RNA测序发现杂交蝉遗传证据
据英国《通讯·生物学》杂志近日发表的一项动物学研究，日本科学家通过RNA测序，出乎意料地发现了13年蝉与近亲17年蝉杂交的遗传证据，而这两种蝉至少221年才相遇一次。研究显示，杂交蝉在极其漫长时间里都维持了各自不同的生命周期，目前科学家无法就这种平行趋异演化给出遗传学解释。长期以来，周期蝉的生命周期已经让科学家们困惑不已。周期蝉遵循着相同的基本生命周期：幼虫在地底生活13年或17年，靠吸食树根的汁液生存，然后破土而出，变成成虫，在夏季大量出现。在它们剩余的生命阶段——不到一个月时间内，它们主要以繁殖为主，而孵化后，幼虫会回到地底，等待下一个“轮回”。因此，周期蝉一生的大部分时间，其实都在地下度过。周期蝉有不同的物种和分组，其共7个种，分为3组，每一组包含一个17年蝉种和一个或两个13年蝉种。13年蝉和17年蝉虽属近亲，但是它们鲜少相遇。此次，日本京都大学的研究团队为了更深入地了解周期蝉相互之间的关系，对7个周期蝉种......阅读全文
安捷伦：用于RNA测序的文库制备与靶向序列捕获解决方案
简化的RNA和DNA测序解决方案，用于精简临床NGS 2020年9月1日，北京——安捷伦科技公司（纽约证交所：A）今日宣布推出SureSelect XT HS2 RNA试剂盒。该解决方案采用模块化设计，为RNA 和 DNA样品提供了一种简单的平行分析方法，从而确保客户能够简化并整合其工作流程，而无
利用单细胞RNA测序技术阐明机体多种类型味觉细胞机制
日前，一项刊登在国际杂志Scientific Reports上的研究报告中，来自美国滨州莫奈尔中心(Monell Center)的研究人员通过研究开发出了一种新技术能够鉴别出了任何味觉受体细胞的一整套基因，相关研究或能帮助研究人员阐明味觉感受器细胞发挥特殊功能的分子机制。 研究者Sunil S
云序生物独家首发m5C－RNA甲基化测序
m5C RNA甲基化简介 通过分析近几年的国自然立项，可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势：特别是从2015年的5项到2017年的25项，项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇，可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段，多篇文章荣登CNS级别期刊
单细胞RNA测序新成果－带你解开心脏发育的长久谜题
制造一颗心脏，这不是简单的事情。在子宫内，这个器官开始是一根管，芽珠状的硬块，自动折叠，最终变成了更熟悉的四腔结构。 但确切地说，心脏细胞是如何按照它们的基因程序，来构建这个复杂的、维持生命的泵状器官呢？这仍然是一个谜。哈佛医学院遗传学教授、心脏病学研究员Jonathan Seidman说：“
PNAS：RNA测序解开“为什么大多数克隆动物胚胎会失败？”
生物通报道：自从20年前英国科学家成功克隆出克隆羊多莉已经20年了，但是克隆哺乳动物仍然是一个挑战。最近，由美国和法国研究人员进行的一项新研究，阐释了为什么大多数克隆胚胎可能会失败。 多莉羊是利用“体细胞核转移”技术克隆出来的，来自一个成年细胞的细胞核被转移到已经去核的未受精卵子中，然后电击以
云序生物独家首发m5C－RNA甲基化测序
m5C RNA甲基化简介 通过分析近几年的国自然立项，可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势：特别是从2015年的5项到2017年的25项，项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇，可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段，多篇文章荣登CNS级别期刊
单细胞RNA测序新成果－带你解开心脏发育的长久谜题
制造一颗心脏，这不是简单的事情。在子宫内，这个器官开始是一根管，芽珠状的硬块，自动折叠，最终变成了更熟悉的四腔结构。 但确切地说，心脏细胞是如何按照它们的基因程序，来构建这个复杂的、维持生命的泵状器官呢？这仍然是一个谜。哈佛医学院遗传学教授、心脏病学研究员Jonathan Seidman说：“
Nature－Methods新方法能矫正RNAseq测序的技术偏差
基因表达分析正越来越多地用于癌症的诊断和检测，是生物学研究的主要工具，一种新型的计算方法可以提高基因表达分析的准确性。 来自卡耐基梅隆大学和纽约州立大学石溪分校的研究人员称，他们的方法（被称作Salmon）能够矫正转录组测序技术（RNA-seq）中的技术偏差。而且这种技术预估基因表达水平的速度
