清华大学王宏伟研究组Cell发表首发性成果

RNA干扰(RNAi, RNA interference)是敲低一个基因表达的最为常用的一种手段。内源性引起RNA干扰的小RNA主要是微小RNA (miRNA)。 到目前为止,人体内已经发现多达1800种微小RNA,越来越多的文献报道认为很多肿瘤的发生发展、转移等行为与微小RNA的异常表达密切相关。 清华大学生命学院、清华-北大生命科学联合中心、北京市结构生物学高精尖创新中心王宏伟教授研究组首次报道了与微小RNA成熟密切相关的人源核酸内切酶Dicer蛋白的全长高分辨率结构,同时还报道了人源核酸内切酶Dicer蛋白结合一种小RNA前体pre-let-7底物的两种不同结构状态。 这一研究成果公布在4月26日的Cell杂志上。第一作者为博士后刘忠民、王家、博士生程航和柯鑫。 人体内绝大部分微小RNA成熟形成都离不开一种核酸内切酶,我们称之为Dicer的蛋白。有趣的是人体内只有一个拷贝的核酸内切酶Dicer基因,表达唯一的一种......阅读全文

关于RNA干扰的化学合成介绍

  许多国外公司都可以根据用户要求提供高质量的化学合成siRNA。主要的缺点包括价格高,定制周期长,特别是有特殊需求的。由于价格比其他方法高,为一个基因合成3—4对siRNAs 的成本就更高了,比较常见的做法是用其他方法筛选出最有效的序列再进行化学合成。  最适用于:已经找到最有效的siRNA的情况

RNA干扰的分子机制首次被发现

  日本东京大学官网近日宣布,东京大学和京都大学研究人员发现了核糖核酸干扰(RNAi)的分子机制。所谓核糖核酸干扰,就是单分子RNA分裂时出现的某种蛋白质合成受到抑制的现象。  由于借助RNAi可以关闭特定基因的表达,科学家一直期待RNAi现象在医疗领域得到应用。在先前研究中,科学家已经发现RNAi

RNA干扰相关知识RISC-loading-complex(RLC)

RISC loading complex(RLC):是一种促使RISC形成的复合物。RLC有方向性地调节小RNA双螺旋,为以后的RISC组装作好铺垫。siRISC loading complexes (siRLCs)在果蝇中研究最多。有研究者认为在果蝇中的siRLCs包含DCR2-R2D2异型二聚体

关于RNA干扰的基本信息介绍

  RNA干扰(RNA interference,RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。基因沉默,主要有转录前水平的基因沉默(TGS)和转录后水平的基因沉默(PTGS)两类:TGS是指由于DN

RNA干扰治疗肿瘤病的方法介绍

肿瘤是多个基因相互作用的基因网络调控的结果,传统技术诱发的单一癌基因的阻断不可能完全抑制或逆转肿瘤的生长,而RNAi可以利用同一基因家族的多个基因具有一段同源性很高的保守序列这一特性,设计针对这一区段序列的dsRNA分子,只注射一种dsRNA即可以产生多个基因同时剔除的表现,也可以同时注射多种dsR

RNA干扰(RNAi)实验原理与方法(1)

近年来的研究表明,将与mRNA对应的正义RNA和反义RNA组成的双链RNA(dsRNA)导入细胞,可以使mRNA发生特异性的降解,导致其相应的基因沉默。这种转录后基因沉默机制(post-transcriptional gene silencing, PTGS)被称为RNA干扰(RNAi)。一、R

RNA干扰(RNAi)实验原理与方法(3)

3.DEAE-葡聚糖和polybrene带正电的DEAE-葡聚糖或polybrene多聚体复合物和带负电的DNA分子使得DNA可以结合在细胞表面。通过使用DMSO或甘油获得的渗透休克将DNA复合体导入。两种试剂都已成功用于转染。DEAE-葡聚糖仅限于瞬时转染。4.机械法转染技术也包括使用机械的方法,

RNA干扰载体的构建的实验流程

RNA干扰载体主要用来研究基因表达调控,RNA干扰技术已已被广泛用于基因结构功能研究和传染性疾病及基因治疗领域,进行RNA干扰实验首先是构建RNA干扰载体,本文以pRI系列载体为例论述了干扰载体的构建的实验流程。产品技术背景pRI系列载体是基于III类rna聚合酶启动子:人类H1启动子的专用于哺乳动

