PNAS：小鼠模型需慎用，基因表达差异大
PNAS：小鼠模型需慎用，基因表达差异大 小鼠被广泛用于模拟人类代谢、疾病和药物应答，是医学研究中的一个基本工具。然而斯坦福大学的研究团队指出，人类和小鼠的基因表达存在着惊人的差异，不论是蛋白编码基因还是非编码基因。这项研究发表在十一月十七日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 Michael Snyder及其同事在15种组织中比较了人类和小鼠的基因表达情况，包括大脑、心脏、肝脏、肾脏等等。他们发现，物种间的基因表达差异要大于组织间的差异。举例来说，小鼠肝脏与人类肝脏基因表达的相似性，要低于小鼠肝脏与小鼠心脏的相似性。这项研究使用了ENCODE、modENCODE等资源的RNA-seq数据，覆盖的组织类型更加全面。 “我们认为人类和小鼠在遗传学上非常类似，但它们的转录组差异其实很大，”耶鲁大学的生物信息学家Mark Gerstein评论道。 之前也有过类似的比较研究，不过它们得出了相反的结论。比如有研究指出，小......阅读全文
PNAS：小鼠模型需慎用，基因表达差异大
PNAS：小鼠模型需慎用，基因表达差异大 小鼠被广泛用于模拟人类代谢、疾病和药物应答，是医学研究中的一个基本工具。然而斯坦福大学的研究团队指出，人类和小鼠的基因表达存在着惊人的差异，不论是蛋白编码基因还是非编码基因。这项研究发表在十一月十七日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 Mic
基因差异表达技术
真核生物中，从个体的生长、发育、衰老、死亡，到组织的得化、调亡以及细胞对各种生物、理化因子的应答，本质上都涉及基因的选择性表达。高等生物大约有30000个不同的基因，但在生物体内任意8细胞中只有10%的基因的以表达，而这些基因的表达按特定的时间和空间顺序有序地进行着，这种表达的方式即为基因的差异表达
基因差异表达的概念
差异表达不仅有助于阐明生命的奥秘，而且还能为基因诊断与治疗提供重要的理论依据。近几年来，差异表达基因克隆技术不断完善与发展，已成为研究肿瘤和疾病等相关基因的重要手段。
基因表达差异分析方法进展
高等真核生物的基因组一般具有80 000～100 000个基因，而每一个细胞大约只表达其中的15%［1］。基因在不同细胞间及不同生长阶段的选择性表达决定了生命活动的多样性，如发育与分化、衰老与死亡、内环境稳定、细胞周期调控等。比较细胞间基因表达的差异为我们揭示生命活动的规律提供了依据。
差异基因表达的定义
中文名称差异基因表达英文名称differential gene express定 义在细胞分化过程中某些奢侈基因表达的结果生成一种类型的分化细胞，另一组奢侈基因表达的结果导致出现另一类型的分化细胞的现象。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞分化与发育（二级学科）
什么是基因的差异表达？
差异表达不仅有助于阐明生命的奥秘,而且还能为基因诊断与治疗提供重要的理论依据。近几年来,差异表达基因克隆技术不断完善与发展,已成为研究肿瘤和疾病等相关基因的重要手段。
差异表达
· What's Differential Display (GenHunter)Introduction to differential display technique· Differential Display (Chun-Ming Liu)The f
AVTBGCre/GOI在小鼠肝脏特异性基因表达敲除应用与分析
AAV-TBG-Cre/GOI系统简介： l AAV-TBG-Cre系统是整合了肝脏特异性TBG启动子和Cre重组酶的腺相关病毒载体。 Ø TBG启动子是一种基于人甲状腺结合球蛋白(TBG)启动子和微球蛋白增强子的混合型启动子，用于肝脏特异性转外源基因表达。 Ø Cre重组酶是
小鼠βactin基因的克隆表达（1）
