新冷泉港实验手册聚焦皮肤癌模拟方法
皮肤癌在美国是最常见的一种人类癌症。为了全面了解人类皮肤癌,科学家就必须利用模型生物如小鼠在实验室研究这种疾病。 这个月发布的新一期《冷泉港实验手册》包括了创造鳞状上皮细胞癌(SCC)小鼠模型的方法。SCC是一种最常见的皮肤癌类型。这个步骤包括给小鼠注射一种叫做DMBA的药物,这种药物能够突变并激活一种促肿瘤基因。使用的第二种药物TPA能够促进携带这种突变基因的细胞的增殖。最终,这些操作导致一个肿瘤的形成。 该实验的protocol可在以下网址免费获得:http://www.cshprotocols.org/cgi/content/full/2007/18/pdb.prot4837 ,内容包括如何监督和评估小鼠的肿瘤形成临床迹象。另外,还包括制备用于组织学分析的肿瘤组织,从而使研究人员能够在微观水平分析肿瘤特征。 这个protocol来自耶鲁大学医学院的Michael Girard博士研究组。该研究组利用这种步骤方法......阅读全文
转基因小鼠模型的建立(SOP)4
(6) 为保暖包裹小鼠于纱布中或将其放置于热垫内使其苏醒,处于麻醉状态下的小鼠应该严格监护直到其完全苏醒。手术后小鼠饲养2周后确定手术是否成功。(7) 实验性饲养:将1-2只母鼠与输精管切除小鼠合笼饲养,次晨进行阴道栓检查。有阴道栓的母鼠,用磷酸缓冲液处理后24小时,其输卵管潮红。卵细胞应该处于单
转基因小鼠模型的建立(SOP)2
[不足之处](1)外源基因随机整合;(2)个别原核不清晰,需进行特殊处理;(3)需大型精密仪器,费用昂贵;(4)操作周期相对较长。(二)实验器材的准备1.输精管切除术用器材:弯式有齿镊、直式有齿镊、显微镊、手术剪、自动小夹涂药器、自动小夹、带弯针4/0丝线及持针器、直径为10cm塑料 Petri氏培
RNAi基因沉默方法
大约在十年前,2006年诺贝尔生理/医学奖得主CraigMello和AndrewFire发现,他们能够将短RNA 分子插入到线虫中并沉默特定基因的表达。今天,研究人员也常常使用这种强大的RNA 干扰方法来研究哺乳动物系统中的特定基因功能。为了进行这种基因沉默实验,研究人员通常需要依赖化学合成的RNA
病毒RNA提取实验方法(protocol)
1,用异硫氰酸胍提取提禽流感病毒的详细步骤,可参考(我提过N次做定量PCR都没问题):1.取200ul样品数+阴性对照+阳性对照个1.5ml灭菌eppendorf管2.加600ul异硫氰酸胍,然后加入对照和样品,再加200ul氯仿,颠倒混匀3.13000rpm离心15min4.在第3步离心快结束时,
广州开发区千亿产业再添一子-美国大牛实验室落户
据悉,广州开发区千亿级生物产业再添一子,美国大牛实验室冷泉港签约落户。8月16日,广州市委常委、黄埔区委书记、广州开发区管委会主任周亚伟在美国与冷泉港实验室签署全面合作备忘录。在此备忘录合作框架下,双方将联合打造冷泉港(广州)研究院和科技成果转化中心,共同设立冷泉港(广州)生物医药产业基金。
SQUID系统“撬开”人工智能“黑匣子”
在生物学研究中,人工智能(AI)可以筛选数十万个基因组数据点,识别出潜在治疗靶点。但科学家仍不确定AI模型是如何得到这些结果的。据最新一期《自然·机器智能》杂志报道,一种名为SQUID的新系统已经出现,它能“撬开”AI模糊的内部逻辑的“黑匣子”。SQUID的计算流程示意图。图片来源:冷泉港实验室SQ
SQUID系统“撬开”人工智能“黑匣子”
在生物学研究中,人工智能(AI)可以筛选数十万个基因组数据点,识别出潜在治疗靶点。但科学家仍不确定AI模型是如何得到这些结果的。据最新一期《自然·机器智能》杂志报道,一种名为SQUID的新系统已经出现,它能“撬开”AI模糊的内部逻辑的“黑匣子”。 SQUID的计算流程示意图。图片来源:冷泉港实验室S
港中大研发精准计算模型预测病毒基因演变
香港中文大学(港中大)2日公布,港中大医学院研究团队建立了一套精准计算模型“beth-1”,能准确预测病毒基因演变,有助在设计流感疫苗时选择最具代表性的病毒株。港中大医学院表示,流感病毒会持续出现基因进化演变,导致免疫逃脱,令已经感染过病毒或打过疫苗的人可能再次感染突变后的病毒,造成新的季节性流感高
自身免疫药检员-BhIL17A小鼠构建EAE模型的实验流程