关于小干扰RNA的siRNA设计介绍

  最初,siRNA序列的选择是基于实验经验而获得的(Elbashir et al. 2001,2002)。最近,生物信息学工具被用来设计siRNA(表18-1),目前多个数据库收录了经过实验确证的siRNA和shRNA。值得推荐的是,在设计新的siRNA之前可以通过搜索已有的siRNA数据库和科研

RNA干扰(RNAi)实验原理与方法(2)

dsRNA消化法的主要优点在于可以跳过检测和筛选有效siRNA序列的步骤,为研究人员节省时间和金钱(注意:通常用RNAse III通常比用Dicer要便宜)。不过这种方法的缺点也很明显,就是有可能引发非特异的基因沉默,特别是同源或者是密切相关的基因。现在多数的研究显示这种情况通常不会造成影响。最

我国学者在抗病毒免疫研究方面获得重要突破

  6月21日,中国科学院武汉病毒研究所周溪研究员课题组与军事医学科学院微生物流行病研究所秦成峰研究员课题组合作,在抗病毒免疫研究方面取得重要进展,揭示了RNA干扰(RNAi)通路在哺乳动物中具有抗病毒免疫功能。相关研究成果以“Human virus-derived small RNAs can c

AGO2基因的结构特点及作用

该基因编码Argonaute家族的一个成员,在RNA干扰中起作用。编码的蛋白质是高度碱性的,包含一个PAZ结构域和一个PIWI结构域它可能与dicer1相互作用,在短干扰RNA介导的基因沉默中发挥作用已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。

癌症相关的基因突变类型及临床解释-AGO2

该基因编码Argonaute家族的一个成员,在RNA干扰中起作用。编码的蛋白质是高度碱性的,包含一个PAZ结构域和一个PIWI结构域它可能与dicer1相互作用,在短干扰RNA介导的基因沉默中发挥作用已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。

国学者在抗病毒免疫研究方面获得重要突破

  6月21日,中国科学院武汉病毒研究所研究员周溪课题组与军事医学科学院微生物流行病研究所研究员秦成峰课题组合作,在抗病毒免疫研究方面取得新进展,揭示了RNA干扰(RNAi)通路在哺乳动物中具有抗病毒免疫功能。相关研究成果以Human virus-derived small RNAs can con

我国科学家解析小RNA的生物合成机制

  小RNA是真核生物中重要的基因调控分子,在生长发育、基因沉默、抵御病毒等动植物的各类生理过程中起着至关重要的作用。小RNA的生物合成中,Dicer家族核酸内切酶选择性识别小RNA前体,切割RNA至特定长度,并选择性地将一条链递呈给下游AGO蛋白从而介导下游基因沉默。Dicer如何起到“分子尺”和

我国科学家解析小RNA的生物合成机制

  小RNA是真核生物中重要的基因调控分子,在生长发育、基因沉默、抵御病毒等动植物的各类生理过程中起着至关重要的作用。小RNA的生物合成中,Dicer家族核酸内切酶选择性识别小RNA前体,切割RNA至特定长度,并选择性地将一条链递呈给下游AGO蛋白从而介导下游基因沉默。Dicer如何起到“分子尺”和

简述RNA干扰技术对肿瘤病的治疗

  肿瘤是多个基因相互作用的基因网络调控的结果,传统技术诱发的单一癌基因的阻断不可能完全抑制或逆转肿瘤的生长,而RNAi可以利用同一基因家族的多个基因具有一段同源性很高的保守序列这一特性,设计针对这一区段序列的dsRNA分子,只注射一种dsRNA即可以产生多个基因同时剔除的表现,也可以同时注射多种d

小干扰RNA转录后基因沉默的介绍

  siRNA诱导的转录后基因沉默始于RNA诱导的沉默复合物(RISC)的组装。该复合物通过切割编码靶基因的mRNA分子来沉默某些基因表达。为了开始该过程,两条siRNA链中的一条(引导链)将被装载到RISC中,而另一条链即过客链被降解。某些Dicer酶可能负责将引导链加载到RISC中。然后,siR

RNA干扰机制的主要特点及优势

1.高效性:Elbashir等在研究中发现分别为25 nmol/L与100 nmol/L的起始双链RNA产生的结果是一样的,只是高浓度起始的更有效些。将双链RNA浓度降低到1.5 nmol/L时产生的基因沉默效果变化不大,只有当浓度降低到0.05 nmol/L时,沉默的效果才消失。Holen等也证实