准确高效的单细胞RNA测序的最佳手段—Quartzseq2
为了确保单细胞RNA测序能够使用最好的方法，日前研究人员对13种方法进行了基准性的测试，一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中，来自西班牙的科学家们通过研究发现，日本理化所开发的Quartz-seq2方法或许是进行单细胞RNA测序的最佳手段。图片来源：CC0 P
Predica与华大智造携手开启肿瘤精准医疗新纪元：高通量测序平台赋能靶向RNA测序技术
7月11日，肿瘤诊断领域的领先创新者Predica Diagnostics与华大智造宣布达成合作，共同在华大智造高通量测序平台上开发Predica的靶向RNA测序技术，助力精准医疗。 此次合作旨在通过实现早期癌症检测和促进个性化靶向治疗策略，通过将Predica Diagnostics的先进测
1亿年前的蝉可能不那么“吵”人
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516026.shtm大约在1亿年前，知了可能无法响亮地鸣叫，更不会在夏日的午后扰人清梦。近期，中国科学院南京地质古生物研究所（以下简称南京古生物所）科研人员与多国学者合作，对化石和现存蝉总科类群的解剖学特
1亿年前的蝉可能不那么“吵”人
大约在1亿年前，知了可能无法响亮地鸣叫，更不会在夏日的午后扰人清梦。 近期，中国科学院南京地质古生物研究所（以下简称南京古生物所）科研人员与多国学者合作，对化石和现存蝉总科类群的解剖学特征进行了分析，研究发现早期的蝉可能无法发出响亮的声音，还报道了已知最早的蝉总科末龄幼虫化石。相关研究成果1月
Genome－Biol：RNA测序有助于前列腺癌个性化治疗
根据最近发表在《Genome Biology》的一项研究报道，RNA测序，而不仅仅是DNA测序，能够帮助医生预测前列腺肿瘤如何响应治疗。因为肿瘤的RNA显示了一种治疗方法正在引起的实时变化，作者认为这可能是一种有用的工具，帮助诊断和预测哪种治疗方法将最有利于患者个人。 来自温哥华沿岸卫生研究所
RNA测序和三级质谱相结合发现CRISPR失效原因
德国欧洲分子生物学实验室Wolfgang Huber、Lars M. Steinmetz和葛兰素史克公司Gerard Drewes等研究人员发现，生物可塑性能够挽救CRISPR敲除中的靶标活性。2019年10月28日，《自然—方法学》在线发表了这项成果。 研究人员设计了一种实验策略，将RNA测
Dolomite微流控芯片成功用于高通量单细胞DNA/RNA测序
随着现代生物学的发展，细胞群体的研究已不再能满足科研需求。单细胞测序通过对单个细胞进行测序，解决了用组织样本测序或样本少时无法解决的细胞异质性难题，为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向。 2011 年，《自然方法》杂志( Nature Methods )将单细胞测序列为年
RNA测序可能有助于医生更早地诊断肝细胞癌
根据2019年3月31日在佐治亚州亚特兰大市举行的美国癌症研究协会（American Association for Cancer Research, AACR）年度会议上提供的初步数据，RNA测序可能有助于医生更早地诊断肝细胞癌（hepatocellular carcinoma, HCC）。图
科研人员研发RNA甲基化7甲基鸟嘌呤测序技术
7-甲基鸟嘌呤（m7G）修饰是转录后调控中最常见的碱基修饰形式之一，广泛分布于tRNA、rRNA以及真核生物mRNA的5’帽子区，对维持RNA的加工代谢、稳定、出核以及蛋白质翻译具有重要作用。近期研究表明高等真核生物mRNA内部也含有m7G修饰，然而对其分布特征和调控作用目前尚不清楚。 中国科
革命性工具：更快捷－更准确的单细胞RNA测序处理方法
2018年12月，《Science》杂志称，如果没有基于scRNA-seq的可视化技术，一个细胞一个细胞地跟踪胚胎发育就不可能实现，因此这是今年最大的突破这一。2019年，研究人员写道，毫无疑问，FIt-SNE将加速发育生物学、神经科学以及癌症研究等领域的进一步工作。 就像从针孔相机到偏光片一
研究发现RNA测序新方法：检测亚细胞水平转录组空间分布
斯坦福大学研究团队在RNA测序方面取得突破性进展，发明了一种亚细胞水平转录组空间分布的RNA测序新方法，研究论文于近日在线发表于国际期刊Cell，论文标题为“Atlas of subcellular RNA localization revealed by APEX-Seq”。 该研究发明了一
