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X射线晶体学的研究步骤

①蛋白或DNA样品纯化②结晶③衍射、数据收集④确定蛋白结构衍射数据→数据处理→相位解析→建模→模型修正→模型检验⑤理解结构与功能的相互关系......阅读全文

X射线晶体学的研究步骤

①蛋白或DNA样品纯化②结晶③衍射、数据收集④确定蛋白结构衍射数据→数据处理→相位解析→建模→模型修正→模型检验⑤理解结构与功能的相互关系

X射线晶体学的研究对象和目的

X射线晶体学是一门利用X射线来研究晶体中原子排列的学科。更准确地说,利用电子对X射线的散射作用,X射线晶体学可以获得晶体中电子密度的分布情况,再从中分析获得原子的位置信息,即晶体结构。对很多余结构相关的问题如整体折叠、配体或底物结合、作用的原子具体信息提供可靠的答案。运用X射线晶体学可以了解大分子如

X射线晶体学的原理和方法

原理:蛋白质晶体内部结构为三维空间周期、有序、重复排列,要求每个结晶重复单位(分子或其复合体)的化学组成与分子构象是均一的。方法:为了获得可供衍射的单晶,就需要将纯化后的生物样品进行晶体生长。晶体生长的方法有很多,如气相扩散法、液相扩散法、温度渐变法、真空升华法、对流法等等,而目前应用最广泛的晶体生

X射线晶体学揭示代谢调控新机制

  来自普渡大学、霍华德休斯医学研究所的研究人员,运用X射线晶体学方法,揭示了大肠杆菌抑制麦芽糖转运蛋白摄入麦芽糖的机制,相关论文公布在6月16日的《自然》(Nature)杂志上。   领导这一研究的是普渡大学生物学系陈觉(Jue Chen)教授,其早年毕业于上海同济大学,2002年受聘于普渡

X射线晶体学的多重同晶置换(MIR)概念

把对X射线散射能力大的重金属原子作为标识原子。这种置换入重原子的大分子应与无重原子时的原晶体有相同的晶胞参数和空间群,且绝大多数原子的位置相同,故称同晶置换。从这些含重原子晶体的衍射数据,利用基于派特逊法的方法可解出重原子的位置,据此算出其结构因子和相角,进而利用相角关系计算出没有重原子的原晶体的相

X射线晶体学的多波长反常散射(MAD)概念

晶体衍射中有一条弗里德耳定律, 就是说不论晶体中是否存在对称中心,在晶体衍射中总存在着对称中心,也即有FHKL=FHKL。但是当使用的X射线波长与待测样品中某一元素的吸收边靠近时,就不遵从上述定律,也即FHKL≠FHKL。这是由电子的反常散射造成的, 利用这一现象可以解决待测物的相角问题。 一般,

X 射线晶体学与冷冻电镜在结构生物学上如何互补?

小刘同学的故事好感慨的题目,基本上就是小刘同学大学生活的变迁2012年,小刘同学刚刚结束了高考。满怀对生命科学的憧憬,心想,二十一世纪是生命科学的世纪。他现在也这样觉得。于是背上小小的行囊,告别了家乡和爹娘;只身来到了帝都,前去某知名985高校学一门手艺。希望能功成名就,回老家盖房子,娶媳妇。小刘同

通过X射线晶体学确定甜叶菊莱鲍迪甙A(RebA)蛋白的结构

  6月10日发表在《美国科学院院刊(PNAS)》上的一项研究,揭示了甜叶菊高强度甜味背后的分子机制,研究结果可用于设计新的无热量产品,且不含任何不良余味。该研究由美国华盛顿大学圣路易斯分校领导。  尽管负责甜叶菊合成生化途径中的基因和蛋白质几乎已完全为人所知,但根据这项新研究的作者称,这是首次发表

X射线荧光光谱仪的测试步骤

 X射线荧光分析是一种物理分析方法, X射线荧光光谱仪分析速度快。测定用时与测定精密度有关,但一般都很短,2~5分钟就可以测完样品中的全部待测元素。  X射线荧光光谱仪是由物质中的组成元素产生的特征辐射,通过侧里和分析样品产生的的产生与特性当用高能电子束照射样品时,人射高能电子被样品中的电子减速,这

X射线辐照诱导肿瘤生长研究

放射疗法通过诱导肿瘤抗原诱导抗肿瘤免疫损伤相关分子模式(DAMP)。 DNA,一种代表性的DAMP放疗,激活干扰素基因(STING)通路的刺激因子增强免疫反应。然而,免疫反应并不总是如此平行与放射治疗相关的炎症。这种缺乏通信可能部分地解释了肿瘤的抗辐射性。添加剂预计免疫疗法将恢复肿瘤特异性CTL