陈功友教授973项目多篇文章解析新机理

来自上海交通大学农业与生物学院的陈功友教授2008年6月进入上海交大组建了“植物-病原物互作功能基因组学”实验室,之后邹华松博士和邹丽芳博士先后加盟,主要从事稻黄单胞菌引起的水稻白叶枯病和水稻细菌性条斑病发生机理与控制的基础研究。 近期这一实验室发表了多篇文章,分别解析了水稻白叶枯病菌和稻黄单胞菌的致病遗传学新机理,相关成果公布在Applied and Environmental Microbiology,以及Microbiology杂志上。 第一篇文章“The Ketoglutarate Transport Protein KgtP is Secreted through the Type III Secretion System and Contributes to Virulence in Xanthomonas oryzae pv. oryzae”主要揭示水稻白叶枯病菌如何利用二羧酸转运蛋白从......阅读全文

高密度光纤芯片技术及其在功能基因组学中的应用

DNA微阵列技术的发展[1]带来了基因表达研究方法上的一场革命。传统的Northern blots或RT-PCR方法只能逐一地研究单个基因的表达,而DNA微阵列技术可以同时例行检测成千上万个基因表达水平的变化,在微芯片上置入寡核苷酸探针或相应于mRNA序列的cDNA,与细胞cDNA或cRNA进行杂交

农科院生物所搭建全国玉米功能基因组学研究协作平台

  近日,由中国农业科学院生物技术研究所、安徽农业大学和齐鲁师范学院共同主办的第四届全国玉米功能基因组学术研讨会在海南三亚召开。会议旨在通过创新共享玉米EMS突变体库种质材料,搭建全国玉米功能基因组研究协作平台,协力推动我国玉米功能基因组学研究迈上新台阶。  会议特邀国家玉米产业技术体系首席科学家、

东北地理所发表大豆基因克隆及功能基因组学综述文章

  中科院东北地理与农业生态研究所大豆分子育种实验室夏正俊研究员近期发表了中英文综述文章,重点介绍了大豆生育期基因的克隆及大豆光周期反应机理等方面所取得的进展。   自上世纪20年代伊始,美国科学家以大豆等作物为材料发现光周期现象近百年来,人们对该现象的研究在模式作物拟南芥及水稻中研究取得了一系列

当免疫治疗遇到基因组学

  近来一种能够激活人体自身免疫系统对付肿瘤的新药大获成功,然而,只有部分癌症患者得以受益。科学家们近来发现编码肺部肿瘤的基因序列有可能能够帮助我们预测免疫药物能够让哪些人受益最多。  肿瘤细胞之所以能否逃脱人体免疫系统的监视,是通过激活了免疫T细胞表面一个叫做PD-1的受体。该受体被激活以后,T细

药物基因组学发展和应用【四】

  药物基因组学为临床医生和临床药师提供了很大程度上改善几百万患者药物治疗效果的机会。但是,这个机会的利用却受到阻碍和挑战,并且新的知识还在不断的更新。    药物受体的基因多态性    一、β肾上腺素受体基因多态性    目前认为至少存在β1、β2和β3三种不同的肾上腺素受体亚型,β1肾上腺素受体

国际基因组学大会在长春落幕

10月24日,2011国际基因组学大会在长春落幕。中科院院士贺林、美国国立卫生研究院癌症研究所资深研究员Charles Vinson等国内外知名专家学者,围绕“基因组学时代的机遇与挑战”主题,从基因组科学、基因组技术、基因组信息学与计算生物学、基因组转化与应用等方面进行了交流,并就全球基因

药物基因组学发展和应用【五】

药物基因组学为临床医生和临床药师提供了很大程度上改善几百万患者药物治疗效果的机会。但是,这个机会的利用却受到阻碍和挑战,并且新的知识还在不断的更新。    药物基因组学临床应用的机遇与挑战    药物反应个体差异的发现和遗传机制的证实,为改变药物治疗模式提供了重要的理论依据。使传统的“千人一

作物基因组学研究进展(一)

作物基因组学研究进展农作物基因组学研究的发展,对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展,已经实现对重要农作物,如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序,在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了2018年度主要农

药物基因组学发展和应用【一】

影响患者对药物反应的因素有很多,包括患者本身的内在因素如年龄、性别、种族/民族、遗传、疾病状态和器官功能,还有其它生理变化,包括怀孕、哺乳以及外源性因素如吸烟和饮食。基因变异可导致疾病表现和药物反应的多样性这一观念目前已得到广泛认可,并经许多的研究证实。对于一些遗传因素影响研究比较明确的药物,在治疗