《细胞》:利用RNA干扰抵御艾滋病毒

这种策略可能被开发成对人类的临床应用 美国科学家近日开发出了一种利用抗体将短链RNA(siRNAs)直接送至免疫细胞的方法,并通过RNA干扰极大地帮助抑制HIV病毒对小鼠的感染。相关论文8月7日在线发表于《细胞》(Cell)杂志上。 进行此次研究的是美国哈佛医学院的Priti Kumar和同事。

PNAS:用RNA干扰来治疗恶性肿瘤

  套细胞淋巴瘤(MCL)被认为是最具侵袭性的血癌,中位生存时间仅为七年,目前可用的治疗方法很少。每年有三千美国人被诊断为MCL,尽管用于身体其他部位转移瘤的个性化疗法已经取得了一定进展,但是,系统性的将治疗药物传递到癌细胞,对世界癌症研究来说仍然是个挑战。  最近,以色列特拉维夫大学(TAU)的一

高通量RNA干扰技术筛选DNA损伤实验

目前,将RNAi库和基于细胞水平的高通量分析技术相结合对于我们鉴定药物敏感性和抵抗性的新机制有非常广阔的前景。举例来说,已有研究者对全基因组进行RNAi筛选找出了导致非小细胞肺癌对紫杉醇敏感的基因。这项研究也证实了RNAi技术在发现影响癌症细胞细胞有丝分裂的靶点上具有很大潜力。 Molecular

RNA干扰的体外转录的相关介绍

  以DNA Oligo为模版,通过体外转录合成siRNAs,成本相对化学合成法而言比较低,而且能够比化学合成法更快的得到siRNAs。不足之处是实验的规模受到限制,虽然一次体外转录合成能提供足够做数百次转染的siRNAs,但是反应规模和量始终有一定的限制。而且和化学合成相比,还是需要占用研究人员相

RNA干扰回复实验的方法和原理介绍

RNA干扰回复实验,主要是为了说明Off-target效应。Off-target效应Off-target effects(脱靶效应)最早由Dharmacon科学家Jackson和他的同事们提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce

中国科大在小干扰RNA领域获进展

  近日,中国科学技术大学生命科学学院及中国科学院分子细胞科学卓越创新中心教授光寿红课题组在小干扰RNA领域取得突破性进展,研究成果以RdRP-synthesized antisense ribosomal siRNAs silence pre-rRNA via the nuclear RNAi p

RNA干扰主体实验的方法和过程介绍

siRNA表达载体构建好后,即可进行RNA干扰主体实验。RNA干扰主体实验的重点在于:成功将siRNA表达载体导入目的细胞如果目的细胞的质粒转染效率较低(低于70%),则应采用腺病毒或慢病毒载体,利用病毒载体的高感染率、高表达特性,更好地开展RNA干扰主体实验。设置好分组和对照按照nature的标准

关于siRNA机制的基本介绍

  1.长dsRNA(可来自发夹,互补RNA和RNA依赖性RNA聚合酶)被称为Dicer的内切核糖核酸酶切割。Dicer切割长dsRNA以形成短干扰RNA或siRNA;这使得分子能够形成RNA诱导的沉默复合物(RISC)。   2.一旦siRNA进入细胞,它就会被整合到其他蛋白质中以形成RISC。

关于Dicer酶的基本介绍

  该酶是一种核糖核酸内切酶,属于RNase III家族中特异识别双链RNA的一员,它能以一种ATP依赖的方式逐步切割由外源导入或者由转基因,病毒感染等各种方式引入的双链RNA,切割将RNA降解为21-23bp的双链RNAs(dsRNAs),每个片段的3’端都有2个碱基突出。

简述Dicer酶的作用机制

  Dicer的作用机制Bernstein认为分二步:  第一步:Dicer结合到dsRNA,dsRNA被加工成许多短片段,每个片段约22nt。  第二步:22nt的siRNA通过PAZ与含有PAZ的Argonaute蛋白结合,而RNase与后者形成多个亚单元的复合物,这样使得22ntsiRNA特异

中山大学等开发RNA编辑新工具

  CRISPR-Cas9系统使用一段引导RNA(其与Cas9蛋白结合起来才能发挥作用)来靶定一段DNA,并裂解双链DNA。这一现象提出了一个问题:由一个Dicer结合RNA元件和一段反义RNA组成的一种人造小RNA(asRNA,是否也能用来诱导Dicer处理和降解一段特定的RNA呢?  为此,5月