植生生态所等在水稻驯化起源研究中取得新突破
最近，中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所国家基因研究中心韩斌课题组与中国水稻研究所及日本国立遗传所等单位合作，于10月4日在《自然》杂志在线发表了题为“水稻全基因组遗传变异图谱的构建及驯化起源”的论文。 水稻、小麦等农作物的驯化、栽培对人类文明的进程产生过重大的影响，也一直被公认为是人类历史上最伟大的发明之一。栽培作物的起源研究十分复杂，涉及植物学、遗传学、生物地理学、考古学和人口学等不同的自然和社会学科。作为一种极其重要的粮食作物，关于水稻起源、驯化过程的研究及驯化基因的鉴定分析一直是学术界的研究热点。根据已有的证据，目前普遍认为亚洲栽培稻是由亚洲的野生稻人工驯化而来，广泛分布于中国、东南亚及南亚的普通野生稻是亚洲栽培稻的野生祖先种。但是，亚洲栽培稻最早起源于哪里（中国、东南亚、南亚或是其他地区）？人类最先开始驯化的是同一类野生稻然后逐......阅读全文
我国科学家完成普通野生稻全基因组框架图谱绘制
2010年8月，中国科学院昆明植物研究所植物种质资源与基因组学研究中心中科院“百人计划”和云南省首届高端科技人才入选者研究员带领的植物种质资源、基因组学与生物信息学团队，历时一年，运用新一代高通量测序技术以及基于高性能超算的生物信息学分析，对野生稻全基因组测序取得了阶段性重大成果。日前
植生生态所等在水稻驯化起源研究中取得新突破
最近，中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所国家基因研究中心韩斌课题组与中国水稻研究所及日本国立遗传所等单位合作，于10月4日在《自然》杂志在线发表了题为“水稻全基因组遗传变异图谱的构建及驯化起源”的论文。 水稻、小麦等农作物的驯化、栽培对人类文明的进程产生过重大的影响，
植物所证实水稻是多次起源的产物
亚洲稻又称水稻（Oryza sativa L.）。亚洲稻包括粳稻（Japonica）和籼稻（Indica）两个亚种，不仅是最重要的粮食作物之一，也是理论研究中日益受到重视的模式生物。尽管迄今针对水稻开展了大量研究，但关于水稻起源/驯化的历史已争论了半个多世纪，存在各种推论和观点。目前存在两种主流假说
野生稻并不“野”
近日，我国科学家对野生稻的研究取得了新进展，研究成果在线发表于《基因组学研究》杂志。他们发现，野生稻并不“野”，颠覆了之前科学家对野生稻的认知，很多相关理论都要重新思考和修订，对野生资源的科学保护也已刻不容缓。 普通野生稻一直被认为是亚洲栽培稻的野生祖先，也是水稻改良过程中的重要种质资源。普通
迄今分辨率最高的野生稻栽培稻泛基因组图谱绘就
亚洲栽培稻驯化历史可追溯至一万年前的普通野生稻。 面对全球人口增长和气候变化加剧的双重压力，如何将野生稻历经万年锤炼的“生存智慧”注入现代品种，培育出兼具高产潜力与抗病抗逆特性的“超级水稻”已成为重要研究课题。然而，传统依赖单一参考基因组的研究模式譬如以管窥天，仅能捕捉水稻遗传多样性的冰山一角。
上海生科所Nature基因组研究新成果
近日来自中科院上海生命科学研究院、日本国立遗传学研究所和中国农业科学院的研究人员通过绘制水稻基因组变异图谱揭示栽培稻(cultivated rice)的起源，相关论文“A map of rice genome variation reveals the origin of cultivate
研究发现野生稻并不“野”
中国科学院遗传发育所研究员储成才研究组和丹麦哥本哈根大学、美国加州大学伯克利分校研究人员合作开展的一项研究发现，野生稻基因组中有着人工选择驯化的痕迹，他们巧妙地证实有大量栽培稻基因流入野生稻群体。日前出版的美国《基因组学研究》杂志发表了这一成果。 研究人员通过对已发表的大量野生稻和栽培稻基因组
遗传发育所等完成短花药野生稻基因组测序及分析
稻属是从事植物比较、进化和功能基因组学研究的理想系统。野生稻蕴含着宝贵的基因资源。为了更好地利用稻属的野生资源，美国亚利桑那大学的Rod Wing教授在2009年发起了国际稻属基因组计划(I-OMAP)，旨在构建稻属所有物种的全基因组序列图谱，并在此基础上开展比较、进化和功能基因组学研究。
中科院、华大基因Nature子刊测序新成果
