基因组所重复序列与哺乳动物内含子扩张关系研究获进展
近日,在中国科学院北京基因组研究所副所长、基因组科学与信息重点实验室主任于军研究员和“百人计划”雷红星研究员的指导下,基因组所王大鹏博士、博士研究生苏尧等科研人员在哺乳动物基因组内含子扩张与基因功能关系研究,以及突变和自然选择在基因组进化中的作用研究中取得新进展。相关学术论文在Evolutionary Bioinformatics杂志发表。 基因组重复序列(Repetitive Sequence,RS)是复杂且进化活跃的,其对基因和基因组结构的稳定和动态性有着很大影响,并且与生物学功能密切相关。处于不同基因结构区域如外显子、内含子和基因间区的重复序列受到不同程度选择压力的影响。一般来说,这些序列重复的DNA片段通常被分为两类:即卫星序列(Satellite Sequences,SSs)和转座元件(transposable elements,TEs)。目前,许多脊椎动物的基因组测序工作已经完成,这为研究不同......阅读全文
脊椎动物寿命影响要素找到
以色列耶路撒冷希伯来大学科学家领导的联合团队在最新一期《自然·衰老》上发表论文称,他们发现了脊椎动物种系调节与寿命、体细胞修复的复杂平衡之间存在新的联系。该研究揭示了对脊椎动物寿命存在重要影响的因素。与经典进化理论相反,事实证明,改变负责种系(繁殖的部分)的工作方式,会对雄性和雌性产生不同的影响。这
高尔基带并非脊椎动物独有
意大利科学家发现,高尔基带,一种以前被认为是脊椎动物独有的细胞器结构,也存在于其他动物分类群中,包括软体动物、蚯蚓和海胆。相关研究3月1日发表于《细胞报告》。一直以来,高尔基带的功能成谜,但它在不同动物谱系中的存在表明其功能并不像以前认为的那样是脊椎动物特有的。研究小组还发现,高尔基带是在胚胎发生的
高尔基带并非脊椎动物独有
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关于内含子的基本信息介绍
断裂基因的非编码序列,在mRNA加工过程中被剪切掉,故成熟mRNA上无内含子编码序列。内含子可能含有“旧码”,就是在进化过程中丧失功能的基因部分。正因为内含子对翻译产物的结构无意义,不受自然选择的压力,所以它比外显子累积有更多的突变。
关于内含子归巢的相关解释
在两个亲本任何一个都可发生突变而抑制以上的归巢。突变的结果使杂交后代中出现了正常分离,即ω+和ω-的后代中出现了正常分离,即ω+和ω-的后代数相等。这种突变表明了这个过程的性质。在ω+的品系中突变发生在紧靠着内含子将要插入的位点。在ω+品系中突变发生在内含子的开放读框中,从而阻止了蛋白质的合成。
基因“时钟”或能预测脊椎动物寿命
近日,一个澳大利亚研究团队报告了一种采用基因标记准确估算不同脊椎动物物种寿命的模型。这个“寿命时钟”筛选了CpG(核苷酸对)位点的42个特定基因,以预测某脊椎动物物种成员可能拥有多长的寿命。CpG位点是DNA上的短片段,其密度与寿命相关。相关论文刊登于《科学报告》。 一个物种的最大寿命难以定义
研究揭示脊椎动物“手”的起源
根据英国《自然》杂志23日发表的研究,科学家发现一块鱼类化石其胸鳍拥有手指样附体,为理解脊椎动物的手的起源带来了全新线索。这是迄今最完整的希望螈样本,其代表了鱼类向陆地脊椎动物过渡的演化阶段,同时其也是第一次在已知动物化石身上发现了手指与鳍“锁”在一起的现象,揭示了人类的手部是如何由远古鱼类的鱼
PNAS:miRNA揭示脊椎动物进化起源
美英科学家的一项最新研究表明,脊椎动物这种复杂生命形式的出现源于miRNA。调控基因表达的miRNA的不断进化是早期脊椎动物出现的背后原因。相关论文近日在线发表于美国《国家科学院院刊》(PNAS)上。 论文高级作者、美国达特茅斯学院的Kevin Peterson表示,“新的研究不仅为认识人类自身的进
