山东大学独家完成Nature子刊文章

东山河上游化工厂排污 取样污水超标10多倍 来自山东大学生科院,微生物技术国家重点实验室的研究人员发表了题为“Crystal structures of STING protein reveal basis for recognition of cyclic di-GMP”的文章,揭示了人体先天免疫相关蛋白STING与细菌信号分子环化双鸟苷酸(c-di-GMP)的相互作用关系,为理解人体内源免疫系统如何感应及防御微生物的感染提供了重要信息。相关成果公布在Nature Structural & Molecular Biology杂志上。 领导这一研究的是山东大学微生物技术国家重点实验室谷立川教授,这是谷立川课题组继今年3月份发表两篇重要论文之后的又一个重要研究成果。博士生尚桂军、李宁,讲师朱德裕,硕士生张俊兵为本论文的共同第一作者,山东大学是本论文的唯一完成单位,这项研究得到了山东大学微生物技术国家......阅读全文

生物物理研究所晶体学方法合作研究取得新成果

  晶体学国际权威杂志Acta Crystallographica Section A近日在线发表了中国科学院生物物理研究所刘志杰课题组题为A multi-dataset data-collection strategy produces better diffraction data

物理所蛋白质晶体学中的直接法研究取得新进展

  中科院物理所范海福院士等研究人员几十年来从事蛋白质晶体学中直接法的研究,近年来又取得了重要进展:2004年提出基于直接法的“双空间SAD(单波长异常衍射)相位迭代推演”方法;2006年又提出基于直接法的“双空间MR(分子置换)结构模型迭代扩展”方法。这两种方法显著地提高了原有SAD和MR方法的效

上海光源生物大分子晶体学线站用户取得新成果

  一、揭示NLRC4蛋白自抑制作用的分子机制(Molecular Mechanisms)   6月14日,清华大学生命科学院柴继杰教授研究组在《科学》杂志在线发表了题为《NLRC4蛋白自抑制机制的结构基础》(Crystal structure of NLRC4 reveals its aut

X-射线晶体学与冷冻电镜在结构生物学上如何互补?

小刘同学的故事好感慨的题目,基本上就是小刘同学大学生活的变迁2012年,小刘同学刚刚结束了高考。满怀对生命科学的憧憬,心想,二十一世纪是生命科学的世纪。他现在也这样觉得。于是背上小小的行囊,告别了家乡和爹娘;只身来到了帝都,前去某知名985高校学一门手艺。希望能功成名就,回老家盖房子,娶媳妇。小刘同

关于月桂酸的晶体学解释

  肥皂的主要成分之一。典型的双亲分子,头尾两端的亲和性截然不同。分子头部是极性基团,亲水。尾部是碳氢链,亲油性。当水油肥皂混合时候,双亲性分子自动组装成层状。分子尾端指向油头部指向水。  低浓度的肥皂液中,呈现各向同性,无规分布的双亲分子形成胶束。加水稀释胶束消失。增加浓度会形成更广延的胶束。导致

X射线晶体学的研究步骤

①蛋白或DNA样品纯化②结晶③衍射、数据收集④确定蛋白结构衍射数据→数据处理→相位解析→建模→模型修正→模型检验⑤理解结构与功能的相互关系

冷冻电镜电子晶体学

电子晶体学利用电子显微镜对生物大分子在一维、二维以致三维空间形成的高度有序重复排列的结构(晶体)成像或者收集衍射图样,进而解析这些生物大分子的结构,这种方法称为电子晶体学。其适合的样品分子量范围为10~500kD,最高分辨率约1.9Å。该方法与X射线晶体学的类似之处在于均需获得高度均一的生物大分子的

冷冻电镜电子晶体学

电子晶体学X-ray晶体学与生物电镜的结合形成电子晶体学,综合了三维密度图和傅立叶变换数学理论,这可追述到D.De Rosier和A.Klug对T4噬菌体尾部的螺旋结构的研究工作上[2]。通过获得已制好的结构规则的二维晶体的高分辨率电子密度图,我们可以解析出它的原子水平结构,螺旋对称样品或二十面体对

上海光源生物大分子晶体学线站用户成果在《自然》发表

FucP蛋白结构及表面静电势分布  上海光源(SSRF)生物大分子晶体学线站用户、清华大学医学院教授颜宁领导的研究组与生命学院王佳伟博士、龚海鹏博士,合作开展大肠杆菌岩藻糖(L-fucose)转运蛋白(FucP)结构与功能的研究,揭示了FucP在底物识别和转运,

