我国科学家解析小RNA的生物合成机制

小RNA是真核生物中重要的基因调控分子,在生长发育、基因沉默、抵御病毒等动植物的各类生理过程中起着至关重要的作用。小RNA的生物合成中,Dicer家族核酸内切酶选择性识别小RNA前体,切割RNA至特定长度,并选择性地将一条链递呈给下游AGO蛋白从而介导下游基因沉默。Dicer如何起到“分子尺”和“分子刀”的功能,切割小RNA前体生成特定长度的小RNA这一机制尚不清晰。 国家“十三五”科技计划“蛋白质机器与生命过程调控”重点专项“植物非编码RNA介导基因沉默过程中重要蛋白质机器的结构功能研究(2016YFA0503200)”项目取得重要进展。项目团队以植物中特异性生成24-nt小RNA的Dicer Like 3 (DCL3)为对象开展了研究,利用合成的DCL3天然底物模拟物和冷冻电镜技术,解析了DCL3和天然底物模拟物的复合物结构,并从中观测到Dicer家族蛋白同时对前体小RNA的5’和3’端同时产生特异性识别的机制。项目团......阅读全文

RNA干扰相关知识Dicer(DCR)

Dicer(DCR):是RNAase Ⅲ家族中的一员,主要切割dsRNA或者茎环结构的RNA前体成为小RNAs分子。对应地,我们将这种小RNAs分子命名为siRNAs和miRNA。Dicer有着较多的结构域,最先在果蝇中发现,并且在不同的生物体上表现出很高的保守性。

我国科学家解析小RNA的生物合成机制

  小RNA是真核生物中重要的基因调控分子,在生长发育、基因沉默、抵御病毒等动植物的各类生理过程中起着至关重要的作用。小RNA的生物合成中,Dicer家族核酸内切酶选择性识别小RNA前体,切割RNA至特定长度,并选择性地将一条链递呈给下游AGO蛋白从而介导下游基因沉默。Dicer如何起到“分子尺”和

我国科学家解析小RNA的生物合成机制

  小RNA是真核生物中重要的基因调控分子,在生长发育、基因沉默、抵御病毒等动植物的各类生理过程中起着至关重要的作用。小RNA的生物合成中,Dicer家族核酸内切酶选择性识别小RNA前体,切割RNA至特定长度,并选择性地将一条链递呈给下游AGO蛋白从而介导下游基因沉默。Dicer如何起到“分子尺”和

Nature:小RNA生物学里程碑成果-解开piRNA生物合成谜题

  PIWI相互作用的RNA,简称piRNAs,是一类小型的调控RNAs ——长度只有22–30个核苷酸的小块核酸。它们可能很小,但是与它们相关的Argonaute蛋白一起,piRNAs就能够“沉默”转座因子,所谓的自私基因,存在于植物、真菌和动物的基因组中。piRNA介导的沉默可以作用于染色质,以

Nature:小RNA生物学里程碑成果-解开piRNA生物合成谜题

  PIWI相互作用的RNA,简称piRNAs,是一类小型的调控RNAs ——长度只有22–30个核苷酸的小块核酸。它们可能很小,但是与它们相关的Argonaute蛋白一起,piRNAs就能够“沉默”转座因子,所谓的自私基因,存在于植物、真菌和动物的基因机制。  虽然科学家们很清楚piRNAs是如何

Dicer(DCR)蛋白的概念和应用特点

Dicer(DCR):是RNAase Ⅲ家族中的一员,主要切割dsRNA或者茎环结构的RNA前体成为小RNAs分子。对应地,我们将这种小RNAs分子命名为siRNAs和miRNA。Dicer有着较多的结构域,最先在果蝇中发现,并且在不同的生物体上表现出很高的保守性。

小分子RNA

RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”,但越来越多的证据清楚的表明,RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设想的更为重要。RNA 干扰(RNA interference)的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识,更因为可以简化/替代基因敲除而成为研究基因功能的有力工具,

Dicer-Pathway

The degradation of endogenous mRNA in a sequence-specific manner can be induced by dsRNA [RNA interfernce (RNAi)], antisense transcription, or viral i

