454用于西红柿基因组测序
最近，西红柿基因组学会完成了一个农业种植西红柿品系Solanum lycopersicum的基因组图谱，以及一个野生型西红柿品系S. pimpinellifolium的基因组图谱，并将其与已知的土豆基因组以及其他植物比较，寻找与水果有些特性相关的基因，相关文献在Nature杂志作为封面文章发表1。 西红柿不但是重要的经济作物，也作为研究有花植物非常重要的研究模型。通过更多的西红柿不同品种的测序研究，能够掌握更多性状相关的信息，从而帮助农业育种以及有花植物研究工作。 此次研究中使用了454 GS FLX测序，获得了Solanum lycopersicum基因组约900Mb的数据，与Sanger测序结果结合，拼接出700Mb的基因组图谱，仅含有91个scaffolds。以此为基础，对野生型的S. pimpinellifolium基因组则通过短读长平台进行测序，获得约740Mb数据。两个基因组共发现54......阅读全文
罗氏454测序用于野生双峰驼基因组图谱绘制
中国及中亚细亚温带荒漠地区的骆驼均为双峰骆驼(Bactrian camel)，中国的双峰驼集中分布于内蒙古西部、宁夏、新疆、甘肃的温带荒漠和荒漠草原区，占全国总驼数的95%。且中国尚有数量比大熊猫还少的世界珍稀濒危动物―野生双峰驼存在。内蒙古阿拉善盟是中国骆驼最多的地区，拥有双峰驼10万峰以
任兵教授Nature重要成果：首张小鼠功能基因组图谱
通常被称之为“生命之书”的人类基因组非常地难于阅读。在没有充分了解其语法和句法的情况下，基因组中29亿的腺嘌呤与胸腺嘧啶、鸟嘌呤和胞嘧啶碱基对为了解人类的基础遗传学提供了有限的认识。 在发表于7月1日《自然》(Nature)杂志上的一篇论文中，来自德维格癌症研究所和加州大学圣地亚哥医学院的
科学家首次绘制小鼠全基因组沉默子图谱
近日，中国农业科学院农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队构建了小鼠全基因组沉默子图谱，阐明了其基本特征，并发现了影响细胞重编程效率的重要沉默子。相关研究成果发表在《先进科学》（Advanced Science）上。转录调控在生物体发育和细胞分化中至关重要，而沉默子作为关键的顺式调控元件，通过结合
鸭嘴兽基因组图谱揭秘独特的性染色体
鸭嘴兽可能是世界上长得最奇怪的动物。据说，当欧洲学者第一次见到这种鸭子嘴、海狸尾、水獭足的动物时，他们认为这是一场精心设计的骗局。它看上去既像爬行动物又像哺乳动物，还像鸟类。实际上，它属于稀有的单孔类动物。 鸭嘴兽不仅有一些奇特的身体特征，其新的基因组版本也强调了它一些不寻常的遗传特性。在上周
我国科学家绘制完成鲤鱼全基因组序列图谱
鲤科鱼类是我国最重要的水产养殖种类，年产量占我国淡水养殖总产量的70%以上，其中鲤鱼不仅是我国也是世界性的重要养殖鱼类。5月6日，中国“鲤鱼基因组计划”学术报告会暨新闻发布会在京举行。由中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心、黑龙江水产研究所和中科院北京基因组研究所共同实施
Nature子刊：非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破
近日，匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归（Elastic Net regression）的机器学习模型，从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱（long noncoding RNAs, lncRNAs）与265种抗癌药物敏感性数据中，挖掘出了27
我国科研人员绘制小细胞肺癌蛋白基因组学图谱
肺癌是全球癌症致死的首位原因，而小细胞肺癌约占肺癌总数的15%，是所有肺癌亚型中恶性程度最高、预后最差的亚型，5年生存率仅为5%。与非小细胞肺癌形成鲜明对比，小细胞肺癌的治疗手段单一，患者总生存率低。分子表征与组学研究不足，限制了小细胞肺癌的基础研究和临床进展，迄今为止，仅有少量针对小细胞肺癌临
中国学者《Nature》《PloS－One》公布两个基因组图谱
