NAR：古细菌NSun6识别tRNA底物的分子机理
中国科学院生物化学与细胞生物学研究所王恩多研究组的最新发表了题为“Archaeal NSun6 catalyzes m5C72 modification on a wide-range of specific tRNAs”的文章，揭示了PH1991确实是P. horikoshii tRNA:m5C72修饰酶(PhNSun6)，并鉴定了它的tRNA底物，研究人员也提出了高等真核生物和超嗜热古细菌NSun6的进化模型。 这一研究成果公布在12月12日的国际学术期刊Nucleic Acids Research上。 m5C72是近期发现的位于人胞质tRNAThr和tRNACys接收茎的修饰，由人NSun6 (hNSun6)负责催化完成。该研究组前期工作揭示了hNSun6识别tRNA的关键元件和其催化机理(Long, T, et al, 2016, JBC； Liu, RJ and Long, T, et al, 2017, NA......阅读全文
细胞化学词汇氨酰tRNA
中文名称：氨酰tRNA英文名称：aminoacyl tRNA定 义：转移核糖核酸的3′端通过酯键与氨基酸连接生成，进入核糖体的A位参与蛋白质生物合成。由氨酰tRNA合成酶催化tRNA与活化氨基酸(即氨酰AMP)反应得到。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
细胞化学词汇tRNA前体
中文名称：tRNA前体英文名称：tRNA precursor定 义：转移核糖核酸(tRNA)基因转录的初始产物，需经过多步加工才能产生成熟的、有功能的tRNA分子。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
tRNA前体的结构特点
中文名称tRNA前体英文名称tRNA precursor定 义转移核糖核酸(tRNA)基因转录的初始产物，需经过多步加工才能产生成熟的、有功能的tRNA分子。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
腺苷化反应和tRNA装载
这一过程是ATP和氨基酸反应最终生成2Pi、氨基酸（AA）-AMP的过程。氨基酸的羟基中的氧原子除了和C、H原子分别形成共价键之外，还具有独立的2个电子对。由氨基酸的羟基向三磷酸腺苷的第一个磷酸发起攻击，在保留第一个高能磷酸键的前提下，使PPi脱离，随后形成2Pi。 这个化学过程可简要概括如下
肽酰tRNA的结构特点
中文名称肽酰tRNA英文名称peptidyl tRNA定 义肽酰基通过酯键连接在转移核糖核酸的3′端CCA的A(腺苷)的羟基上形成的化合物。蛋白质生物合成时，肽酰tRNA中的肽链逐步延伸。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
脱酰tRNA的结构特点
中文名称脱酰tRNA英文名称deacylated tRNA定 义脱去酰基(氨酰基或肽酰基)的转移核糖核酸(tRNA)。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
tRNA,－rRNA－,－mRNA有什么作用
mrna是以dna为模板复制的，作为肽链合成的模板；rrna是核糖体的组成部分，其作用是在肽链合成过程中催化肽键的形成；trna则负责把氨基酸搬运到核糖体处合成肽链。
细胞化学词汇肽酰tRNA
中文名称：肽酰tRNA英文名称：peptidyl tRNA定 义：肽酰基通过酯键连接在转移核糖核酸的3′端CCA的A(腺苷)的羟基上形成的化合物。蛋白质生物合成时，肽酰tRNA中的肽链逐步延伸。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
同工tRNA的基本信息
中文名同工tRNA外文名cognate tRNA定义：同工tRNA（cognate tRNA）：指几个代表相同氨基酸、能够被一个特殊的氨酰-tRNA合成酶识别的tRNA。