关于RNA剪接的简介
大多数脊椎动物基因的编码序列,无论是编码多肽的基因还是编码除mRNA以外的RNA分子的基因,都是由非编码的间隔序列(内含子)分隔为各个外显子部分。这些基因的外显子和内含子都转录在一条初级RNA转录分子中,接下来,此初级RNA转录分子要经过RNA剪接,此过程包括一系列的加工反应:RNA的内含子部分
分子遗传学词汇内含子归巢
中文名称:内含子归巢外文名称:homing定 义:内含子的归巢intron homing 在I类II类的某些内含子中含有开放阅读框,可产生具有三种功能的蛋白。这些蛋白可使内含子(或以其原来的DNA形式,或作为RNA的DNA拷贝)移动(mobile),使内含子可插到一个新的靶位点,这个现象
关于基因内含子的基本信息介绍
基因内含子是阻断基因线性表达的序列。DNA上的内含子会被转录到前体RNA中,但RNA上的基因内含子会在RNA离开细胞核进行转译前被剪除。在成熟mRNA被保留下来的基因部分被称为外显子。基因内含子有时也叫内显子,与外显子相对。真核生物的基因含有外显子和基因内含子,是前者区别原核生物的特征之一。
关于Ⅱ型内含子的基本信息介绍
同I型内含子类似,是一类具有酶催化功能的内含子,转录成RNA后,可以自我剪接。Ⅱ型内含子以与剪接体类似的方式进行剪接,但不需要任何蛋白质(自剪接)。 Ⅱ型内含子是主要存在于线粒体中的一类内含子,它的剪接位点类似于核编码结构基因的内含子,并同样遵从GU-AG规律。剪接机理同核内含子的剪接相似,也
内含子归巢的移动系统的介绍
将一种核糖核蛋白和DNA底物的一道温育在体内可产生移动系统。这个核糖核蛋白含有一个带有第II组内含子的RNA和它的蛋白产物。它具有核酸内切酶活性,在恰当的靶位点交错切割双链。核糖核蛋白的RNA和蛋白两种成份对于剪切都是需要的。在催化中二者可能都有作用。可移动的内含子似乎是被插入到先前存在的基因中
内含子归巢的基本信息介绍
内含子的归巢intron homing 在I类II类的某些内含子中含有开放阅读框,可产生具有三种功能的蛋白。这些蛋白可使内含子(或以其原来的DNA形式,或作为RNA的DNA拷贝)移动(mobile),使内含子可插到一个新的靶位点,这个现象叫做归巢(homing)I组和II组内含子分布很广。
-姥鲨基因揭示早期脊椎动物进化
在过去的4.2亿年里,姥鲨(Callorhinchus milii)几乎没有什么变化,这就使其DNA序列在与其他脊椎动物物种进行比较时更有价值。 这种有着大吻状突起、外形古怪的鱼类是最原始的颌类脊椎动物,研究人员已经对其基因组进行了测序。姥鲨的DNA序列有助于解释为什么鲨鱼具有一副软骨
最古老的脊椎动物,原来长这样!
中国古生物学者运用先进的实验技术证实,5.18亿年前的云南虫是地球上最古老的脊椎动物。这是中国化石宝库澄江动物群中诞生的又一位“超级明星”。该发现对了解我们自身所在的脊椎动物谱系起源具有重要意义,相关成果8日刊发在国际权威期刊《科学》上。 云南虫生态复原图。(中科院南京地质古生物研究所研究员赵方臣
海口虫:揭开脊椎动物远祖的面纱
陈均远等人对海口虫的研究成果表明,脊椎动物的演化在5.2亿年前就已拉开序幕。这些保存惊人完好的化石,展现了一幅包括人类在内的脊椎动物远祖的生动“肖像”。这一发现被一些国外科学家誉为“人类重塑地球生命史的一项惊人成就”。 云南昆明滇池之畔,海口镇耳材村村后,有一个长2000米、宽1000米的斜
关于第一类内含子的基本信息介绍
第一类内含子(groupIintron)广泛在于各种生物的线粒体、叶绿体及基因组内,内含子移动分内含子回归(intron loss)和内含子转座(imtron transposition),前者已为实验证实,后者则尚未被证实。 一类新的可动因子即第一类内含子(groupIintron)已被发现
内含子归巢蛋白的作用是什么?