继中国科学家在《Nature》上公布首个中国人基因组“炎黄一号”后，近期中国的科学家又在《Nature》及《PLoS One》上公布新的基因组序列。 陈竺领导的研究小组在Nature发表血吸虫基因组 犹他大学病理学系博士解析“第二代测序前的序列捕获芯片及比较基因组杂交芯片在临床
Nature：科学家绘成高质量油棕榈全基因组图谱
日前，一支国际联合研究小组确定了一种称之为 Shell 的基因调控了油棕榈树的产量。油棕榈的果实和种子是全球近一半食用植物油的供应源，并且是最有前景的生物燃料来源之一。 新研究为我们提供了高质量的油棕榈全基因组图谱，并且还搜索了对于科学和工业均极为重要的基因序列。这一付诸多年努力所取得
基因组图谱揭示多种免疫细胞参与多发性硬化的发生
根据最近Science上发表的最新研究结果，研究者们找到了多发性硬化的新型致病机制。在一项对115,803名个体的研究中，作者确定了人类基因组中233个位点，这些位点与MS的发病有关。该研究是迄今为止在MS领域中最大规模的，它基于47,429名MS患者和68,374名健康个体的DNA样本。研究结
我国科学家成功绘出高质量木本棉基因组图谱
我国科学家成功绘制出高质量的木本棉基因组图谱，并对棉属进化机制及重要经济性状功能基因进行了分析。对四倍体棉种及其它多倍体物种的形成过程的揭示，为研究棉花纤维质量和抗病虫灾害等重要农艺性状奠定了遗传学基础。研究成果近日发表在《自然·遗传学》杂志上。 棉花是全球最重要的经济作物之一，棉花属共包括4
我国科学家首次绘制出葡萄属超级泛基因组图谱
2月26日，记者从北京大学现代农业研究院获悉，该院叶文秀研究员和郭立研究员团队绘制了全球首个涵盖葡萄属的欧亚、北美和东亚世界三大种群的72个葡萄种质材料的单倍型超级泛基因组图谱，从而揭示葡萄属丰富遗传多样性和杂交历史。相关成果发表在国际期刊《自然·遗传学》上。葡萄样品全球地理分布及其果实和叶片形态。
透过大规模基因组分析推出－泛癌症图谱－开启癌症治疗
【Technews科技新报】美国国立卫生研究院（NIH）资助的研究团队已经完成了一份详细的基因组分析，这个被称为泛癌症图谱（PanCancer Atlas）的研究结果收录了 27 篇论文，并包含了 33 种癌症、1 万多个种不同肿瘤分子和临床讯息的数据资料。 泛癌症图谱主要是针对癌症基因组
新研究构建出小麦属全基因组遗传变异图谱
小麦是人类历史上最成功的作物之一，它起源于新月沃地一个狭小的核心区域，一万年间，从地区性的野生植物迅速转变成为全球种植面积最广的作物之一，在多种多样的环境下为人类提供大量的碳水化合物和蛋白质。然而，小麦对自然环境和人类粮食需求两方面同时适应的遗传机制尚不清楚，理解小麦适应性进化对气候变化条件下小
绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱完成
绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱已经由中国烟草完成。这是全球第一套烟草全基因组序列图谱，也是继马铃薯和番茄基因组之后全球完成的第三种茄科植物全基因组序列图谱。该绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱是目前已知植物基因组序列图谱中基因组最大、组装精度最高、组装结果最好的2个图谱。绒毛
科学家绘就全球首张家蚕超级泛基因组图谱
家蚕是重要的经济昆虫和新兴模式生物，10月9日，西南大学发布最新科研成果：家蚕基因组生物学国家重点实验室团队完成家蚕大规模种质资源基因组解析，在全球首次绘就家蚕超级泛基因组图谱，并率先创建“数字家蚕”基因库，将我国家蚕基因研究推向设计育种阶段。对于家蚕基因的研究，之前仅有单一参考基因组及部分重测序数
北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human can
伊成器教授Nature子刊：人基因组脱氧尿嘧啶修饰图谱
来自北大-清华生命联合中心的研究人员发表了题为“Genome-wide mapping reveals that deoxyuridine is enriched in the human centromeric DNA”的研究论文，解析了人类基因组上脱氧尿嘧啶的图谱，发现该修饰在染色体的着丝
谷子单倍体型图谱及全基因组关联分析研究出炉
