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青岛能源所等提出微生物组功能校正算法MetaApo

基于元基因组测序的微生物组功能分析和比较,在疾病诊断、生态监控、生物安全等领域具有应用价值,而高昂的成本限制了其更广泛应用。近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心开发出微生物组功能校正算法Meta-Apo(Metagenomic Apochromat),为大规模的菌群功能比较提供了保证分析精度且可大幅降低实验和计算成本的解决方案。 目前,微生物组功能的分析和比较,主要基于基因组序列进行代谢重建。路线之一是鸟枪法元基因组测序(Whole Metagenome Sequencing;WMS),但其高昂的测序成本(~1000~2000元/样本)和冗杂的分析过程阻碍了该方法的大规模应用。此外,通过扩增子测序(~200元/样本),利用16S rRNA等进化标记基因和其参照基因组之间的关联,亦能推断微生物组的功能。该方法大幅降低了成本,但16S rRNA基因片段经常带有扩增偏好性,而且与全基因组序列的关联并非完全可靠,......阅读全文

2449.8万!这所高校发布采购建设分析测试中心平台

  分析测试百科网讯 近日,海南省教学仪器设备招标中心受招标人海南大学委托,采购场发射透射电子显微镜、基质辅助激光解析电离串联飞行时间质谱仪、纳米喷雾干燥仪、石英晶体微天平、多功能样品前处理平台、热重-红外图像-气质联用原位反应系统、显微傅里叶变换红外光谱仪+光声光谱检测器、差示扫描量热

2019北京光谱年会——人工智能与光谱的结合

  分析测试百科网讯 2020年1月7日,由北京理化分析测试技术学会光谱分会主办的2019年北京光谱年会在北京天文馆如期举办。此次会议旨在围绕拉曼光谱、原子发射光谱和光谱计算等光谱方法和应用进行学术交流,同时会议邀请了诸多领域专家亲临现场并发表多篇精彩报告。分析测试百科网作为此次会议的支持媒体,全程

2017 CCLTA——大会报告:《MALDI-TOF MS 引领分子诊断新时代》

  第三届全国临床检验装备技术与应用学术大会暨第六届SAC/TC136高峰论坛已于5月7日在橘子洲头——长沙国际会展中心完美落幕。可谓盛况空前!专家学者的报告精彩纷呈,让我们颇受启发。  5月7日下午,在质谱学组分论坛中,毅新专家——高级工程师、斯坦福大学访问学者马庆伟教授,作为医学装备协会检验医学

实时微生物检测分析仪

实时微生物检测分析仪 现已有在线实时微生物检测分析仪上市,可用于实时、连续地测量制药用水中的微生物浓度。其采用的 LIF 技术,可瞬时测量微生物污染,无需染色剂或试剂等任何消耗品;同时,还可以测量来自膜体、过滤器和 O 型圈的惰性粒子。 其应用原理为:水系统水样通过连接管进入分析

Nature重磅:节食减肥易反弹原来是肠道微生物捣的鬼!

  减肥最怕的就是反弹,可是反弹又是减肥成功后的常态问题,那究竟是为什么会反弹呢?  首先,我们要告诉大家,其实这个罪魁祸首就是我们的“老朋友”——肠道微生物!这个发现要归功于以色列魏茨曼科学研究所的Eran Segal和他的团队,他们的研究成果发表在了11月24日的《自然》杂志上。  一直以来,在

Nature重磅!PacBio 三代测序技术又一重大应用

  近期,《Nature Biotechnology》上在线发表了一篇由西奈山伊坎医学院,生物信息学公司Sema4,纽约大学和佛罗里达大学的科学家们联合开展的研究结果。在这项新工作中,科学家使用PacBio长读长单分子实时测序技术(SMRT 测序技术)和新型算法进行微生物组菌株鉴定,提出不同种的微生

这套人工智能咋这么“聪明” 判定肺炎准确率堪比专业医生

  近日,广州市妇女儿童医疗中心基于深度学习开发出一个能诊断眼病和肺炎两大类疾病的人工智能系统,这项研究成果以封面文章登上了2月23日的世界顶级期刊《细胞》。  这项人工智能成果能够根据影像资料,给医生提出诊断建议,并解释判断的依据。比对实验发现,该系统在诊断眼疾时的准确率达96.6%;在区分肺炎和

美最新研究显示人体微生物或成身份识别新“指纹”

  美国哈佛大学公共卫生学院一项新研究显示,每个人体内的微生物群落都含有独特的“指纹”,此特征可作为区分个体的标识。该研究结果刊登在5月11日的美国《国家科学院学报》上。  据物理学家组织网报道,研究论文首席作者、哈佛大学生物统计学研究部研究人员埃里克·弗兰佐萨说:“将人类DNA样本与人类DNA‘指

