中科院青岛生物能源所发布单细胞拉曼分选测序耦合系统
2018年10月20日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心在第二十届全国分子光谱学学术会议暨2018年光谱年会,发布了自主研发的单细胞拉曼分选及测序耦合(RACS-SEQ)系统。 RACS-SEQ系统通过拉曼组(Ramanome)分析原理、拉曼光镊液滴单细胞分选(RAGE)、流式微液滴单细胞拉曼分选(RADS)等关键器件的创新,在单细胞水平实现了非标记式拉曼表型识别与功能分选,为功能单细胞研究提供拉曼表型组与基因组的整体解决方案,以免标多维的表型组识别、精准简捷的单细胞获取,以及高效低噪的核酸扩增等为系统的三大创新特色,具有单细胞拉曼成像、单细胞表型组识别、单细胞功能分选,以及单细胞测序文库制备等四大功能。 RACS-SEQ搭载了智能信息系统,自动化采集软件(RamLIS)可快速、准确地获取单个细胞内部所有化合物的拉曼光谱信息,一站式分析软件(RamEX)可进行在线式数据处理与挖掘,通过结合多层次/易扩展的多维......阅读全文
专注于单细胞分析仪器研发与生产,星赛生物完成近亿元A++轮融资
近日,青岛星赛生物科技有限公司(以下简称“星赛生物”)宣布完成近亿元人民币新一轮融资。本轮融资由中科育成投资、浙商资本、山东财金资本共同投资,凯乘资本担任独家财务顾问。本轮融资将围绕“技术深度融合、智能生态构建、全球市场拓展”三大战略方向,全面推动星赛生物从“关键技术突破与产品化”阶段迈向“仪器
时空分辨单细胞测序技术与传统单细胞测序技术有何不同?
时空分辨单细胞测序技术与传统单细胞测序技术主要有以下几个方面的不同:空间信息获取传统单细胞测序技术通常无法提供细胞在组织中的空间位置信息,只是对分离的单细胞进行独立分析。时空分辨单细胞测序技术能够在获取单个细胞基因表达等信息的同时,明确细胞在组织中的具体位置。细胞间相互作用研究传统技术难以直接揭示细
星赛生物牵头国家重点“高通量拉曼流式细胞分选仪”项目
8月8日,青岛市人民政府会议中心迎来国家重点研发计划“基础科研条件与重大科学仪器设备研发”重点专项2022年度青岛部市联动项目启动会顺利召开。科技部基础司、中国21世纪议程管理中心、中国科学院前沿科学与教育局、青岛市科技局、青岛市科技局高产促进中心等领导,青岛星赛生物科技有限公司(以下简称“星赛
单细胞DNA测序揭示微生物“暗物质”
据《自然》杂志网站7月14日(北京时间7月15日)报道,天文学家们认为,宇宙总物质量的23%由弥漫于其间且肉眼看不见的“暗物质”组成;现在,美国科学家进行了微生物“暗物质”研究,他们用单细胞DNA测序技术对多种微生物的基因组进行测序后发现,微生物远比我们所知道的要丰富多样,研究同时揭示了不同物种
单细胞测序需要准备什么再去测序
DNA测序的测序原理: DNA测序是指分析特定DNA片段的碱基序列,也就是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)与鸟嘌呤的(G)排列方式。快速的DNA测序方法的出现极大地推动了生物学和医学的研究和发现。
事关幽门螺杆菌!这项成果鉴定准确率达98.5±0.27%
据科技日报消息,6月22日,我国科研人员依托原创的临床单细胞拉曼药敏快检系统(CAST-R),建立了单个细菌细胞精度、“鉴定-药敏-溯源”全流程一体化的H.pylori诊疗技术CAST-R-HP,具有快速病原鉴定、精确药敏表型检测、基于单细胞全基因组支撑耐药机制研究与精准溯源等优势。 该成果团
研究开发出原位代谢靶向的功能菌筛选、培养和强化技术
环境修复与生态系统工程高度依赖于原位功能菌的挖掘和应用,但长期以来,业界普遍采用的“先养后筛”范式面临着挑战。由于缺乏有效的菌群原位功能快检方法,因此通常难以快速识别和挖掘具有潜在功能的原位菌株。此外,即使能分离出功能菌,其在纯培养条件下的代谢效能(如除磷效率)往往与其原位环境有巨大差异,经常导致环
