中国学者NatureBiotechnology发表蛋白质组学分析新技术
来自中科院计算技术研究所的研究人员发表了题为“Comprehensive identification of peptides in tandem mass spectra using an efficient open search engine”的文章，公布了新一代开放式搜索算法Open-pFind，可提高质谱数据解析的数量与质量，有望成为蛋白质组学日常数据分析的主力工具。 来自中科院计算技术研究所的研究人员发表了题为“Comprehensive identification of peptides in tandem mass spectra using an efficient open search engine”的文章，公布了新一代开放式搜索算法Open-pFind，可提高质谱数据解析的数量与质量，有望成为蛋白质组学日常数据分析的主力工具。 这一研究成果公布在10月9日的Nature Biotechnolog......阅读全文
蛋白质质谱测序
蛋白质谱一般来讲是用来对某个蛋白质进行鉴定的方法而蛋白质测序实际上就是检测蛋白质的多肽链数目，不一定要用到质谱技术简单说，蛋白质测序的方法有很多，一般是在构建完成后，通过测序来对比之前的预测的序列是否正确。而质谱检测一般是用在蛋白质表达纯化完成后，用来鉴定是否是最初设计的那个蛋白。
SCIEX学堂新课－|－质谱及数据的底层逻辑第2期—质谱数据概览
质谱进阶不用愁，短视频轻松看“质谱攻略之质谱和数据的底层逻辑”，是“SCIEX 学堂”平台中一个专注于分享质谱知识的实用技巧小课程。 亲爱的质谱友友们，你是否曾对生命科学、药物研发、食品、司法、环境监测等领域中的复杂的化合物分析或结构确认感到困惑？现在，让我们一起探索质谱技术的奥秘，带你深入了解质谱
质谱技术助力全新定量蛋白质组数据差异分析计算模型
8月13日，国际学术期刊Cell Discovery 在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所中科院计算生物学重点实验室（马普计算生物学研究所）邵振课题组研究论文“MAP: model-based analysis of proteomic data to detect proteins wit
质谱检测法与蛋白质分析
质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高，希望检测技术的灵敏度也越来越高，同时能够对更为复杂的样品进行分析处理，因此推动了质谱检测技术的发展，出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。 在生命科学研究工作中有一个重要问
质谱检测法与蛋白质分析
在生命科学研究工作中有一个重要问题，就是发现、鉴定蛋白质并弄清楚它们的一级结构。知道了蛋白质的氨基酸序列信息，我们就可以通过遗传密码将其与编码序列对应起来，从原则上来说，也就将细胞的生理学与遗传学联系起来了。发现、鉴定出了一个蛋白质就好像给我们打开了一扇窗，透过这个窗口，我们就能够对复杂的细胞调控网
质谱实验质量控制之数据质控
质谱实验的QC方法包括：样品准备、液相色谱、质谱采集以及谱图质量等。前两期关于质谱污染物的防控，大部分是属于样品准备阶段的质控工作。质控专题共分三期内容：1. 质谱污染的来源与防控篇2. 质谱原始数据中的污染物信息篇3. 质谱数据质控篇——Quic软件介绍点击目录链接可以回顾往期，本期质控专题进行到
质谱仪质谱仪数据处理的分析扫描质谱数据的处理
对于逐点扫描得到的一段质谱数据，数据处理的首要任务是峰位置的判别。其实质是峰数据与既有模型的匹配过程，这与质谱仪的特性、扫描参数以及数据的统计信息等多种因素有关系。简单情况下，连续几个数据都大于设定的阈值（如最大值5％）即可认为该段数据是峰数据，而剩余的数据可认为是本底。在峰位置判别的基础上，根据本
质谱仪数据处理的操作规范扫描质谱数据的处理
