《Cell》利用CRISPR技术破解古老谜题——DNA复制的最后一块拼图
佛罗里达州立大学的一个研究小组解开了一个古老的谜题——细胞的关键过程到底是如何进行监控的,这对于未来遗传学研究意义重大。 这一研究成果公布在12月27日Cell杂志上,由分子生物学David Herbert带领他的博士生Jiao Sima完成。 对于细胞来说,DNA等遗传物质定期进行复制,是所有生物体必不可少的过程,这决定了包括从头发颜色,到生物体对疾病的反应等。DNA复制是在20世纪50年代后期发现的,之后虽然全球各地的研究人员都试图了解这一过程是如何被调节的,但依然有许多未解之谜。 “这真是一个谜,”Gilbert说,“复制似乎对我们试图干扰它所进行的各种尝试都能避开。虽然现在我们已经详细描述了DNA复制过程,发现了它在不同细胞类型中的变化,以及在疾病中被破坏的情况。但直到现在,我们还找不到最后一块拼读——控制元件。” 在这项最新研究中,Sima在DNA分子上尝试检测了近一百个基因突变,希望能更好地解释复制过程的......阅读全文
PNAS:CRISPR协助细胞对抗HIV
宿主细胞在面对病毒感染的时候,会表达一系列对抗病毒的蛋白,这些蛋白被称为宿主限制因子。哺乳动物细胞编码的限制因子,可以限制HIV-1和其他病毒的复制。不过,被病毒感染的细胞往往不表达这样的限制因子。人们普遍认为,诱导宿主限制因子的表达是抑制病毒复制的一个潜在途径。 杜克大学的Bryan R.
Science:CRISPR女神发表新成果
Jennifer Doudna(左) 来自加州大学伯克利分校、德国马克斯普朗克生物物理化学研究所的研究人员揭示出了为识别靶DNA,预先组织形成的一种Cas9-导向RNA(gRNA)复合物的构象。这项研究发布在近期的《科学》(Science)杂志上。 文章的通讯作者是加州大学伯克利分校的Jenni
中国农大特聘教授发表CRISPR文章
2015年12月10日,中国农业大学特聘教授韩建永带领的研究小组,以Letter的形式在《Protein & Cell》杂志上发表题为“Highly efficient generation of biallelic reporter gene knock-in mice via CRISPR-
详解CRISPR基因编辑技术的利与弊
说到基因编辑,大家都会想起CRISPR技术。这个当年名声大噪的技术,现今依旧热度不减,尤其是我们的CRISPR大神张锋,近期发表的文章频频亮相于知名杂志,又引起一片热议。时过境迁,CRISPR技术并没有销声匿迹,一直在线。但任何事物包括技术有利就有弊,CRISPR技术当然也毫不例外。 CR
著名华人院士CRISPR改写致病突变
CRISPR/ Cas9已经作为基因组编辑工具被用于各种各样的研究,比如将HIV从人类基因组切下,以及在灵长类动物中关闭基因的表达。现在,科学家们又通过CRISPR/Cas9在人类细胞系中,改写了一个引起β-地中海贫血(β-thalassemia)的突变基因,这一成果于八月五日发表在Genome
什么是CRISPR/Cas9技术
CRISPR/Cas9系统的原理是利用gRNA特异性识别靶序列,并引导Cas9核酸内切酶对靶序列的PAM上游进行切割,从而造成靶位点DNA双链断裂,随之利用细胞的非同源末端连接(NHEJ)或同源重组(HDR)的方式对切割位点进行修复,实现DNA水平的基因敲除、敲入或点突变。
CRISPR-实验利器:BTX-电转仪
什么是 CRISPR?CRISPR(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats), 是细菌中用于与病毒进行斗争的免疫武器。 生命进化历史上,细菌为了将病毒的外来入侵基因清除,进化出 CRISPR 系统,利用这个系统,细菌可以不动
改良CRISPR工具-产前编辑致病基因
科学家们首次在实验动物体内进行产前基因编辑试图阻止致命的代谢紊乱疾病,为出生前治疗人类先天性疾病提供了可能。费城儿童医院(CHOP)和宾夕法尼亚大学医学院的研究发表在今天出版的《Nature Medicine》上,证明了产前基因编辑的低毒性。 使用CRISPR-Cas9和碱基编辑器3(BE3)
用CRISPR实现基因转录活体成像
最近,日本的一个研究小组开发出一种实时成像方法,用于内源基因转录活性和核定位的同步测量。研究人员用该方法来检测亚基因组范围的流动性变化,这取决于小鼠胚胎干细胞中多能性相关基因的活性。 Hiroshi Ochiai博士和他的同事Takeshi Sugawara博士、Takashi Yamamoto
