NAR:古细菌NSun6识别tRNA底物的分子机理

中国科学院生物化学与细胞生物学研究所王恩多研究组的最新发表了题为“Archaeal NSun6 catalyzes m5C72 modification on a wide-range of specific tRNAs”的文章,揭示了PH1991确实是P. horikoshii tRNA:m5C72修饰酶(PhNSun6),并鉴定了它的tRNA底物,研究人员也提出了高等真核生物和超嗜热古细菌NSun6的进化模型。 这一研究成果公布在12月12日的国际学术期刊Nucleic Acids Research上。 m5C72是近期发现的位于人胞质tRNAThr和tRNACys接收茎的修饰,由人NSun6 (hNSun6)负责催化完成。该研究组前期工作揭示了hNSun6识别tRNA的关键元件和其催化机理(Long, T, et al, 2016, JBC; Liu, RJ and Long, T, et al, 2017, NA......阅读全文

NAR:古细菌NSun6识别tRNA底物的分子机理

  中国科学院生物化学与细胞生物学研究所王恩多研究组的最新发表了题为“Archaeal NSun6 catalyzes m5C72 modification on a wide-range of specific tRNAs”的文章,揭示了PH1991确实是P. horikoshii tRNA:m5

王恩多院士两篇JBC文章解析tRNA新分子机制

  tRNA是细胞内主要的RNA之一,是蛋白质合成中的关键生物大分子。在所有胞内的RNA中,tRNA具有最多的修饰,这些修饰对于tRNA在细胞内发挥功能起着重要作用,缺失某些修饰将引起细胞的严重缺陷甚至导致人类疾病。  近期来自中科院上海生科院的王恩多研究组通过质谱、定点突变和酶学动力学等生物化学手

上海生科院揭示甲基化酶TrmJ对底物tRNA的识别机制

  7月21日,国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王恩多研究组题为tRNA recognition by a bacterial tRNA Xm32 modification enzyme from

古细菌会感染人类

   新华社电 日本研究人员日前宣布,他们发现脑脊髓炎患者体内感染了古细菌。这是医学界首次发现古细菌能感染人类。这一发现有望帮助人们弄清原因不明的慢性病和炎症的原因。  在深海的火山口、陆地的热泉以及盐碱湖等生命难以生存的地方,却生活着一群鲜为人知的古怪微生物——古细菌。它们是一种古老的生物,是地球

古细菌的结构特点

古细菌(archaeobacteria)(又可叫做古生菌或者古菌)是一类很特殊的细菌,多生活在极端的生态环境中。具有原核生物的某些特征,如无核膜及内膜系统;也有真核生物的特征,如以甲硫氨酸起始蛋白质的合成、核糖体对氯霉素不敏感、RNA聚合酶和真核细胞的相似、DNA具有内含子并结合组蛋白;此外还具有既

古细菌向达尔文叫板

  走极端的小怪物   世界上的生物有千千万万,我们熟悉的那些生物往往都是肉眼所见的动植物,比如一些家畜、农作物、观赏树等。其实我们人类属于体型很大的生物了,所以我们站在自己大动物的角度上观察生物界,难免有失偏颇。   201808231534989602349.jpg   比如,很少有人知道

古细菌的结构和特征

古细菌(archaeobacteria)(又可叫做古生菌、古菌、古 核细胞或原细菌)是一类很特殊的细菌,多生活在极端的生态环境中。具有原核生物的某些特征,如无核膜及内膜系统;也有真核生物的特征,如以甲硫氨酸起始蛋白质的合成、核糖体对氯霉素不敏感、RNA聚合酶和真核细胞的相似、DNA具有内含子并结合组

科学家从结构上揭示酵母核糖核酸酶P加工tRNA前体机制

  作为一种通用酶,核糖核酸酶P(RNase P)是一种通用核酶,已在生命的三个王国中发现。它加工tRNA前体(pre-tRNA)的5'端。RNase P是一种核糖核蛋白复合物,由单个具有催化能力的RNA组分和可变数量的蛋白组成。与仅含有一种小蛋白辅因子的细菌RNase P不同的是,古细菌R