美最新研究显示人体微生物或成身份识别新“指纹”

  美国哈佛大学公共卫生学院一项新研究显示,每个人体内的微生物群落都含有独特的“指纹”,此特征可作为区分个体的标识。该研究结果刊登在5月11日的美国《国家科学院学报》上。  据物理学家组织网报道,研究论文首席作者、哈佛大学生物统计学研究部研究人员埃里克·弗兰佐萨说:“将人类DNA样本与人类DNA‘指

全自动菌落计数仪 icount 30F/30D

  全新设计的三色LED混合光源,消除了上一代白光LED照明偏蓝问题,能真实还原菌落色泽。上光源呈360度环绕分布,视场更均匀;新设计的晶锐悬浮式暗视野,极大地提高了暗视野的衬度,更适合微小菌落的观察。icount 30 是icount系列中的高配置、扩展型智能菌落计数仪,内置254nm紫外消毒模块

昆明动物所发布精准诊断一类疾病的核心使能技术

  近日,中国科学院昆明动物研究所马占山团队发布了两项生物信息技术(算法和软件),这两项技术可用于精准诊断菌群相关疾病指标的研发,也可用于其它环境微生物群系监测的研究。其技术报告以The P/N (Positive-to-Negative Links) ratio in complex networ

全自动菌落计数仪 icount 30F/30D

全新设计的三色LED混合光源,消除了上一代白光LED照明偏蓝问题,能真实还原菌落色泽。上光源呈360度环绕分布,视场更均匀;新设计的晶锐悬浮式暗视野,极大地提高了暗视野的衬度,更适合微小菌落的观察。icount 30 是icount系列中的高配置、扩展型智能菌落计数仪,内置254nm紫外消毒

盘点2019我国农业领域9大突破

  2019年,中国农业科学院基础研究不断深入,全年共发表科技论文6429篇,其中SCI/EI收录论文3094篇,同比增长8.3%。在《Science》《Nature》《Cell》《PNAS》四大刊物上发表高水平论文12篇,处于国内领先地位。涌现了非洲猪瘟病毒结构及装配机制解析、二倍体马铃薯自交不亲

Cell封面文章:摄入食物机体血糖水平改变或因人而异

  什么食物更容易升高血糖水平?寿司还是冰激凌?近日一项发表在国际杂志Cell上的研究论文中,来自魏兹曼研究所(Weizmann Institute)的研究人员通过对800人进行为期一周的血糖水平监测发现,针对食物机体的血糖水平变化因人而异。  研究者Eran Segal教授说道,我们选择主要对血糖

融智生物发布全球首个商用化生物组学微生物质谱数据库

  近日,融智生物宣布建设完成基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商品化生物组学微生物质谱数据库。  传统上,基于不同的细菌或真菌内蛋白组成分特别是核糖体蛋白有显著的差异,对核糖体蛋白组的质谱测试,可用于快速、高准确度鉴定微生物。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TO

超4000种 融智生物发布商用化生物组学微生物质谱数据库

  近日,融智生物宣布建设完成基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商品化生物组学微生物质谱数据库。  传统上,基于不同的细菌或真菌内蛋白组成分特别是核糖体蛋白有显著的差异,对核糖体蛋白组的质谱测试,可用于快速、高准确度鉴定微生物。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TO

《Nature》1月最受关注的十篇论文

  英国著名杂志《Nature》周刊是世界上最早的国际性科技期刊,自从1869年创刊以来,始终如一地报道和评论全球科技领域里最重要的突破。其办刊宗旨是“将科学发现的重要结果介绍给公众,让公众尽早知道全世界自然知识的每一分支中取得的所有进展”。近期《Nature》下载论文最多的十篇文章(2016年12

全球微生物组大数据搜索引擎上线

  日前,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心正式发布首个微生物组大数据搜索引擎——MSE(Microbiome Search Engine; http://mse.single-cell.cn),使得以整个微生物组为分析单元的智能搜索和大数据挖掘成为现实。   微生物组,又称“菌群”。

MIT与OPH为亚洲带来病原体快速检测方案

  加利福尼亚圣克利门蒂7月1日电 /美通社亚洲/-- Micro Imaging Technology, Inc.(场外交易公告板代码:MMTC)宣布与香港 OPH 有限公司建立了战略经营发展关系。OPH 将帮助该公司在亚洲寻找一位制造业合作伙伴。此外,OPH 还将通过其销售渠道为 MIT 100

地表过程与资源生态国家重点实验室开放课题申请

   地表过程与资源生态国家重点实验室(北京师范大学)  2015年度开放课题申请指南  为资助国内外学者和科技工作者到地表过程与资源生态国家重点实验室开展工作, 促进地表过程、资源生态、地表系统模型与模拟、区域可持续发展模式以及灾害风险评估等方向的实验与研究工作,2015年度开放课题开始申请。  

Cell、Nature Medicine:绘制第三大常见癌症肠道细菌全图谱

  很早,我们就知道癌症是由于不良生活习惯引起的,比如不健康的饮食或吸烟。近年来生活在我们身体内和身体上的微生物作为关键参与者进入了这个研究舞台,比如科学家们发现胃癌可以由单一细菌物种:幽门螺杆菌引起,但是关于全世界第三大常见癌症——结直肠癌的肠道细菌的影响,一直还没得到解答。  为了回答这个问题,

第二届AVDC大会新增会议嘉宾抢先看!

