥有国际会员总数1800余人，供相关专家交流新思想、新方法、新应用的国际顶级学术机构。 每隔4年，国际结构与多学科优化学会的执行委员就会选举一次。2015年，又到了该学会选举新
DNA微序列技术
· Protocols for Making Drosophila Arrays (Stanford U.)Detailed protocol for making arrays including PCR Amplification of cDNAs for Printing,
DNA－序列分析技术
试剂、试剂盒 琼脂糖TE 水饱和酚无水乙醇70％乙醇TEMED测序酶溴化乙锭仪器、耗材 电泳仪离心管离心机冰浴箱恒温板DNA 测序仪
DNA－序列分析技术
DNA序列分析技术可用于：（1）分析物种的遗传多样性；（2）鉴定新的物种；（3）用于比较基因组学。实验方法原理本节描述运用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自动DNA 测序仪进行双链DNA 测序的方法。热循环测序反应使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDe
DNA序列测定技术
DNA序列测定技术序列测定的技术和策略Sanger双脱氧链终止法Maxam－Gilbert DNA化学降解法测序策略 目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等（1977）提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭，但这两种方法都是同样生成互相独立的
DNA－序列分析技术
实验方法原理 本节描述运用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自动DNA 测序仪进行双链DNA 测序的方法。热循环测序反应使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDeoy TM Terminator
DNA序列测定技术
DNA序列测定技术序列测定的技术和策略Sanger双脱氧链终止法Maxam－Gilbert DNA化学降解法测序策略目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等（1977）提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭，但这两种方法都是同样生成互相独立的若干