中科院青岛生物能源所发布单细胞拉曼分选测序耦合系统
2018年10月20日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心在第二十届全国分子光谱学学术会议暨2018年光谱年会，发布了自主研发的单细胞拉曼分选及测序耦合（RACS-SEQ）系统。 RACS-SEQ系统通过拉曼组（Ramanome）分析原理、拉曼光镊液滴单细胞分选（RAGE）、流式微液滴单细胞拉曼分选（RADS）等关键器件的创新，在单细胞水平实现了非标记式拉曼表型识别与功能分选，为功能单细胞研究提供拉曼表型组与基因组的整体解决方案，以免标多维的表型组识别、精准简捷的单细胞获取，以及高效低噪的核酸扩增等为系统的三大创新特色，具有单细胞拉曼成像、单细胞表型组识别、单细胞功能分选，以及单细胞测序文库制备等四大功能。 RACS-SEQ搭载了智能信息系统，自动化采集软件（RamLIS）可快速、准确地获取单个细胞内部所有化合物的拉曼光谱信息，一站式分析软件（RamEX）可进行在线式数据处理与挖掘，通过结合多层次/易扩展的多维......阅读全文
单细胞生物的种类
概括 单细胞生物主要分有核和无核的单细胞。 有核的如草履虫就是典型的有核单细胞生物。有核单细胞生物主要由细胞核、细胞质、还有细胞器。 它包括：线粒体、高尔基体、核糖体、细胞膜、这是动物型单细胞。如果是植物型单细胞比如 红藻，就是细胞壁、细胞核、细胞质，它的细胞器就包括线粒体、高尔基体、核糖体
单细胞生物的概述
单细胞生物主要分有核和无核的单细胞。 有核的如草履虫就是典型的有核单细胞生物。有核单细胞生物主要由细胞核、细胞质、还有细胞器。 它包括：线粒体、高尔基体、核糖体、细胞膜、这是动物型单细胞。如果是植物型单细胞比如 红藻，就是细胞壁、细胞核、细胞质，它的细胞器就包括线粒体、高尔基体、核糖体、叶绿
靶向深度测序和单细胞基因测序的区别
1、目标序列靶向测序是一种对感兴趣的基因组区域进行富集测序的研究策略。目标区域测序的主要优势在于可针对特定区域进行测序，有效降低了测序成本，提高了测序深度，能够更为经济有效地研究特定区域的遗传变异。2 单细胞测序是指单个细胞水平上对基因组进行测序。3、靶向测序步骤为 样品准备、探针/引物设计、目标序
靶向深度测序和单细胞基因测序的区别
1、目标序列靶向测序是一种对感兴趣的基因组区域进行富集测序的研究策略。目标区域测序的主要优势在于可针对特定区域进行测序，有效降低了测序成本，提高了测序深度，能够更为经济有效地研究特定区域的遗传变异。2 单细胞测序是指单个细胞水平上对基因组进行测序。3、靶向测序步骤为 样品准备、探针/引物设计、目标序
对抗进口－国产科研仪器产业面临多重考验
科研仪器是学科发展的重要“引擎”。但在中国，科研却常常苦于被仪器卡住“脖子”。 曾在美国华盛顿大学基因组研究院任教、现任山东省能源生物遗传资源重点实验室主任徐健深有体会。 2008年，徐健回国后便与同事组建中科院青岛生物能源与过程所公共仪器平台，但让他颇感无奈的是，研究所需要的高端生
开发出非标记液滴单细胞微生物生长表型筛选技术
微生物生长表型筛选是工业育种、酶定向进化和合成生物学等领域面临的限速步骤。精准的单细胞精度生长表型测量是突破上述瓶颈的关键。近日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心开发了低成本、非标记的微型液滴微流控平台。该平台可通过单细胞微液滴培养、液滴自荧光检测、目标微液滴自动分选等步骤完成单细胞
单细胞测序技术的发展趋势
单细胞测序技术的发展呈现出以下几个主要趋势：更高的分辨率和准确性不断提高检测的灵敏度和特异性，能够更精确地检测低丰度的转录本和稀有细胞类型。减少技术噪音和误差，提供更准确的基因表达定量。多组学整合整合基因组、转录组、表观基因组、蛋白质组等多组学信息，全面揭示细胞的状态和功能。实现同时对多个层面的分子
Science：单细胞分析？并行测序技术可以
近日，一项发表于国际杂志Science上的研究论文中，来自美国的研究者描述了一种新型的大规模并行技术，通过利用新一代测序技术来在单细胞水平上实现对基因表达的监测；研究者表示，单细胞分析对于理解人类造血系统的必要性及重要性不断凸显，如果没有这种分析的话，来自少许细胞的大量表达改变就和来自许多细胞的