大化所蛋白质和RNA复合物相互作用合作研究取得新进展

  中科院大连化学物理研究所海洋生物产品工程组薛松研究员在其2008年非编码RNA如何帮助蛋白质寻找特异底物分子研究工作(Nature Structural & Molecular Biology)基础上,再次与合作者利用结构生物学手段,揭示了另一类非编码RNA及其相关蛋白质和RNA的

科学家重组真核生物tRNA乙酰化修饰活力并实现RNA定点高效乙酰化修饰

4月13日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员周小龙团队,在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上以Activity reconstitution of Kre33 and Tan1 reveals a molecular ruler mechanism in euka

氨酰tRNA

中文名称氨酰tRNA英文名称aminoacyl tRNA定  义转移核糖核酸的3′端通过酯键与氨基酸连接生成,进入核糖体的A位参与蛋白质生物合成。由氨酰tRNA合成酶催化tRNA与活化氨基酸(即氨酰AMP)反应得到。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

甲硫氨酸tRNA

中文名称甲硫氨酸tRNA英文名称methionine tRNA定  义真核生物的一种起始tRNA,携带甲硫氨酸进入核糖体,进入新生肽链的N端。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

tRNA的结构

1.tRNA结构保守:70-80个碱基。2.二级结构:三叶草。3.五个主要臂:(1)接受臂:携带氨基酸;(2)TΨC臂;(3)反密码子臂;(4)双氢尿嘧啶臂(DHU);(5)附加臂:大小反映了整个tRNA分子的大小,根据其大小,tRNA分为两类:第Ⅰ类tRNA,3/4 tRNA只有3-5个碱基的附加

探秘婆罗洲巨型洞穴网-发现远古细菌

  北京时间9月28日消息,据美国国家地理网站报道,30多年前,科学家在马来西亚的婆罗洲沙捞越姆鲁山国家公园地下发现了一个天然洞穴网络。今年5月,一个英国探险小组对沙捞越姆鲁山洞穴系统进行了新的研究和考察,继续绘制这个蜿蜒曲折的地下网络的结构图。根据他们公布的最新照片,这个洞穴系统确

什么是底物?

底物为参与生化反应的物质,可为化学元素、分子或化合物,经酶作用可形成产物。一个生化反应的底物往往同时也是另一个化学反应的产物。在异裂反应中,底物即为亲电试剂或亲核试剂进攻的物质特定的底物会在特定的酶作用下,合成或分解。

底物的定义

底物为参与生化反应的物质,可为化学元素、分子或化合物,作用可形成产物。一个生化反应的底物往往同时也是另一个化学反应的产物。

什么是底物?

底物为参与生化反应的物质,可为化学元素、分子或化合物,作用可形成产物。一个生化反应的底物往往同时也是另一个化学反应的产物。

底物的定义

底物为参与生化反应的物质,可为化学元素、分子或化合物,作用可形成产物。一个生化反应的底物往往同时也是另一个化学反应的产物。

关于基因表达的基本信息介绍

  基因表达产物通常是蛋白质,但是非蛋白质编码基因如转移RNA(tRNA)或小核RNA(snRNA)基因的表达产物是功能性RNA。  所有已知的生命,无论是真核生物(包括多细胞生物)、原核生物(细菌和古细菌)或病毒,都利用基因表达来合成生命的大分子。  基因表达可以通过对其中的几个步骤,包括转录,R

tRNA的结构特征

tRNA的结构特征之一是含有较多的修饰成分,如上面提到的 D、T、 Ψ等;核酸中大部分修饰成分是在tRNA中发现的。修饰成分在tRNA分子中的分布是有规律的,但其功能不清楚。1974年用X射线晶体衍射法测出第一个tRNA——酵母苯丙氨酸tRNA晶体的三维结构,分子全貌象倒写的英文字母L,呈扁平状,长

