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中国学者NatureBiotechnology发表蛋白质组学分析新技术

来自中科院计算技术研究所的研究人员发表了题为“Comprehensive identification of peptides in tandem mass spectra using an efficient open search engine”的文章,公布了新一代开放式搜索算法Open-pFind,可提高质谱数据解析的数量与质量,有望成为蛋白质组学日常数据分析的主力工具。 来自中科院计算技术研究所的研究人员发表了题为“Comprehensive identification of peptides in tandem mass spectra using an efficient open search engine”的文章,公布了新一代开放式搜索算法Open-pFind,可提高质谱数据解析的数量与质量,有望成为蛋白质组学日常数据分析的主力工具。 这一研究成果公布在10月9日的Nature Biotechnolog......阅读全文

董梦秋:化学交联质谱让结构生物学研究如虎添翼

  在蛋白质组学分析方法中,质谱获得的是多肽序列结构的信息;那么用质谱是否可研究大分子蛋白的结构信息?近几年来,董梦秋实验室在中国做出了多项先驱性工作,主要集中在化学交联质谱领域。在用单颗粒冷冻电镜技术研究结构生物学屡创佳绩的当下,很多研究者都把样品一分为二,一份做冷冻电镜,一份做交联质谱。那么交联

赛默飞世尔举办“蛋白质组学及质谱基础知识”网络讲座

  2011年3月23日,赛默飞世尔科技借分析测试百科网这一平台成功举办了本月第三场网络视频讲座——蛋白质组学及质谱基础知识。赛默飞世尔科技蛋白质组学市场专员唐佳工程师为大家介绍了蛋白质组学、生物质谱的发展历史、基本原理、最新进展以及The

质谱检测法与蛋白质分析(三)

  Protein(s):待测蛋白质样品;Enz. Digestion:酶解;Pep. Mixture:裂解产物混合物;   MS Analysis:质谱检测分析;DB Search:数据库比对搜索;Identities:鉴定;   Prot.DB :蛋白质数据库;Proteom

Nature:科学家发布人类蛋白质组草图里程碑成果

两个独立研究小组绘制了人体组织和细胞系质谱分析图谱,公布了近乎完整的人类蛋白质组草图。  日前,两个国际小组均在《自然》杂志上公布了人类蛋白质组第一张草图,这些在大部分非患病人体组织和器官中表达的精选蛋白,为更好的理解疾病状态下发生的机体变化,奠定了坚实的基础。这两项最新研究揭示了人类基因组的更多复

你必须知道的质谱鉴定中14条FAQ

   质谱技术在蛋白鉴定等实验中具有不可忽视的作用,不过,目前的应用还不是特别广泛。那么,有问题了怎么解决呢?本文收集了相关的新手对于这项技术的常见问题与解决方法。希望能更好地帮助大家了解这项技术。  问题1. 一级质谱和二级质谱有什么区别?什么时候做一级,什么时候做二级?  答:一级质谱鉴定的方式

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验             实验步骤

AB SCIEX QTRAP 5500系统:突破与超越

AB SCIEX QTRAP ® 5500系统突破与超越—AB SCIEX QTRAP ® 5500系统能解决其它LC/MS/MS系统所不能解决的更多难题 超越与突破 — 超快的扫描速度和高灵敏度,解决其它质谱系统所不能解决的难题       A

Nature发布大规模癌症蛋白质基因组学研究重要成果

  基于来自癌症基因组图谱(TCGA)计划的数据,一个多机构科学家小组完成了首个大规模的乳腺癌“蛋白质基因组学”( proteogenomic)研究,将一些DNA突变与蛋白质信号联系到一起,并帮助确定了一些驱动癌症的基因。  这项研究旨在通过蛋白质和它们的修饰来更好地认识癌症。发表在5月25日《自然

蛋白质组学之逆袭,深度注释基因组

  申请课题缺创新点?撰写论文没思路?急着毕业时间紧?别怕,对于吉凯,一切都是套路!更有甚者,对于宇宙终极难题:“屌丝如何逆袭白富美?”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。   从前,在生物学研究领域,有一个白富美叫基因组学(Genomics),她有一项强大的技能:DNA测序,凭借这项技能,她完