单细胞测序基准数据集的概念
单细胞测序基准数据集是一组经过精心挑选和整理、具有高质量和代表性的单细胞测序数据集合。这些基准数据集通常具有以下特点和作用：特点：高质量：数据经过严格的质量控制和处理，具有低噪声、高准确性和完整性。多样性：涵盖多种细胞类型、组织、疾病状态、实验条件等，以全面反映单细胞测序的各种情况。详细标注：对细胞
单细胞测序基准数据集如何选择？
选择单细胞测序基准数据集时，可以考虑以下几个关键因素： 1. 研究目的和问题 - 明确您的具体研究目标，例如是关注特定细胞类型的分类、细胞发育轨迹分析还是差异表达基因检测等，选择与研究问题相关的数据集。 2. 细胞类型和组织 - 确保数据集包含您感兴趣的细胞类型和组织来源。如果您
《自然—方法学》年度方法：单细胞测序
2014年1月《自然—方法学》(Nature Methods)上发表年度特别报道，将“单细胞测序”(Singled out for sequencing)的应用列为2013年度最重要的方法学进展。 近几年来，基于单细胞测序技术的科学研究取得了突飞猛进的发展，其成果有望为一些重
Nature新技术：CRISPR+单细胞测序=？
CRISPR-Cas9“基因剪刀”的基因组编辑技术是生物研究和新型靶向药物研发的有力工具。比如利用CRISPR筛选基因（pooled CRISPR screens），可以通过CRISPR gRNAs靶向成百上千个不同的基因，同时编辑许多细胞，然后实验筛选编辑细胞，gRNA可以帮助确定哪些基因对于生物
单细胞测序技术的原理和步骤
单细胞测序技术是一种在单个细胞水平上对核酸（如 DNA、RNA）进行测序和分析的强大工具。这项技术的主要步骤通常包括：单细胞分离：通过各种方法（如流式细胞术、微流控技术等）从组织或细胞群体中分离出单个细胞。核酸提取和扩增：从单个细胞中提取核酸，并进行扩增以获得足够的量用于后续测序。文库构建：将扩增后
时空分辨单细胞测序技术的优势
时空分辨单细胞测序技术具有以下显著优势：全面解析细胞微环境能够清晰地揭示细胞与其周围微环境的相互作用，包括细胞外基质、血管、神经以及其他细胞类型，从而更深入地理解细胞的功能和行为。精准追踪细胞发育和分化路径可以精确地确定细胞在发育和分化过程中的时空顺序，揭示细胞状态转变的关键时间点和空间位置，有助于
《细胞》：单细胞测序助力基因重组图谱
来自斯坦福大学医学院等处的研究人员发表了题为“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章，首次公布了来自一个成人男子91个
Nature－methods发布单细胞测序新技术
来自瑞典Ludwig癌症研究所及Karolinska研究所的研究人员，在最新一期(9月22日)的《自然方法》(Nature Methods)杂志上报告了一项获得重大改良的新技术，可以利用它来分析单细胞中的基因表达——这一性能与从基础研究到未来癌症诊断的一切事物均存在关联。 资深作者Ri
单细胞测序技术的应用场景
单细胞测序技术是一种在单个细胞水平上对基因组、转录组、表观基因组等进行高通量测序分析的技术。以下是其一些主要的应用场景：发育生物学描绘胚胎发育过程中细胞的分化轨迹和命运决定。揭示器官形成过程中不同细胞类型的特化和相互作用。肿瘤研究解析肿瘤细胞的异质性，包括不同的亚型、突变状态和药物反应。追踪肿瘤的进
单细胞测序技术的技术优势
单细胞测序技术具有许多优势：揭示细胞异质性：能够发现不同细胞之间基因表达和遗传变异的差异。研究细胞发育和分化：追踪细胞在发育过程中的动态变化和谱系关系。解析复杂组织：剖析组织中各种细胞类型的组成和功能。助力疾病研究：在肿瘤学中，有助于了解肿瘤细胞的进化、异质性和耐药机制。
单细胞测序技术的缺点有哪些？
单细胞测序技术存在以下一些缺点： 1. 成本较高：包括实验设备、试剂和数据分析等方面的费用相对较高，限制了其在大规模研究中的广泛应用。 2. 技术难度：实验操作流程较为复杂，对操作人员的技术要求较高，容易出现操作失误导致数据质量下降。 3. 数据量大且复杂：产生的数据量巨大，数据分析和处理具有
时空分辨单细胞测序技术的原理