石乐明教授Nature子刊：RNA测序到底可不可靠
RNA测序可以检测人类和其他生物的基因表达情况。最近这一方法在生物科学和医学研究中非常流行，而且正在逐渐走向临床应用。与之前的方法相比，RNA测序的优势是便于研究选择性剪切形成的基因异构体或转录本。 那么RNA测序到底可不可靠呢？日前，由美国FDA牵头的测序质量控制（SEQC）项目对RNA测序
整合RNA测序与ATAC测序：揭示耐盐水稻品种抗氧化防御机制，助力培育抗逆水稻新种
在广袤的农田里，水稻是人类重要的主食作物之一。然而，土壤盐渍化这一全球性难题，正严重威胁着水稻的生长与产量。据联合国粮食及农业组织相关数据显示，全球至少 10% 的土地受到盐渍化影响，这使得水稻在生长过程中面临诸多挑战。盐胁迫会导致水稻植株矮小、千粒重下降、小穗数量减少，最终造成产量大幅降低。在众多
版纳植物园在青藏高原发现沫蝉科化石记录
沫蝉科（Cercopidae）包含178属约1561种，现生种类全球广布。迄今为止，沫蝉科的化石记录较多，从古新世到更新世报道了40多种，主要分布于欧亚和美洲地区。沫蝉科最古老的确切记录为报道于中国香港的疹状奇沫蝉（Allocercopis punctatis Lin，1997）。然而，大部分沫
中国首发纳米孔RNA直接测序揭示其在全长转录本中的作用
近日发表在RNA Biology上的研究中，来自中国科学院北京生命科学研究院、动物研究所及中国科学院大学等多家单位的科学家们首次通过5’-Cap捕获法对蝗虫的 RNA直接测序，揭示了Piwi 外显子化模式的广泛建立以及蝗虫转录组中的转座子（TEs）对RNA剪接的重要作用。 转座子（TEs）在后
直接RNA测序、串联质谱法揭示新冠转录组和蛋白质组特征
此前，南开大学高山、阮吉寿等在中国预印本ChinaXiv网站发表论文，称新冠病毒S蛋白可能存在Furin蛋白酶切位点。近日，发表在预印本网站bioRxiv上的一篇论文使用直接RNA测序和串联质谱法表明了SARS-CoV-2的转录组和蛋白质组的特征，揭示了细胞通道在去除了疑似Furin 蛋白酶切位点的
Nat.－Methods:－更精细！多维度！单细胞RNA测序又往前一步
美国纽约基因组中心的科学家开发出了一种新技术，在单细胞的RNA测序方面向前迈出重要的一步，推进了为了解单个细胞的基因组学领域的发展，让在单个细胞水平上区分不同类型的细胞和研究疾病的机制成为可能。 CITE-seq叫做细胞转录组和表位抗原通过测序的索引（Cellular Indexing of
基于单细胞RNA测序绘制人类大脑高分辨率免疫细胞图谱
近日，在德国弗赖堡大学医学中心科学家的指导下，一个联合研究团队利用单细胞RNA测序技术绘制了首个人类大脑高分辨率免疫细胞图谱！有史以来第一次证明大脑中的小胶质细胞（即吞噬细胞）具有相同的核心特征，并会根据大脑功能需求进行适应性表达，揭示了小胶质细胞的时间和空间异质性。2月14日，相关研究成果发表
重大突破！新加坡发布长读长RNA测序数据集SGNEx
由新加坡科技研究局基因组研究所领导的科学家团队，发布了迄今全球最大、最全面的长读长RNA测序数据集之一——新加坡纳米孔表达数据集（SG-NEx）。这一成果有望解决疾病研究中长期存在的技术瓶颈，使研究人员能够更精确地解析RNA的复杂结构，为制定下一代精准诊断和治疗策略奠定了坚实基础。相关研究发表在最新
单细胞核RNA测序技术建立了种子早期胚乳发育的转录图谱
种子是裸子植物和被子植物特有的繁殖体，是胚珠经过受精以后形成的结构，在植物生命周期中处于关键位置。种子主要由种皮、胚和胚乳组成。其中胚乳是大多数开花植物双受精后产生的组织，一般为三倍体（每个细胞核有三套染色体），胚乳中含有丰富的营养物质，是人类消耗热量的主要来源。 基因组印迹是一种表观遗传基因
细胞周期蛋白质的细胞周期
我们可以把细胞周期人为地划分为几个时期。开始人们按照细胞所处的形态学变化将细胞划分为间期和分裂期两相，霍华德学说划分细胞周期各期则是以细胞核的遗传物质DNA的复制和分裂作为主要标界——即按时间顺序将细胞周期确定为四个期：DNA合成前期(G1期)，DNA合成期(S期)，DNA合成后期(G2期)和分裂期
－螳螂捕蝉黄雀在后：迈兰制药在夹缝中生存
从4月初开始，Mylan制药（股票代码：MYL）为了躲避以色列企业Teva制药（股票代码：TEVA）的鲸吞，已经连续3次向美国Perrigo（股票代码：PRGO）发起了敌意并购攻击，竞价从最初的290亿美元上升到了312亿美元依旧遭到Perrigo的高层拒绝。 在Teva制药向Mylan发出了