454用于西红柿基因组测序
最近,西红柿基因组学会完成了一个农业种植西红柿品系Solanum lycopersicum的基因组图谱,以及一个野生型西红柿品系S. pimpinellifolium的基因组图谱,并将其与已知的土豆基因组以及其他植物比较,寻找与水果有些特性相关的基因,相关文献在Nature杂志作为封面文章发表1。 西红柿不但是重要的经济作物,也作为研究有花植物非常重要的研究模型。通过更多的西红柿不同品种的测序研究,能够掌握更多性状相关的信息,从而帮助农业育种以及有花植物研究工作。 此次研究中使用了454 GS FLX测序,获得了Solanum lycopersicum基因组约900Mb的数据,与Sanger测序结果结合,拼接出700Mb的基因组图谱,仅含有91个scaffolds。以此为基础,对野生型的S. pimpinellifolium基因组则通过短读长平台进行测序,获得约740Mb数据。两个基因组共发现54......阅读全文
首个家鸡泛三维基因组图谱构建成功
鸡是如何从野生原鸡演化为如今的高产肉鸡或蛋鸡的?其背后的基因“开关”在哪里?近日,华南农业大学动物科学学院家禽遗传育种研究团队联合国内多家单位,成功构建了首个高分辨率家鸡泛三维基因组图谱。相关成果发表于《先进科学》(Advanced Science)。“该研究成果就像是一张高精度的‘立体导航图’,将
找到“广陈皮”效用线索-破译茶枝柑基因组图谱
茶枝柑,主要分布于广东新会等地,其果皮制干即为中药“广陈皮”,含有多种生物活性成分。多甲氧基黄酮是广陈皮中关键的药用成分,目前尚不清楚其生物合成的遗传基础及调控机制。5月11日,深圳华大生命科学研究院联合华南农业大学、中国药科大学、南京中医药大学,通过多组学技术破译了茶枝柑基因组的遗传图谱,揭示了多
顶级实验室《Nature》发布表观基因组学图谱
基因组中表观遗传变化是能遗传的,近期来自Salk生物学研究所等处的一组研究人员完成了一项野生植物表观基因组学全范围内的研究分析,从中发现了这种修饰与遗传信息相互作用的共同模式。这一成果公布在3月7日Nature杂志在线版上。 文章通讯作者是Salk研究所的著名教授Joseph R. E
我国科学家完成甜橙基因组图谱找到甜橙起源
甜美又不上火的甜橙来源于柚作为母本和橘杂交,其后代再与橘杂交而形成的杂种。华中农业大学徐强博士等人26日发表在国际著名学术刊物《自然-遗传学》题为“甜橙基因组图谱”的研究论文,提出了甜橙起源这一新理论。 专家表示,甜橙基因组将在理论上为柑橘基因功能研究提供框架,也将在应用上为果实品质包括色
NIH-340万美元资助癌症基因组图谱研究计划
美国国立卫生研究院于当地时间7月2日宣布,决定对八个单位(或个人)进行为期两年、总值340万美元的资助,以支持癌症基因组图谱研究计划(Cancer Genome Atlas pilot program)。 癌症基因组图谱计划是美国国立癌症研究所和美国国家人类基因组研究的合作项目,于2005年晚期,
首个山羊基因组图谱在《自然•生物技术》杂志发表
2012年12月24日,由中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院等单位合作完成的首个山羊全基因组图谱在《自然•生物技术》(Nature Biotechnology)杂志在线发表。本研究采用新一代测序技术(NGS)与全基因组酶切图谱(Whole-genome mapping)技术相结
Cell绘制广泛的人类基因组互作图谱
来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)、斯坦福大学的科学家们阐明了,我们的基因表达在DNA中受控的机制。发表在《细胞》(Cell)杂志上的这项新研究,将促成更好地了解某些遗传变异可以开启或关闭控制基因表达的调控元件,最终表现为个体特征和疾病易感性的机制。 这些变异存在于非直接负责编码基因,而是发
首张拓扑异构酶II全基因组剪切图谱
DNA切割酶对基因结构调节起着关键作用。研究人员发现,它在导致癌症的(如白血病和实体瘤)易位(translocations)异常重排中表现活跃。 II型拓扑异构酶(type II topoisomerase, TOP2)通过断裂DNA双链磷酸二酯键,来更正DNA连环数,使细胞DNA正常转录、复
科学家成功绘制-首幅小麦基因组物理图谱
一个由法国、美国、澳大利亚等国科学家组成的研究小组日前为小麦的一个基因组绘制出了首幅物理图谱,这一成果将有助于科学家培育出更高产和抗旱的小麦新品种。 基因组物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息,它是通过对构成基因组的DNA分子进行测定而绘制的。绘制物理图谱的目的是把有关基因的遗传