对于逐点扫描得到的一段质谱数据，数据处理的首要任务是峰位置的判别。其实质是峰数据与既有模型的匹配过程，这与质谱仪的特性、扫描参数以及数据的统计信息等多种因素有关系。简单情况下，连续几个数据都大于设定的阈值（如最大值5％）即可认为该段数据是峰数据，而剩余的数据可认为是本底。在峰位置判别的基础上，根据本
质谱检测法与蛋白质分析（三）
Protein(s)：待测蛋白质样品;Enz. Digestion：酶解;Pep. Mixture：裂解产物混合物; MS Analysis：质谱检测分析;DB Search：数据库比对搜索;Identities：鉴定; Prot.DB ：蛋白质数据库;Proteom
质谱检测法与蛋白质分析（二）
传统的和最新的蛋白质组学研究策略虽然到目前为止，还没有一种蛋白质组学研究策略能够对某个蛋白质组进行常规的、完整的分析，但是现在的技术已经非常强大，我们相信，很快就能进行全蛋白质组学研究了。而且，对某个亚蛋白质组（比如某个细胞器或亚细胞结构的蛋白质组）进行研究早就已经不是什么难题了，这已经成为了一种常
质谱检测法与蛋白质分析（一）
质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高，希望检测技术的灵敏度也越来越高，同时能够对更为复杂的样品进行分析处理，因此推动了质谱检测技术的发展，出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。本文将对近几年质谱技术的发展以及质谱技术在蛋
质谱检测法与蛋白质分析（二）
离子回旋加速器与轨道离子阱质谱仪 随着功能强大的带有外部离子源的傅里叶变换-离子回旋加速器(FT-ICR)质谱仪的出现以及商业化，我们在质谱仪的分辨率与准确性方面取得了质的飞跃。有了这种新型的质谱仪，我们现在可以对ppm级乃至亚ppm级的样品进行分析了。该质谱仪的高分辨率特性不仅提高了数
质谱研究蛋白质相互作用（一）
质谱技术已经成为了蛋白质组学研究的主力。这种技术方法能精确的检测多肽，从而帮助研究人员识别并测序多肽分子，分析它们的特征，了解它们如何进行化学修饰的。 但大多数蛋白质并不是单独行动的，一些关键的生物学过程，如DNA 复制、转录、翻译、细胞分裂和能量生成都依赖于大型蛋白复合物的行为，这些蛋白复合
质谱检测法与蛋白质分析（一）
质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高，希望检测技术的灵敏度也越来越高，同时能够对更为复杂的样品进行分析处理，因此推动了质谱检测技术的发展，出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。本文将对近几年质谱技术的发展以及质谱技术在蛋白质
质谱和蛋白质组学：击中目标
Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008) 作者：Nathan Blow 分析测试百科 译 近年来，质谱仪大幅提高了动态范围和灵敏度，使研究者们在疾病生物标志物的发现和验证方面，更从容地面对挑战。 在2008年6月的美国质谱大会（ASMS）
质谱中常见的碎片离子数据表
质谱中常见的碎片离子数据表包括以下内容：1. 碳氢离子：碳氢离子是最常见的离子碎片，通常用作分子离子的碎片离子。常见的碳氢离子包括M+1、M+2、M+3、M+4等。2. 碳氧离子：碳氧离子是分子中含有羧基和醛基时产生的离子碎片。常见的碳氧离子包括M-1、M-15、M-29等。3. 氮碳离子：氮碳离子
SCIEX－质谱数据审计追踪（Audit－Trail）的策略
分析测试百科网讯 2015年10月18日，第42期质谱沙龙在北京朝阳医院举行。活动由首都医科大学附属北京朝阳医院和SCIEX 公司主办，分析测试百科网协办。本次沙龙活动的主题是质谱技术在医院临床药学科研中的应用，吸引了质谱领域的专家学者、一线工作者近50人参加此次活动。SCIEX公司资
Orbitrap质谱蛋白质组沙龙在京举行
