北大汤富酬、乔杰、付卫Science发表结直肠癌新成果

结直肠癌是胃肠道中常见的恶性肿瘤。基因组不稳定性、表观遗传异常以及基因表达失调是结直肠癌的典型分子特征。以往的单细胞研究只能分别检测基因组、甲基化组或转录组,而不能以单细胞分辨率同时开展多组学研究。 为了更好地了解结直肠癌的发展,北京大学的研究团队开发出一种单细胞测序方法,不仅能够分析单细胞的基因表达,还能够分析拷贝数变异和表观遗传异常。这有助于了解肿瘤内部的异质性,以及肿瘤转移的机制,为转移性结直肠癌的治疗提供了新的理论依据。 这项题为“Single-cell multiomics sequencing and analyses of human colorectal cancer”的文章于11月30日发表在《Science》杂志上。北京大学生物医学前沿创新中心的汤富酬教授、北京大学第三医院的乔杰教授、付卫教授为共同通讯作者。 2016年,汤富酬教授及其合作者曾在《Cell Research》上发表论文,介绍一种单细......阅读全文

通过单细胞RNA测序,揭示PD1疗法成功治疗结直肠癌的机制

结直肠癌(Colorectal Cancer,CRC)是全世界范围内发病率第三的癌症,每年新增发病人数近200万(仅次于乳腺癌和肺癌),每年导致的死亡人数接近100万(仅次于肺癌)。大约每25个人就有1人会在其一生中患上结直肠癌。而在我国,结直肠癌年发病人数仅次于肝癌,2020年新增56万结直肠癌患

【结直肠癌】检查方法

    检查    常用的检查方法有以下几项:    (1)大便隐血试验 大规模普查时或对一定年龄组高危人群作为结、直肠癌的初筛手段。阳性者再做进一步检查。    (2)肿瘤标记物 结、直肠癌诊断和术后监测较有意义的肿瘤标记物是癌胚抗原(CEA)。但认为CEA作为早期结、直肠癌的诊断缺乏价值。血

【结直肠癌】治疗手法

    治疗    (一)手术治疗    手术切除仍然是结、直肠癌的主要治疗方法。    直肠内超声检查的开展使术前明确早期结、直肠癌的浸润深度和范围成为可能,为结、直肠癌内镜治疗的选择提供了依据。    1.右半结肠癌的手术    右半结肠癌应包括盲肠、升结肠、结肠肝曲部癌,右半结肠癌除因癌肿巨大

结直肠癌早期症状有哪些?

  变化的排便习惯:如便秘、腹泻、便便变细等。  腹痛或不适:在腹部感到疼痛或不适。  便血:出现鲜红色或暗红色的血液或便便中带血。  排气异常:如放屁时有异味或感觉排便不完全。  体重下降:无明显原因的体重下降。  疲劳感:感觉疲乏无力,缺乏精力。  贫血:由于失血而导致贫血。

北大汤富酬、乔杰、付卫Science发表结直肠癌新成果

  结直肠癌是胃肠道中常见的恶性肿瘤。基因组不稳定性、表观遗传异常以及基因表达失调是结直肠癌的典型分子特征。以往的单细胞研究只能分别检测基因组、甲基化组或转录组,而不能以单细胞分辨率同时开展多组学研究。  为了更好地了解结直肠癌的发展,北京大学的研究团队开发出一种单细胞测序方法,不仅能够分析单细胞的

单细胞测序技术在癌症研究中的应用案例分享

以下是一些单细胞测序技术在癌症研究中的应用案例:  1. 胶质母细胞瘤:通过单细胞 RNA 测序,发现了肿瘤细胞中的不同亚型,以及肿瘤微环境中免疫细胞的特征。这有助于理解肿瘤的异质性和免疫细胞的功能状态,为开发更有效的治疗策略提供了依据。  2. 乳腺癌:研究人员利用单细胞测序揭示了肿瘤细胞在转移过

