约翰霍普金斯大学的研究人员Michael Schatz概括了目前所做的工作和进展情况,而贝勒医学院的研究人员Fritz Sedlazeck介绍了样本选择和结构变异检测的详细信息。 番茄是最有价值的经济作物之一,在世界各地广泛栽培。根据联合国粮农组织的统计,2016年番茄产量达到1.77亿吨,价值约850亿美元。 早在2012年,国际团队就利用Sanger测序、罗氏454测序等技术绘制了番茄的参考基因组。据Schatz介绍,这个950 Mb的二倍体基因组代表了当时高质量的组装,已成为一种宝贵资源。不过,它不太适合结构变异的分析,而这些结构变异促成了农业和经济上的重要性状。 “之前的研究已表明,结构变异在番茄驯化及其他重要表型上发挥作用,”Sedlazeck在会上谈到,并表示这些变异“难以通过短读长测序技术来捕获和定相,挑战了群体测序的可行性。” 于是,Schatz及其同事开始利用长读长测序技术、计算生物学以及功能研究来......阅读全文
一项新技术或产品的问世,给人们带来欣喜的同时,也必然会引起担忧,基因测序技术便是其中之一。基因测序技术被看作自疫苗问世以来疾病预防最重要的科技突破,它不仅可以大大降低遗传相关的疾病发生率,减少出生缺陷,还可以实现对疾病预测、预防、预警以及个体化诊疗;但目前,国内的基因测序市场却并不让人满意,甚至
每年12月,《科学》杂志都会公布年度突破及入围成果。以下为今年的10大突破和赢家,排名不分先后。 1.时空涟漪撼动科学界 今年发现时空涟漪(即引力波)撼动了科学界。它完成了阿尔伯特·爱因斯坦在100年前完成的一项预测,为40年来寻找这种无穷小的涟漪画上了句号。但这个故事并未结束,科学家将此次
人们盼星星、盼月亮,总算等到了纳米孔测序仪开放试用。如今,1000多个实验室测试了MinION测序仪,并发表了结果。他们在这一期的《Nature Methods》上介绍了他们的使用体会。而更多的产品也在开发之中。 纳米孔(nanopore)技术让核酸分子穿过直径只有几纳米的孔而确定其序列。这个
2019年底爆发新型冠状病毒性肺炎COVID-19疫情,全球已有许多感染和死亡病例,截止2020年3月1日,累计确诊超8万人,死亡近三千例,但仍存在许多临床疑似病例无法确诊。既往COVID-19诊断依赖于qPCR核酸检测,但是该方法显示出较高的假阴性率和低敏感性(阳性检出率仅为30%至50%),
在DNA测序过去的40年中,我们见证了诸多技术的变革和测序规模的极度增长。从几千个碱基到第一个人体基因组,乃至当前数以万计的人体和无数其它的基因组。包括作为大量分子现象的“计数器”在内,DNA测序被广泛和创造性地应用于各个领域。从长远来看,我们可以预测DNA测序技术所带来的影响将会与显微镜的使用
2018年即将过去,年末为大家献上生物谷本年度心脑血管疾病专题盘点,希望读者朋友们能够喜欢。1. Science:重磅!亲联蛋白2切割竟可阻止心力衰竭产生doi:10.1126/science.aan3303. 美国爱荷华大学心脏研究员Long-Sheng Song博士及其团队在之前的研究中已
近年来,Pacific Biosciences、Oxford Nanopore Technologies、Bionano Genomics和10x Genomics等公司的长读长测序和基因组图谱技术越来越受欢迎。随着相关技术的推广应用,长读长测序技术在快速、高效提取高质量高分子量DNA方面的痛点
自从AlphaGo成了围棋界的No.1,“智能”的潜力被广而周知,尤其对于大量的重复性工作,写个“算法”让电脑“跑”,得出的结果说不定比人强。科学家不仅有足够大的脑洞,还有着非凡的执行力。这次是生物学者,他们借鉴了信息学科的思维,发明了基因测序的新方法。日前,一篇名为《基于信息理论来修正错误的高准确