tRNA二级结构特点
tRNA的二级结构为三叶草结构，其结构特征为： (1)tRNA的二级结构由四臂、四环组成，已配对的片断称为臂，未配对的片断称为环。 (2)叶柄是氨基酸臂，其上含有CCA-OH3’，此结构是接受氨基酸的位置。 (3)氨基酸臂对面是反密码子环，在它的中部含有三个相邻碱基组成的反密码子，可与mRNA
细胞化学词汇脱酰tRNA
中文名称：脱酰tRNA英文名称：cognate tRNA定 义：同工tRNA，指几个代表相同氨基酸、能够被一个特殊的氨酰-tRNA合成酶识别的tRNA。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
起始tRNA－的基本信息
起始tRNA initiation tRNA是指能特异性地认别mRNA上的起始密码子，是使蛋白质合成开始的tRNA。在细胞中有两种甲硫氨酸tRNA分子，其中的一种就起这种作用。在大肠杆菌中，已接受甲硫氨酸的tRNAfMet在被甲酰化之后，以其30S核糖体亚基与mRNA共同结合，使蛋白质合成开始。即使
细胞化学词汇甲硫氨酸tRNA
中文名称：甲硫氨酸tRNA英文名称：methionine tRNA定 义：真核生物的一种起始tRNA，携带甲硫氨酸进入核糖体，进入新生肽链的N端。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
含硒tRNA的结构特点
中文名称含硒tRNA英文名称selenium-containing tRNA定 义通常指含硒代半胱氨酸或硒代甲硫氨酸的转移核糖核酸(tRNA)。分别参与含硒代半胱氨酸或硒代甲硫氨酸的硒蛋白的合成。从一些细菌、哺乳动物和植物中分离得到。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
研究人员把GCMS用于古细菌化石研究
分析测试百科网讯 研究人员相信，他们使用常用于法医学的GC-MS分析方法，发现了新古典分子化石。 根据微生物学家卡尔·沃斯（Carl Woese）设计的系统，地球上有三个生物领域：细菌、古细菌和真核生物。到目前为止，古细菌的分布情况仍然不清楚，特别是对于可追溯到200多万年的地质时期。这是因为
揭秘古老的古细菌如何帮助解释复杂生命的起源
近日，来自日本的科学家们首次捕捉到了一种非常特殊的微生物，其与可能产生地球上所有复杂生命的微生物相似，相关研究成果发表于国际杂志bioRxiv上，研究者表示，如今他们已经能从古细菌单细胞微生物的一个古老谱系中分离并培养出微生物了，这些微生物表面上看起来像细菌，但实则与只从基因组序列中发现的微生物
营养学词汇硒代半胱氨酸功能及结构介绍
在遗传密码中，硒半胱氨酸的编码是UGA（即乳白密码子），通常用作终止密码子。但如果在mRNA中有一个硒半胱氨酸插入序列(SElenoCysteine Insertion Sequence, SECIS)，UGA就用作硒半胱氨酸的编码。SECIS序列是由特定的核苷酸序列和碱基配对形成的二级结构决定的。
SD序列的特点和应用
Shine-Dalgarno （SD）是细菌和古细菌中信使RNA中核糖体结合位点序列。通常位于翻译起始密码子AUG上游约8~10个碱基位置。SD序列帮助招募核糖体RNA，并将核糖体比对并结合到信使RNA（mRNA）的起始密码子，从而开始蛋白质合成。一旦被招募，tRNA可以按照密码子的指令顺序添加氨基
源于SD序列的基本信息介绍
Shine-Dalgarno （SD）是细菌和古细菌中信使RNA中核糖体结合位点序列。通常位于翻译起始密码子AUG上游约8~10个碱基位置。SD序列帮助招募核糖体RNA,并将核糖体比对并结合到信使RNA（mRNA）的起始密码子,从而开始蛋白质合成。一旦被招募,tRNA可以按照密码子的指令顺序添加
上海生科院发现苏氨酰tRNA合成酶具有tRNA等的编校特性
