MolecularOncology:废物利用!新方法使乳腺癌诊断更精准
一项发表在《Molecular Oncology》上的新研究表明对乳腺癌常规检测剩下的组织进行蛋白质和RNA检测可能会使检测结果更准确。图片来源于网络 通过使用细针抽吸25名乳腺癌病人和33名良性肿瘤病人的组织样品,研究人员发现通过蛋白质和RNA分析竟然可以完全将所有恶性肿瘤病人和良性病人区分开。 这项研究表明除了提供结论性诊断信息之外,通过微创技术对乳腺癌进行分型很重要,这样有助于决定每个病人最适合的疗法、监控疾病进程以及对治疗的反应。......阅读全文
蛋白质组学之逆袭,深度注释基因组
申请课题缺创新点?撰写论文没思路?急着毕业时间紧?别怕,对于吉凯,一切都是套路!更有甚者,对于宇宙终极难题:“屌丝如何逆袭白富美?”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。 从前,在生物学研究领域,有一个白富美叫基因组学(Genomics),她有一项强大的技能:DNA测序,凭借这项技能,她完
梁晗:RNA编辑为精确癌症治疗带来新希望
如果说所有癌症都有一个共同点的话,那就是无共同性。 因此这造成了癌症难以治疗的一个根本原因。近期来自德州大学MD安德森癌症中心的研究人员发现了为什么作为许多癌症的“孵化器”的蛋白质,会出现癌症类别的差异,甚至患者之间的差异。这一发现为科学家们提供了新思路,对于开发更有效的癌症精确治疗方法十分重
一文近期癌症转移研究新进展
本文中,小编整理了近期与癌症转移相关的最新研究进展,与大家一起学习! 图片来源:Wellcome Collection 【1】Nat Cell Biol:乳腺癌细胞或能转变其代谢策略来发生转移 doi:10.1038/s41556-020-0477-0 近日,一项刊登在国际杂志Natur
大化所蛋白质和RNA复合物相互作用合作研究取得新进展
中科院大连化学物理研究所海洋生物产品工程组薛松研究员在其2008年非编码RNA如何帮助蛋白质寻找特异底物分子研究工作(Nature Structural & Molecular Biology)基础上,再次与合作者利用结构生物学手段,揭示了另一类非编码RNA及其相关蛋白质和RNA的
亚甲基蓝介导光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互作用
亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构,亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合,插入碱基。浓度较高时,亚甲基蓝带阳离子,可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反
亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA相互作用
实验方法原理 亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构,亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合,插入碱基。浓度较高时,亚甲基蓝带阳离子,可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。
纯化RNA实验——从组织中纯化总RNA
实验材料组织试剂、试剂盒RNA 抽提缓冲液氯仿实验步骤1. 从动物取下组织,直接进行第 2 步或在液氮中快速冷冻新鲜解剖的组织。冷冻后的组织可以贮存在 -70℃。2. 组织(0.05~0.3 g)在 2.0 ml RNA 抽提缓冲液中匀浆。3. 每管加 200 μl 氯仿,混合均匀,冰浴 15 分钟
什么是RNA?RNA的作用是什么?
核糖核酸(缩写为RNA,即Ribonucleic Acid),存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。RNA由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和碱基构成。RNA的碱基主要有4种,即A(腺嘌呤)、G(鸟嘌呤)、C(胞嘧啶)、U(尿嘧啶),其中,U(尿
RNA干扰(RNA-interference,RNAi)基础知识(3)
SiRNASmall interfering RNA (siRNA):是一种小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默。ShRNAshRNA 短发夹RNAshRNA
RNA干扰(RNA-interference,RNAi)基础知识(1)
Rnai最近由于RNA 干扰(RNA interference,RNA i)的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的(1),是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在 RNA i领域取得的进步,已经有许多这方面的综述发表(2-4)。RNA 干扰是
RNA干扰(RNA-interference,RNAi)基础知识(2)
1RNA i的发现RNA i是在研究秀丽新小杆线虫(C. elegans)反义RNA (antisenseRNA )的过程中发现的,由dsRNA 介导的同源RNA 降解过程。1995年,Guo等发现注射正义RNA (senseRNA )和反义RNA 均能有效并特异性地抑制秀丽新小杆线虫par
什么叫做外源性RNA和内源性RNA
核糖核酸(缩写为RNA,即RibonucleicAcid),存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。RNA由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和碱基构成。RNA的碱基主要有4种,即A腺嘌呤、G鸟嘌呤、C胞嘧啶、U尿嘧啶,其中,U(尿嘧啶)取代了DNA
小RNA(tsRNA)的发现与临床价值
转移 RNA (tRNA) 衍生的小RNA (tsRNA) 是一种新型的非编码小 RNA,可通过酶从 tRNA 上切割下来,在转录和翻译水平调节基因表达。tRNA的化学修饰可以直接影响 tsRNA 的产生和生物学功能。tsRNA参与多种疾病的发病机制,包括免疫紊乱、代谢紊乱和恶性肿瘤的发展,并且是各
化妆品易致乳腺癌?盘点乳腺癌7大诱因
统计数据显示,多达1/8的女性在一生中的某个时间会患上乳腺癌。但是,乳腺癌风险存在很大的个体差异,美国“福克斯新闻网”11月3日载文,刊出“乳腺癌的风险因素”,并提醒所有女性每年查一次乳房X光片,以提早发现乳腺癌征兆。 1.体重超标。体重超标或肥胖会导致乳腺癌风险增加30%~60%。其原因是,
乳腺癌三联疗法获FDA批准,用于早期乳腺癌
近日,罗氏(Roche)集团成员基因泰克(Genentech)公司宣布,美国FDA已批准Perjeta(pertuzumab,帕妥珠单抗)加赫赛汀(trastuzumab,曲妥珠单抗)和化疗(简称基于Perjeta的治疗方案)的三联疗法,作为HER2阳性、有高复发风险的早期乳腺癌(EBC)患者的
Nature-Methods发布新RNA测序技术
Santa Cruz公司和Rochester大学的研究人员开发了一种新的RNA测序技术。他们通过这一技术发现了许多此前未被检测到的调控性小RNA。这一成果发表在八月三日的Nature Methods杂志上。 这个新技术可以在细胞中灵敏检测到带有化学修饰(甲基化)的小RNA。“tRNA是生物体内
Nature公布800个癌症基因组
来自癌症基因组计划的科学家们近期报告了他们最新的癌症基因组研究成果,他们公布了800个乳腺癌的遗传特征,包括发现了导致乳腺癌最常见的形式的遗传原因,为新的治疗靶点提供线索,并确定乳腺癌和卵巢癌一种亚型之间的分子遗传相似性。 这项研究结果有助于更全面的了解每种乳腺癌亚型背后的分子机制,相关成
Cell:Hedgehog信号通路为何引发乳腺癌转移?