 为进一步提高中国兽医诊断服务在可靠性、准确性、及时性和高通量等方面的表现,第二届国际兽医检测诊断大会将于2020年9月10-12日在南京国际展览中心举行。大会广泛邀请全球兽医检测诊断的杰出代表与不断进取的中国兽医进行深层次的分享、对话及相互启迪。大会详情时  间:2020年9月

全球首个微生物质谱云中心在中国建立!

  感染性疾病的爆发与流行是我国乃至全球的公共卫生威胁,感染性疾病占全部死因的25%以上,而微生物快速准确鉴定是感染性疾病治疗的关键因素。国家卫计委关于全国食物中毒事件情况的通报中,微生物性中毒事件及中毒人数均居首位。2010年美国沙门氏菌感染、2015年肉毒杆菌污染奶粉等生物安全公共事件,都突显出

碳云智能联手中粮 精准餐饮全方位调控血糖健康

   2018年7月12日,北京,碳云智能与中粮营养健康研究院签署战略合作协议,携手在动态血糖管理研究及其相关应用领域进行合作,致力通过长期监测、观察、分析、评估血糖异常人群的数字化生命动态图谱,构建个体化的精准血糖管理模型,从而对特定群体给予个性化干预方案,有效达成健康管理目标。  众所周知,错误

“嗜血”的质谱

  卫生部临检中心组织的2018年第一次临床微生物室间质评已经结束,但关于流感嗜血杆菌和溶血嗜血杆菌的鉴定问题,在微信朋友圈里谈得正热烈 (见文《溶血 or 流感?傻傻分不清?》)[1]。主要是因为在这次质评中,生化鉴定仪和有些品牌的质谱仪的鉴定结果出错了。令小布自豪的是,布鲁克MALDI Biot

微生物细胞体内实现多色荧光信号的同时成像

  荧光蛋白的发现革新了生命科学的研究,应用荧光蛋白可以观测到细胞内部的活动,例如荧光蛋白可以标记特定的蛋白,也可以作为报告探针用于检测特定基因的活性。荧光蛋白的开发和进化使其光谱得到了全面的扩展,也使得多个荧光蛋白的同时使用成为可能。  目前,多色成像较多局限于两个荧光蛋白的同时使用。通常是选取两

我国学者研制多色荧光成像技术,可精准分离特定信号

  荧光蛋白的发现革新了生命科学的研究,应用荧光蛋白可以观测到细胞内部的活动,例如荧光蛋白可以标记特定的蛋白,也可以作为报告探针用于检测特定基因的活性。荧光蛋白的开发和进化使其光谱得到了全面的扩展,也使得多个荧光蛋白的同时使用成为可能。图:(左)1-4色荧光报告系统的质粒系统示意图,(右)串色校正后

三维全息显微镜快速鉴别细胞技术

全息成像原理是相干光源通过半透明镜头时,光束的振幅和相位在光和物质相互作用时受到调制,这种调制信号使得输出波前带有物体全部三维结构信息。 使用数字全息显微镜(DHM),我们可以间接记录物体波前的相位和振幅信息。通过单个全息样本,数字重构生物样品不同深度层次的图像。因此,DHM一般被归类为三维光

宏基因组测序帮助科学家增加12倍海洋病毒种类

  你知道吗?当你在海里游泳时吞下一口海水,就可能吞下了数以亿计的病毒。  尽管海洋中的病毒数量惊人,并且在自然界的碳循环等过程中发挥着关键作用,但自海洋病毒首次被发现以来的几十年里,科学家仍然对其多样性及遗传信息知之甚少。近年来,随着基因组学技术的进步,科学家开始着手分析海洋病毒的功能与多样性,特

青岛能源所提出“微生物组影响指数”

  微生物组是微生物在自然界的存在形式,与人体、空气、土壤与海洋的健康息息相关。因此,微生物组科学与产业已经成为国际科技合作与竞争的“战略高地”。然而,大数据挖掘工具的匮乏,阻碍着微生物组研究从“数据分析”向“数据科学”的跨越。2010年,来自43个国家的500多名研究人员联合启动了“地球微生物组计