来自中科院遗传与发育生物学研究所、深圳华大基因研究院和亚利桑那大学等机构的研究人员完成了对短花药野生稻(Oryza brachyantha)的全基因组测序，并揭示出了稻属基因组进化的机制。相关成果发表在3月12日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。
云南建立三种野生稻基因文库
云南省农科院生物技术与种质资源研究所目前已为该省分布的三种野生稻建立了基因文库。 云南省农科院生物技术与种质资源研究所副所长程在全博士接受新华社记者专访时表示，在优异种质基因发掘研究方面，研究所首次构建了普通野生稻、疣粒野生稻和药用野生稻cDNA文库，并从中发现和分离获得一大批野生稻重要功能基因
中国科学家完成水稻5个“近亲”基因组测序
中国科学家３日说，他们完成了亚洲栽培稻（一般称为水稻）５个“近亲”的全基因组测序，获得了高质量的基因组参考序列。这有望进一步推动水稻品种的改良。 中国科学家在美国《国家科学院学报》上报告说，他们从２００７年至今，自主完成了尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展颖野生稻和南方野生
多重基因编辑改善野生稻农艺性状
近日，中国农业科学院农业基因组研究所超级稻种质创新团队利用多重基因编辑成功改善了野生稻农艺性状，为现代育种工作提供了新策略。相关研究成果发表在《植物学报（英文版）》（Journal of Integrative Plant Biology）上。水稻的栽培品种起源于野生稻。在长期的驯化过程中，野生稻中
科学家发现野生稻“长寿基因”
中国科学院分子植物科学卓越创新中心韩斌院士团队、王佳伟研究员团队合作，首次克隆了决定野生稻多年生习性的关键基因Endless Branches and Tillers 1（EBT1），并阐明了该基因座位表达模式的改变，是水稻在驯化过程中由多年生“长寿”植物变为一年生“短命”植物的导火索，深化了人们对
昆明植物所破译稻属植物5个物种全基因组
亚洲栽培稻（一般称为水稻）是世界上最重要的粮食作物之一，是中国第一大粮食作物，养活了80％以上的中国人口。在水稻与其它约23个物种共同组成的稻属植物中，它和7个稻种（普通野生稻、尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展颖野生稻、长雄蕊野生稻和南方野生稻）都是AA基因组类型，这些水稻近缘物种间断分
我国首个普通野生稻高通量优异基因发掘平台发布
近日，中国农业科学院作物科学研究所水稻优异种质资源创新利用创新团队首次组装了普通野生稻单倍型无间隙染色体基因组，构建了野生稻种质资源优异基因发掘利用与种质创新的平台，并鉴定了关键的耐盐与抗稻瘟病基因。相关研究成果发表在《自然通讯》（Nature Communications）上。栽培稻是由二倍体普通
我国首个普通野生稻高通量优异基因发掘平台发布
近日，中国农业科学院作物科学研究所水稻优异种质资源创新利用创新团队首次组装了普通野生稻单倍型无间隙染色体基因组，构建了野生稻种质资源优异基因发掘利用与种质创新的平台，并鉴定了关键的耐盐与抗稻瘟病基因。相关研究成果发表在《自然通讯》（Nature Communications）上。栽培稻是由二倍体普通
守护东南亚野生动物多样性
中国西南和东南亚是北半球生物多样性最丰富的地区，据统计，东南亚涵盖了全球约20％的植物、动物和海洋物种，全境都是生物多样性热点地区。所谓“生物多样性热点”指的是生物物种高度集中，且面临高度破坏威胁的地区。团队在Zeyardan村驻地处理标本 在中科院昆明动物所，就有这样一个研究团队——东南亚野
花生二倍体野生种全基因组测序完成
国际花生基因组计划(International Peanut Genome Initiative, IPGI)——由多国作物遗传学家参与的国际团队，于2014年4月2日宣布，历经数年努力后成功完成了世界上首个花生全基因组测序。新测定的花生基因组序列将为世界各地的研究人员和植物育种者使用，来促
吃了一辈子的水稻，为何如此多样？
近日，中国农业科学院作物科学研究所水稻优异种质资源发掘与创新利用创新团队、作物基因组选择育种创新团队和华盛顿圣路易斯大学的肯·奥尔森团队合作完成了水稻（亚洲栽培稻）及其祖先种（普通野生稻）非编码区长链非编码RNA（lncRNA）的注释，研究了水稻lncRNA的进化历史，并从全基因组水平揭示了ln
作物基因组学研究进展（一）
