超级泛基因组助水稻种质资源遗传变异挖掘利用

水稻泛NLRs家族基因的共线性位点(左);基于全基因组SNPs的水稻系统发生树(右)。中国农科院供图 近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所与国内多家高校、科研单位合作,组装了251份高质量的水稻基因组,构建了目前植物中群体规模最大、基因组充分注释、稻属中最为系统的超级泛基因组。该图谱的完成将极大地促进水稻功能基因挖掘和水稻种质资源利用。相关成果发表于《细胞研究》(Cell Research)。 该研究通过地理分布来源、基因型和表型变异,精心选择了具有高度代表性的202份亚洲栽培稻核心种质材料、28份普通野生稻、11份非洲栽培稻和10份短舌野生稻进行测序组装。为准确比较等位基因在不同水稻材料中的遗传变异,研究人员还利用高质量的群体基因组构建了基于基因组序列比对的泛基因组图谱,并对每个变异位点进行基因注释和序列整合。该图谱囊括了目前最全面的水稻基因序列的复等位信息,为水稻比较基因组学和进化基因组学研究提......阅读全文

全球水稻核心种质资源重测序在深圳启动

  由中国农科院、国际水稻所和华大基因研究院协作开展的“全球3000份水稻核心种质资源重测序重大科研项目”11月15日在深圳启动,将在2012年年内完成并向全球发布。  这一项目的启动意味着水稻全基因分子育种全面展开。国际水稻研究所所长罗伯特·瑞格勒表示,这是具有里程碑意义的事件

这项研究为水稻的种质创新带来更多可能

近日,电子科技大学生命科学与技术学院真菌与植物功能基因组学研究团队开发并展示了TadA-8e来源的胞嘧啶碱基编辑系统TadCBEs,和双碱基编辑系统TadDE能够用于高效率、高纯度、高特异性的植物基因组编辑,为水稻等农作物的种质创新带来更多的可能性,具有巨大的应用潜力。相关成果发表于《自然-通讯》上

这项研究为水稻的种质创新带来更多可能

近日,电子科技大学生命科学与技术学院真菌与植物功能基因组学研究团队开发并展示了TadA-8e来源的胞嘧啶碱基编辑系统TadCBEs,和双碱基编辑系统TadDE能够用于高效率、高纯度、高特异性的植物基因组编辑,为水稻等农作物的种质创新带来更多的可能性,具有巨大的应用潜力。相关成果发表于《自然-通讯》上

全球三千份水稻核心种质重测序项目即将发布

  在深圳市大鹏新区召开的中国农业科学院深圳生物育种创新研究院科研用房升级改造工程启动仪式上披露,由该创新研究院主导的全球3000份水稻核心种质的重测序项目接近完成,即将向全球发布。   据介绍,3000份核心资源基本涵盖了世界上主要水稻品种的遗传多样性,其基因组测序的完成,将搭建起一个包含水稻全

能够合成辅酶Q10的水稻新种质来了

  辅酶Q10要不要补?什么情况下补?怎么选?……在社交平台上,经常能看到此类咨询帖。辅酶Q10与人体健康,尤其是心脏健康息息相关,是近年来最受欢迎的膳食补充剂之一。  然而,辅酶Q10不容易被人体吸收,且有些市售产品单片药的辅酶Q10含量达200毫克,导致一些因剂量过大造成的副作用随之产生。  中

利用PLSM定向进化可为水稻育种提供遗传新种质

  遗传变异是作物育种基础。尽管近年来功能基因组研究为作物分子育种提供了大量主效改良位点/基因;但由于传统诱变靶向性不足、突变随机性较大等技术问题,在多数情况下,挖掘和鉴定主效基因最适等位型仍较为困难。如何在体内实现重要基因关键位点的饱和氨基酸突变是该类研究的难点问题。  2021年6月10日,安徽

“水稻种质资源开发及超级稻创制”新品会在海南召开

   4月11日,江西省重大科技专项“水稻种质资源开发及超级稻创制”水稻新品种2015年现场观摩会在海南三亚市召开。江西省科技厅党组书记郭学勤、副厅长卢福财出席会议并讲话,江西农业大学原党委书记石庆华、江西省农科院副院长余传元、江西省种子管理局相关负责人参加会议并代表部门和专家讲话,项目实施单位——

超级泛基因组助水稻种质资源遗传变异挖掘利用

 水稻泛NLRs家族基因的共线性位点(左);基于全基因组SNPs的水稻系统发生树(右)。中国农科院供图 近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所与国内多家高校、科研单位合作,组装了251份高质量的水稻基因组,构建了目前植物中群体规模最大、基因组充分注释、稻属中最为系统的超级泛基因组。该图谱