由中国农科院作物所、中科院上海生科院植生生态所国家基因中心、中科院遗传发育所等8家单位合作，在国际上率先完成了谷子单倍体型图谱的构建和大量农艺性状的全基因组关联分析，该成果于6月24日在Nature Genetics(自然-遗传学)发表，标志着我国在谷子遗传学研究领域取得了重要的突破。
我国科学家完成普通野生稻全基因组框架图谱绘制
2010年8月，中国科学院昆明植物研究所植物种质资源与基因组学研究中心中科院“百人计划”和云南省首届高端科技人才入选者研究员带领的植物种质资源、基因组学与生物信息学团队，历时一年，运用新一代高通量测序技术以及基于高性能超算的生物信息学分析，对野生稻全基因组测序取得了阶段性重大成果。日前
解读“生命之书”－－新发现填补人类基因组图谱空白
美国加州大学圣地亚哥分校（UCSD）的研究人员制作了一份人类基因组的单细胞染色质图谱，确定了240种多基因特征和与疾病特征相关的细胞类型，并注释了非编码DNA变异的风险，有利于更好地理解遗传学与疾病之间的联系。这一发现发表在12日的《细胞》杂志在线版上。 此前，科学家在公布最新的被称为“生命之
北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cance
Frontiers－in－Genetics首个非性逆转黄鳝高质量基因组参考图谱
中国水产科学研究院长江水产研究所水产养殖与遗传育种研究室科研人员在国际期刊《遗传学前沿》（Frontiers in Genetics）发表题为《Chromosome-Scale, Haplotype-Resolved Genome Assembly of Non-Sex-Reversal Fem
科学家绘制细胞游离DNA单分子全基因组突变图谱
体细胞突变是肿瘤发生的标志，可用于癌症的无创诊断。美国约翰·霍普金斯大学医学院绘制细胞游离DNA单分子全基因组突变图谱，用于癌症无创检测。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》杂志上，题为：Single-molecule genome-wide mutation profile
中外科学家Nature子刊绘制蜘蛛基因组图谱
来自奥胡斯大学和华大基因研究中心的研究人员，在成功完成对蜘蛛基因组的测序后得出了惊人的结论：令人毛骨悚然的八条腿蜘蛛在某些方面与人类相似。 而这并非只是一个可怕的研究发现。这一测序对于未来我们更深入地了解蜘蛛的某些特性具有重要的意义。这一重要的研究成果发表在5月6日的《自然通讯》（Nature
我国学者成功完成小麦A基因组的测序和精细图谱绘制
小麦是全球最重要的粮食作物，养活了世界上40%的人口，提供了人类所需热能和蛋白质的20%。我国是世界上小麦生产和消费大国，常年种植面积为2,400万公顷左右，年产量近1.3亿吨。生产上广泛种植的普通小麦是一个经两次自然杂交而形成异源六倍体，含有A、B和D三个亚基因组，其基因组大（约17 Gb，是
新型转基因西红柿具有“好”胆固醇功能
据物理学家组织网3月20日(北京时间)报道，美国加州大学洛杉矶分校研究人员研发出一种新型转基因西红柿，食用后能产生可以模仿“好”胆固醇功能的肽(也称缩氨酸)。小鼠实验证实，喂食这种冻干的西红柿后，其炎症和动脉中的斑块聚集都有所减少。 这种西红柿可制造一种被称为6F的小肽，能模仿高
研究发现常吃西红柿抑郁症减半
据英国《每日邮报》12月4日报道，《情感紊乱杂志》刊登中日科学家共同完成的一项新研究发现，每周吃几次西红柿可以使罹患抑郁症危险降低一半。 据统计，超过20%的人在一生的某段时间会发生抑郁，女性抑郁症发病率比男性更高。老年人群抑郁症发病率也相对较高，其原因是健康状况一日不如一日，亲人离世以及
不甜、没味？他们干脆切了20000个西红柿
番茄是世界上产值最高的蔬菜作物，因风味独特深受喜爱。然而今天的消费者常常抱怨“番茄越来越没有番茄味了”。 “糖含量是风味的首要因素，但是糖含量与果实大小负相关，产量和品质是一对矛盾，现有番茄商业品种，尤其是大果番茄中糖含量普遍偏低。”中国科学院院士、中国农业科学院研究员黄三文说，如何在不影响番
科学家揭示为何冷藏西红柿有损味道
一些食物是注定不能被放在冰箱里的，比如西红柿。正如一些消费者早就知道的，将西红柿冷藏起来会永久性地损害它们的味道。不过，个中原因一直不得而知。对为何会出现这种情况的新见解或许有一天能帮助人们开发出在冷藏存储期间也能保持原有味道的西红柿品种。 由来自美国佛罗里达大学的Harry Klee领导的