Science:热点受体结构纤毫毕现
研究人员得到了人体细胞膜蛋白前所未有的清晰图像。Leiden研究人员Ad IJzerman、Laura Heitman与其同事得到了一种医学靶点蛋白,G蛋白偶联受体家族A2A腺苷受体分辨率最高的晶体结构,研究发表在Science杂志上。 受体 A2A腺苷受体是人体的主要咖啡因受体,并且与帕金森症相关。A2A腺苷受体所属的一类约800种蛋白(G蛋白偶联受体GPCR)是目前约一半药物的作用靶点。“难关全球的研究人员研究了这些蛋白数十年。”IJzerman评论道。 G 蛋白偶联受体GPCR的药理反应能被变构剂微调。此前,这种效应的结构研究受到了GPCR结构分辨率的限制。研究人员对人A2A腺苷受体进行了改造,并得到了1.8埃分辨率的蛋白结构。高分辨率蛋白结构显示,水分子、钠离子和脂质/胆固醇对GPCR稳定性和功能具有潜在作用。 蛋白晶体化 要了解药物是否有效,就需要理解细胞膜上受体的工作机制。其......阅读全文
如何选择蛋白晶体结构?
在使用殷赋云计算平台的时候,有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。1. 确定蛋白种属在实验当中,研究人员通常使用动物模型(如小鼠)来研究人源蛋白。这样做有许多原因,比如:1) 无
如何选择蛋白晶体结构
在使用殷赋云计算平台的时候,有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。 1. 确定蛋白种属 在实验当中,研究人员通常使用动物模型(如小鼠)来研究人源蛋白。这样做有许
帕金森病相关蛋白结构确定
澳大利亚沃尔特和伊丽莎霍尔医学研究所团队在对抗帕金森病的斗争中取得重大突破:他们成功解开了一个长达数十年的谜团,确定了人类PINK1蛋白与线粒体结合的具体结构,为开发治疗帕金森病的新药开辟了新道路。这项成果发表在最新一期《科学》杂志上。 PINK1蛋白自20多年前首次被发现以来,因其与帕金森病
硅的晶体结构
两个面心立方结构相互套构而成,其中一个面心立方结构沿另一个的体对角线平移1/4。
晶体结构测定方法
晶体结构测定方法,crystal structure determination,即利用晶体 X射线衍射可测定晶体结构。但衍射实验只能测得衍射强度(即结构振幅)而测不到相角,这样就不可能直接从强度得到晶体结构数据,而要利用其他方法。
晶体结构测定方法
晶体结构测定方法,crystal structure determination,即利用晶体 X射线衍射可测定晶体结构。但衍射实验只能测得衍射强度(即结构振幅)而测不到相角,这样就不可能直接从强度得到晶体结构数据,而要利用其他方法。
什么是晶体结构?
晶体结构是指晶体以其内部原子、离子、分子在空间作三维周期性的规则排列为其最基本的结构特征。任一晶体总可找到一套与三维周期性对应的基向量及与之相应的晶胞,因此可以将晶体结构看作是由内含相同的具平行六面体形状的晶胞按前、后、左、右、上、下方向彼此相邻“并置”而组成的一个集合。晶体学中对晶体结构的表达可采
中科院发现寨卡病毒关键蛋白晶体结构
近日,中科院微生物研究所院士高福和中科院北京生命科学研究院副研究员施一带领的科研团队针对寨卡病毒(ZIKV)进行分析,发现非结构蛋白1(NS1)的分子结构。该研究成果提供了非结构蛋白1的原子层面图像,在这之前非结构蛋白1同样参与了登革热、西尼罗河病毒等疾病的发病机制,相关研究成果在线发表于4月1
中国科学家解析寨卡病毒蛋白晶体结构
近日,《自然—结构和分子生物学》网络版发表了中科院微生物研究所研究员施一和中科院院士高福团队最新发现的寨卡病毒(ZIKV)的非结构蛋白1(NS1)的分子结构,并提供了一个原子层面的图像。NS1参与了例如登革热、西尼罗河病毒等疾病的发病机制当中。 蚊子传播的寨卡病毒目前正在美洲流行。虽然寨卡病毒