【导语】使用质谱仪器进行蛋白质组研究中有三个关键环节，第一个是样品的处理阶段，这是最简单，也是最重要的一个步骤。第二个阶段是仪器的操作部分，使用液相、质谱等仪器把蛋白质进行分离、分析。主要涉及仪器参数的优化调整。第三步是生物信息学分析部分，这也是最难的部分。本期沙龙中中科院生物物理所的
华盈视角：蛋白质组学——质谱技术
蛋白质作为功能的直接执行者，在生物医学领域中有着重要意义，检测蛋白质表达、修饰、互作等有助于我们理解生命机体的各类机制和活动规律，为疾病的治疗、诊断，药物的开发、优化等提供有力的支持。质谱技术作为检测蛋白质组学的主流技术，有必要了解其核心原理，才能更好的服务于科学问题的解决。1.质谱的原理： 质谱是
质谱检测法如何进行蛋白质分析？
串联质谱仪通常使用的都是离子模式来鉴定蛋白质的氨基酸序列。目前所有的MS/MS质谱仪都具有该功能。不过其它特殊的质谱仪也具有MS/MS功能。如果要发现蛋白质中的某个功能基团则需要用到母离子扫描功能或者中性丢失扫描功能，而这就必须用到三重四级杆质谱仪，如Q-Q-Q质谱仪，或四级杆离子阱质谱仪，如Q
质谱检测法如何进行蛋白质分析？
MS/MS操作模式 串联质谱仪通常使用的都是离子模式来鉴定蛋白质的氨基酸序列。目前所有的MS/MS质谱仪都具有该功能。不过其它特殊的质谱仪也具有MS/MS功能。如果要发现蛋白质中的某个功能基团则需要用到母离子扫描功能或者中性丢失扫描功能，而这就必须用到三重四级杆质谱仪，如Q-Q-Q质谱仪，或四
气体分析质谱质谱原理
质谱仪配备QuaderaTM 分析软件, 操作简单, 功能强大, 有128 个检测通道，可生成用户特殊应用软件界面. 在参数设置, 多种实测方式, 谱库, 数据统计, 谱图放大, 光标, 输入输出模块等性能的支持下, 可以更方便地进行定性定量分析以及在线离线分析. Omnistar/
质谱及质谱的目的
质谱，是一种分析方法，原理就是让带电原子、分子或分子碎片按质荷比的大小顺序排列，打出相应的谱线。待分析的样品分子在离子源中离化成具有不同质量的单电行分子离子和碎片离子，这些单电荷离子在加速电场中获得相同的动能并形成一束离子，进入由电场和磁场组成的分析器中；其中离子束中速度较慢的离子通过电场后编转大，
品茗论谱－|－第一届杭州西子质谱沙龙——大数据背景下的质谱组学研究
2024年4月2日，SCIEX举办的“第一届杭州西子质谱沙龙——大数据背景下的质谱组学研究”在春意盎然的西湖畔顺利落幕。来自复旦大学的特聘教授唐惠儒教授和西湖大学郭天南教授、浙江大学的徐飞教授和王保红教授等浙江省内30余位质谱专家学者莅临沙龙；来自SCIEX全球和中国区的领导也参加沙龙交流。 沙龙伊
用质谱数据对肽段从头测序实验
方案一 方案二 方案三 实验方法原理 单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列，即相邻肽段间相差一个氨基酸残基，用质谱分析肽阶梯，通常用 MALD
质谱联用仪分析和数据处理过程
质谱联用仪分析： 当柱温、汽化室温度设定好后，按START键，开始升温到设定的温度。当柱室温度达到所设定温度±1℃以内时，READY灯亮。但因温度稳定达到所设定值之前，会略有波动，REDAY灯会闪烁一、二次，但很快就会稳定。当柱箱和汽化室温度达到设定的温度时，就可以进样分析了。 质谱联用仪数
用质谱数据对肽段从头测序实验
实验方法原理 单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列，即相邻肽段间相差一个氨基酸残基，用质谱分析肽阶梯，通常用 MALDI-TOF,MS 分析。 MS/MS 测序用的是上文所述用于数据库检索的 CID 谱，但碎片离子由人工完全解析。用于MS 序列分析的肽阶梯是由化学或酶法降解肽段产生，由 C 未端或N未端
气相色谱质谱联用－得到的数据如何分析
一是全扫描模式（SCAN），还有一个是选择离子扫描模式（SIM），前者主要用来做未知化合物的定性分析，后者主要用于目标化合物检测和复杂混合物中杂质的定量分析。全扫描模式（SCAN）和选择离子模式(SIM)，二者均可以进行定量分析，但是SIM模式需要SCAN模式提供定性和定量离子，且灵敏度更高。