作物基因组学研究进展农作物基因组学研究的发展，对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展，已经实现对重要农作物，如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序，在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了２０１8年度主要农
基因组所合作研究揭开两种家养水稻起源进化“篇章”
6月9日，在最新一期的PLOS Genetics上，来自中国科学院北京基因组研究所的吴仲义研究员和中山大学施苏华教授发表了合作研究文章《水稻基因组两种进化历史：驯化基因的角色》(Two Evolutionary Histories in the Genome of Rice: the R
花生基因组宣称花生二倍体野生种全基因组测序完成
国际花生基因组计划4月2日在美国弗吉尼亚州亚历山大市宣布，包括中方合作单位在内的多国科研人员已经成功完成花生基因组测序，将为选育更高产、适应性更广的花生品种提供帮助。 国际花生基因组计划宣称，花生全基因组测序取得的重大进展，分别代表花生属A基因组和B基因组的两个二倍体野生种的全基因组测序已
浙大教授Nature子刊：水稻基因组重测序及群体遗传学研究
浙江大学农业与生物技术学院作物科学研究所，中国水稻研究所的研究人员发表了题为“Genomic variation associated with local adaptation of weedy rice during de-domestication” 的文章，以杂草稻群体为材料，通过基因组
中科院合作研究发现野生稻并不“野”
中国科学院遗传发育所研究员储成才研究组和丹麦哥本哈根大学、美国加州大学伯克利分校研究人员合作开展的一项研究发现，野生稻基因组中有着人工选择驯化的痕迹，他们巧妙地证实有大量栽培稻基因流入野生稻群体。日前出版的美国《基因组学研究》杂志发表了这一成果。 研究人员通过对已发表的大量野生稻和栽培稻基因
超级泛基因组助水稻种质资源遗传变异挖掘利用
水稻泛NLRs家族基因的共线性位点（左）；基于全基因组SNPs的水稻系统发生树（右）。中国农科院供图 近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所与国内多家高校、科研单位合作，组装了251份高质量的水稻基因组，构建了目前植物中群体规模最大、基因组充分注释、稻属中最为系统的超级泛基因组。该图谱
我科学家参与完成非洲稻基因组测序
最近，美国亚利桑那大学（UA）研究人员带领的一个国际研究小组，完成了非洲稻（Oryza glaberrima）的全基因组测序。中科院遗传与发育生物学研究所的陈明生（Mingsheng Chen）和Jinfeng Chen也参与了此项研究工作。相关研究结果，以“The genome sequenc
中国科学家揭示杂草稻遗传机制，指导精准防控
杂草稻是田间的“山寨版”水稻，直接导致稻田减产，品质下降。浙江大学联合中国水稻研究所的科研人员通过基因组重测序及分析，揭示了杂草稻的遗传机制，为杂草稻防治奠定理论基础。相关论文日前在线发表在《自然·通讯》杂志上。 “杂草稻出现在田间，与正常的栽培水稻争阳光、水和养分，严重影响着水稻产量与品
中国科学家揭示杂草稻遗传机制，指导精准防控
“杂草稻出现在田间，与正常的栽培水稻争阳光、水和养分，严重影响着水稻产量与品质。杂草稻米粒口感坚硬粗糙，如果农民在收割时混入了杂草稻，大米就卖不出好价钱。” 浙江大学农业与生物技术学院作物科学研究所教授樊龙江说。 在田间，杂草稻是一枚“潜伏者”。从苗期开始，杂草稻就与栽培水稻一同拔节长叶，外形
拯救“植物大熊猫”－云南野生稻研究获重大进展
记者8月25日从云南省农科院生物技术与种质资源研究所了解到，云南野生稻保护与遗传特性研究取得重大进展，研究成果被包括中国科学院院士在内的鉴定专家组肯定为“整体成果达到国际先进水平，部分成果达到国际领先水平”。 云南省农科院生物技术与种质资源研究所副所长程在全介绍，野生稻是水稻的原始祖先，被专家称为“
专家呼吁：用边际性土地资源发展生物质能源
国家发改委等部门制定的《可再生能源发展“十二五”规划》提出，到2015年，生物燃料乙醇利用量将达到400万吨，但2011年我国燃料乙醇产量仅为169万吨。发展生物燃料如何破解不与民争粮、不与粮争地，日前中科院昆明植物研究所中国西南野生生物种质资源库副主任高立志博士接受采访时指出，大多数木本油料植