Scott Tighe(左)等研究人员利用MinION设备在南极泰勒谷测序微生物DNA。 “我们能从手机上的残留物预言谁刚吃了一个橘子或者谁吃了猪肉。”美国纽约威尔康奈尔医学院计算生物学家Mason表示。你们相信吗?Christopher Mason有一个喜欢在会议上展示的技巧。通过从志愿者手机
Christopher Mason有一个喜欢在会议上展示的技巧。通过从志愿者手机上收集的化验样本获取DNA,他和同事能在1个小时内现场进行谱系分析,甚至详细描述出捐赠者一天的生活细节。“我们能从手机上的残留物预言谁刚吃了一个橘子或者谁吃了猪肉。”美国纽约威尔康奈尔医学院计算生物学家Mason表示
随着大数据和全基因组测序的发展成熟和大量研究的广泛开展,有时不免让人觉得研究人员将他们的显微镜(microscope)更换为宏观镜(macroscope)。但是,《科学家》杂志举办的2018年十大创新竞赛讲述了一个不同的故事:单个细胞。在《科学家》杂志的独立评审团评选出的2018年十大创新产品中,它
公司:DNAe (DNA Electronics) 网站:https://www.dnae.com 简介:2003年成立,英国。 核心技术:基于电微流体半导体(CMOS)的合成法测序技术 是否属于单分子测序技术:否 公司产品:LiDia测序平台 描述:使用离子敏感场效应晶体管(ISF
一、导读: 在大部分投资者对“二代测序”(NGS)还没有搞清技术细节的情况下,“三代测序”(3GS)又火了。 6月17日,医药板块中基因测序相关标的在“三代测序技术获得重大突破”的新闻影响上出现明显涨幅,我们也接到较多投资者对相关新闻的背景及观点的询问。为此,我们结合各方面资料归纳总结了三代
蕾妮·瓦林特(Renee Valint)的女儿谢尔碧(Shelby)在2000年出生时,看起来虚弱无力,就如同一只耷拉着的布娃娃。谢尔碧学着走路和说话,但学得非常慢,错过了儿童发展的重要阶段。到4岁时,她还只能坐在轮椅上。到五年级时,她开始要用电子语音设备与人交流。绝望无助的蕾妮把女儿从菲尼克斯
随着对DNA结构和序列的研究,DNA测序技术不断发展,成为生命科学研究的核心领域,对生物、化学、电学、生命科学、医学等领域的技术发展起到巨大的推动作用。利用纳米孔研究出新型的快速、准确、低成本、高精度及高通量的DNA测序技术是后人类基因组计划的热点之一。 纳米孔测序技术发展简介 纳米孔检测技
2015年度国家自然科学基金委员会与瑞典科研与教育国际合作基金会合作交流项目初审结果的通知 根据国家自然科学基金委员会(NSFC)与瑞典科研与教育国际合作基金会(STINT)的双边合作协议,双方在2015年共同资助中国与瑞典科研人员之间在科学研究的基础上开展的合作交流项目。2015年7月,我
在“二代测序”(NGS)尚未迎来投资热潮的情况下,技术突破捷报连连的“三代测序”(3GS)又进入到了投资人的视野中。1986年,第一台商用基因测序设备正式出现,到第二代测序设备出现,期间间隔了19年时间。而第二代设备问世,到第三代设备的诞生,仅仅用了5年,基因测序设备的更新换代速度正在不断加快。
在个体化医疗前景的诱惑下,研究人员将研发出更有效的基因测序新方法视为首要任务。如今,宾夕法尼亚大学物理学家利用固态的纳米孔区分单链DNA分子,这一有前景的技术,在DNA穿过纳米孔时,通过检测电流变化进而读取DNA序列。相关研究发表在《ACS Nano》期刊上。 领导这项研究的是艺术与科学学院物
本文由原创作者 矮小森 授权 分析测试百科网发表,从中我们可以闻到NGS战场上的硝烟,感受到科学奇才们的大胆创意和持续的斗志。 说起基因测序仪,很多人都会第一时间想起进口的品牌和产品。这没办法,因为目前能够有自主知识产权和生产能力