研究表明Th17细胞以及相关的IL17、IL22 、IL23 等细胞因子参与到多种自身免疫疾病发展过程中[1]。其中IL17家族细胞因子可以动员、募集及活化中性粒细胞,从而介导炎症反应的产生,并参与到自身免疫疾病的发病过程中(如图1)。所以针对于IL17靶点相关的抗自身免疫药物一直是研发的热点。目前
自身免疫药检员-BhIL17A小鼠构建EAE模型的实验流程
研究表明Th17细胞以及相关的IL17、IL22 、IL23 等细胞因子参与到多种自身免疫疾病发展过程中[1]。其中IL17家族细胞因子可以动员、募集及活化中性粒细胞,从而介导炎症反应的产生,并参与到自身免疫疾病的发病过程中(如图1)。所以针对于IL17靶点相关的抗自身免疫药物一直是研发的热点。
Cell:增强大脑中Fezf2神经元的活动使小鼠工作更卖力
在一项新的研究中,来自美国冷泉港实验室(CSHL)的Bo Li教授与CSHL兼职教授Z. Josh Huang合作,发现了小鼠大脑中的一组神经元,它们影响着小鼠执行任务以获得奖励的动机。增强这些神经元的活动会使小鼠在一定程度上工作得更快或更卖力。这些神经元有一种可以防止小鼠对奖励成瘾的特点。
小鼠免疫实验
实验方法原理 实验材料 任意品系小鼠(6~8 周)试剂、试剂盒 PBS完全和不完全弗氏佐剂抗原仪器、耗材 22-G 注射针头带塞的 3 ml 注射器双头带塞的连接器无菌剪刀剃须刀片解剖刀片木制涂棒实验步骤 1. 准备等体积 PBS 含 25~100 μg 抗原和弗氏完全佐剂的乳化液(200~40
如何唤醒睡眠的癌症?
即使癌症治疗成功,那些处于休眠状态、不分裂的从原发肿瘤上面脱落下来的癌细胞可能早已遍布身体各个角落,如果它们被唤醒了就会成长为转移性肿瘤。冷泉港实验室研究转移到肺部的肿瘤,发现了伴随炎症反应唤醒沉睡癌细胞的信号。 炎症是否能直接导致癌症复发?在此之前答案还不明确。这篇《Science》文章证明
综述PTEN调控造血系统和白血病发生的研究进展
应冷泉港实验室邀请,北京大学生命科学学院吴虹教授课题组撰写了题为“PTEN in Regulating Hematopoiesis and Leukemogenesis”的综述文章,近期在Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine杂志上发表,对PTE
北大吴虹团队撰写关于PTEN调控造血系统和白血病的文章
应冷泉港实验室邀请,北京大学生命科学学院吴虹教授课题组撰写了题为“PTEN in Regulating Hematopoiesis and Leukemogenesis”的综述文章,近期在Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine杂志上发表,对PTE
最新RNAi技术可媲美转基因小鼠模型
基因编辑技术一直都是生命科学的热门研究领域,近来编辑领域出现了可与转基因小鼠技术相媲美的新RNAi干扰技术,该技术由洛克菲勒大学的研究人员研制出,在全基因组水平上首次对小鼠进行RNAi筛查研究,并在数月内发现了导致表皮肿瘤生长的基因,研究成果发表在《自然》期刊上。 RNAi技术筛查致病基因
小鼠模型不能很好模拟人类炎症疾病
数十年以来,在进行人体试验之前,实验小鼠模型一直被用于确认和测试候选药物,但是一项研究发现这些模型不能准确地代表人类对炎症疾病的响应。 Junhee Seok及其同事研究了创伤、烧伤和来自例如大肠杆菌等细菌的毒素是如何影响病人的遗传应答的。这组作者将观察到的模式与在小鼠模型中观察到的模
SARS小鼠模型的构建策略与应用进展
在全国疫情逐步清零时,北京的疫情却出现了“反弹”,牵动着全国人民的心。截止6月18日24时,北京8天内已出现新增确诊病例183例,还有一些主动筛查中发现的无症状携带病例。这无疑在告诉我们每一个人:疫情尚未结束,仍需加强防疫! 对于中国乃至整个世界来说,由新冠病毒(SARS-CoV-2) 引起的全
Cell新突破:CRISPR技术助力构建小鼠模型
来自Whitehead研究所的研究人员利用基因调控系统CRISPR/Cas,一步操控小鼠基因组纳入了报告基因和条件性等位基因。现在生成包含如此复杂工程等位基因的动物只需数周而非数年的时间,并可利用这些动物来构建疾病模型及研究基因功能。这一突破性的研究发表在《细胞》(Cell)杂志上。 Wh
