ScienceAdvance|​农科院揭示lncRNAs调控水稻农艺性状变异机制

2019年12月18日,Science Advances杂志在线发表了来自中国农业科学院作物科学研究所杨庆文团队、刘君团队和华盛顿圣路易斯大学的Ken Olsen团队完成了水稻(亚洲栽培稻)及其祖先种(普通野生稻)非编码区lncRNA的注释,结合多重组学方法研究了水稻lncRNA的进化历史,从全基因组水平揭示了lncRNAs调控水稻重要农艺性状变异的分子机制。 尽管高达90%的真核生物基因组能够发生转录,但仅2%的转录本能够编码蛋白。阐明非编码区变异对农艺性状多样性形成的作用机理具有重要意义,是揭示作物遗传变异的基础。研究结果表明,栽培稻中95%的lncRNA表达量下调,且下调的lncRNA在进化过程中具有与定向选择一致的显著分子特征,差异表达的lncRNAs靶基因富集于与碳固定能力和碳水化合物代谢相关的位点。部分lncRNAs表达量降低直接导致淀粉含量和粒重的增加,从而通过lncRNAs的全基因组注释重塑了水稻转录组的表......阅读全文

Science-Advance|​农科院揭示lncRNAs调控水稻农艺性状变异机制

  2019年12月18日,Science Advances杂志在线发表了来自中国农业科学院作物科学研究所杨庆文团队、刘君团队和华盛顿圣路易斯大学的Ken Olsen团队完成了水稻(亚洲栽培稻)及其祖先种(普通野生稻)非编码区lncRNA的注释,结合多重组学方法研究了水稻lncRNA的进化历史,从全

灵长类动物结构变异的机制

  2013年度基因组生物学大会(The Biology Of Genomes 2013)于5月7日晚在美国纽约冷泉港实验室召开。这是基因组学领域最大的会议之一,吸引了多个著名研究所的大牛参加。会议主题包括高通量基因组学和遗传学、复杂性状的遗传学、功能和癌症基因组学、计算基因组学、进化基因组学以

张德强团队深度解析林木次生生长遗传调控机制

  近日,北京林业大学教授张德强研究团队依托林木分子设计育种高精尖创新中心与国家重点研发计划课题,以毛白杨群体为模式,采用转录组测序、基因组重测序、SNP检测等技术手段及关联作图策略,系统揭示了林木次生微管组织差异表达lncRNAs的全基因组分布模式与表达规律,发现lncRNA保守序列元件主要与“维

Nature-Methods:针对LncRNAs的新型精准基因测序技术

  现在有一种新的基因测序技术-“捕获测序'(CaptureSeq),能使我们以更高的分辨率去探索人类基因组。它优于现有的基因测序技术,能精确捕捉测量许多具体的活性基因样品(即使基因的表达时间仅按分钟水平计算)。这个技术对癌症研究具有革命性的影响。在实际应用中,可用于包括许血液肿瘤的诊断。这篇文章由

Science、EMBO重要发现:编码蛋白质的lncRNAs

  不久之前,研究人员还认为RNA分为两类:生成蛋白质的编码RNAs和发挥结构作用的非编码 RNAs。发现小分子RNAs开启了全新的研究领域。然而现在研究人员兜了个圈又回到了原地,推测一些长链非编码RNAs可能生成了具有生物功能的小蛋白。近期发表在《EMBO Journal》杂志上的一项研究

汉字首登Nature-农科院等完成亚洲栽培稻基因组变异研究

  水稻是全世界最重要的粮食作物之一,对水稻全球品种进行基因组研究,对于挖掘有利等位基因和指导基于全基因组信息的分子育种具有重大的理论和实践意义,是关系着国家乃至全球粮食安全的重大战略问题。  2011年9月,全球3000份水稻核心种质资源基因组项目(3K Rice Project)正式启动,该项目

农科院研究揭示水稻全基因组功能单倍型自然变异特征

  近日,中国农业科学院作物科学研究所(以下简称作科所)水稻分子设计技术与应用创新团队构建了一个全基因组基因功能单倍型(gcHap)数据集,全面揭示了亚洲栽培稻基因功能单倍型自然变异特征,提出亚洲栽培稻多起源(驯化)假说,并开发了适用于功能单倍型数据全基因组关联分析和全基因组预测的软件包“HAPS”

科学家揭开耳聋基因变异分子机制

小核糖核酸miR-96变异是主因  英国科学家最近发表在美国《国家科学院院刊》(PNAS)上的一份研究报告称,小核糖核酸miR-96发生变异,可导致渐进性失聪。该分子机制的发现为改善听力损失和失聪的治疗手段奠定了基础。  该研究由英国谢菲尔德大学和剑桥桑格研究院等几所研究机构科学

《Cell》:lncRNAs开辟增强子生物学新时代

  长链非编码RNAs(long noncoding RNAs ,LncRNAs)是在真核生物中发现的一类长度大于200个核苷酸、没有长阅读框架、但往往具有mRNA结构特征的RNA。LncRNAs在基因组中存在普遍的转录现象,但较之编码蛋白质的基因,往往表达水平比较低。LncRNAs自身的表达水

多篇文章聚焦lncRNAs与人类健康的密切关联!