研究开发出原位代谢靶向的功能菌筛选、培养和强化技术
环境修复与生态系统工程高度依赖于原位功能菌的挖掘和应用,但长期以来,业界普遍采用的“先养后筛”范式面临着挑战。由于缺乏有效的菌群原位功能快检方法,因此通常难以快速识别和挖掘具有潜在功能的原位菌株。此外,即使能分离出功能菌,其在纯培养条件下的代谢效能(如除磷效率)往往与其原位环境有巨大差异,经常导
单细胞测序的临床应用
近期精准医学的进展集中在发展基于基因组学的诊断和治疗。这些方法通常包括从患者的组织样本中生成DNA或RNA序列信息,并分析它以确定可用于诊断、预后或通知临床管理的特定特征。‘bulk’一词指的是从大量细胞中集体生成基因组数据的方法,或者在无细胞DNA的情况下,来自许多细胞的基因组材料。因此,这些基因
单细胞分离对单细胞测序领域有着很大的帮助
单细胞分离可以采用特制的毛细管在载玻片的琼脂涂层上选取单孢子并切割下来,然后移到合适的培养基进行培养,分离法对操作技术有比较高的要求,多限于高度专业化的科学研究中采用。 它不仅仅可以用于分离单细胞,还可以用于nl级别试剂的分配和磁珠的分选,对于单细胞测序领域有着很大的帮助。快速高效接种单个活细胞
Namocell单细胞分离仪在单细胞测序领域的应用
9月26至27日2019年细胞产业大会暨2019第四届(上海)细胞与肿瘤医疗高峰论坛在上海新南雅酒店举行。本届会议,邀请了全国30位专家学者、人物演讲、40家企业参展,400余人报名参会,逾500人参加了会议,就细胞储存、细胞治疗、细胞培养、细胞工程、细胞银行、细胞能量与代谢、细胞免疫学、细胞生理学
怎样用拉曼光谱检测单细胞水平的固态氮
氮是维持生命活动最重要的营养元素之一。氮气是氮元素的丰富来源,但由于性质惰性,不能为生物直接利用。氮的生物地球化学循环是将氮转化成生物可利用形式的关键过程。固氮微生物,包括固氮细菌和固氮古菌,可将惰性的氮气转化成生物可利用的氨态氮或硝态氮。据估计,生物可利用氮的半数由生物固氮过程提供。然而,由于
单细胞拉曼光谱助力揭示持留菌的代谢特征
近期,中国科学院青岛生物能源与过程研究所与香港大学合作,利用单细胞拉曼光谱技术在单菌体精度揭示了持留菌的代谢特征,为研究微生物持留现象的产生和持留菌复苏的机制提供了进一步的线索,有助于开发针对慢性感染复发的新治疗策略和方法。 面对恶劣的生存条件和巨大的生存压力,微生物开发了多种策略,“持留”(
科研人员开发出基于流式拉曼的益生菌快检新技术
近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所与相关高校、企业等合作,开发出基于流式拉曼(RFC)的高通量、高精度益生菌快速质检技术。该成果为益生菌产品提供了单细胞分辨率的多参数质量评估手段,带来了“菌株身份证”级别的质量评估新方法。益生菌产业是全球健康产业的重要分支。但是,益生菌产品质量参差不齐,核心技
研究人员开发基于拉曼组的细菌药物应激效应成像技术
在国家自然科学基金项目(项目编号:91231205,31327001,31425002)等资助下,中国科学院青岛生物能源与过程研究所徐健课题组及其合作者创立了基于重水(D2O)标记单细胞拉曼成像的药物抗菌效果评价技术,实现了在单个细菌细胞精度下药物对细胞代谢活性抑制性的快速精确测量,有可能成为指
幽门螺杆菌单细胞精准诊疗技术来了
幽门螺杆菌(Helicobacter pylori)是人类最常见的慢性感染细菌,它生长缓慢且培养条件苛刻,因此临床合理用药和精准溯源均面临挑战。中国科学院青岛生物能源与过程研究所与中国疾病预防控制中心传染病预防控制所(中国疾控中心传染病所)、青岛市立医院、青岛星赛生物等医产学研联合团队,依托原创
单细胞拉曼结合重水标记技术实现土壤解磷微生物筛选
