汉字首登Nature农科院等完成亚洲栽培稻基因组变异研究
水稻是全世界最重要的粮食作物之一，对水稻全球品种进行基因组研究，对于挖掘有利等位基因和指导基于全基因组信息的分子育种具有重大的理论和实践意义，是关系着国家乃至全球粮食安全的重大战略问题。 2011年9月，全球3000份水稻核心种质资源基因组项目（3K Rice Project）正式启动，该项目是由中国农业科学院的黎志康研究员主持，联合国际水稻研究所和华大基因共同参与的重大国际合作研究项目。2014年5月，3000份水稻基因组序列与世界饥饿日公开发布于 Giga Science 杂志，同时测序数据发布在NCBI, DDBJ，Giga Science 以及阿里云等数据库,供全世界下载。在3,000份水稻基因组初步分析的基础上建立了SNP数据库（Rice SNP-Seek Database）、3K 泛基因组数据库（RPAN: RicePan-genome Browser）等多个数据库。泛基因组和结构变异（SVs）原始数据将发布在......阅读全文
迄今分辨率最高的野生稻栽培稻泛基因组图谱绘就
亚洲栽培稻驯化历史可追溯至一万年前的普通野生稻。 面对全球人口增长和气候变化加剧的双重压力，如何将野生稻历经万年锤炼的“生存智慧”注入现代品种，培育出兼具高产潜力与抗病抗逆特性的“超级水稻”已成为重要研究课题。然而，传统依赖单一参考基因组的研究模式譬如以管窥天，仅能捕捉水稻遗传多样性的冰山一角。
汉字首登Nature－农科院等完成亚洲栽培稻基因组变异研究
水稻是全世界最重要的粮食作物之一，对水稻全球品种进行基因组研究，对于挖掘有利等位基因和指导基于全基因组信息的分子育种具有重大的理论和实践意义，是关系着国家乃至全球粮食安全的重大战略问题。 2011年9月，全球3000份水稻核心种质资源基因组项目（3K Rice Project）正式启动，该项目
中国科学家完成水稻5个“近亲”基因组测序
中国科学家３日说，他们完成了亚洲栽培稻（一般称为水稻）５个“近亲”的全基因组测序，获得了高质量的基因组参考序列。这有望进一步推动水稻品种的改良。 中国科学家在美国《国家科学院学报》上报告说，他们从２００７年至今，自主完成了尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展颖野生稻和南方野生
我国学者在野生稻基因解析和种质资源利用领域取得进展
图普通野生稻和亚洲栽培稻泛基因组及进化分析 在国家自然科学基金项目（批准号：32388201）等资助下，中国科学院分子植物科学卓越创新中心韩斌院士团队完成了145份亚洲栽培稻及普通野生稻的参考基因组级别的基因组组装，绘制了高质量“野生稻-栽培稻泛基因组图谱”，系统挖掘了普通野生稻广泛的遗传多样
植生生态所等在水稻驯化起源研究中取得新突破
最近，中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所国家基因研究中心韩斌课题组与中国水稻研究所及日本国立遗传所等单位合作，于10月4日在《自然》杂志在线发表了题为“水稻全基因组遗传变异图谱的构建及驯化起源”的论文。 水稻、小麦等农作物的驯化、栽培对人类文明的进程产生过重大的影响，
基因组研究让水稻育种走向精准设计
由中国主导的国际间科研大协作项目“3000份水稻基因组研究”26日结出硕果——北京时间当日凌晨1时，国际顶级学术期刊《自然》正式发表《3010份亚洲栽培稻基因组研究》。该研究针对水稻起源、分类和驯化规律进行了深入探讨，揭示了亚洲栽培稻的起源和群体基因组变异结构，剖析了水稻核心种质资源的基因组遗传
中科院合作研究发现野生稻并不“野”
中国科学院遗传发育所研究员储成才研究组和丹麦哥本哈根大学、美国加州大学伯克利分校研究人员合作开展的一项研究发现，野生稻基因组中有着人工选择驯化的痕迹，他们巧妙地证实有大量栽培稻基因流入野生稻群体。日前出版的美国《基因组学研究》杂志发表了这一成果。 研究人员通过对已发表的大量野生稻和栽培稻基因
研究发现野生稻并不“野”
中国科学院遗传发育所研究员储成才研究组和丹麦哥本哈根大学、美国加州大学伯克利分校研究人员合作开展的一项研究发现，野生稻基因组中有着人工选择驯化的痕迹，他们巧妙地证实有大量栽培稻基因流入野生稻群体。日前出版的美国《基因组学研究》杂志发表了这一成果。 研究人员通过对已发表的大量野生稻和栽培稻基因组
野生稻并不“野”