我国学者首次绘制一串红基因组图谱
北京市园林科学研究院21日对外称,由该研究院和北京林业大学合作共同完成了一串红高质量的基因组图谱绘制项目工作,这使我国成为世界上首个绘制出一串红基因组图谱的国家。图片来源于网络 唇形科是开花植物中的第六大科,包括约236个属,6900—7200个种类。而一串红则隶属唇形科鼠尾草属,其花色艳丽
研究称喝西红柿汁减轻运动疲劳
日本一个研究小组报告说,实验鼠运动前和运动中喝纯西红柿汁,有减轻运动疲劳的效果。 在以往的研究中,研究人员就发现西红柿含有抗氧化物质番茄红素以及多种维生素、矿物质和有机酸等营养成分,能减轻疲劳。为了弄清西红柿汁在抗疲劳方面的具体作用,日本著名食品企业可果美公司和铃鹿医科大学成立联合研究小组,
研究称喝西红柿汁减轻运动疲劳
日本一个研究小组报告说,实验鼠运动前和运动中喝纯西红柿汁,有减轻运动疲劳的效果。 在以往的研究中,研究人员就发现西红柿含有抗氧化物质番茄红素以及多种维生素、矿物质和有机酸等营养成分,能减轻疲劳。为了弄清西红柿汁在抗疲劳方面的具体作用,日本著名食品企业可果美公司和铃鹿医科大学成立联合研究小组
西红柿含有尼古丁?揭露食物隐藏的秘密
专家表示,番茄里面的尼古丁含量甚微,和香烟无法比拟。很多茄科植物中含有尼古丁,比如茄子、辣椒、土豆以及枸杞等。但是真的有那么可怕吗? 尼古丁是一种剧毒成分。科普书上写着,一匹活蹦乱跳的马,只要静脉注射8滴尼古丁,就能令其死亡;一支香烟中所含的尼古丁提取出来,注射到小鼠体内就会令其死亡。香烟的
麦当劳:污染西红柿未现中国市场
从4月中旬开始,美国至少16个州暴发沙门氏菌病疫,造成145例圣保罗沙门氏菌感染,此次致病病原已锁定某些未经烹饪的西红柿食品,包括麦当劳、汉堡王、沃尔玛超市等美国连锁店已紧急终止了西红柿供应。对此,麦当劳中国昨天发表声明称,麦当劳在中国市场没有供应生鲜西红柿产品。同时,沃尔玛也表示,中国市场所销售的
西红柿出现氮磷钾有哪些危害
缺氮症:番茄缺氮时,植株生长缓慢吖,叶脉由黄绿色变为深紫色,茎秆变硬,呈深紫色,富含纤维。补救措施发现缺氮,及时用尿素、碳铵等氮肥或人粪尿开沟埋施,或者用0.3%~0.5%尿素溶液叶面喷施。 缺磷症:番茄缺磷时,早期叶背呈紫红色,叶肉组织开始呈斑点状,随后则扩展到整个叶片上,叶脉逐渐变为紫红色
武汉植物园等完成中国莲基因组框架图谱绘制
中科院武汉植物园与美国、澳大利亚科学家合作完成了对中国古代莲的基因组测序和分析,相关研究成果已于5月10日刊登在《基因组生物学》杂志上。 研究人员利用全基因组鸟枪测序法完成了对中国莲(Nelumbo nucifera)基因组的测序。结果显示,莲基因组大约有2.7万个基因,全长9.3亿个
人类基因组“primiRNA”剪切位点图谱绘制
人体的基因表达是一个复杂的过程,那么多的基因不可能都总是持续表达。指挥基因表达的功臣之中就包括几种RNA分子。MicroRNA(miRNA)是一类真核生物内源性的小分子单链RNA,它是一种古老的、生死攸关的基因调节因素,30-60%的哺乳动物蛋白质编码基因都受miRNA的调控(主要是基因沉默调控
日本研究人员首次成功绘制日本人基因组图谱
据日本共同社报道,日本理化学研究所基因组医科学研究中心日前通过新一代DNA测序仪成功绘制出首份日本人基因组图谱。该成果10月24日发表在美国《自然—遗传学》杂志网络版上。 DNA一共有4种碱基排列组合,人类大约有30亿对碱基对。新一代测序仪可将DNA进行极其精细的切片,对大量切片同时
人类首张黄种人基因组图谱有望在深面世
人类第一张“黄种人基因组图谱”有望在深面世,并计划在今年高交会期间向全世界发布。目前,深圳华大基因研究院近百位科学家已进驻盐田。市区两级政府正着手将沙头角海山街道辖区的恩上村整体搬迁改造成“生物研发加速器”,作为该项目基地。 人们对基因工程技术应用于制药和医学治疗的信心在不断增强。2006年底,
我国绘制完成世界首个鹅全基因组序列图谱
6月3日,深圳华大基因研究院和浙江省农业科学院、象山县浙东白鹅研究所联合召开新闻发布会,宣布“鹅全基因组序列图谱绘制完成”。这是我国独立研究完成的全世界首个鹅全基因组序列图谱,这一研究成果对于揭示家鹅繁殖、抗逆、生长、肉质、羽色等性状的遗传基础,鹅的驯化、不同鹅种的生物学分类、中国家鹅
Lal-Teer畜牧公司联合华大基因成功绘制水牛基因组图谱
2014年1月24日,孟加拉Lal Teer畜牧科技公司(孟加拉Lal Teer种业科技公司的联营公司,以下简称"Lal Teer")与华大基因联合宣布水牛基因组图谱绘制完成。该项科研成果将为深入了解水牛这一物种的起源、驯化过程及其品种选育等奠定重要的遗传学基础。 水牛,也叫印度水牛,
多样性增加281%,人类肠道菌群基因组图谱公布!