PNAS:小鼠模型需慎用,基因表达差异大
PNAS:小鼠模型需慎用,基因表达差异大 小鼠被广泛用于模拟人类代谢、疾病和药物应答,是医学研究中的一个基本工具。然而斯坦福大学的研究团队指出,人类和小鼠的基因表达存在着惊人的差异,不论是蛋白编码基因还是非编码基因。这项研究发表在十一月十七日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 Mic
PDX模型的好帮手——BNDG®小鼠
随着医学的不断发展,人们对肿瘤的认识越来越深入,同时对肿瘤模型的要求也越来越高。PDX (Patient-derived xenograft )模型,由于其更贴近病人的肿瘤遗传特性和异质性(Fig 1),不断受到药企和科研院所的青睐。然而PDX模型因为在构建过程中受制于异源移植物免疫反应,所以免
Nature长文:构建人源化的小鼠模型
小鼠常被用于研究癌症,但科学家仍在努力改善这一模型,以更好地研究人类疾病。基因编辑的进步使研究人员能够构建更能反映人类疾病的小鼠模型。 1915年,全球处于战争状态,日本病理学家Katsusaburo Yamagiwa和他的助理Koichi Ichikawa正在努力研究一个致命武器,其杀伤力
小鼠模型在转化医学研究中的应用
小鼠模型已经成为研究基因功能与致病机制、建立人相关疾病模型和评价研发药物安全性与有效性等生物医药研究不可取代的模式动物。转化医学研究就是针对来自临床患者实际问题,通过实验室包括分子、细胞及模式动物的相关基础及临床前研究,最终实现解决临床所面临的已知与未知的难题。所以,转化医学研究解决问题的思路与策略
季茂业:詹姆斯·沃森与中国生命科学
中国必将在世界科学版图上占有更加重要的地位 在过去的一个世纪里,冷泉港国际会议及培训班在生命科学领域起到了重要推动和导向作用。继与英国剑桥成立合作平台后,近年来冷泉港将其目光投向了日益活跃的亚洲。在物色亚太合作对象时,冷泉港管理者考虑了诸多可能,曾考察了韩国、日本、新加坡和我国香港等。
走进细胞屋-玩转DNA
在江苏省苏州工业园区独墅湖高教区的新平街上,有座由玻璃幕墙构成的相互连接的3个圆形建筑,隐约在树林中,与周围四方形耸立入云的高楼形成差异。而别出心裁是,走进这座圆形建筑后,似乎进入了细胞空间。 屋顶正中央倾泻下来的光线,让整个屋子透明鲜亮。环型房间,外周墙面以人类基因序列编号为装饰,作为实验室
冷泉港推出两个精选新方法-分别用于分析基因组和植物细胞
基因组分析法: 2008年6月冷泉港报:人类基因组计划后时代推动了其他个体基因组拷贝序列测定的发展,令人惊讶的是大量的基因拷贝数和DNA系列在个体之间存在很大的差异。这些拷贝数变异(CNV)是产生生物多样性的主要原因,也是导致诸多遗传疾病的元凶。本月的冷泉港期刊Cold Spring Habor
实验员基础知识手册
常用分析仪器的使用与维护 1.分析天平: (1)分析天平的工作原理: 杠杆原理F1L1=F2L2 (2)分析天平的种类: 根据构造分摆动式天平、空气阻尼天平、机械加码光电天平、单盘光电天平。 (3)分析天平的维护: ①分析天平应放在专设的天平室内,室内要求空气干燥、温
层析实验冷柜使用说明手册
一、 仪器用途及特点:层析冷柜是专为生化层析实验而研制的特殊用途冷柜。本装置制冷系统设计合理、降温快、噪音低。温度控制系统的测温和控温均为数字显示,控温精度高。设有声光报警系统,保证样品安全。本设备内设施齐全。ZX-CXG型有二层可上下移动的搁板,便于内部仪器的放置。有两个固定立柱、一个消毒灯、一个
免疫组化双染实验protocol
第一抗体的染色: 1、 将切片浸在3%H2O2甲醇溶液(新鲜配制)中10分钟,PBS冲洗2分钟×3次 2、 加100ul(2滴)血清封闭溶液(试剂1)到切片上,室温孵育10分钟,倒掉(不能冲洗) 3、 加入一抗(按照说明推荐浓度和孵育条件) 4、 使用含有0.05%吐温20的PBS( TPB
Western-blotting-Protocol(试剂配方和实验操作)
一、 试剂配方:1X TBS: Tris-base 12.11gNacl 8.775g用HCl 调pH7.4,用纯水稀释至1L5X Transfer buffer: Tris-base 15.1gGlycine 72.0gTo 1 L10X碱性磷酸酶缓冲液: 1 mol/L Tris-HCl pH