近日,美国著名的《麻省理工科技评论》评选出了全球最聪明(创造力)的50家公司。这50个名单不仅包含了亚马逊、谷歌、微软等互联网巨头,也包含了创立于2013年的Editas Medicine这一类新型公司。在这50家公司里,生物医疗相关的公司总共有15家。 在这15家公司中,有10家公司与基因相
分析测试百科网讯 近日,2019年度黑龙江省自然科学基金项目拟立项名单公示,共有500个项目,涉及了生命科学、材料、化工、环境、临床等领域。大庆师范学院、东北林业大学、东北农业大学、东北轻合金有限责任公司、东北石油大学、哈尔滨电机厂有限责任公司、哈尔滨工程大学、哈尔滨工业大学、哈尔滨理工大学、哈
基因检测技术是近年来伴随“精准医疗”概念的提出而迅速发展起来的一门科学技术,它可以从基因组机制上阐释遗传学、发育生物学、进化生物学等学科的经典概念,在全基因组水平延伸了染色体高级构象、细胞异质性、功能模块等新概念,为精准医学开辟了应用性新领域。 近年来,随着分子水平的基因检测技术平台不断发展和
时间总是过得很快,2016年马上就要过去了,迎接我们的将是崭新的2017年,2016年,我国有很多优秀科研机构的科学家们都做出了意义重大、影响深远的研究成果,发表在国际顶级期刊上。本文中小编盘点了2016年我国科学家发表的一些重磅级研究,以饕读者。 --结构生物学 -- 1.清华大学 施一
纵观测序技术的发展历程,没有哪一个技术像纳米孔测序那样慢热,但也没有哪一个技术像纳米孔测序这么接近普罗大众。将单链DNA拉过蛋白孔,检测碱基穿过时电导的微小改变,纳米孔测序的这一基础理念已经有十几年历史了。 1996年哈佛大学的DanielBranton、加州大学的DavidDeamer及其同
公司:Quantum Biosystems 网站:https://quantumbiosystems.com 简介:2013年成立,日本。 核心技术:基于电信号的纳米孔单分子测序技术 是否属于单分子测序技术:是 公司产品:暂无推出 描述:采用亚纳米间隙和兆分之一安培级电流来直接检测单
1 植物群体遗传蛋白质组学 1.l 遗传多样性蛋白质研究基于基因组学的一些遗传标记,如RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)、RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)、SSR(Simple Sequen
提及测序仪,那就不得不说Illumina和Thermo两只“大鳄”。这两家公司提供的测序仪占据了绝大部分市场份额。出于应对特殊政策的需要,国内的几家企业也纷纷推出了“自己”的测序仪。放眼国际市场,有一些企业另辟蹊径,研发出别具特色的测序仪,力图从垄断者手中分得一杯羹。小编今天就带大家认识一下这些
这是一个与 mRNA 结合的细菌核糖体的分子模式图,该核酸蛋白复合体正在合成蛋白质。 随着科研人员逐渐揭开 RNA 修饰的奥秘,帮助我们了解表观转录组学(epitranscriptomics)的工具也变得越来越多了。 2004 年,以色列特拉维夫大学(Tel Aviv University
截至2019年12月23日,中国学者在Cell,Nature及Science在线发表了107篇文章(2019年的Cell ,Nature 及Science 已经全部更新),iNature团队对于这些文章做了系统的总结: 按杂志来划分:Cell 发表了31篇,Nature 发表了44篇,Scie
新加坡基因组研究院(GIS)的研究人员开发了一种方法,称为INC-Seq,能够提高牛津纳米孔技术公司掌上测序仪MinIon的测序准确性。目前他们正努力改进该方法,将它应用到复杂样本的16S测序、RNA测序以及基因组复杂区域测序等中。 研究人员在近日发表于《Giga Science》的文章中描述