作物基因组学研究进展(三)

⑸棉花基因组研究棉花是重要的天然纤维和油料作物,也是研究多倍体进化和作物驯化的重要模式植物。南京农业大学张天真等课题组通过将栽培棉与野生棉对比,绘制出了棉花表观遗传基因的“甲基化基因图谱”,对野生棉和栽培棉之间超过1200万个的差异甲基化胞嘧啶进行分析,鉴定出519个表观等位基因(epiallele

药物基因组学发展和应用(三)

 药物基因组学为临床医生和临床药师提供了很大程度上改善几百万患者药物治疗效果的机会。但是,这个机会的利用却受到阻碍和挑战,并且新的知识还在不断的更新。    药物转运体的基因多态性    药物的生物利用度不仅取决于药物代谢酶的活性,在较大程度上也有赖于生物膜上转运体的活性。转运体分布在许多屏

基因组学出手助番茄复“味”

  以《更好吃的番茄》为题,1月27日的《科学》杂志用封面报道介绍了中美科学家关于番茄风味改良的化学和遗传学路线图研究成果,同期刊发了两国科学家合作的论文。与此同时,《自然》杂志也就此在线发表了亮点报道。   《科学》和《自然》杂志如此重视这小小番茄的原因在于,番茄既是一种非常受消费者欢迎的蔬菜,根

作物基因组学研究进展(二)

⑵小麦基因组研究小麦是全球最重要的粮食作物之一,小麦的稳产和增产对我国乃至全世界粮食安全的影响举足轻重。近年来由于全球气候变化、环境变化的影响,小麦生产面临严峻的挑战,对于小麦的育种和品种改良工作提出了新的要求。普通小麦(Triticum aestivum L.)是3个不同亚基因组形成的异源

基因组学推进肿瘤研究未来发展

  ——访亿明达肿瘤业务营销副总裁约翰·莱特  基因组学正在改变肿瘤研究,其最终目标是推进癌症的诊断、治疗、监控及最终的筛查方式。  癌症通常按照形态进行分类,这指的是病理学家在显微镜下看到的内容。“如今,癌症分类依据已经开始从形态特征转变为更有效的治疗方式,其中的主要转变在很大程度上归功于基因组研

基因组学出手-寻找番茄旧时味

  近日,《科学》杂志以封面报道形式介绍了中美科学家关于番茄风味改良的化学和遗传学路线图研究成果,同期刊发了两国科学家合作的论文。与此同时,《自然》杂志也就此在线发表了亮点报道。   小小番茄之所以获得如此高的关注度,源于这种果实既是一种非常受消费者欢迎的蔬菜,又是植物生物学家的最爱之一,堪称植物遗

药物基因组学发展和应用【二】

 药物基因组学为临床医生和临床药师提供了很大程度上改善几百万患者药物治疗效果的机会。但是,这个机会的利用却受到阻碍和挑战,并且新的知识还在不断的更新。    药物代谢酶的基因多态性    一、I相代谢酶    人类细胞色素P450(CYP459)超家族在诸多药物的代谢中发挥着重要作用,CYP

宏基因组学技术测序木乃伊的肺结核基因组

  来自华威大学的研究者使用宏基因组学技术发现215年之久的木乃伊的肺结核基因组。   由Mark Pallen带领的研究团队试图用技术来发现组织学标本中的肺结核的DNA。   宏基因组学是一种从样本中检测DNA序列的技术,并且样本不需要培养或扩增。这种方法避免了与细菌培养或DNA扩增

“特色植物功能基因组学研究与应用”项目总结交流会召开

  近日,“十二五”国家863计划现代农业技术领域“特色植物功能基因组学研究与应用”项目总结交流会在中国农业科学院棉花研究所海南繁育基地召开。科技部农村科技司郭志伟副司长出席会议并讲话,农村科技司农业科技处和农村中心有关同志,项目首席专家、中国工程院院士喻树迅研究员,项目牵头单位中国农业科学院棉花研

深圳市化学基因组学重点实验室通过建设计划论证

  2010年9月16日,深圳市科技工贸和信息化委员会组织专家在深圳对依托北京大学深圳研究生院的深圳市化学基因组学重点实验室―省部共建国家重点实验室培育基地的建设计划进行可行性论证。科技部基础研究司、深圳市科技工贸和信息化委员会有关负责同志以及依托单位的领导和实验室工作人员参加了会议。  