X射线晶体学的原理和方法

原理:蛋白质晶体内部结构为三维空间周期、有序、重复排列,要求每个结晶重复单位(分子或其复合体)的化学组成与分子构象是均一的。方法:为了获得可供衍射的单晶,就需要将纯化后的生物样品进行晶体生长。晶体生长的方法有很多,如气相扩散法、液相扩散法、温度渐变法、真空升华法、对流法等等,而目前应用最广泛的晶体生

光源生物大分子晶体学线站用户最新成果在CELL上发表

  近日,上海光源生物大分子晶体学线站用户——清华大学生命学院施一公、医学院颜宁研究组在CELL发表论文揭示CED-4细胞凋亡体的结构与功能机理。  施一公领导的实验室一直致力于对细胞凋亡调控机理的研究。颜宁的博士研究即因为揭示EGL-1、CED-9调控CED-4的机理而获

蛋白质的含量生物

蛋白质在人体中占18%左右,它是人类生命活动的物质基础,如果体内缺乏蛋白质,容易引起营养不良,诱发疾病的发生。一般医学上说的蛋白质多少,指的是人体血液中的白蛋白和球蛋白,人体白蛋白正常含量是35-55g/L,球蛋白是20-30g/L。

蛋白质的生物合成

生物按照从脱氧核糖核酸 (DNA)转录得到的信使核糖核酸(mRNA)上的遗传信息合成蛋白质的过程。由于mRNA上的遗传信息是以密码(见遗传密码)形式存在的,只有合成为蛋白质才能表达出生物性状,因此将蛋白质生物合成比拟为转译或翻译。所以,RNA是蛋白质合成的直接模板。

蛋白质生物合成过程

  1.氨基酸的活化与搬运:氨基酸的活化以及活化氨基酸与tRNA的结合,均由氨基酰tRNA合成酶催化完成。反应完成后,特异的tRNA3’端CCA上的2’或3’位自由羟基与相应的活化氨基酸以酯键相连接,形成氨基酰tRNA。  2.活化氨基酸的缩合——核蛋白体循环:活化氨基酸在核蛋白体上反复翻译mRNA

生物物理所蛋白质多肽药物实验室与华兰生物结成战略伙伴

座谈会现场   为进一步加强交流、推进中国科学院与生物医药企业的合作,3月9日,“华兰生物—生物物理所蛋白质与多肽药物实验室”座谈会在中科院生物物理研究所召开。蛋白质与多肽药物实验室有关科研人员及华兰生物工程股份有限公司代表参加了会议。   中科院生物局生物医学处副处长沈毅主持了会

新晶体学技术让你看到分子“摆动”

新晶体学技术让你看到分子“摆动”  日前,来自英国利兹大学的研究人员研发的一种新晶体技术能帮助科学家观察到分子是如何工作的。  这一研究成果公布在10月5日《自然-方法》(Nature Methods)杂志上,介绍了这种时间分辨晶体学技术怎样帮助研究人员观察分子结构内部的变化。  虽然已经研发出了快

Nature方法学:晶体学技术重大突破

  由英国利兹大学研发的一种新晶体技术能帮助科学家们观察到分子是如何工作的。这一研究成果公布在10月5日Nature Methods杂志上,介绍了这种时间分辨晶体学技术怎样帮助研究人员观察分子结构内部的变化。  虽然已经研发出了快速时间分辨晶体学技术(time-resolved crystallog

X射线晶体学的研究对象和目的

X射线晶体学是一门利用X射线来研究晶体中原子排列的学科。更准确地说,利用电子对X射线的散射作用,X射线晶体学可以获得晶体中电子密度的分布情况,再从中分析获得原子的位置信息,即晶体结构。对很多余结构相关的问题如整体折叠、配体或底物结合、作用的原子具体信息提供可靠的答案。运用X射线晶体学可以了解大分子如

-窥探原子结构秘密-晶体学一百年

  随着技术进步,发现的步伐也在加速:每年数以万计的新结构留下影像。   1914年,德国科学家Max von Laue因发现晶体如何衍射X射线而摘得诺贝尔物理学奖桂冠,这一发现直接推动了X射线晶体学的出现。从那时以来,研究人员利用衍射推算出了越来越多复杂分子的晶体结构,从简单矿物到

百人学者Nature子刊获结构生物学新进展

中科院上海有机所生命有机化学国家重点实验室,加州大学洛杉矶分校的研究人员报道了真菌非核糖体多肽合酶(NRPS)关键功能域(CT)(1.8Å分辨率)和处于活化状态T-CT复合物(2.49Å分辨率)晶体结构,这解释了真菌NRPS中CT功能域为何必须依赖T功能域才发挥作用。这一研究成果10月18日公布在N