抗白叶枯病和细菌性条斑病水稻新种质创制成功

  4日,记者从中国农业科学院获悉,该院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队与作物科学研究所等国内科研单位合作,采用基因编辑等方法,快速创制出对白叶枯病和细菌性条斑病具有广谱抗性的水稻新种质,为水稻抗病生物育种提供了新策略。相关研究成果发表在国际期刊《植物生物技术》(《Plant Bio

种质细胞的概念

中文名称种质细胞英文名称germ cell定  义多细胞生物体内能分化成配子的前体细胞。应用学科遗传学(一级学科),发育遗传学(二级学科)

种质资源库对入库种质资源的要求是什么?

    种植资源是人类的宝贵财富,种植资源中蕴藏着丰富多样的基因资源,是育种专家培育农畜新品种的重要素材来源。而为了保存这些种质资源,人们采用种质资源库这种保温隔湿的设备来保存,通过常年保持低温干燥的环境,来减缓种子新陈代谢的速度,延长种子寿命,使种子在几乃至近百年仍不丧失原有的遗传性和发芽能力。 

海南椰子种质资源特点

椰子种质资源的特性是决定其开发价值的主要因素,因此科研人员针对海南椰子,选取了海南高种、马哇、文椰78F1、黄矮、绿矮和红矮6个品种作为分析对象。通过分析其特性,总结出了它们之间的差异性和稳定性。其中各类品种的椰子都能够从种质资源库得到。差异性对比主要分析海南椰子各品种间在形态特征、椰果组分和品质上

种质资源研究技术方案

《史记》有云:“王者以民人为天,而民人以食为天。”粮食问题在中国历朝历代都占据着极其重要的位置。新中国成立后,解决粮食问题、保证14亿中国人民的粮食安全更是政府工作的重中之重。中共中央、国务院2004年至2020年已连续十七年发布以“三农”(农业、农村、农民)为主题的中央一号文件,强调了“三农”问题

哪种质谱最厉害?

据说能用上质谱的实验室都不差钱,呸,谈钱多俗!恩,据说用质谱的实验室都在干大事!~看看这些质谱,你用过哪些?  四极杆质谱仪,QMS      QMS是最常见的质谱仪器,定量能力突出,在GC-MS中QMS占绝大多数。   优点:      结

银杏种质资源保存方式

我们知道,种质资源的保存非常有必要,只有做好种质资源保护工作,才能为育种研究提供更多材料。以银杏种质资源来说,种质保存方式主要有三种:①就地保存。指在银杏生长所在地通过保护银杏原来所处的自然生态条件来保存银杏种质。种质就地保存主要有两个方面:一是适当地建立野生银杏的自然保护区,这是自然资源保存的永久

木荷种质资源库确定为国家林草种质资源库

日前,国家林业和草原局发布公告,中国林业科学研究院亚热带林业研究所(以下简称亚林所)支撑建设的浙江省龙泉林科院木荷种质资源库新增为国家级林木种质资源库。这是目前全国唯一的国家木荷种质资源库,意味着亚林所收集保存的木荷育种资源得到了国家认可。这批新增的国家林木种质资源库是国家围绕“绿化、彩化、珍贵化”

采取林木种质资源保存库开展种质资源离体保存的重要性

   林木种质资源是良种选育的基础材料,也是国家重要的战略资源,近年来为了更好的收集和保存林木种质资源,建立完善的林木种质资源普查信息管理体系,林木种质资源保存库的应用变得越来越重要,尤其是在种质资源离体保存方面,发挥了其重要的作用。   林木种质资源保存的原则是:   第一,以保护濒危树种不灭绝,

种质资源库应用价值

随着气候环境和社会环境的改变,越来越多的农作物、林木种质资源等需要被保护,以避免消失的厄运。虽然我国对种质资源的认识起步较晚,但是由于种质资源的价值非常高,因此种质资源的保护和挖掘利用也得到了足够的重视,不少地区更是建立了专业的种质资源库来进行保存和保护。下面就来简单介绍一下种质资源库的应用价值。种

桑黄菌的种质资源

  关于桑黄菌种质,目前已经作为产品提供的鉴定标本中被当作桑黄菌使用的物种就有很多,但所述桑黄菌均属于木层孔菌(Phellinus Quél)。该属很多子实体都具有褐色蹄形的共同点,因此宏观上很多种具有相似之处。[1]

