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超级泛基因组助水稻种质资源遗传变异挖掘利用

水稻泛NLRs家族基因的共线性位点(左);基于全基因组SNPs的水稻系统发生树(右)。中国农科院供图 近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所与国内多家高校、科研单位合作,组装了251份高质量的水稻基因组,构建了目前植物中群体规模最大、基因组充分注释、稻属中最为系统的超级泛基因组。该图谱的完成将极大地促进水稻功能基因挖掘和水稻种质资源利用。相关成果发表于《细胞研究》(Cell Research)。 该研究通过地理分布来源、基因型和表型变异,精心选择了具有高度代表性的202份亚洲栽培稻核心种质材料、28份普通野生稻、11份非洲栽培稻和10份短舌野生稻进行测序组装。为准确比较等位基因在不同水稻材料中的遗传变异,研究人员还利用高质量的群体基因组构建了基于基因组序列比对的泛基因组图谱,并对每个变异位点进行基因注释和序列整合。该图谱囊括了目前最全面的水稻基因序列的复等位信息,为水稻比较基因组学和进化基因组学研究提......阅读全文

全球水稻核心种质资源重测序在深圳启动

  由中国农科院、国际水稻所和华大基因研究院协作开展的“全球3000份水稻核心种质资源重测序重大科研项目”11月15日在深圳启动,将在2012年年内完成并向全球发布。  这一项目的启动意味着水稻全基因分子育种全面展开。国际水稻研究所所长罗伯特·瑞格勒表示,这是具有里程碑意义的事件

全球三千份水稻核心种质重测序项目即将发布

  在深圳市大鹏新区召开的中国农业科学院深圳生物育种创新研究院科研用房升级改造工程启动仪式上披露,由该创新研究院主导的全球3000份水稻核心种质的重测序项目接近完成,即将向全球发布。   据介绍,3000份核心资源基本涵盖了世界上主要水稻品种的遗传多样性,其基因组测序的完成,将搭建起一个包含水稻全

利用PLSM定向进化可为水稻育种提供遗传新种质

  遗传变异是作物育种基础。尽管近年来功能基因组研究为作物分子育种提供了大量主效改良位点/基因;但由于传统诱变靶向性不足、突变随机性较大等技术问题,在多数情况下,挖掘和鉴定主效基因最适等位型仍较为困难。如何在体内实现重要基因关键位点的饱和氨基酸突变是该类研究的难点问题。  2021年6月10日,安徽

“水稻种质资源开发及超级稻创制”新品会在海南召开

   4月11日,江西省重大科技专项“水稻种质资源开发及超级稻创制”水稻新品种2015年现场观摩会在海南三亚市召开。江西省科技厅党组书记郭学勤、副厅长卢福财出席会议并讲话,江西农业大学原党委书记石庆华、江西省农科院副院长余传元、江西省种子管理局相关负责人参加会议并代表部门和专家讲话,项目实施单位——

超级泛基因组助水稻种质资源遗传变异挖掘利用

 水稻泛NLRs家族基因的共线性位点(左);基于全基因组SNPs的水稻系统发生树(右)。中国农科院供图 近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所与国内多家高校、科研单位合作,组装了251份高质量的水稻基因组,构建了目前植物中群体规模最大、基因组充分注释、稻属中最为系统的超级泛基因组。该图谱

种质资源库对入库种质资源的要求是什么?

    种植资源是人类的宝贵财富,种植资源中蕴藏着丰富多样的基因资源,是育种专家培育农畜新品种的重要素材来源。而为了保存这些种质资源,人们采用种质资源库这种保温隔湿的设备来保存,通过常年保持低温干燥的环境,来减缓种子新陈代谢的速度,延长种子寿命,使种子在几乃至近百年仍不丧失原有的遗传性和发芽能力。 

海南椰子种质资源特点

椰子种质资源的特性是决定其开发价值的主要因素,因此科研人员针对海南椰子,选取了海南高种、马哇、文椰78F1、黄矮、绿矮和红矮6个品种作为分析对象。通过分析其特性,总结出了它们之间的差异性和稳定性。其中各类品种的椰子都能够从种质资源库得到。差异性对比主要分析海南椰子各品种间在形态特征、椰果组分和品质上

哪种质谱最厉害?

据说能用上质谱的实验室都不差钱,呸,谈钱多俗!恩,据说用质谱的实验室都在干大事!~看看这些质谱,你用过哪些?  四极杆质谱仪,QMS      QMS是最常见的质谱仪器,定量能力突出,在GC-MS中QMS占绝大多数。   优点:      结

银杏种质资源保存方式

我们知道,种质资源的保存非常有必要,只有做好种质资源保护工作,才能为育种研究提供更多材料。以银杏种质资源来说,种质保存方式主要有三种:①就地保存。指在银杏生长所在地通过保护银杏原来所处的自然生态条件来保存银杏种质。种质就地保存主要有两个方面:一是适当地建立野生银杏的自然保护区,这是自然资源保存的永久

种质资源研究技术方案

《史记》有云:“王者以民人为天,而民人以食为天。”粮食问题在中国历朝历代都占据着极其重要的位置。新中国成立后,解决粮食问题、保证14亿中国人民的粮食安全更是政府工作的重中之重。中共中央、国务院2004年至2020年已连续十七年发布以“三农”(农业、农村、农民)为主题的中央一号文件,强调了“三农”问题