动物组织RNA的提取实验目的：掌握由动物组织中提取总RNA的方法实验原理：Trizol试剂是一个包含酚、异硫氰酸胍和SDS的单相酸性溶液，其在裂解细胞的同时抑制RNase的活性，随后加入氯仿，酚会大量的溶解在氯仿中。由于DNA和RNA在酸性酚中的溶解性不同，造成DNA分布在下层的氯仿酚溶液中，RNA
小鼠βactin基因的克隆表达（4）
实验步骤：（1）诱导靶蛋白表达分别挑取对照菌和重组菌1~2个菌落，接入5ml含Amp（30μg/ml）的LB培养液，37℃振荡培养过夜。取5ml过夜培养物接入500ml含Amp（30μg/ml）的LB培养液，37℃振荡培养2h以上，至对数中期（A550=0.5~1.0）。向诱导管中加入IPTG使其浓
小鼠βactin基因的克隆表达（3）
（2）质粒的提取及酶切鉴定分析 质粒的提取按照质粒提取试剂盒的操作步骤进行，然后进行双酶切鉴定。 管号 ① ② 质粒DNA
小鼠βactin基因的克隆表达（2）
实验步骤： （1）目的基因与表达载体的连接反应： ①表达载体和目的片段的酶切 管号 ① ② pGEX 4T-1
寻找差异表达基因方法——简化SSH法
无论是从一个胚胎细胞分化为不同的组织器官，或者是从正常的组织突变为肿瘤组织，都可能涉及在同一基因组背景下不同基因的差异性表达。寻找差异表达的基因就有可能揭示细胞分化的机制或者肿瘤的成因，因而也就成为一项热门的技术。 寻找差异表达的基因有不少方法，抑制消减杂交（SSH）是比较有效的一种方法
AAVTBGCre/GOI在小鼠肝脏特异性基因表达或敲除中的应用...
AAV-TBG-Cre/GOI在小鼠肝脏特异性基因表达或敲除中的应用与优势分析AAV-TBG-Cre/GOI系统简介：l AAV-TBG-Cre系统是整合了肝脏特异性TBG启动子和Cre重组酶的腺相关病毒载体。Ø TBG启动子是一种基于人甲状腺结合球蛋白(TBG)启动子和微球蛋白增强子的混合型启动子
数字PCR在基因表达差异研究的应用
数字PCR由于检测时完全不依赖传统的Ct值即可实现真正意义上的绝对定量，因而可以提供比实时荧光定量PCR更精确的基因差异表达研究，尤其对于那些靶基因表达差异微小的情况，如：mRNA、microRNA、lncRNAs等的表达分析；等位基因的不平衡表达；单细胞基因表达分析；外泌体核酸分子定量分析等。
简化抑制消减杂交(SSH)法寻找差异表达基因
无论是从一个胚胎细胞分化为不同的组织器官，或者是从正常的组织突变为肿瘤组织，都可能涉及在同一基因组背景下不同基因的差异性表达。寻找差异表达的基因就有可能揭示细胞分化的机制或者肿瘤的成因，因而也就成为一项热门的技术。 寻找差异表达的基因有不少方法，抑制消减杂交（SSH）是比较有效的一种方法。
基因表达差异解释女人为什么来自金星
英国伦敦大学学院的科学家们，在11月22日的Nature Communications杂志上发表的一项研究表明，基因——人身体的基本构件，在男女脑部的表达存在一个普遍的差异。他们发现，基因表达和剪接的性别差异是遍布成人大脑的，能够在所有的主要大脑区域中检测到，男女大部分脑部区域的基因表达是不
tDEG（转录组差异表达基因深度分析）
本公司采用自主研发与成熟开源软件相结合的方式构建了专业高效的生物信息分析流程，对您获得的海量RNA-seq序列的质量、特征等重要信息进行图形可视化；对两个以上生物学样本之间的差异表达基因进行可信分析；对差异表达所揭示出的重要科学问题进行中肯分析；让您快速“发现”所关注生物学问题，医学问题和农业问题
荧光定量pcr为什么能够测基因表达差异
荧光定量PCR会加入带有荧光基团的探针，探针是能和目的基因结合的单链DNA，如果合成双链DNA后，荧光基团就会激活发光，所以实时检测反应物的荧光强度，反应的就是双链DNA的浓度，由于合成双链DNA的速率和模板浓度有关，所以和参考曲线比较以后是可以计算出模板的相对浓度，当模板是信号RNA是，其反应的就
汉族和日本人之间的基因表达谱差异
6月4日，《医学遗传学杂志》在线发表了上海生科院计算生物学研究所徐书华研究组的研究成果“Identification of well-differentiated gene expressions between Han Chinese and Japanese using genome