粳稻种质资源耐碱性鉴定条件和指标

种质资源库能够利用仪器设备控制贮藏环境,长期贮存作物种质的仓库。又称基因库。农作物种质资源库能够保存和收集各种农作物品种种子,科学的加以贮藏,对于品种改良,培育高产、优质、抗逆性强的新品种,具有重要意义。程广有等通过不同碱胁迫强度下对水稻株高、分蘖数及总绿叶数的研究指出,在pH8·6碱胁迫条件下较适

直链淀粉含量对水稻品质的影响

  低直链淀粉含量水稻,具有米饭柔软、外观油润光泽、冷不回生、膨化性好等特点,不仅成为人们直接煮食的特优稻米,也是加工方便调理米饭、膨化食品和各种米类点心的上等原料。低直链淀粉含量的种质,将是低直链淀粉含量水稻选育及淀粉合成研究的优质资源材料。直链淀粉测定仪能够用于快速测定直链淀粉的含量。  近几年

基因组研究让水稻育种走向精准设计

  由中国主导的国际间科研大协作项目“3000份水稻基因组研究”26日结出硕果——北京时间当日凌晨1时,国际顶级学术期刊《自然》正式发表《3010份亚洲栽培稻基因组研究》。该研究针对水稻起源、分类和驯化规律进行了深入探讨,揭示了亚洲栽培稻的起源和群体基因组变异结构,剖析了水稻核心种质资源的基因组遗传

我国超级稻基因组数据从“云端”向全球共享

  “我们的3000份绿色超级稻基因组原始测序数据,覆盖了全球25万份种质基因全部遗传变异的95%。这份核心数据,将正式通过阿里云平台,向全球免费开放。”9月15日,中国农业科学院、阿里云计算有限公司、华智水稻生物技术有限公司、北京聚道科技有限公司在长沙共同启动“云之稻项目”,中国农科院农作物基因资

华中农大建成全球首个水稻基因索引数据库

华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室张建伟教授课题组近日发表最新研究成果,他们建成世界上首个基于同源基因的水稻泛基因组综合数据库——水稻基因索引数据库。据介绍,这个数据库如同一本近义词词典。在数据库里,亚洲稻的每一个基因都能轻松找到同源或相近的基因,以及追踪其演变历史。目前,数据库

稻米中直链淀粉含量的测定及水稻品种淀粉含量的多样性

  稻米胚乳中最主要的成份是淀粉,在含水量为14%的精米中,淀粉占77%~78%,它由直链淀粉和支链淀粉组成。其中直链淀粉含量是稻米食味品质的主要决定因素,在一定范围内直链淀粉含量越低,米质越好。有研究表明,随着直链淀粉含量的增加,抗性淀粉含量也随之增加。  本文主要研究的水稻,来自日本、韩国、中国

华中农大建成全球首个水稻基因索引数据库

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498200.shtm 华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室张建伟教授课题组近日发表最新研究成果,他们建成世界上首个基于同源基因的水稻泛基因组综合数据库——水稻基因索引数据库。 据

数据平台让水稻更易“读懂”-以水稻为研究对象的数据库

  水稻生物学数据库众多、信息量大,但大多是生物学原始数据;国内传统种质资源数据库鲜有二次开发功能;国内缺少整合多学科数据的集成性数据库……如何从海量数据中挖掘有用信息提供给农业科研工作者,一直是个难题。中国水稻研究所鄂志国、王磊、庄杰云等创建了“国家水稻数据中心”(http://www.riced

遗传发育所等在亚洲稻群体结构和演化研究中取得进展

  亚洲栽培稻是世界上最重要也是最古老的粮食作物之一,在亚洲文明和日常生活中扮演着举足轻重的角色。水稻起源问题也引起了广泛的研究兴趣。经过一个多世纪不同学科研究者的不断探索,已经积累了大量水稻驯化起源知识。但水稻驯化是单次起源还是多次起源尚没有统一结论。  美国农业部(USDA)种质资源库在过去10

几种质谱仪常用进样技术

在室温和常压下,气态或液态样品可通过一个可调喷口装置以中性流的形式导入离子源。吸附在固体上或溶解在液体中的挥发性物质可通过顶空分析器进行富集,利用吸附柱捕集,再采用程序升温的方式使之解吸,经毛细管导入质谱仪。对于固体样品,常用进样杆直接导入。将样品置于进样杆顶部的小坩埚中,通过在离子源附近的真空环境

基因工程“番”新种质资源

  我国是番茄第一生产大国。随着全球气候变暖趋势加剧,高温严重影响番茄的生长发育。此外,从品种培育的角度来看,我国番茄种业也面临着原始创新能力不足、原创性成果少等问题。因此,通过基因工程手段培育抗高温的作物新品种成为重要途径之一。  近年来,扬州大学生物科学与技术学院教授丁海东课题组在番茄抗盐方面已