省部共建国家重点实验室取得基因组学重要成果

  1月26日,省部共建猪遗传改良与养殖技术国家重点实验室撰写的“全基因组重测序揭示猪环境适应性的分子机理及可能的属间杂交现象”论文,在国际上首次采用新一代测序技术,对猪开展了深度(25X)基因组重测序分析,全文在线发表于国际顶级学术期刊《自然-遗传》,这是我国猪遗传育种领域第2篇发表于该刊物的论文

中南大学医学表观基因组学实验室获批湖南省重点实验室

中南大学医学表观基因组学实验室正式获批湖南省重点实验室  根据湖南省科技厅《关于同意组建2010年度省级重点实验室的通知》(湘科计字【2010】116号)精神,中南大学医学表观基因组学实验室正式获得立项批准组建省级重点实验室,建设期为2年,此次湖南省有6个实验室获得批准。  医学

杂交稻基因组学研究获进展

  中科院上海生科院植物生理生态研究所韩斌院士课题组联合中国水稻所杨仕华等团队,在杂交稻基因组学及杂种优势遗传机制研究中获重要进展,2月5日,相关成果在线发表于《自然—通讯》杂志。  据介绍,杂交水稻育种技术的成功是我国近几十年来取得的一项重要科技成就。伴随着汕优63、两优培九等一大批高产杂交稻品种

解决基因组学重要挑战的新工具

  单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术,可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多,但是,仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列,从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前,去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列,还是一个手动和耗时的过程,为了去除污染

Neogen农业基因组学解决方案(二)

遗传异常测试遗传病不仅会导致生产商的经济损失,还会对牲畜造成过大的压力。在接种前的遗传测试可以给生产商提供必要的信息,以做出最佳的接种决定,从而避免遗传病,诸如:•  小腿弯曲(多发性关节硬化症)•  神经性脑积水(NH)•  先天性西昌趾(挛缩性蜘蛛指综合征)•  肺发育不良,并全身水肿(PHA)

2011国际基因组学大会在长春召开

  10月23日,由中科院、吉林省政府主办的2011国际基因组学大会暨中国北方药用物种基因组学转化研究中心成立仪式在吉林省长春市举行。海内外200多名知名专家学者出席大会。   与会专家学者围绕“基因组学时代的机遇与挑战”主题,从“基因组科学”“基因组技术”“基因组信息学与计算生物学”,及“基因组

研究指出基因组学引领生物育种变革

  记者从近日举行的第五届国际农业基因组会议暨深圳国际食品谷研讨会上获悉,现代农业研究已迈入生物组学大数据时代,特别是基因组学及其衍生技术在生物育种中发挥着重要的引领作用。  基因组学是对生物体所有基因进行集体表征、定量研究及不同基因组比较研究的一门交叉生物学学科。基因组学主要研究基因组的结构、功能

英国基因组学研究进展迅速

  随着基因数据的逐渐增多,临床医生能够更好地治疗患者,同时减少医疗事故的发生。英国国家医疗服务体系(National Health Service,NHS)中的许多遗传学中心现在都在使用芯片和外显子测序。  近日,英国卫生大臣Jeremy Hunt和生命科学部长George Freeman将宣布新

协同创新驱动农业基因组学发展

   “作为生物技术领域最基础的学科,农业基因组学研究不仅需要国内外科学家同行的协同创新,更需要与生物技术产业发展需求无缝衔接,才能发挥出农业基因组学的最大潜能。基于这种认识,在国家农业科技创新联盟的框架下,建立农业基因组学的协同创新联盟就显得十分迫切。”中国农科院科技局局长梅旭荣表示。  7月24

Neogen农业基因组学解决方案(一)

纽勤农业基因组学: 增强全球食品安全纽勤的子公司GeneSeek 是全球领先的农业基因组学实验室,自1998 年起便开始提供全面的兽医和农业基因组学诊断解决方案。在农产品生产商需要就畜群作出决定时,GeneSeek 可为其提供必要的信息,进而为农场内的食品安全问题提供基因组学解决方案。GeneS

安捷伦科技发布基因组学站式网站

  2010年4月19日,北京 – 安捷伦科技公司(NYSE:A)日前发布了一个全新的的动态基因组学网站,genomics.agilent.com。   此网站将是所有基因组学资源的一站式供应点。用户可在其中找到众多组织有序、易于查找的信息,从最新的科学进展到最热门的产品一应俱全。此网站以一体化网