磷是一种至关重要但不可再生的资源。磷肥是作物生长必须三大营养元素(氮、磷、钾)之一,但磷矿是有限资源,据估计,以目前的磷矿储备,大概还能继续开采100年,因此,磷又被称为“正在消失的元素”。随着长期大量的磷肥施用,土壤中积累了大量固定态磷,大大降低了磷素的生物有效性,加剧了磷资源短缺的问题,对土
单细胞分离仪在单细胞测序领域有着很大的帮助
单细胞分离仪可以实现从微孔芯片转移单细胞到细胞收集管中。单细胞转移分离系统集单细胞成像,单细胞隔离,单细胞选择功能于一体,自动聚焦成像。 转移单细胞到微管,PCR微孔板或其它反应微管中,在隔离单细胞后,它可以对选定收集的细胞进行扫描并成像,采用倒置荧光显微镜,配备自动扫描显微镜载物台,自
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。
拉曼光镊技术成功实现单细胞无损识别与精确提取
单细胞研究是当今生物医学领域备受关注的热点方向之一。传统生物学对细胞进行识别,往往需要借助染色等标记方式,导致细胞的损伤甚至死亡,限制对同一特定细胞的进一步分析和应用。近日,北京大学信息科学技术学院电子学系、纳米器件物理与化学教育部重点实验室叶安培教授课题组设计了一款生物芯片,并结合自主开发的“
如何让单细胞测序变得简单?
单细胞生物学研究一直是当今的热门话题,而且最前沿的领域就是单细胞RNA测序了(scRNA-seq)。常规RNA测序方法一次性能够对成千上万个细胞进行加工测序,并给出平均差异,但并没有两个细胞是完全一样的,而新型的scRNA-seq方法就能够揭示出制造每一种特异性的微小改变,甚至这种技术还能够阐明完整
Fluidigm推出单细胞TCR测序产品
解析细胞表型是免疫学中一个共同的单细胞分析目标。然而,T细胞受体V(D)J基因区域的随机重排带来了T细胞群体的复杂变化。这形成了庞大的T细胞部队,以便识别特定的外源蛋白,引发有效的免疫反应。 为了在单细胞水平实现深度的T细胞分析,Fluidigm近日在C1™系统上推出了一个全新的免疫学应用 –
!单细胞测序的”CPU-2.0”时代
对单个人类细胞的基因组进行准确的变异检测和大范围单倍体型分析一直以来都是测序领域的巅峰挑战。单细胞测序使我们能在更高的分辨率下研究生命的机制。一方面,在像癌症这样的组织样本中存在大量具有不同基因组类型的单个细胞,因此需要分析单细胞水平基因组而不是大量细胞的平均值;另一方面,对于非常珍贵的细胞样品
单细胞测序基准数据的特点
单细胞测序基准数据集是用于评估和比较不同单细胞测序数据分析方法和工具的标准化数据集。这些数据集通常具有以下特点:高质量和准确性:经过严格的质量控制和验证,以确保数据的可靠性。多样性:涵盖不同的细胞类型、组织、物种和实验条件,以全面测试分析方法的通用性。详细的注释:包括细胞类型、状态、疾病信息等,以便
单细胞测序技术的技术特点
单细胞测序技术是一种在单个细胞水平上对基因组、转录组、表观遗传组等进行高通量测序分析的技术。 它具有以下几个重要特点和优势: 1. 揭示细胞异质性:能够发现细胞群体中不同细胞之间的细微差异,识别罕见细胞类型和细胞的不同状态。 2. 深入了解细胞发育和分化:追踪细胞从干细胞到成熟细胞的发育轨迹,揭
漫谈单细胞测序及其临床应用
一、概述随着现代生物学的发展,细胞群体的研究已不再能满足科研需求。单细胞测序解决了用组织样本测序或样本少时无法解决的细胞异质性难题,为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向。单细胞测序正在成为科研热点。二、单细胞测序倍受青睐的原因人们最初以为一个细胞类群是均质的(即各细胞都是
什么是单细胞生物?
单细胞生物 生物可以根据构成的细胞数目分为单细胞生物(Protozoa)和多细胞生物(Metazoa)。单细胞生物只由单个细胞组成,个体微小,用肉眼很难看的见,大多数单细胞生物生活在水域环境中,有些寄生在我们身上。单细胞生物靠分裂繁殖(酵母菌在适宜的环境下出芽繁殖)单细胞生物包括所有古细菌和真细菌和