近两年来,以免疫检查点为药物靶点的免疫检查点抑制剂治疗癌症受到越来越多科研工作者的青睐。但是临床研究结果表明,许多癌症患者因接受免疫药物治疗而出现不同程度的免疫相关不良反应,最终出现不得不提前终止治疗的情况。 而寄居在人体内的肠道菌群可以影响免疫检查点抑制剂治疗癌症,能够极大地改善患者对该疗法
任兵教授Nature重要成果:首张小鼠功能基因组图谱
通常被称之为“生命之书”的人类基因组非常地难于阅读。在没有充分了解其语法和句法的情况下,基因组中29亿的腺嘌呤与胸腺嘧啶、鸟嘌呤和胞嘧啶碱基对为了解人类的基础遗传学提供了有限的认识。 在发表于7月1日《自然》(Nature)杂志上的一篇论文中,来自德维格癌症研究所和加州大学圣地亚哥医学院的
科学家首次绘制小鼠全基因组沉默子图谱
近日,中国农业科学院农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队构建了小鼠全基因组沉默子图谱,阐明了其基本特征,并发现了影响细胞重编程效率的重要沉默子。相关研究成果发表在《先进科学》(Advanced Science)上。转录调控在生物体发育和细胞分化中至关重要,而沉默子作为关键的顺式调控元件,通过结合
罗氏454测序用于野生双峰驼基因组图谱绘制
中国及中亚细亚温带荒漠地区的骆驼均为双峰骆驼(Bactrian camel),中国的双峰驼集中分布于内蒙古西部、宁夏、新疆、甘肃的温带荒漠和荒漠草原区,占全国总驼数的95%。且中国尚有数量比大熊猫还少的世界珍稀濒危动物―野生双峰驼存在。内蒙古阿拉善盟是中国骆驼最多的地区,拥有双峰驼10万峰以
科学家首次绘制小鼠全基因组沉默子图谱
近日,中国农业科学院农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队构建了小鼠全基因组沉默子图谱,阐明了其基本特征,并发现了影响细胞重编程效率的重要沉默子。相关研究成果发表在《先进科学》(Advanced Science)上。转录调控在生物体发育和细胞分化中至关重要,而沉默子作为关键的顺式调控元件,通过结合
八倍体红颜草莓端粒到端粒完整基因组图谱发布
近日,中国农业科学院郑州果树研究所草莓种质改良团队联合中国农科院深圳农业基因组研究所联合发布八倍体栽培品种红颜草莓的端粒到端粒完整基因组,系统解析了八倍体草莓亚基因组结构和遗传分化,并解析了亚基因组的表观遗传进化机制。相关成果发表于《园艺研究》(Horticulture Research)。
科学家绘制小细胞肺癌蛋白基因组学图谱
肺癌是全球癌症致死的首位原因,而小细胞肺癌约占肺癌总数的15%,是所有肺癌亚型中恶性程度最高、预后最差的亚型,5年生存率仅为5%。与非小细胞肺癌形成鲜明对比,小细胞肺癌的治疗手段单一,患者总生存率低。分子表征与组学研究不足,限制了小细胞肺癌的基础研究和临床进展,迄今为止,仅有少量针对小细胞肺癌临
我国专家首绘蝎子基因组图谱-揭开多样性面纱
由武汉大学领衔,与上海生物信息技术研究中心合作,近日完成了对马氏正钳蝎(Mesobuthus martensii)的基因组测序,预测了32016个蛋白质编码基因,在国际上第一个揭示了蝎子(scorpion)这一种独特的节肢动物适应模式。 专家表示,马氏正钳蝎基因组的解析揭开了蝎毒素多样
全球首个青稞基因组图谱绘制完成-揭示其驯化栽培过程
青稞经过藏族人民长达3500—4000年的驯化栽培,已经完全适应了极端的高原气候,成为了藏族人民的主食。全球首个青稞基因组图谱由我国科学家正式绘制成功,1月13日,其研究成果在线发表在PNAS杂志上。研究成果揭示了青稞的高原适应性机制,解读其起源、驯化及栽培选育过程。 科学家对西藏的地方品种青