C/D-RNA蛋白质复合物催化RNA核糖甲基化的结构机理

上海光源用户研究发现C/D RNA蛋白质复合物催化RNA核糖甲基化的结构机理  1月27日,北京生命科学研究所叶克穷实验室在《自然》杂志发表了题为Structural basis for site-specific ribose methylation by box C/D RNA

生物物理所安捷伦科技蛋白质组学合作实验室揭牌

  2010年4月13日下午,安捷伦科技公司总裁兼首席执行官邵律文(William P. (Bill) Sullivan)先生、大中华区总裁霍丰先生、生命科学与化学分析集团大中华区总经理牟一萍女士,中国区公共事务总监付向东先生等一行六人参观访问了中科院生物物理研究所,并举行中国科学院生物物理研究所-

2018国际蛋白质和多肽大会召开-共享生物实验室落户西安

11月8日下午,作为全球硬科技创新暨“一带一路”创新合作大会分论坛之一的“2018国际蛋白质和多肽大会”在西安曲江召开,大会邀请了诺贝尔奖得主、国际知名药企高管、海内外行业精英等作精彩演讲。大会开幕式上,陕西慧康生物联手阿里云共同搭建的“1+X”生物科技实验室建设项目举行了签约仪式。线上共享实验室的

中加蛋白质组学及系统生物学联合实验室成立

"大连化物所—渥太华大学(DICP-uOttawa)蛋白质组学及系统生物学联合实验室”成立  11月11日上午,中科院大连化学物理研究所举行“大连化物所—渥太华大学(DICP-uOttawa)蛋白质组学及系统生物学联合实验室”成立仪式。参加成立仪式的加方人员有:加拿大驻华大使馆一等秘书(技术)兼副领

冷冻电镜:正在并将为中国提供广阔的研究“舞台”

  2014年7月28日-30日,“2014冷冻电镜三维分子成像国际研讨会”在中国科学院上海生科院生化与细胞所/国家蛋白质科学中心•上海(筹)召开。  冷冻电镜三维分子成像国际研讨会源起于2008年由郭可信先生的学生组织发起的“郭可信电子显微学和晶体学暑期学校”。当时我国在电子显微学领域的

施一公Cell综述:X射线晶体学技术和结构生物学的历史与现状

  X射线晶体学技术是人们了解原子世界的利器,人们通过这一技术获得了许多重要的生物学结构。在晶体学技术百年诞辰之际,Cell杂志发表了清华大学施一公教授的前沿文章。这篇综述性文章全面介绍了X射线晶体学技术和结构生物学的历史和现状,读者现在可以在Cell网站免费获取全文。  1914年,德国科学家Ma

冷冻电镜三维分子成像国际研讨会在京举行

  8月8日至12日,第三届郭可信电子显微学与晶体学暑期学校暨冷冻电镜三维分子成像国际研讨会在北京中科院生物物理研究所召开。  郭可信先生培养的81级硕士生、现纽约大学教授王大能是这项活动的倡导者和发起者之一。他回忆说:“郭先生虽然是著名的材料物理学家,但对电子显微镜在生物学领域的应用也有很多思考。

蛋白质生物合成翻译模板

不同mRNA序列的分子大小和碱基排列顺序各不相同,但都具有5ˊ-端非翻译区、开放阅读框架区、和3ˊ-端非翻译区;真核生物的mRNA的5ˊ-端还有帽子结构、3ˊ-端有长度不一的多聚腺苷酸(polyA)尾。帽子结构能与帽子结合,在翻译时参与mRNA在核糖体上的定位结合,启动蛋白质生物的合成;帽子结构和p

蛋白质生物合成的调控

生物体内蛋白质合成的速度,主要在转录水平上,其次在翻译过程中进行调节控制。它受性别、激素、细胞周期、生长发育、健康状况和生存环境等多种因素及参与蛋白质合成的众多的生化物质变化的影响。由于原核生物的翻译与转录通常是偶联在一起的,且其mRNA的寿命短,因而蛋白质合成的速度主要由转录的速度决定。弱化作用是

蛋白质生物合成的调控

生物体内蛋白质合成的速度,主要在转录水平上,其次在翻译过程中进行调节控制。它受性别、激素、细胞周期、生长发育、健康状况和生存环境等多种因素及参与蛋白质合成的众多的生化物质变化的影响。由于原核生物的翻译与转录通常是偶联在一起的,且其mRNA的寿命短,因而蛋白质合成的速度主要由转录的速度决定。弱化作用是