单细胞测序需要准备什么再去测序

DNA测序的测序原理: DNA测序是指分析特定DNA片段的碱基序列,也就是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)与鸟嘌呤的(G)排列方式。快速的DNA测序方法的出现极大地推动了生物学和医学的研究和发现。

单细胞测序方法汇总

单细胞生物学研究一直是当今的热门话题,而且-前沿的领域就是单细胞RNA测序了(scRNA-seq)。常规RNA测序方法一次性能够对成千上万个细胞进行加工测序,并给出平均差异,但并没有两个细胞是完全一样的,而新型的scRNA-seq方法就能够揭示出制造每一种特异性的微小改变,甚至这种技术还能够阐明完整

如何-解读-单细胞-测序

单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。

Nature:单细胞测序(下)

  随着技术的飞速发展,成本大大降低,使得基因组测序成为常规技术。然而,大多数的人类基因组、癌症或其他仍然是通过从多个细胞中抽提DNA来进行测序,它所忽略的细胞间的差异对于控制基因表达、细胞行为和药物反应却有可能是至关重要的。   该研究小组也观测了其他类型的乳腺癌。将肿瘤作为一个整体测序,研究小

Nature:单细胞测序(上)

  Nicholas Navin所需要的就只是一个细胞――问题是如何得到它。这是在2010年,冷泉港实验室的博士后研究员正在探究驱动乳腺癌的遗传改变。此前的大部分癌症基因组研究都是碾碎少量的肿瘤组织,一并将这些DNA进行测序,生成的是一张癌症基因组的一致图像。但Navin想要解析来自单个细胞的序

如何-解读-单细胞-测序

单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。

单细胞测序方法介绍

单细胞RNA测序(scRNA-seq)作为一种全基因组测序的方式,在单细胞层面广泛用于确定细胞类型和细胞变异的鉴定。Namocell单细胞分离仪可以通过细胞标记CD27以及一种细胞活性的染料,来分选出单个活的B细胞。通过分析分离后的单细胞基因表达情况,对比静息记忆B细胞,可以从单细胞层面研究基因表达

什么是单细胞测序?

单细胞测序是一种能够在单个细胞水平上对基因组、转录组、表观遗传组等进行分析的技术。通过单细胞测序,可以:揭示细胞的异质性:了解即使是看似相同的细胞群体中,每个细胞在基因表达、染色质可及性等方面的独特特征。发现新的细胞类型和状态:识别出传统方法难以区分的稀有细胞类型以及细胞在不同生理或病理条件下的特殊

如何-解读-单细胞-测序

单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。

如何-解读-单细胞-测序

单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。

单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例

以下是一些单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例:  **案例一:乳腺癌** 研究人员利用单细胞测序技术对乳腺癌肿瘤组织进行分析,发现了不同亚型乳腺癌细胞之间的基因表达差异和肿瘤细胞的异质性。他们鉴定出了具有干细胞特性的肿瘤细胞亚群,这些细胞可能与肿瘤的复发和耐药性有关。这为开发更有针对性的治疗

Namocell单细胞分离仪应用——单细胞测序

2018年11月,Namocell与CZ-Biohub(Chan Zuckerburg Biohub)合作,在单细胞测序领域做出了新的尝试。CZ-Biohub利用Namocell单细胞分离仪分选出目的B细胞,并且将其进行单细胞测序,为抗体新药的发现迈出了重要一步。单细胞RNA测序(scRNA-s

时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术的差异

时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术主要在以下方面存在区别:空间信息获取普通单细胞测序技术:通常不提供细胞在原始组织中的空间位置信息。时空分辨单细胞测序技术:能够同时获取细胞的基因表达等信息以及它们在组织内的空间位置。细胞间相互作用分析普通单细胞测序技术:难以直接推断细胞间基于空间位置的相互作

时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术的区别

时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术主要有以下区别:空间信息获取传统单细胞测序:通常无法获取细胞在组织中的空间位置信息,只是对分离出的单细胞进行独立分析。时空分辨单细胞测序:能够在测定单细胞基因表达等信息的同时,明确细胞在原始组织中的具体空间位置。细胞互作研究传统单细胞测序:难以直观地揭示基于

结直肠癌早期症状有哪些表现?