微生物所解析寨卡病毒蛋白晶体结构
中国科学院微生物研究所研究员施一和中国科学院院士高福团队通力合作在揭示寨卡病毒致病机制方面取得新进展,研究结果以Zika virus NS1 structure reveals diversity of electrostatic surfaces among flaviviruses(《寨卡病
简述晶体结构的信息
晶体结构即晶体的微观结构,是指晶体中实际质点(原子、离子或分子)的具体排列情况。自然界存在的固态物质可分为晶体和非晶体两大类,固态的金属与合金大都是晶体。晶体与非晶体的最本质差别在于组成晶体的原子、离子、分子等质点是规则排列的(长程序),而非晶体中这些质点除与其最相近外,基本上无规则地堆积在一起
晶体结构的固定熔点
实验表明:从气态、液态或非晶态过渡到晶体时都要放热,反之,从晶态转变为非晶态、液态或气态时都有要吸热。表明:在相同的热力学条件下,与同种化学成分的气体、液体或非晶体相比,晶体的内能最小。即在相同的热力学条件下,以具有相同化学成分的晶体与非晶体相比,晶体是稳定的,非晶体是不稳定的,后者有自发转变为晶体
原子晶体的晶体结构
结构特征:空间立体网状结构(如金刚石、晶体硅、二氧化硅等)。原子晶体的结构特点:①由原子直接构成晶体,所有原子间只靠共价键连接成一个整体。②由基本结构单元向空间伸展形成空间网状结构。③破坏共价键需要较高的能量。在原子晶体的晶格结点上排列着中性原子,原子间以坚强的共价键相结合,如单质硅(Si)、金刚石
黄病毒重要蛋白NS5晶体结构研究取得突破
中国科学院武汉病毒研究所龚鹏学科组在乙型脑炎非结构蛋白NS5的研究中取得突破,相关结果于8月8日在线发表于病毒学期刊PLoS Pathogens上,题为Crystal Structure of the Full-Length Japanese Encephalitis Virus NS5
晶体结构分析的相关介绍
晶体学中的一个重要的领域,它研究晶态物质内部在原子尺度下的微观结构。它为固体物理学、材料科学、结构化学、分子生物学、矿物学、医药学等许多学科的基础研究和应用研究提供必不可少的实验资料,使人们有可能从分子、原子以及电子分布的水平上去理解有关物质的行为规律。 按所用试样的不同,晶体结构分析有多晶体
关于晶体结构的基本介绍
晶体结构是指晶体以其内部原子、离子、分子在空间作三维周期性的规则排列为其最基本的结构特征。任一晶体总可找到一套与三维周期性对应的基向量及与之相应的晶胞,因此可以将晶体结构看作是由内含相同的具平行六面体形状的晶胞按前、后、左、右、上、下方向彼此相邻“并置”而组成的一个集合。晶体学中对晶体结构的表达
晶体结构鉴定手段或方法
X射线衍射分析、红外光谱分析X-射线粉末衍射法是利用单色X-射线照射到粉末晶体或多晶样品上,所得的衍射图称为粉末图。用粉末图谱解决有关晶体结构等问题的方法称为X-射线粉末衍射法;通常用Debye-Scherrer照相法。其优点是所需样品少,甚至0.1mg也可以测定,收集的衍生数据完全,仪器设备和试验
果胶酶的晶体结构
所有果胶酶结构都包括一个由七到九个平行β-螺旋组成的棱柱形右手圆柱体。产生该结构棱柱形状的三个平行β螺旋被称为PB1、PB2和PB3,PB1和PB2产生反平行的β,PB3与PB2垂直。各种酯酶、水解酶和裂合酶的所有底物结合位点都位于结构上的突出环和PB1之间的中央平行β-螺旋结构的外部裂缝上。
简述葡糖激酶的晶体结构
GK晶体分为大区域和小区域, 大小区域之间通过连接区域连接,两区域间存在一个能与底物结合的可变角。在人体内GK存在三种构象,当葡萄糖浓度较低时,GK处于非活性超开放构象;当体内葡萄糖浓度升高时,GK与葡萄糖结合,处于活性开放/闭合构象。 作为单体变构酶,葡萄糖激酶GK在糖代谢中存在三种构象和两
请问晶体结构有哪些类型?