tRNA的功能特点

作为“搬运工具”的tRNA有很多种,体内20种氨基酸都有其自已特有的tRNA,所以,tRNA的种类不少于20种。tRNA在ATP供应能量和酶的作用下,可分别与特定的氨基酸结合。每个tRNA都有一个由三个核苷酸编成的“反密码”。这个反密码可以根据碱基配对的原则与mRNA上对应的密码配对,而且只有当反密

tRNA的结构基础

tRNA的二级结构如图1所示,其在原核生物和真核生物均相对保守。主要结构有D-loop(D环)、T(C)-loop(T环)、Anticodon-loop(反密码子环)、Accepter Arm(受体臂)、3'端CCA保守序列、Discriminator(识别碱基)、Variable-loop

tRNA的功能介绍

作为“搬运工具”的tRNA有很多种,体内20种氨基酸都有其自已特有的tRNA,所以,tRNA的种类不少于20种。tRNA在ATP供应能量和酶的作用下,可分别与特定的氨基酸结合。每个tRNA都有一个由三个核苷酸编成的“反密码”。这个反密码可以根据碱基配对的原则与mRNA上对应的密码配对,而且只有当反密

tRNA测序,约吗?

  高通量RNA测序(RNA-seq)技术的使用让我们认识了细胞中无比精彩的RNA世界。然而,目前的方法无法检测高度修饰或大量折叠的RNA,如tRNA。近日,《Nature Methods》上的两种方法通过在文库制备前去除tRNA的修饰,解决了tRNA测序的技术难题。  尽管tRNA被认为是看家RN

tRNA转录加工过程

主要加工方式是切断和碱基修饰。真核生物tRNA前体一般无生物学特性,需要进行加工修饰。加工过程包括:(1)剪切和拼接tRNA前体在tRNA剪切酶作用下,切成一定大小的分子。大肠杆菌RnaseP特异切割tRNA前体5′旁侧序列,3′-核酸内切酶如RnaseF可将tRNA前体3′端一段序列切下来。Rna

tRNA的结构介绍

1.tRNA结构保守:70-80个碱基。2.二级结构:三叶草。3.五个主要臂:(1)接受臂:携带氨基酸;(2)TΨC臂;(3)反密码子臂;(4)双氢尿嘧啶臂(DHU);(5)附加臂:大小反映了整个tRNA分子的大小,根据其大小,tRNA分为两类:第Ⅰ类tRNA,3/4 tRNA只有3-5个碱基的附加

Science:极端环境下嗜热古细菌的奥秘

  发表于国际杂志Science上的一篇研究论文中,来自约克大学的研究人员通过研究揭示了嗜热微生物如何将自身DNA从一代传递给下一代,该研究或为进一步理解超级细菌提供一定思路。  硫化叶菌是古细菌王国的一名成员,其个细菌相似是一种单细胞有机体,可以在日本北海道的温泉中分离得到;一些古细菌往往在平凡的

什么是假底物?

假底物是可以特异地结合到酶的活性中心但不被催化、阻止真底物结合的物质。

底物溶液的配制

pH 5.0磷酸-柠檬酸缓冲液加入邻苯二胺1mg/ml,再加入30%的H2O2 (1μl/ml)溶解后即为ELISA底物液,临用前配制,避光保存。

什么是底物循环?

也称之底物循环(substrate cycle)。一对催化两个途径的中间代谢物之间循环的方向相反、代谢上不可逆的反应。有时该循环通过ATP的水解导致热能的释放。例如,葡萄糖+ATP=葡萄糖-6-磷酸+ADP与葡萄糖-6-磷酸+H2O=葡萄糖+Pi反应组成的循环反应,其净反应实际上是ATP+H2O=A