近日，我国科学家对野生稻的研究取得了新进展，研究成果在线发表于《基因组学研究》杂志。他们发现，野生稻并不“野”，颠覆了之前科学家对野生稻的认知，很多相关理论都要重新思考和修订，对野生资源的科学保护也已刻不容缓。 普通野生稻一直被认为是亚洲栽培稻的野生祖先，也是水稻改良过程中的重要种质资源。普通
世界首个种间远缘杂交后代粳稻新品种选育成功
7月7日，“2021年度云南省科学技术奖励大会”在昆明海埂会堂举行。云南省农业科学院陶大云团队历时二十余年攻关，首次利用非洲栽培稻资源培育出国际上首个种间远缘杂交后代粳型水稻新品种“云稻一号”。该团队项目“稻属AA基因组种间杂种不育的遗传研究”荣获自然科学类一等奖。 据介绍，世界各国收集并保存的
中国科学家主导国际大协作助力水稻精准育种
英国时间4月25日，《自然》杂志长文报道由中国农业科学院作物科学研究所牵头，联合国际水稻研究所、上海交通大学、华大基因、深圳农业基因组研究所、安徽农业大学、美国亚利桑那大学等16家单位共同完成的3000份亚洲栽培稻基因组研究。 该研究针对水稻起源、分类和驯化规律进行了深入探讨，揭示了亚洲栽培稻
吃了一辈子的水稻，为何如此多样？
近日，中国农业科学院作物科学研究所水稻优异种质资源发掘与创新利用创新团队、作物基因组选择育种创新团队和华盛顿圣路易斯大学的肯·奥尔森团队合作完成了水稻（亚洲栽培稻）及其祖先种（普通野生稻）非编码区长链非编码RNA（lncRNA）的注释，研究了水稻lncRNA的进化历史，并从全基因组水平揭示了ln
高立志团队破解水稻“祖先”野生稻－优秀刻在基因里
水稻是世界上最重要的粮食作物之一，是中国第一大粮食作物，其产量多年来不断挑战着新高峰。然而被公认为水稻祖先的普通野生稻，却被列为了濒危植物。不同种类野生稻。（华南农业大学供图） 事实上，野生稻资源在应对未来水稻稳产高产的挑战中具有重大价值。 由于对生物多样性的认知逐渐深刻，近年来，我国对于野
昆明植物所破译稻属植物5个物种全基因组
亚洲栽培稻（一般称为水稻）是世界上最重要的粮食作物之一，是中国第一大粮食作物，养活了80％以上的中国人口。在水稻与其它约23个物种共同组成的稻属植物中，它和7个稻种（普通野生稻、尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展颖野生稻、长雄蕊野生稻和南方野生稻）都是AA基因组类型，这些水稻近缘物种间断分
农科院研究揭示水稻全基因组功能单倍型自然变异特征
近日，中国农业科学院作物科学研究所（以下简称作科所）水稻分子设计技术与应用创新团队构建了一个全基因组基因功能单倍型（gcHap）数据集，全面揭示了亚洲栽培稻基因功能单倍型自然变异特征，提出亚洲栽培稻多起源（驯化）假说，并开发了适用于功能单倍型数据全基因组关联分析和全基因组预测的软件包“HAPS”
大规模基因重测序确认亚洲栽培稻起源于中国
美国研究人员在一项通过大规模基因重测序分析稻米进化史的研究中确认，亚洲栽培稻起源于中国，最早可能8000多年前就出现在中国长江流域。 亚洲栽培稻是世界上最古老的农作物物种之一。此前曾有研究认为，亚洲栽培稻有两个起源地——印度和中国。但5月2日刊登在美国《国家科学院院
全球水稻去驯化、趋同野化的证据找到了
近日，开放获取期刊《基因组生物学》（Genome Biology）在线发表了全球首次杂草稻调查研究结果。浙江大学教授樊龙江领导的一个国际研究团队，通过对全球稻区杂草稻（俗称鬼稻）材料采集与分析发现，水稻在世界各稻区均存在野化或去驯化的现象，并描绘了野化水稻的基因组特征。该成果对水稻进化、资源利用
科学家揭示水稻“编码基因集”－有助提升产量
北京时间1月16日，《自然-遗传学》杂志在线发表了中国科学家题为“泛基因组分析揭示栽培稻和野生稻中基因组变异”的研究论文，该研究首次绘制了栽培稻-野生稻的泛基因组图谱，有助于育种家充分利用各类群水稻丰富的遗传变异，进一步提升中国水稻的产量潜力等。 这项研究由中科院分子植物科学卓越创新中心/植物
中科院，上海师范大学Nature－Genetics发文：
来自中科院植物生理生态研究所，上海师范大学生命与环境科学学院等处的研究人员发表了题为“Pan-genome analysis highlights the extent of genomic variation in cultivated and wild rice”的文章，通过泛基因组分析揭示
超级泛基因组助水稻种质资源遗传变异挖掘利用