  排便习惯改变:如便秘、腹泻、便血等。  腹部不适:如腹痛、腹胀、恶心、呕吐等。  肠道不适:如肠鸣音增强、肠胀气等。  消瘦:无明显原因的体重减轻。  贫血:由于肿瘤出血导致贫血。  疲劳:由于贫血和肿瘤消耗能量导致疲劳。

结直肠癌研究体内外模型综述

  引言:上海吉凯基因化学技术有限公司成立于2002年,拥有国内最大的慢病毒文库,同时也是国内最大的疾病关键基因科研服务供应商,在疾病研究领域的实验积累已逾14年!在这里,我们为大家特别整理了10多个研究领域的经验所得,将最实用的精华分享给大家!上一期帮大家总结了胃癌研究中体内外模型的选择,以及病毒

结直肠癌化疗抵抗新机制

  氟尿嘧啶(Fluorouracil,Fu)是最常用的尿嘧啶抗代谢药,在肿瘤内科治疗中占有重要地位。然而因药物抗性,极大限制了其治疗结直肠癌的疗效。2019年3月发表于国际期刊《Nature Communications》的一篇文章介绍了,结直肠癌对FU药物敏感性的关键,主要完成单位为陆军军医大学

Biomarker时代的结直肠癌精准治疗

  日前,2016届CSCO学术年会在厦门圆满完成,本届年会以“精细管理、精准医疗”为主题,其中精准检测作为实施精准医学的第一步,成为本届CSCO学术年会的热点话题。  在艾德生物与默克联合举办的结直肠癌专场卫星会中,来自临床的刘云鹏教授、李进教授、王新教授和来自病理的丁彦青教授、阎晓初教授、邰艳红

维甲酸抑制结直肠癌的发展

  最近,斯坦福大学医学院的研究人员报道称,维甲酸——来自于维生素A的一种化合物,对于抑制小鼠和人类结直肠癌,起着重要的作用。研究人员发现,癌症小鼠肠道内的代谢产物水平低于正常水平。此外,如果一些结直肠癌患者的肠道组织中高水平地表达一种蛋白质(可降解维甲酸),那么这些患者往往比其他患者的表现更差。相

PNAS:研究重塑结直肠癌发生模型

这一发现导致的治疗策略可能同样有助于治疗II型糖尿病 图片说明:美国德州大学西南医学中心的Lawrence Lum博士(右)和Wei Tang博士。 (图片来源:UT Southwestern Medical Center) 美国科学家近日研究发现,一个之前被认为会促进结直肠癌的蛋白实际

【结直肠癌】病因与临床表现

    结、直肠癌是我国常见的恶性肿瘤。占我国恶性肿瘤的第四位,并有上升的趋势。中国人结、直肠癌与西方人比较有3个流行病学特点:①直肠癌比结肠癌发病率高,约1.5∶1;②低位直肠癌在直肠癌中所占比例高,约占75%,大多数直肠癌可在直肠指检时触及;③青年人(

便隐血试验(FOBT)与结直肠癌

最近科华生物获得便隐血(FOB)检测试剂盒(胶体金法)的注册证,该检测项目丰富了科华生物的POCT产品线,其应用具有重要的临床意义和公共卫生意义。目前,FOBT已被世界各国广泛应用于结直肠癌的大规模人群筛查。随着中国老龄化进程的加快和结直肠癌发病率的逐年上升,科华生物在此刻推出的检测性能优越、质量可

结直肠癌诊治还须“早”发力

   一例早期结直肠癌,只需采用内镜黏膜下剥离术(ESD)即可治疗,人均住院天数为5天,相关医疗费用在1.05万元。但如果是一例IV期结直肠癌,通常需要采取手术+放化疗+靶向用药等手段治疗,人均住院天数为140天,相关医疗费用至少在30万元。  前不久,在第三届国家癌症中心结直肠癌国际高峰论坛上,山

单细胞测序和转录组测序的区别

单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。