真核生物与原核生物基因表达调控的差异
原核生物同一群体的每个细胞都和外界环境直接接触，它们主要通过转录调控，以开启或关闭某些基因的表达来适应环境条件（主要是营养水平的变化），故环境因子往往是调控的诱导物。而大多数真核生物，基因表达调控最明显的特征是能在特定时间和特定的细胞中激活特定的基因，从而实现“预定”的，有序的，不可逆的分化和发育过
三种基因表达差异的显著性分析方法
DNA微阵列基因表达数据分析 用于检测基因表达水平的 DNA 微阵列实验，应用之一是比较实验，目的是比较两个条件下的基因表达差异，从中识别出与条件相关的特异性基因，例如，识别可用于肿瘤分型的特异基因等。为了提高实验的可靠性，对于同一样本，往往有两次或更多次的重复实验，但是，由于 DNA 微
人类肝脏与小鼠肝脏更接近，还是与人类心脏？
西班牙基因组调控中心的Alessandra Breschi通过鉴定多个物种各个器官的RNA-Seq图谱，发现一些基因的表达是随物种而变化，而另一些是随器官类型而变化。她表示，那些随物种而变化的基因更可能是看家基因。 在近日召开的2015冷泉港基因组生物学会议（The Biology Of Ge
遗传差异让小鼠变身“施瓦辛格”
PLoS ONE：此研究有助于探索人类肌肉萎缩症的治疗 利用特定的遗传差异，科学家创造了小鼠中的“施瓦辛格”，它的肌肉质量超过普通小鼠四倍。该研究成果有助于探索人类肌肉萎缩症、艾滋病以及癌症引起的肌肉损失。相关论文发表在近期的PLoS ONE上。 进行该项研究的是美国约翰·霍普金斯大学医学院的Se
研究揭示汉族和日本人之间的基因表达谱差异
6月4日，《医学遗传学杂志》在线发表了中科院上海生科院计算生物学研究所徐书华研究组的研究成果Identification of well-differentiated gene expressions between Han Chinese and Japanese using geno
3篇Science文章：大规模人类基因表达差异图谱
在美国国立卫生研究院基因型-组织表达（GTEx）项目的资金资助下，研究人员构建出了一个万众期待的新数据资源，它可以帮助确立个体基因组构成之间的差异对于基因活性的影响以及对疾病的贡献。借助于这一新资源，科学家们可以同时探究许多不同人类组织和细胞的潜在基因组学，并有望为研究和了解人类生物学开辟新途径
提高SIRT6基因表达，能够延长小鼠模型30％寿命
生老病死是自然规律，人总会不可避免地衰老，并伴随着健康状况下降、能量稳态下降、脆弱性增加。众所周知，人类整个生命过程中，染色体末端的端粒会随着细胞分裂而不断缩短，就像是生命的一个时钟，当端粒缩短到一定程度，生命也就随之停止。 就在几天前，Nature Communications 期刊发表了一
充满差异的单细胞蛋白表达
哈佛大学谢晓亮小组的最新研究结构显示，蛋白的数量（绿色）与mRNA的数量（红色）在各个细胞中有很大差异。 科学家们近日首次实现了对物种在整个表达谱范围内的蛋白表达噪声测量。该项成果是单分子技术与系统生物学交互融合的典范，预示了单细胞基因表达分析时代的来临。 在基因表达研究领域，传
PNAS：小鼠模型须谨慎使用
小鼠被广泛用于模拟人类代谢、疾病和药物应答，是医学研究中的一个基本工具。然而斯坦福大学的研究团队指出，人类和小鼠的基因表达存在着惊人的差异，不论是蛋白编码基因还是非编码基因。这项研究发表在十一月十七日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 Michael Snyder及其同事在15种组织中比较了
从基因表达和代谢组学层次揭示疫苗引发免疫反应差异
沃尔特·里德陆军研究所（Walter Reed Army Institute of Research，WRAIR）领导的一个研究小组利用单细胞RNA测序和代谢谱技术，对疫苗诱导的T细胞免疫机制有了新的认识。尽管有许多疫苗可以诱导和扩增T细胞(机体适应性免疫系统的关键部分)，但在决定T细胞反应的大