NAR：古细菌NSun6识别tRNA底物的分子机理
中国科学院生物化学与细胞生物学研究所王恩多研究组的最新发表了题为“Archaeal NSun6 catalyzes m5C72 modification on a wide-range of specific tRNAs”的文章，揭示了PH1991确实是P. horikoshii tRNA:m5C72修饰酶(PhNSun6)，并鉴定了它的tRNA底物，研究人员也提出了高等真核生物和超嗜热古细菌NSun6的进化模型。 这一研究成果公布在12月12日的国际学术期刊Nucleic Acids Research上。 m5C72是近期发现的位于人胞质tRNAThr和tRNACys接收茎的修饰，由人NSun6 (hNSun6)负责催化完成。该研究组前期工作揭示了hNSun6识别tRNA的关键元件和其催化机理(Long, T, et al, 2016, JBC； Liu, RJ and Long, T, et al, 2017, NA......阅读全文
tRNA，mRNA，rRNA有什么区别
1、功能不同tRNA：主要是携带氨基酸进入核糖体，在mRNA指导下合成蛋白质。mRNA：将DNA中的gene转录成RNA并且运送出细胞核，经过剪接修饰后在核糖体上完成翻译生成蛋白质。rRNA：rRNA是核糖体的主要结构成分，具有肽酰转移酶的活性；为tRNA和多种蛋白质合成因子提供结合位点；在蛋白质合
教你如何玩转tRNA机制研究（一）
文章导读：“忽如一夜春风来，千树万树梨花开！”自然界的花花草草在悄无声息的感受着大自然的变化。随着全球气候的变化，环境温度也在不断的变化，那么什么是温度感受器？AET1是tRNA上鸟苷转移酶，它是水稻高温条件下正常生长所必需的。本文研究结果表明，tRNAHis鸟苷转移酶AET1在植物应对高温环境中发
研究人员把GCMS用于古细菌化石研究
分析测试百科网讯 研究人员相信，他们使用常用于法医学的GC-MS分析方法，发现了新古典分子化石。 根据微生物学家卡尔·沃斯（Carl Woese）设计的系统，地球上有三个生物领域：细菌、古细菌和真核生物。到目前为止，古细菌的分布情况仍然不清楚，特别是对于可追溯到200多万年的地质时期。这是因为
揭秘古老的古细菌如何帮助解释复杂生命的起源
近日，来自日本的科学家们首次捕捉到了一种非常特殊的微生物，其与可能产生地球上所有复杂生命的微生物相似，相关研究成果发表于国际杂志bioRxiv上，研究者表示，如今他们已经能从古细菌单细胞微生物的一个古老谱系中分离并培养出微生物了，这些微生物表面上看起来像细菌，但实则与只从基因组序列中发现的微生物
研究发现人胞质亮氨酰tRNA合成酶CP发卡结构域功能
7月29日，国际学术期刊RNA在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王恩多课题组的最新研究成果，解析了人胞质亮氨酰-tRNA合成酶的CP发卡结构域在酶催化过程中的功能和机制。 亮氨酰-tRNA合成酶(LeuRS)催化亮氨酸和对应tRNALeu之间的酯化反应。亮氨酸和
细胞化学词汇SD序列
中文名称：SD序列外文名称：Shine-Dalgarno sequence定 义：Shine-Dalgarno （SD）是细菌和古细菌中信使RNA中核糖体结合位点序列。通常位于翻译起始密码子AUG上游约8~10个碱基位置。SD序列帮助招募核糖体RNA，并将核糖体比对并结合到信使RNA（m
HRP底物归类以及操作流程
二氨基联苯胺／金属盐 DAB是辣根过氧化物酶最比较敏感、常见的底物。它造成明显的深棕色物质，在水和醇中不融解。大部分状况下，强烈推荐在DAB中添加不一样的金属正离子。当添加金属盐如钴、镍至底物液中，辣根过氧化物酶能够更为比较敏感。该类反映物质呈暗灰蓝色至灰黑色，且在水及醇中平稳。DAB／金
生物学术语假底物
可以特异地结合到酶的活性中心但不被催化、阻止真底物结合的物质。有些酶具有假底物结构域，其中的特定序列或残基作为假底物结合到酶的活性部位，抑制酶活性，当酶与配基结合后发生构象变化，释放假底物，恢复催化功能。这是体内调节酶活性的一种重要方式。