CRISPR大规模基因组研究
来自杜克大学的研究人员设计出了一种能快速,方便有效靶向人类基因组任何基因的新方法,这种新工具建立在一种来自细菌的RNA引导酶的基础上,即CRISPR-Cas RNA引导性核酸酶(RNA-guided nucleases,RGNs)。 这一研究成果公布在7月25日Nature Met
Science等两篇论文实现CRISPR多基因编辑与多重基因编辑
12月,首先是Braod研究院的研究人员在CRISPR–Cpf1的基础上打造了一个多重化基因编辑系统,其后,来自中科院动物所的研究人员也在CART细胞中实现多基因编辑。这两项成果分别公布在Science和Cell Research杂志上。 CRISPRs和CRISPR相关蛋白(Cas)蛋白的新
一个新软件让CRISPR方法更加容易
最近,瑞典卡罗林斯卡学院和哥德堡大学的科学家,研发出了一个基于网络的软件——Green Listed,可以方便CRISPR方法的使用。该软件发表在《Bioinformatics》,可以通过greenlisted.cmm.ki.se网站免费获取。延伸阅读:Cell最新公布CRISPR技术新发现:更
基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(下)
上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。 一、大规模基因功能的筛选 尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展,但是解析复杂的基
与CRISPR/Cas系统相爱相杀的抗CRISPR蛋白研究最新进展-二
利用一种被称作冷冻电镜的高分辨率成像技术,这些研究人员发现了CRISPR系统和抗CRISPR蛋白的三个重要的方面。首先,他们准确地观察这种CRISPR监视复合物如何识别病毒遗传物质以便发现它应当在何处发起攻击。这种监视复合物中的蛋白像握手那样缠绕在细菌crRNA的周围,让这种crRNA的特定片段暴露
三大顶级期刊分别报道CRISPR重要成果
随着CRISPR-Cas9技术平台在各个研究领域中的扩展,相信生物行业的很多人都熟悉了CRISPR,Cas9这些名词,但对于III型CRISPR-Cas系统、RT-Cas1、CRISPR样系统(MIMIVIRE)这些新词语,大家了解吗? 近期Nature,Science,Cell三大著名期刊分
Cell-Reports:基于内源性IF型CRISPR的高效便捷基因编辑系统
直接在临床分离的多重耐药菌中进行功能基因组学研究是解析耐药机制以及开发抗耐药策略最直接有效的方法。然而,由于缺乏能在临床耐药菌中直接进行高效基因编辑的工具,目前耐药机制仍主要是采用组学分析加在模式菌中的异源验证进行研究。这种脱离了临床耐药菌本身遗传背景的研究策略,往往忽略了遗传背景本身对耐药因子
Cell子刊介绍一种高效精确的基因敲入技术:TildCRISPR
一组研究人员设计了一种新型基因靶向整合策略Tild-CRISPR,它可以在小鼠和人的细胞中实现高效精确的基因敲入。Tild-CRISPR不仅适用于高效地构建小鼠动物模型,同时为研究体内的基因功能以及开发潜在的基因疗法提供新思路。 这一研究成果公布在Developmental Cell期刊上,题
Realspace-and-realtime-dynamics-of-CRISPRCas9-visualized-by-...(五)
Correlation analysis of HS-AFM images2D correlation coefficients were calculated between the HS-AFM images of the first frame and each of the fram
高光坪教授:CRISPR无疤基因编辑纠正遗传病中的DNA突变
来自麻省大学医学院的一组研究人员提出了一种基因组编辑新策略,可以用于纠正小鼠模型中引起人类遗传疾病??的DNA突变。 这一研究成果公布在8月13日Nature Biotechnology杂志上,领导这一研究的是麻省大学医学院的高光坪教授。高教授是当今全球基因治疗领域的领导者之一,他早年毕业于四
高光坪教授:CRISPR无疤基因编辑纠正遗传病中的DNA突变