一文了解蛋白质组学分析技术

  蛋白质组学(英语:proteomics,又译作蛋白质体学),是以蛋白质组为研究对象,研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。这个概念最早是在1994年,由Marc Wikins首先提出的新名词。  蛋白质组(Proteome)一词,源于蛋白质(protein)与 基因组(genome

国内外蛋白质组学大腕云集 聚焦生物质谱前沿技术

  2014年7月3日,全国生物质谱学术报告会--生物质谱前沿技术邀请报告会在上海复旦大学隆重召开。此次活动旨在积极促进我国生物质谱技术的发展和应用,加强国内外相关研究领域的专家学者之间的交流与合作,特邀瑞士苏黎世联邦技术学院分子系统生物学

郭天南:全景式组学研究为新冠重症早诊断提供决策依据

  分析测试百科网讯 在新冠肺炎COVID-19疫情肆虐全球之际,PCR技术在快速筛查中已大显神威,但进入临床后如何更早地区分轻症和重症患者,从而更准确地治疗和用药?5月27日中国研究人员在《Cell》发表文章,利用蛋白质组学和代谢组学的全景式分析,发现了重症患者体内应对病毒进攻特征性的分子改变,并

质谱检测法与蛋白质分析(二)

  离子回旋加速器与轨道离子阱质谱仪   随着功能强大的带有外部离子源的傅里叶变换-离子回旋加速器(FT-ICR)质谱仪的出现以及商业化,我们在质谱仪的分辨率与准确性方面取得了质的飞跃。有了这种新型的质谱仪,我们现在可以对ppm级乃至亚ppm级的样品进行分析了。该质谱仪的高分辨率特性不

AB Sciex视频讲座“AB Sciex 电喷雾质谱在蛋白质组学中的应用”

  4月12日,AB Sciex 公司在分析测试百科网成功举办了题为“AB Sciex 电喷雾质谱在蛋白质组学中的应用”的网络视频讲座。AB Sciex 亚太应用支持中心的靳文海博士首先为大家简单介绍了蛋白质组学和质谱技术发展方向,接下来重

华质泰科与美国 Protein Metrics Inc 达成代理合作协议

  华质泰科生物技术(北京)有限公司(ASPEC)和美国加州硅谷生物质谱软件开发商 Protein Metrics Inc (PMI)就下一代蛋白质及翻译后修饰搜索与鉴定引擎Byonic™ 和Preview™ 在大中华地区的独家总代理达成了战略合作协议。PMI 授权ASPEC在中国大陆、台湾

第三届质谱论坛:质谱技术在组学研究中的应用

技术讲座 沃特世科技(上海)有限公司技术专家 贾伟博士   来自沃特世科技(上海)有限公司技术专家贾伟博士带来了题为《蛋白质结构质谱分析技术进行》的报告。贾博士在报告中重点介绍了蛋白质修饰分析、蛋白高级结构分析和蛋白差异构象分析这三方面内容。   蛋白质修饰分析   蛋白质

聚焦药物和蛋白 质谱技术创新开发临床应用研讨会落幕

  分析测试百科网讯 2018年7月6日,由上海市徐汇区中心医院/复旦大学附属中山医院徐汇医院,中国科学院上海临床研究中心,上海市徐汇区医学会共同主办,分析测试百科网承办的“质谱技术的创新开发及临床应用研讨会”在上海市徐汇区中心医院召开(相关链接:聚焦质谱技术创新开发与应用 拓展临床质谱方法学研究)

2016CMSS中国质谱学会质谱网络研讨会第二日顺利召开

2016CMSS中国质谱学会质谱网络研讨会——仪器研发新技术与生物质谱专场  分析测试百科网讯 2016年11月2日上午,2016CMSS中国质谱学会质谱网络研讨会——仪器研发新技术专场共有五位专家学者为大家带来精彩的报告。Excellims公司创始人和CEO 吴青博士  Excellims公司创始