酶免疫技术酶与底物
酶结合物是酶与抗原或者抗体、半抗原在交联剂作用下联结的产物,是 ELISA 成败的关键试剂。它不仅具有抗原抗体的特异性反应,还具有酶促反应的特性,最终产生生物放大的特性。酶免疫反应中,最常用的酶是辣根过氧化物酶,HRP的催化反应需要底物过氧化氢(H2O2)和供氢体(DH2)。供氢体多为无色的还原型染
HRP底物分类及其操作步骤
底物范围较广，包括二氨基联苯胺(DAB)、氯萘酚和氨乙基咔唑等。二氨基联苯胺／金属盐 DAB是辣根过氧化物酶最敏感、常用的底物。它产生强烈的棕色产物，在水和醇中不溶解。多数情况下，推荐在DAB中加入不同的金属离子。当加入金属盐如钴、镍至底物液中，辣根过氧化物酶可以更加敏感。此类反应产物呈暗蓝灰色至黑
科学家解析膜蛋白DGGGPase结构与功能
膜脂是细胞膜的重要组成部分，主要由脂类分子以双分子层的形式构成的膜骨架。微生物在生长过程中，生物膜脂的合成与代谢调控具有重要作用。虽然微生物细胞膜脂质合成的主要机制已被阐明，但古细菌细胞膜的甘油磷脂生物合成机制，由于涉及膜内多个蛋白的参与，目前仍不完全清晰。 其中，古细菌膜脂关键合成酶CDP-
链霉菌亮氨酰tRNA合成酶识别两类亮氨酸tRNA的分子机理
国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心/生物化学与细胞生物学研究所王恩多研究组的最新研究成果：LeuRS can leucylate type I and type II tRNALeus in Streptomyce
分子遗传学词汇抑制型tRNA
中文名称:抑制型tRNA英文名称：suppressor tRNA定 义：反密码子发生突变的tRNA分子。可校正错义或无义突变。应用学科：遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
Cell惊人发现：抑癌的tRNA片段
多年来，科学家们一直对漂浮在从细菌到哺乳动物，包括人类在内各种细胞中的一些遗传物质短片段感到困惑。它们是细胞利用来生成蛋白质的一些遗传指令的片段，但由于长度太短而无法实现它们通常的用途。在本周的《细胞》（Cell）杂志上，来自洛克菲勒大学的研究人员发现了有关这些片段在人体中所起作用的一个重大线索
转录产物tRNA前体的后加工
目前分离得到的tRNA前体有两类:①含单个tRNA的tRNA前体,在5′端和3′端各有一段多余顺序;②含二个tRNA的tRNA前体,除5′端和3′端有长短不一的多余顺序外,在两个tRNA之间还有数目不等的核苷酸隔开。有的真核tRNA前体的反密码子环区含有一个居间顺序。原核和真核生物tRNA前体的后加
甲硫氨酸tRNA的结构和功能特点
中文名称甲硫氨酸tRNA英文名称methionine tRNA定 义真核生物的一种起始tRNA，携带甲硫氨酸进入核糖体，进入新生肽链的N端。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
氨酰tRNA的结构和功能特点
中文名称氨酰tRNA英文名称aminoacyl tRNA定 义转移核糖核酸的3′端通过酯键与氨基酸连接生成，进入核糖体的A位参与蛋白质生物合成。由氨酰tRNA合成酶催化tRNA与活化氨基酸(即氨酰AMP)反应得到。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
tRNA前体的后加工过程介绍
目前分离得到的tRNA前体有两类：①含单个tRNA的tRNA前体，在5′端和3′端各有一段多余顺序；②含二个tRNA的tRNA前体，除5′端和3′端有长短不一的多余顺序外，在两个tRNA之间还有数目不等的核苷酸隔开。有的真核tRNA前体的反密码子环区含有一个居间顺序。原核和真核生物tRNA前体的后加
简述tRNA对氨基酸的识别
tRNA通过反密码子和mRNA上的密码子相互配对,将特定的氨基酸运送到核糖体上肽链合成位点上,但是tRNA如何来识别特定的氨基酸呢？这就涉及tRNA的“身份”（identity）问题,这个问题是核酸领域的热点之一。人们需要解决几个问题： （1）tRNA怎样接受特定的氨基酸,氨基酰－tRNA合成