时空分辨单细胞测序技术的原理通常包括以下几个关键步骤：单细胞分离和捕获利用微流控技术、激光捕获切割或荧光激活细胞分选等方法，从组织样本中分离并捕获单个细胞，同时尽量保持细胞的完整性和生物活性。空间定位标记通过特定的标记方法，如给组织切片进行区域划分、使用特定的条码标记或成像技术，记录每个细胞在原始组
青岛能源所合作开发抗菌药效评价新技术
抗生素的不当使用一方面贻误病情、导致复发感染，甚至造成人体菌群紊乱，诱导其它疾病的发生，另一方面则加速耐药菌乃至“超级细菌”的出现。因此，如何实现“快、准、狠”的抗生素精准用药既是精准医学的重要前沿，也是遏制耐药性蔓延的核心挑战之一。而准确全面的抗菌效果评价技术是抗生素精准用药的前提与基础。近日
研究提出“过程拉曼组”技术助力啤酒发酵过程智能监控
啤酒的风味与品质主要由发酵过程中酵母代谢产生的醇、酯、酸等多种化合物共同决定。传统发酵过程监控主要依赖气相色谱、液相色谱等多种仪器来“分别”检测发酵液中不同物质的含量，过程繁琐、耗时长且成本高昂。更重要的是，这些发酵过程监控技术无法快速获取酵母细胞自身的实时代谢状态，也忽视了细胞群体中存在的代谢差异
单细胞测序基准数据集对单细胞分析方法的发展有哪些影响？
单细胞测序基准数据集对单细胞分析方法的发展具有多方面的重要影响：促进方法的比较和评估为不同的单细胞分析方法提供了共同的测试平台，使得研究人员能够客观地比较各种方法的性能，从而筛选出更优的方法。推动方法的改进和优化当新的分析方法在基准数据集上表现不佳时，能够促使开发者反思和改进算法，以提高准确性和可靠
单细胞生物的生产特性
单细胞蛋白质生产周期短。单细胞生物繁殖特别快，世代周转迅速。如酵母菌在良好条件下每接种100千克，1天即可获得2500千克酵母，其生长繁殖速度约为大豆的1300倍，为动物生长的2000倍。所以，这类饲料生长速度快，世代周转迅速。 生产单细胞蛋白质饲料产品的原料多为烃类及其衍生物、天然气、石油加
单细胞生物的科技应用
单细胞分析 单细胞分析是分析化学、生物学和医学多学科相互渗透发展形成的跨学科前沿领域。单细胞分析的各种方法，包括毛细管电泳、微流控芯片、多种光学显微镜（荧光显微镜、聚焦荧光显微镜、全内反射荧光显微镜、多光子荧光显微镜、荧光相关显微镜、近场扫描光学显微镜等）、扫描电化学显微镜、质谱成像、原子力显
单细胞生物的主要影响
单细胞生物虽然个体微小，但是与人类的生活有着密切的关系。多数单细胞生物是浮游生物的组成部分，是鱼类的天然饵料。草履虫对污水净化有一定的作用，据统计，一只草履虫每小时大约能形成60个食物泡，每个食物泡中大约含有30个细菌，因此，一只草履虫每天大约能吞食43000个细菌。但是单细胞生物也有对人类有害
单细胞生物也具有“智慧”
虽然"智慧"是一种十分复杂难以定义的概念，我们却都明白具备一个大脑是生物具有智慧的生理前提。但是对于单细胞生物来讲，它们是否也存在智慧呢？ 如果我们坚信智慧来源于大脑，那么答案就是否定的。不过，最近一项研究表明情况比我们想象的要复杂，研究者们发现"无脑"的单细胞生物也具有学习的能力。 正如科
单细胞生物的相关介绍
单细胞生物指的是身体只有一个细胞，在生物圈中还有肉眼很难看见的生物。 生物可以根据构成的细胞数目分为单细胞生物（Protozoa）和多细胞生物（Metazoa）。单细胞生物只由单个细胞组成，而且经常会聚集成为细胞集落。单细胞生物个体微小，全部生命活动在一个细胞内完成，一般生活在水中。 第一个
青岛能源所等提出微生物组功能校正算法MetaApo
基于元基因组测序的微生物组功能分析和比较，在疾病诊断、生态监控、生物安全等领域具有应用价值，而高昂的成本限制了其更广泛应用。近日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心开发出微生物组功能校正算法Meta-Apo（Metagenomic Apochromat），为大规模的菌群功能比较提供
拉曼光谱法超快速微生物药敏检测
刚接触到拉曼光谱概念的时候，小编产生了这样一个问题：拉曼光谱法跟质谱相比有什么优势，类似还是超越？就让我们一起带着问题找答案。 学术渊源首先天眼查。威朋（苏州）医疗器械有限公司致力于开发先进的医疗成像与感知技术，用于疾病诊断与治疗。公司创始人为光学成像领域世界级专家、长江学者、“千人计划”专家程继新