  长链非编码RNA(lncRNAs)因其重要的调控功能而受到全球科学家们的广泛关注,许多研究都表明,lncRNAs与多种人类疾病有千丝万缕的关系,其或会通过调控基因的转录,或会调节蛋白的功能。本文中,小编就整理了多篇研究报告,共同解读长链非编码RNA与人类健康的密切关联,分享给大家!  基因组扩增

中国农科院植保所揭示水稻抗病新机制

  近日,笔者从中国农业科学院植物保护研究所获悉,该所王国梁研究团队对泛素连接酶SPL11底物SPIN6蛋白在水稻抗病调控途径中的作用机理研究取得新进展。相关研究结果于2015年2月6日在线发表在院选SCI顶尖核心期刊《科学公共图书馆病原(PLoSPatho⁃gens)》上。  泛素蛋白酶体途径是真

-农科院深化机制体制改革-稳定经费并适度竞争

粮油加工创新团队首席科学家王强(左三)研究员在指导实验。中国农科院加工所提供   让科研人员从到处跑课题,到待在实验室里搞科研   走进北京中关村南大街12号,中国农业科学院的大院里,往日繁忙的景象没有了:主楼前停放的一排排汽车不见了,来回穿梭的人也少多了。岁末年初,本该是科研人员最忙碌的时候,

Science采用改进CRISPR技术-发现近500个新的lncRNAs

  长链非编码RNA (lncRNAs)是一类长度大约为200个核苷酸,但不编码任何蛋白的神秘分子,一直以来科学家们都想知道基因组中这类分子到底是起什么作用的。  12月15日Science杂志公布了一项最新研究发现:来自加州大学旧金山分校的研究人员识别出了499个新lncRNAs,这为理解这些小分

研究揭示桃红肉与成熟期协同变异机制

  近日,中国农业科学院郑州果树研究所桃资源与育种创新团队利用基因组学与分子生物学相结合技术,组装了红肉桃品种“天津水蜜”基因,发掘出红肉桃关键基因和遗传变异机制,并阐明了红肉性状和成熟期协同变异的分子机制,为多样化红肉桃育种奠定了基础。相关成果发表在《园艺研究》(Horticulture Rese

研究揭示桃红肉与成熟期协同变异机制

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517293.shtm近日,中国农业科学院郑州果树研究所桃资源与育种创新团队利用基因组学与分子生物学相结合技术,组装了红肉桃品种“天津水蜜”基因,发掘出红肉桃关键基因和遗传变异机制,并阐明了红肉性状和成熟期

中国农科院揭示蓝耳病病毒免疫抑制机制

   近日,中国农业科学院上海兽医研究所马志永研究员领衔的猪呼吸道传染病创新团队,揭示了高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(HP-PRRSV)抑制抗原递呈作用新机制,为深入理解猪繁殖与呼吸综合征病毒PRRSV的免疫抑制和免疫逃逸提供新认识。相关研究成果日前在线发表于《病毒学杂志》。  猪繁殖与呼吸综合征

中国农科院作物所揭示成花素基因分子新机制

  近日,由中国农业科学院作物科学研究所研究员毛龙领衔的创新团队在麦类作物模式植物二穗短柄草开花调控的分子机制研究中取得新进展。该研究从成花素基因FT2的可变剪切角度揭示了一个新成花素基因转录后调控的分子机制。相关研究成果在线发表于《自然》系列刊物《自然通讯》上。  据介绍,小麦抽穗期和开花期的调控

农科院种质资源所解析绿豆基因组及驯化机制

种质资源所农作物种质资源收集保护和评价创新团队在绿豆(Vigna radiata)基因组组装及驯化机制研究上取得新进展。研究论文“Telomere-to-telomere, gap-free genome of mung bean (Vigna radiata) provides insights

农科院专家揭示玉米抗倒伏性的新机制

 过表达ZmSPL12提高玉米抗倒伏性和单株产量              中国农科院供图近日,中国农业科学院生物技术研究所玉米功能基因组创新团队和华南农业大学合作,研究发现“类绿色革命”基因ZmSPL12通过调控D1基因转录增强玉米抗倒伏性的新机制,为玉米耐密株型改良提供了新的思路和基因源。相关研