Cell惊人发现：抑癌的tRNA片段
多年来，科学家们一直对漂浮在从细菌到哺乳动物，包括人类在内各种细胞中的一些遗传物质短片段感到困惑。它们是细胞利用来生成蛋白质的一些遗传指令的片段，但由于长度太短而无法实现它们通常的用途。在本周的《细胞》（Cell）杂志上，来自洛克菲勒大学的研究人员发现了有关这些片段在人体中所起作用的一个重大线索
氨酰tRNA合成酶的概念
氨酰-tRNA合成酶（Aminoacyl-tRNA synthases ）是一类参与将氨基酸结合到其对应的tRNA上的过程的酶 [1] 。氨酰-tRNA合成酶参与的合成分两步进行。第一步是氨酰-tRNA合成酶识别它所催化的氨基酸以及另一底物ATP，在氨酰-tRNA合成酶的催化下，氨基酸的羧基与AM
胰岛素受体底物的概念
胰岛素受体底物(insulin receptor substrate，IRSs)是一种能够被激活的胰岛受体酪氨酸激酶的底物, 其上具有十几个酪氨酸残基可被磷酸化，磷酸化的IRSs能够结合并激活下游效应物。
底物量对反应结果的影响
化学反应是化学学习的一个重要内容。物质间发生的化学反应往往错综复杂、变化万千。不少化学反应是需要在一定条件下发生的，缺少了反应条件，有的反应是不能发生的，或进行得很慢。反应物的量的不同对反应结果有影响。1、CO2气体通入NaOH溶液中。当n CO2/n NaOH≤1/2时，反应方程式为CO2+ 2N
什么是底物化学发光？
根过氧化酶使试剂中的发光物(luminol)氧化并发光,而试剂中含有增强剂这使得发光增强了1000倍。在免疫印迹中,将复杂的蛋白混合物经sds-page分离,并转移到固相膜上(如nc、pvdf)等,用于免疫学检测,经HRP标记的抗体与膜上的蛋白直接(标记一抗)或间接(标记二抗)反应。
酶底物复合物的概念
中文名称酶-底物复合物英文名称enzyme-substrate complex定 义在酶催化的反应中，酶首先与底物结合形成的过渡态中间物。可转化成产物和酶。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），酶（二级学科）
底物化学发光的用途
非放射性发光系统,用于检测固定在膜上的蛋白,其敏感性达1-5pg。用x光片可快速地获得永久的硬拷贝结果。所含独特的底物足以维持12小时以上的发光,便于反复曝光操作,免疫印迹膜经抗体脱卸处理后可供再次抗体探查使用。适用于痕量蛋白或核酸检测。
使用荧光底物的直接－ELISA－实验
实验概要使用荧光偶联一抗的直接 ELISA 测定的程序。实验步骤第 1 天：1. 在滤过的 PBS 中稀释包被抗体后，在每孔中加入 100 μl 进行包被。用封板膜覆盖酶标板，将酶标板在 4℃下孵育过夜。 第 2 天：2. 将 4 g Block ACE 粉末稀释于 100 ml 去离子水中，使用其
胰岛素受体底物的定义
胰岛素受体底物(insulin receptor substrate，IRS)，参与胰岛素及其他细胞因子信号转导的磷酸化蛋白。IRS在被胰岛素受体磷酸化以后，如同一块“磁铁”与那些具有SH2结构域的蛋白结合，根据所结合蛋白的具体结构产生不同的效应，如激活SH2蛋白的酶活性、改变蛋白质构型并同另外的蛋
底物量对反应结果的影响
化学反应是化学学习的一个重要内容。物质间发生的化学反应往往错综复杂、变化万千。不少化学反应是需要在一定条件下发生的，缺少了反应条件，有的反应是不能发生的，或进行得很慢。反应物的量的不同对反应结果有影响。1、CO2气体通入NaOH溶液中。当n CO2/n NaOH≤1/2时，反应方程式为CO2+ 2N
试剂盒酶的底物分类
酶的底物 1.3.3.1 HRP的底物 HRP催化过氧化物的氧化反应，最具代表性的过氧化物为H2O2，其反应式如下：DH2+ H2O2 D+ H2O上式中，DH2为供氧体，H2O2为受氢体。2.在ELISA试剂盒中，DH2一般为无色化合物，经酶作用后成为有色的产品，以便作比色测定。常用的供氢体有邻苯