这种蛋白的作用是什么呢?ω内含子的产物是一种核酸内切酶,它能识别ω-基因并将它作为靶切开其双链。这种核酸内切酶识别18bp的靶序列,此含有内含子插入位点。靶序列的剪切是在每条链插入位点的3’端这一侧2个碱基处交错切,这样剪切位点占4个bp,产生了凸出的单链末端。 这种类型的剪切是和转座子移到新
简述第一类内含子的意义
对大量的生物研究表明,大批内含子在生物中的分布物不均衡,表示为 (1)同一种的不同个体中,有的有内含子,有的没有; (2)同一基因在不同种生物基因组中的内含子的特性,数目位置等不同,如Sccoxl.2b和Ancoxl.3是高度同源内含子插入在不同种的同一回归位点的例子,这两种内含子有70%顺
关于I型内含子的基本信息介绍
一类具有酶催化功能的内含子,转录成RNA后,可以自我剪接。此类内含子转录后可以形成9个由碱基配对形成的特定二级结构,分别命名为P1至P9,P1和P7是保守的。 I型内含子具有自我剪接的功能,在剪接反应中,要有一种鸟嘌呤核苷(含有游离的3'-OH)G-OH。G首先结合到内含子的5'
简述第Ⅳ类内含子的剪接tRNA的剪接
酵母基因组共有约400个tRNA基因,含有内含子的基因仅占十分之一。内含子的长度从14到46个碱基对不等,它们之间并无保守序列,切除内含子的酶识别仅是共同的二级结构,而不是共同的序列。通常内含子插入到靠近反密码子处,与反密码子碱基配对,未成熟tRNA的反密码子环不存在,而是以插入的内含子所构成的
海洋无脊椎动物胚胎的培养设备实验
培养胚胎用玻璃器具和塑料器具的处理 试剂、试剂盒 硝酸 EDTA 蒸馏水
最新发现:云南虫不是脊椎动物
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脊椎动物恐怖反应选择机理揭开
日本理化学研究所10月11日宣布,他们的一个联合研究小组利用斑马鱼研究发现,脊椎动物共有的称为“缰核”的大脑部位,能够基于过去的恐怖经验对行动选择作出指令。该研究成果发表在10月10日的美国科学杂志《自然·神经科学》网络版。 当捕食者或危险突然降临的时候,立刻逃跑或是站立不
海洋无脊椎动物胚胎的培养设备实验
培养胚胎用玻璃器具和塑料器具的处理试剂、试剂盒硝酸 EDTA
海洋无脊椎动物胚胎的培养设备实验
试剂、试剂盒硝酸EDTA蒸馏水仪器、耗材玻璃器具实验步骤一、胚胎学玻璃器具的酸洗1. 将需洗涤的玻璃器具放在到防烟尘盖的大容器中。2. 小心加入硝酸,完全覆盖玻璃器具。3. 浸泡过夜。4. 第二天早上,用镊子小心取出玻璃器具并放入新容器内。硝酸可保存起来并能反复使用几次。5. 用去离子水彻底冲洗,以
CpG密度可准确预测脊椎动物的寿命?
“少小离家老大回,乡音无改鬓毛衰。”衰老是几乎所有动物都存在的现象。它涉及到多种生物功能的下降,并限制了物种的最大寿命。之前的研究表明,衰老与表观遗传变化相关,包括DNA甲基化。最近,澳大利亚的一组研究人员就试图通过表观遗传模式来预测物种的寿命。 研究人员研究了250多种寿命已知的脊椎动物的启
5亿年化石可能改写脊椎动物起源
在7月6日发表于《自然-通讯》的一篇论文中,美国哈佛大学古生物学家Karma Nanglu与合著者报告说,一块保存完好的5亿年前的化石与今天一些被囊动物非常相似,即用两根虹吸管过滤水中的有机颗粒,复杂的肌肉组织则用来控制虹吸管。这一发现为早期被囊动物的出现时间和发育提供了线索,甚至可能推迟被囊动
为什么QPCR引物设计在跨外显子的接头区
如果反转录体系里面有基因组残留,而且你的引物没有跨内含子,这样的情况下就很容易造成你的Ct偏小(除了cDNA扩增外,基因组的模板也会作为模板进行扩增,导致模板起始量偏高);cDNA逆转后是切除内含子的,而基因组是存在内含子的,如果你的引物设计在了跨两个外显子的区域,则只能扩增cDNA而不扩增基因组。