11月20日，国际学术期刊Nucleic Acids Research（《核酸研究》）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王恩多研究组题为A minimalist mitochondrial threonyl-tRNA synthetase exhibits tRNA
生物学术语假底物
可以特异地结合到酶的活性中心但不被催化、阻止真底物结合的物质。有些酶具有假底物结构域，其中的特定序列或残基作为假底物结合到酶的活性部位，抑制酶活性，当酶与配基结合后发生构象变化，释放假底物，恢复催化功能。这是体内调节酶活性的一种重要方式。
HRP底物分类及其操作步骤
底物范围较广，包括二氨基联苯胺(DAB)、氯萘酚和氨乙基咔唑等。二氨基联苯胺／金属盐 DAB是辣根过氧化物酶最敏感、常用的底物。它产生强烈的棕色产物，在水和醇中不溶解。多数情况下，推荐在DAB中加入不同的金属离子。当加入金属盐如钴、镍至底物液中，辣根过氧化物酶可以更加敏感。此类反应产物呈暗蓝灰色至黑
酶免疫技术酶与底物
酶结合物是酶与抗原或者抗体、半抗原在交联剂作用下联结的产物,是 ELISA 成败的关键试剂。它不仅具有抗原抗体的特异性反应,还具有酶促反应的特性,最终产生生物放大的特性。酶免疫反应中,最常用的酶是辣根过氧化物酶,HRP的催化反应需要底物过氧化氢(H2O2)和供氢体(DH2)。供氢体多为无色的还原型染
HRP底物归类以及操作流程
二氨基联苯胺／金属盐 DAB是辣根过氧化物酶最比较敏感、常见的底物。它造成明显的深棕色物质，在水和醇中不融解。大部分状况下，强烈推荐在DAB中添加不一样的金属正离子。当添加金属盐如钴、镍至底物液中，辣根过氧化物酶能够更为比较敏感。该类反映物质呈暗灰蓝色至灰黑色，且在水及醇中平稳。DAB／金
含硒tRNA的基本信息
中文名称含硒tRNA英文名称selenium-containing tRNA定 义通常指含硒代半胱氨酸或硒代甲硫氨酸的转移核糖核酸(tRNA)。分别参与含硒代半胱氨酸或硒代甲硫氨酸的硒蛋白的合成。从一些细菌、哺乳动物和植物中分离得到。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
教你如何玩转tRNA机制研究（二）
4.AET1而不是RACK1A以及eIF3h直接和OsARF mRNA结合AET1与RACK1A以及eIF3h的结合是否和mRNA相关？RIP测序（云序生物提供）帮助研究者快速的明确哪些mRNA能够和蛋白AET1结合，分析结果显示高温条件下545个mRNA分子只在野生型水稻株当中和AET1结合，而仅
甲硫氨酸tRNA的基本信息
中文名称甲硫氨酸tRNA英文名称methionine tRNA定 义真核生物的一种起始tRNA，携带甲硫氨酸进入核糖体，进入新生肽链的N端。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
教你如何玩转tRNA机制研究（一）
文章导读：“忽如一夜春风来，千树万树梨花开！”自然界的花花草草在悄无声息的感受着大自然的变化。随着全球气候的变化，环境温度也在不断的变化，那么什么是温度感受器？AET1是tRNA上鸟苷转移酶，它是水稻高温条件下正常生长所必需的。本文研究结果表明，tRNAHis鸟苷转移酶AET1在植物应对高温环境中发
分子遗传学词汇tRNA剪接
中文名称：tRNA剪接英文名称：tRNA splicing定 义：切除前体tRNA中的内含子。应用学科：遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
关于tRNA转录加工的基本介绍
主要加工方式是切断和碱基修饰。真核生物tRNA前体一般无生物学特性，需要进行加工修饰。加工过程包括： （1）剪切和拼接 tRNA前体在tRNA剪切酶作用下，切成一定大小的分子。大肠杆菌RnaseP特异切割tRNA前体5′旁侧序列，3′－核酸内切酶如RnaseF可将tRNA前体3′端一段序列切