水稻泛NLRs家族基因的共线性位点（左）；基于全基因组SNPs的水稻系统发生树（右）。中国农科院供图 近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所与国内多家高校、科研单位合作，组装了251份高质量的水稻基因组，构建了目前植物中群体规模最大、基因组充分注释、稻属中最为系统的超级泛基因组。该图谱
我科学家参与完成非洲稻基因组测序
最近，美国亚利桑那大学（UA）研究人员带领的一个国际研究小组，完成了非洲稻（Oryza glaberrima）的全基因组测序。中科院遗传与发育生物学研究所的陈明生（Mingsheng Chen）和Jinfeng Chen也参与了此项研究工作。相关研究结果，以“The genome sequenc
华中农大建成全球首个水稻基因索引数据库
华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室张建伟教授课题组近日发表最新研究成果，他们建成世界上首个基于同源基因的水稻泛基因组综合数据库——水稻基因索引数据库。据介绍，这个数据库如同一本近义词词典。在数据库里，亚洲稻的每一个基因都能轻松找到同源或相近的基因，以及追踪其演变历史。目前，数据库
中国科学家主导完成“绿色超级稻”国际扶贫项目
自2008年启动以来，由中国农业科学院主导的“为亚洲和非洲资源贫瘠地区培育绿色超级稻”国际农业科技扶贫项目，已在18个非洲和亚洲国家审定高产、优质、多抗品种78个，累计推广面积达612万公顷，令160万农户收入显著增加。 4月2日，“绿色超级稻”项目结题会在京举行。项目首席科学家、中国农科院作
华中农大建成全球首个水稻基因索引数据库
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498200.shtm 华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室张建伟教授课题组近日发表最新研究成果，他们建成世界上首个基于同源基因的水稻泛基因组综合数据库——水稻基因索引数据库。 据
128个环境适应性位点：有望培育广适性水稻
近日，《植物生物技术》（Plant Biotechnology Journal）在线发表了中国农业科学院作物科学研究所水稻优异种质资源发掘与创新利用团队与国际水稻研究所合作的最新成果。通过对185个野生稻和743个栽培稻品种进行关联分析，他们找到了128个与水稻环境适应性相关联的基因位点，解析了水稻
基于同源基因簇的水稻泛基因组综合数据库建成
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498300.shtm近日，华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室教授张建伟课题组联合国内外高校与科研机构在《自然—通讯》与《分子植物》连续发表两篇研究论文。这两项工作以代表亚洲稻群体结构的
科学家阐述水稻驯化分子遗传机制
将野生植物驯化为人赖以生存的栽培作物是人类历史上最伟大的创举之一，对人类文明的发展起到至关重要的作用。揭示作物驯化过程中一些重要性状发生改变的分子机制不仅有助我们认识从野生植物到栽培作物的演化规律，也为现代作物育种提供重要的理论基础。 水稻是世界最重要的粮食作物之一，也是驯化最早的作物之一。稻属
院士团队揭示控制水稻杂种不育的自私基因系统
中国农科院作物科学研究所水稻功能基因组学创新研究组万建民院士领衔的科研团队系统解析了水稻粳稻与籼稻杂种不育问题及遗传特性，发现自私基因系统控制水稻杂种不育，并影响稻种基因组的分化。该研究有望解决水稻杂种不育难题。相关研究成果在线发表于《科学（Science）》期刊。 自私基因是指双亲杂交后，父
Science－Advance|农科院揭示lncRNAs调控水稻农艺性状变异机制
2019年12月18日，Science Advances杂志在线发表了来自中国农业科学院作物科学研究所杨庆文团队、刘君团队和华盛顿圣路易斯大学的Ken Olsen团队完成了水稻（亚洲栽培稻）及其祖先种（普通野生稻）非编码区lncRNA的注释，结合多重组学方法研究了水稻lncRNA的进化历史，从全
中国农业科学家首次揭秘水稻自私基因
中国农业科学家系统解析了水稻粳稻与籼稻杂种不育问题及遗传特性，发现自私基因系统控制水稻杂种不育，影响稻种基因组的分化，并有望解决水稻杂种不育的难题。该项研究成果于6月8日在国际学术顶级期刊《科学（Science）》杂志上在线发表。该研究由中国农科院作物科学研究所与南京农业大学等单位合作完成，获得科技