RNA干扰的作用机制

病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内,并利用宿主细胞进行转录时,常产生一些dsRNA。宿主细胞对这些dsRNA迅即产生反应,其胞质中的核酸内切酶Dicer将dsRNA切割成多个具有特定长度和结构的小片段RNA(大约21~23 bp),即siRNA。siRNA在细胞内R

RNA干扰技术的作用机制

病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内,并利用宿主细胞进行转录时,常产生一些dsRNA。宿主细胞对这些dsRNA迅即产生反应,其胞质中的核酸内切酶Dicer将dsRNA切割成多个具有特定长度和结构的小片段RNA(大约21~23 bp),即siRNA。siRNA在细胞内R

miRNA和siRNA简介及区别

1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室

miRNA和siRNA的基本介绍及区别

1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室中是

RNA生物合成的抑制剂相关介绍

  一、碱基类似物  有些人工合成的碱基类似物能干扰和抑制核酸的合成。作用方式有以下两类:  (一)作为代谢拮抗物,直接抑制核苷酸生物合成有关酶类。如6-巯基嘌呤进入体内后可转变为巯基嘌呤核苷酸,抑制嘌呤核苷酸的合成。可作为抗癌药物,治疗急性白血病等。此类物质一般需转变为相应的核苷酸才能表现出抑制作

RNA干扰的作用机制

病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内,并利用宿主细胞进行转录时,常产生一些dsRNA。宿主细胞对这些dsRNA迅即产生反应,其胞质中的核酸内切酶Dicer将dsRNA切割成多个具有特定长度和结构的小片段RNA(大约21~23 bp),即siRNA。siRNA在细胞内R

关于RNA干扰的作用机制介绍

  病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内,并利用宿主细胞进行转录时,常产生一些dsRNA。宿主细胞对这些dsRNA迅即产生反应,其胞质中的核酸内切酶Dicer将dsRNA切割成多个具有特定长度和结构的小片段RNA(大约21~23 bp),即siRNA。siRNA在细胞

基因干扰技术的作用机制介绍

病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内,并利用宿主细胞进行转录时,常产生一些dsRNA。宿主细胞对这些dsRNA迅即产生反应,其胞质中的核酸内切酶Dicer将dsRNA切割成多个具有特定长度和结构的小片段RNA(大约21~23 bp),即siRNA。siRNA在细胞内R

蛋白质生物合成过程

  1.氨基酸的活化与搬运:氨基酸的活化以及活化氨基酸与tRNA的结合,均由氨基酰tRNA合成酶催化完成。反应完成后,特异的tRNA3’端CCA上的2’或3’位自由羟基与相应的活化氨基酸以酯键相连接,形成氨基酰tRNA。  2.活化氨基酸的缩合——核蛋白体循环:活化氨基酸在核蛋白体上反复翻译mRNA

蛋白质的生物合成

生物按照从脱氧核糖核酸 (DNA)转录得到的信使核糖核酸(mRNA)上的遗传信息合成蛋白质的过程。由于mRNA上的遗传信息是以密码(见遗传密码)形式存在的,只有合成为蛋白质才能表达出生物性状,因此将蛋白质生物合成比拟为转译或翻译。所以,RNA是蛋白质合成的直接模板。

原弹性蛋白的生物合成

弹性蛋白是通过将许多小的可溶性前体原弹性蛋白蛋白分子(50-70kDa)连接在一起制成的,以制成最终的大量不溶性、耐用的复合物。未连接的原弹性蛋白分子通常在细胞中不可用,因为它们在被细胞合成后立即交联成弹性蛋白纤维,在它们输出到细胞外基质后。每个原弹性蛋白由一串36个小结构域组成,每个结构域重约2k

清华大学《Cell》文章:解决多个技术难题,终发首发性成果

  清华大学生命学院再次发表了一最新结构生物学成果:首次报道了人源核酸内切酶Dicer蛋白的全长高分辨率结构,同时还报道了人源核酸内切酶Dicer蛋白结合一种小RNA前体pre-let-7底物的两种不同结构状态。  这一研究成果公布在Cell杂志上,文章通讯作者为清华大学生命学院、清华-北大生命科学

清华大学王宏伟研究组Cell发表首发性成果

  RNA干扰(RNAi, RNA interference)是敲低一个基因表达的最为常用的一种手段。内源性引起RNA干扰的小RNA主要是微小RNA (miRNA)。 到目前为止,人体内已经发现多达1800种微小RNA,越来越多的文献报道认为很多肿瘤的发生发展、转移等行为与微小RNA的异常表达密切相