2016CMSS中国质谱学会质谱网络研讨会 大咖抢先看第二弹

  为进一步加强国内外质谱界学术交流,并采用更新颖的互联网形式组织交流活动,将质谱新技术和研究应用拓展和普及到更多的人,共同提高我国质谱研究及应用水平,中国质谱学会将在2016年11月1日-4日,组织“2016 CMSS中国质谱学会质谱网络研讨会”。会议邀请30位质谱大咖与您在线对话,报告内容涵盖质

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

国家重点基础研究发展计划09申报指南发布

  科技部基础研究司日前发布了《关于发布国家重点基础研究发展计划(含重大科学研究计划)2009年度项目申报指南的通知》。   国家重点基础研究发展计划是以国家重大需求为导向,对我国未来发展和科学技术进步具有战略性、前瞻性、全局性和带动性的基础研究发展计划,主要支持面向国家重大需求的基础研究领域和重

质谱鉴定,常见疑问解答

问题1、一级质谱和二级质谱有什么区别?什么时候做一级,什么时候做二级?答:一级质谱鉴定的方式主要为胎指纹图谱(PMF),即利用质谱仪精确测量酶解片段的分子量并搜库比较实现蛋白质的鉴定;二级质谱是在一级质谱的基础上再选择部分肽段做进一步的破碎并对碎片进行深入分析和比较,鉴定出该肽段的序列并结合PMF的

“组学国标”项目结硕果:最精准的mRNA测序与蛋白质组质谱

  二代测序、蛋白质组质谱,这些“高大上”的组学手段早已不是稀罕事,使人们对生命和疾病的理解进入了一个崭新的时代。这些组学技术大量用于科研的同时,在应用领域却陷入了巨大的困境。  蛋白质组质谱技术和RNA测序目前几乎没有任何值得一提的临床应用,即便是在临床应用得相对较多的DNA测序,也饱受重复性差、

质谱MRM技术定量分析与应用

质谱多反应监测(multiple reaction monitoring, MRM)技术作为一种质谱检测的分析方法,具有特异性强、灵敏度高、准确度高、重现性好、线性动态范围宽、自动化高通量的突出优点,这些特质能够满足今天很多研究领域的迫切需要。通过MRM技术进行实时的定量监测可以进行药代动

第四届中国计算蛋白质组学研讨会(CNCP-2016)

  一、CNCP会议简介  随着蛋白质组学的兴起,特别是质谱技术的快速发展,蛋白质组学研究中产生的数据规模越来越大,必须通过先进的计算机算法、高效的软件与硬件来自动处理大批量的蛋白质组数据,这已经成为蛋白质组学研究的一个重要分 支,即"计算蛋白质组学"(Co

《Nature》:新方法提高单细胞蛋白质组学质谱定量准确度

  单细胞蛋白质组学在蛋白丰度检测、转录修饰和翻译后修饰方面填补了单细胞转录组学的空白。单细胞蛋白质组学质谱(SCoPE-MS)是近年来兴起的一种定量分析多功能单细胞蛋白质组的方法,这种方法采用同位素标记和载体蛋白质组学来分析单个细胞【1】。同位素标记具有相同质量的化学标签,其中包含了独特的质量条码

杨芃原:Exploration of human chromosomes by biomass spectrometry

复旦大学化学系 杨芃原教授   2014年4月26日,首届全国质谱分析学术研讨会在北京西郊宾馆盛大开幕。来自复旦大学的杨芃原教授带来了题为《Exploration of human chromosomes by biomass spectrometry based

首届全国质谱分析学术研讨会大会报告(一)

北京大学化学与分子工程学院 刘虎威教授  来自北京大学化学与分子工程学院的刘虎威教授为大家带来题为《实时直接分析质谱离子化新技术及其应用》的报告。   刘教授课题组近年来针对样品预处理、分离、检测技术、数据处理以及应用方面做了许多工作,在报告中主要针对检测技术方面所做

2014第三届中国计算蛋白质组学研讨会(CNCP)学术报告(二)

  2014年11月12日, “2014第三届中国计算蛋白质组学研讨会(CNCP)”在中国科学院计算技术研究所举行。CN