来自麻省大学医学院的一组研究人员提出了一种基因组编辑新策略,可以用于纠正小鼠模型中引起人类遗传疾病??的DNA突变。 这一研究成果公布在8月13日Nature Biotechnology杂志上,领导这一研究的是麻省大学医学院的高光坪教授。高教授是当今全球基因治疗领域的领导者之一,他早年毕业于四
浙江大学Nature子刊聚焦CRISPR–Cas的抑制系统
来自浙江大学生命科学研究院的研究人员揭示出了,噬菌体蛋白AcrF3抑制Cas3的结构基础。他们的研究结果发布在7月25日的《自然结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。 浙江大学生命科学研究院的朱永群(Yongqun Zhu)教授
北大教授用CRISPR技术定点改造水稻基因
长期以来,科学家们一直想按照人类的设计定点改造特定基因以提高水稻的产量和质量,但定点基因改造技术在水稻等植物中一直没有突破。 CRISPR-Cas 系统定点突变水稻基因 北京大学生命科学学院的瞿礼嘉教授实验室利用最新的CRISPR-Cas系统成功地实现了对水稻特定基因的定点突变,效率
Cell-Res发布重要基因表达调控新技术
来自Whitehead研究所的研究人员通过构建出一种叫做CRISPR-on的强大新基因调控系统,现在能够同时提高多个基因的表达,并精确操控每个基因的表达水平。他们证实这一系统能够有效应用于小鼠细胞、人类细胞和人类胚胎中。研究人员在发表于8月27日《细胞研究》(Cell Research)杂志
华中农大:利用I型及III型CRISPRCas系统实现基因组编辑
CRISPR-Cas系统广泛存在于细菌和古细菌中,近年来科学家们针对它们的分子机制开展研究促使开发出了基于II型系统的一些基因编辑技术(延伸阅读:中科院Cell发表CRISPR-Cas研究新成果 )。然而,却未有研究报道利用I型及III型系统来实现基因组编辑。 来自华中农业大学的研究人员报告称
CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激活细胞
题目:CRISPR-Based Chromatin Remodeling of the Endogenous Oct4 or Sox2 Locus Enables Reprogramming to Pluripotency 期刊:Cell stem cell 影响因子:23.3
自然子刊:揭示基因组编辑新机制
中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所杨力研究组与上海科技大学陈佳研究组、南京医科大学沈彬研究组合作研究揭示了胞嘧啶脱氨酶(APOBEC)在CRISPR/Cas9引发的DNA断裂修复过程中产生突变的新机制,为进一步提高基因组编辑保真度提供了新思路。 C
清华百人计划发表CRISPR新成果
CRISPR/Cas已成为强有力的基因组编辑技术,并已成功地应用于 许多生物,其中包括几个植物物种。然而,在植物中,基因组编辑试剂载体的传递仍然是一个挑战。最近,来自清华大学和中科院微生物研究所的研究人员,在 Nature子刊《Scientific Reports》发表的一项研究中,报道了一个基
当“魔剪”CRISPR遇上干细胞,会撞出什么火花?
自发现以来,基于CRISPR的基因编辑系统已经从根本上改变了研究者们操纵基因组的能力。近日,Cell杂志推出CRISPR特辑——Gene Editing in Stem Cells,用2个SnapShots、2篇综述以及7篇论文,回顾了近阶段基因编辑技术与干细胞之间“擦出的火花”。 Cell
PNAS:科学家制备双重核酸酶让CRISPR技术更上一层楼
生物通报道:最近,美国西安大略大学的研究人员,就像玩分子乐高游戏一样,向革命性的新基因编辑工具CRISPR/Cas9添加了一种工程酶。他们的研究发表在12月12日出版的美国国家科学院院刊PNAS,表明他们添加的这种工程酶,使得CRISPR基因编辑技术能够更有效和有特异性地靶定基因。延伸阅读:从N
CRISPR/Cas9应用近期重大进展
基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一,受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称,Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas最初是在细菌体内发现的,是细菌用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。