《Nature》RNA调节蛋白质合成的隐藏信号

  RNA以A、U、C和G等基本核苷酸在细胞的蛋白质加工厂中指挥蛋白质生产。为了制造蛋白质,机器的一端先锁定在RNA上,然后扫描整条RNA,直到AUG字符串后停止扫描,AUG是将遗传密码翻译成蛋白质的开始信号。  在巡查第一个AUG位点时,蛋白质制造机器经常会遇到一个与AUG不同的字符串(如AUA)

遗传发育所水稻特定小分子RNA合成机制研究取得新进展

  植物中的Dicer-like (DCL)蛋白属于第III类RNA酶,负责加工产生各种类型的小分子RNA。Phased small RNA是新近在水稻中发现的一类小分子RNA,包括21-nt和24-nt两种形式。其中24-nt长的phased small RNA在模式植物拟南芥中尚未

果蝇Dicer2结合双链RNA加工生成siRNA的分子机制

RNA干扰(RNAi)是许多真核生物中一种保守的RNA沉默机制, 小干扰RNA是RNA干扰的关键组成部分。在小RNA的加工过程中,Dicer家族蛋白起到了重要的作用,它们发挥作用的过程中常需要双链结合蛋白(dsRBP)作为辅因子来帮助它们发挥功能。在果蝇中,siRNA的产生是由ATP依赖型的Dice

林可霉素生物合成获突破-小分子硫醇“导演”抗生素合成

  分子硫醇广泛存在于所有真核和原核生物体系中,长期以来,对其功能的理解局限于对抗各种内源性和外源性因素所引起的细胞氧化还原平衡失调。近日,中国科学院上海有机化学研究所刘文团队的发现显然突破了这一认知“禁锢”:小分子硫醇不但可以充当广为人知的“保护性”角色,而且可以前所未有地扮演“建设性”的角色用于

Nature聚焦小RNA-破解系统生物学大难题

  最新一期的Nature Genetics在线版刊登了三篇文章,三个独立的研究团队解决了系统生物学理论中最重要的理论,三文章释放了一系列的数据解答了系统生物学细胞定向分化的关键调控网络。同期Nature配发了评论文章,FANTOM studies networks in cells。   系统生

蛋白质生物合成的调控

生物体内蛋白质合成的速度,主要在转录水平上,其次在翻译过程中进行调节控制。它受性别、激素、细胞周期、生长发育、健康状况和生存环境等多种因素及参与蛋白质合成的众多的生化物质变化的影响。由于原核生物的翻译与转录通常是偶联在一起的,且其mRNA的寿命短,因而蛋白质合成的速度主要由转录的速度决定。弱化作用是

蛋白质生物合成的调控

生物体内蛋白质合成的速度,主要在转录水平上,其次在翻译过程中进行调节控制。它受性别、激素、细胞周期、生长发育、健康状况和生存环境等多种因素及参与蛋白质合成的众多的生化物质变化的影响。由于原核生物的翻译与转录通常是偶联在一起的,且其mRNA的寿命短,因而蛋白质合成的速度主要由转录的速度决定。弱化作用是

蛋白聚糖的生物合成介绍

包括肽链的合成及糖链的合成。核心蛋白质肽链的合成是蛋白聚糖合成的限速步骤,在粗面内质网进行,其过程与一般蛋白质相同。肽链的糖基化在内质网起始,在戈尔吉氏体完成。氨基聚糖糖链的合成过程与糖蛋白者类似。亦由一系列糖基转移酶催化逐个将活化单糖的糖基转移到肽链及未完成的糖链,使之不断延长。糖基的硫酸化是在糖

蛋白质生物合成翻译模板

不同mRNA序列的分子大小和碱基排列顺序各不相同,但都具有5ˊ-端非翻译区、开放阅读框架区、和3ˊ-端非翻译区;真核生物的mRNA的5ˊ-端还有帽子结构、3ˊ-端有长度不一的多聚腺苷酸(polyA)尾。帽子结构能与帽子结合,在翻译时参与mRNA在核糖体上的定位结合,启动蛋白质生物的合成;帽子结构和p