晶体可以由原子、离子或分子结合而成。例如非金属的碳原子通过共价键可以形成金刚石晶体。金属的钠原子与非金属的氯原子可以先分别形成Na和Cl离子,然后通过离子键结合成氯化钠晶体,每个离子周围是异号离子。离子结合而成的晶体称为离子晶体。在有些晶体中原子可以先结合成分子,然后通过分子间键或范德华(Van
晶体结构的主要类型介绍
晶体可以由原子、离子或分子结合而成。例如非金属的碳原子通过共价键可以形成金刚石晶体。金属的钠原子与非金属的氯原子可以先分别形成Na和Cl离子,然后通过离子键结合成氯化钠晶体,每个离子周围是异号离子。离子结合而成的晶体称为离子晶体。在有些晶体中原子可以先结合成分子,然后通过分子间键或范德华(Van d
原子晶体的晶体结构介绍
结构特征:空间立体网状结构(如金刚石、晶体硅、二氧化硅等)。 原子晶体的结构特点: ①由原子直接构成晶体,所有原子间只靠共价键连接成一个整体。 ②由基本结构单元向空间伸展形成空间网状结构。 ③破坏共价键需要较高的能量。 在原子晶体的晶格结点上排列着中性原子,原子间以坚强的共价键相结合,
晶体结构的解理性简介
当晶体受到敲打、剪切、撞击等外界作用时,可有沿某一个或几个具有确定方位的晶面劈裂开来的性质。如固体云母(一种硅酸盐矿物)很容易沿自然层状结构平行的方向劈为薄片,晶体的这一性质称为解理性,这些劈裂面则称为解理面。自然界的晶体显露于外表的往往就是一些解理面。
高福、施一等解析寨卡病毒蛋白晶体结构
近日,《自然—结构和分子生物学》网络版发表了中科院微生物研究所研究员施一和中科院院士高福团队最新发现的寨卡病毒(ZIKV)的非结构蛋白1(NS1)的分子结构,并提供了一个原子层面的图像。NS1参与了例如登革热、西尼罗河病毒等疾病的发病机制当中。 蚊子传播的寨卡病毒目前正在美洲流行。虽然寨卡病
Nat-Chem-Biol:首次解析癌症蛋白的3D晶体结构
来自格里菲斯大学的科学家日前在Nature Chemical Biology杂志上刊登了他们的最新研究成果,研究者通过研究确定了一种和癌症扩散相关的特殊蛋白的三维结构图谱,研究者表示,这种关键蛋白的3-D图谱展示了细菌的乙酰肝素酶的架构及原子水平细节,而乙酰肝素酶是一种可以降解名为硫酸类肝素的酶
ACSDBC:科学家阐明埃博拉病毒复制关键蛋白的晶体结构
当前西非等国爆发的埃博拉病毒感染已经夺去了2000多人的生命,这就急需科学家们早日阐明该病毒的分子生物学特性来帮助开发出保护性的疫苗或者抗病毒药物来抑制疫情的发展。 近日,刊登在国际杂志Acta Crystallographica Section D Biological Crystallog
生物物理所解析出植物光保护蛋白PsbS的晶体结构
植物与太阳光的关系是“爱恨交加”,一方面光能对于植物进行光合作用是必需的,但另一方面过量的光能又会导致植物光合作用装置的氧化性损伤,于是植物逐渐进化出了一种保护机制。在高光照条件下,植物类囊体腔侧的pH会由正常条件下的6.5降低至5.5–5.8,从而激活嵌在类囊体膜上的光保护蛋白PsbS,并进而
科学家解析了小G蛋白家族成员Rbj的晶体结构
小G(small GTPases)蛋白作为信号转导中重要的分子开关,与许多不同的调控因子和效应器分子相互作用,产生细胞功能的多样性。在人类中,目前共发现超过150个家族成员。在果蝇、秀丽隐杆线虫、酿酒酵母、粟酒裂殖酵母和植物中也都发现了家族中保守的同源物。Ras癌基因蛋白是该家族的创始成员,基于
如何用衍射仪判断晶体结构
一种物质会有可能会有多种晶型,因此就有多个pdf卡片,如不同的αfe或γfe。有了pdf卡片,这种晶型的该物质的结构就已经确定了,卡上有该晶体的空间群晶格常数等信息。对于未知物质或其晶体类型,需要用透射电子衍射或者会聚束方法
关于晶体结构晶体的共性介绍
如果将大量的原子聚集到一起构成固体,那么显然原子会有无限多种不同的排列方式。而在相应于平衡状态下的最低能量状态,则要求原子在固体中有规则地排列。若把原子看作刚性小球,按物理学定律,原子小球应整齐地排列成平面,又由各平面重叠成规则的三维形状的固体。 人们很早就注意一些具有规则几何外形的固体,如岩