陈润生院士、赵春华教授Cell子刊解析长链非编码RNA

  来自中科院生物物理研究所、中国医学科学院的研究人员证实,长链非编码RNA ADINR通过在转录水平上激活C/EBPα调控了脂肪生成。这项研究发布在10月15日的《Stem Cell Reports》杂志上。  中科院生物物理研究所的陈润生(Runsheng Chen)院士和中国医学科学院的赵春华

上千种lncRNAs-可能被定义为新的肿瘤标记物

  密西根大学综合癌症中心的研究者们最近对人类基因组中没有被详细研究过的长链非编码RNA (lncRNAs)进行了全面分析。他们发现lncRNAs可能在癌症中扮演很重要的角色,深入研究lncRNAs将会找到有利于癌症诊断,预后和治疗的新标记物。  LncRNAs在基因组研究领域很长一段时间以来都没有

抗原变异基因家族相互排斥性表达的分子机制

  2月6日,国际学术期刊《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所江陆斌课题组题为DNA helicase RecQ1 regulates mutually exclusive expression of virulence genes in Plasmodium fa

中国农科院狂犬病病毒感染机制研究取得进展

  近日,中国农业科学院哈尔滨兽医研究所重要人兽共患病与烈性外来病研究团队在狂犬病病毒(rabies virus,RABV)致病机制研究方面取得重要进展,发现代谢型谷氨酸受体2(mGluR2)为RABV入侵神经细胞的全新受体,相关研究在病原学权威期刊《公共科学图书馆—病原体》(PLOS Pathog

中国农科院植保所揭示双生病毒致病新机制

  近日,中国农业科学院植物保护研究所周雪平团队在国际知名期刊PLoS Pathogens上发表论文,揭示了双生病毒致病新机制。该研究第一作者为博士生梅玉振,通讯作者为周雪平。  双生病毒是在世界范围内普遍发生的一类植物DNA病毒,在番茄、烟草、棉花、玉米、小麦、豆类、木薯等经济和粮食作物上造成毁灭

中国农科院狂犬病病毒感染机制研究取得进展

  近日,中国农业科学院哈尔滨兽医研究所重要人兽共患病与烈性外来病研究团队在狂犬病病毒(rabies virus,RABV)致病机制研究方面取得重要进展,发现代谢型谷氨酸受体2(mGluR2)为RABV入侵神经细胞的全新受体,相关研究在病原学权威期刊《公共科学图书馆—病原体》(PLOS Pathog

同济大学康九红:lncRNAs如何精确调控干细胞基因转录

  来自同济大学生命科学与技术学院的研究人员发表了题为 “LincRNA-1614 coordinates Sox2/PRC2 mediated repression of developmental genes in pluripotency maintenance”的研究成果。着重揭示了多能干细

中国农科院研究揭示油菜生长能力和抗逆性同步提升机制

近日,中国农业科学院油料作物研究所油料作物营养与栽培团队研究揭示了氮驱动的叶片解剖结构变化促进油菜生长能力和抗逆性同步提升的机制,相关研究成果发表在《实验植物学杂志(Journal of Experimental Botany)》上。据科研人员介绍,油菜生长能力和抗逆性分别受叶片光合速率和叶片单位面

河南省农科院揭示黄色灯光防治蛾类害虫分子机制

  日前,河南省农科院植保所武予清团队利用第二代高通量测序技术,分析了利用夜间黄色光照改变夜蛾类害虫——黏虫成虫的相关基因组表达,揭示了利用灯光防治害虫的分子机理。相关成果已在《科学报告》发表。  黏虫具有敏感的视觉系统,因此光照条件改变可能会影响其行为活动,进而影响其繁殖和种群数量等。近20年来,

植物所发现植物果实大小自然变异遗传调控新机制

  茄科(Solanaceae)酸浆属(Physalis)的一些物种的果实药食同源,其生殖器官(包括花部器官、浆果和种子)的大小协同变化,可分为大、中和小3个组。这一器官大小自然变异现象的分子遗传调控基础尚不清楚。  中国科学院植物研究所贺超英研究组最近研究发现,Physalis Organ Siz

新机制或影响新冠病毒变异株传染性

  自新冠疫情流行以来,已经有几个更具传染性的新冠病毒变种出现。美国国立卫生研究院的科学家发现,阿尔法和德尔塔变异株的突变克服了被称为GALNT1的酶的活性抑制效应,这可能会增强病毒进入细胞的能力,提高病毒的传播能力。相关研究论文在线发表于5日的美国《国家科学院院刊》上。  新冠病毒利用其外表面的刺