长链非编码RNA(lncRNAs)与乳腺癌有牵连,但其在癌症转移和肿瘤生长中的相关机制仍不甚明朗。 得克萨斯大学MD安德森癌症中心科学家报告说,刺猬(hedgehog)是一个独特的细胞信号转导通路(其已知能导致许多类型的癌症),亦可能是乳腺癌转移的背后机制。这种分子与BCAR4协同,给肿瘤生长
暨南大学张灏教授团队:唾液外泌体检测肿瘤嵌合RNA
外泌体作为液态活检的三驾马车之一,特点和优势日益凸显,比如外泌体存在于各种细胞,外泌体检测不仅可用血液标本还可以用其它体液标本,外泌体不仅可以检测DNA,还可检测RNA和蛋白质等。外泌体液态活检在伴随诊断和肿瘤早诊早筛方面的应用前景,越来越受到重视。 和传统的液体活检材料血液标本相比,唾液活
饮酒导致胃癌不良预后的生物标志物证据
饮酒被认定是导致癌症的一个潜在风险因子,但证明酒精与癌症相关性的生物标志物却鲜有报道。1月10日《The American Journal of Pathology》一篇最新文章指出,某些特定蛋白质与酒精具相关性,可以证明酒精影响胃癌患者生存和对铂类辅助化疗反应。 文章首次证明转录因子IIB
Nature子刊惊人发现:抑癌的snoRNA分子
根据斯坦福大学医学院的研究人员所说,一对原以为只是充当细胞管家的RNA分子,在超过四分之一的常见人类癌症中缺失。肿瘤中丧失这些RNA分子的乳腺癌患者相比于其他的乳腺癌患者生存率要低。 研究人员发现,这些RNA分子直接结合并抑制了一个众所周知的癌症相关蛋白KRAS。在缺失这些分子的情况下,KRA
RNA加工修饰
中文名RNA加工修饰所属领域生物学定义RNA加工修饰,主要加工方式是切断和碱基修饰,真核生物tRNA前体一般无生物学特性,需要进行加工修饰。
RNA提取原理
RNA抽取一般使用Trizol法抽提:Trizol是一种总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速裂解细胞,抑制细胞释放出的核酸酶活性。目前常用Trizol法进行提取组织或细胞中的RNA。Trizol作用原理:在匀质化或溶解样品中,Trizol试剂可保持RNA的完整性,同时能破坏细胞及溶解细胞成
RNA提取原理
RNA抽取一般使用Trizol法抽提:Trizol是一种总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速裂解细胞,抑制细胞释放出的核酸酶活性。目前常用Trizol法进行提取组织或细胞中的RNA。Trizol作用原理:在匀质化或溶解样品中,Trizol试剂可保持RNA的完整性,同时能破坏细胞及溶解细胞成
RNA点线杂交
RNA点线杂交(Dot and Slot blotting)· RNA dot blot and slot blot (Beverly Faulkner-Jones)This methods allows the rapid analysis of numerous small sa
RNA微注射
· RNA Injection (Hoshi Lab)The oocyte is a useful model for the investigation of the function of usr/localious genes and is a widely used syst
前信使RNA
中文名称前信使RNA英文名称pre-messenger RNA;pre-mRNA;precursor mRNA定 义未经剪接加工的基因转录产物。即初级转录物。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)
Reverse-Transcription-of-RNA
实验概要The purpose of Reverse transcription of RNA is acquiring cDNA for follow research.实验原理Reverse Transcription (RT reaction) is a process in which s
RNA病毒介绍
RNA是核糖核酸,single-stranded是单链。一般看脱氧核糖核酸(DNA)的图片都是有两条链扭在一起,而核糖核酸一般都是单链的。讲到ssRNA,一般都是在说RNA病毒。一般来说生物学家是根据RNA能否直接起mRNA作用而分成正链ssRNA病毒与负链ssRNA病毒两种。(1)正链RNA病毒(
RNA干涉实验
化学合成siRNA分子实验 体外转录合成siRNA分子实验 采用RNA聚合酶Ⅲ启动子表达siRNA分子 采用RNaseⅢ制备siRNA分子实验 实验方法